MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_015183	CAG	3	9	1899425	1899433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293347
41002	NC_015183	CAG	3	9	1899446	1899454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293347
41003	NC_015183	AGC	2	6	1899468	1899473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293347
41004	NC_015183	TTC	2	6	1899492	1899497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293347
41005	NC_015183	AAT	2	6	1899612	1899617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41006	NC_015183	CTT	2	6	1899650	1899655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293348
41007	NC_015183	TGC	2	6	1899695	1899700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293348
41008	NC_015183	CAG	2	6	1899743	1899748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293348
41009	NC_015183	GC	3	6	1899753	1899758	0 %	0 %	50 %	50 %	325293348
41010	NC_015183	CCG	2	6	1899831	1899836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293348
41011	NC_015183	AAC	2	6	1899839	1899844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293348
41012	NC_015183	GAC	2	6	1899875	1899880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293348
41013	NC_015183	TTC	2	6	1899990	1899995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293348
41014	NC_015183	GC	3	6	1900020	1900025	0 %	0 %	50 %	50 %	325293348
41015	NC_015183	AACCG	2	10	1900085	1900094	40 %	0 %	20 %	40 %	325293348
41016	NC_015183	CTGT	2	8	1900153	1900160	0 %	50 %	25 %	25 %	325293348
41017	NC_015183	TTTGCC	2	12	1900200	1900211	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41018	NC_015183	CGC	2	6	1900272	1900277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41019	NC_015183	CAGGCA	2	12	1900287	1900298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41020	NC_015183	CGA	2	6	1900523	1900528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293349
41021	NC_015183	GAG	2	6	1900560	1900565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293349
41022	NC_015183	TGA	2	6	1900615	1900620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293349
41023	NC_015183	TTC	2	6	1900646	1900651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293349
41024	NC_015183	CGAA	2	8	1900666	1900673	50 %	0 %	25 %	25 %	325293349
41025	NC_015183	GCC	2	6	1900730	1900735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293349
41026	NC_015183	CATC	2	8	1900762	1900769	25 %	25 %	0 %	50 %	325293349
41027	NC_015183	CAT	2	6	1900796	1900801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293349
41028	NC_015183	CGA	2	6	1900834	1900839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293349
41029	NC_015183	CAT	2	6	1900844	1900849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293349
41030	NC_015183	GCC	2	6	1900886	1900891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293349
41031	NC_015183	TTC	2	6	1900910	1900915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293349
41032	NC_015183	CAA	2	6	1900921	1900926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293349
41033	NC_015183	CAG	2	6	1900936	1900941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293349
41034	NC_015183	TCA	2	6	1900950	1900955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293349
41035	NC_015183	CGC	2	6	1901023	1901028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293349
41036	NC_015183	TCG	2	6	1901088	1901093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293349
41037	NC_015183	TCT	2	6	1901176	1901181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293349
41038	NC_015183	CTA	2	6	1901214	1901219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293350
41039	NC_015183	CCATTG	2	12	1901253	1901264	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325293350
41040	NC_015183	GCA	2	6	1901279	1901284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293350
41041	NC_015183	CTTC	2	8	1901391	1901398	0 %	50 %	0 %	50 %	325293350
41042	NC_015183	CGG	2	6	1901416	1901421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293350
41043	NC_015183	TGA	2	6	1901463	1901468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293350
41044	NC_015183	GGC	2	6	1901506	1901511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293350
41045	NC_015183	ATG	2	6	1901534	1901539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293350
41046	NC_015183	CGG	2	6	1901572	1901577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293350
41047	NC_015183	TC	3	6	1901642	1901647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41048	NC_015183	TTCAA	2	10	1901653	1901662	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41049	NC_015183	TC	3	6	1901678	1901683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41050	NC_015183	CGG	2	6	1901698	1901703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41051	NC_015183	GTG	2	6	1901714	1901719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41052	NC_015183	TCG	2	6	1901873	1901878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293351
41053	NC_015183	AAC	2	6	1901887	1901892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293351
41054	NC_015183	ACG	2	6	1901901	1901906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293351
41055	NC_015183	TGA	2	6	1902078	1902083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293351
41056	NC_015183	GC	3	6	1902110	1902115	0 %	0 %	50 %	50 %	325293351
41057	NC_015183	ACG	2	6	1902166	1902171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293351
41058	NC_015183	TCGG	2	8	1902188	1902195	0 %	25 %	50 %	25 %	325293351
41059	NC_015183	GAT	2	6	1902216	1902221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293351
41060	NC_015183	TCGA	2	8	1902248	1902255	25 %	25 %	25 %	25 %	325293351
41061	NC_015183	CTT	2	6	1902265	1902270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293351
41062	NC_015183	GC	3	6	1902304	1902309	0 %	0 %	50 %	50 %	325293351
41063	NC_015183	CAG	2	6	1902387	1902392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293352
41064	NC_015183	A	6	6	1902394	1902399	100 %	0 %	0 %	0 %	325293352
41065	NC_015183	GCG	2	6	1902457	1902462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293352
41066	NC_015183	CTG	2	6	1902499	1902504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293352
41067	NC_015183	AAT	2	6	1902572	1902577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41068	NC_015183	CCG	2	6	1902768	1902773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41069	NC_015183	GAA	2	6	1902898	1902903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41070	NC_015183	T	6	6	1902928	1902933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41071	NC_015183	TAT	2	6	1903037	1903042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325293353
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41074	NC_015183	T	6	6	1903342	1903347	0 %	100 %	0 %	0 %	325293353
41075	NC_015183	CGG	2	6	1903411	1903416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293353
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41077	NC_015183	GTC	2	6	1903477	1903482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293353
41078	NC_015183	GTC	2	6	1903573	1903578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293353
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41085	NC_015183	GAA	2	6	1903858	1903863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41086	NC_015183	AGCC	2	8	1903882	1903889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41087	NC_015183	AAT	2	6	1903937	1903942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41088	NC_015183	ATT	2	6	1903963	1903968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41089	NC_015183	AGA	2	6	1903973	1903978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41090	NC_015183	TA	3	6	1904082	1904087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41091	NC_015183	A	7	7	1904113	1904119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41092	NC_015183	CGG	2	6	1904120	1904125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41093	NC_015183	CCG	2	6	1904137	1904142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41094	NC_015183	CCG	2	6	1904174	1904179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41095	NC_015183	CGA	2	6	1904196	1904201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293354
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41097	NC_015183	GCC	2	6	1904233	1904238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293354
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41100	NC_015183	GCC	2	6	1904422	1904427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293354
41101	NC_015183	TTC	2	6	1904428	1904433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293354
41102	NC_015183	CTT	2	6	1904464	1904469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293354
41103	NC_015183	CGC	2	6	1904532	1904537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293354
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41107	NC_015183	CGA	2	6	1904637	1904642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293354
41108	NC_015183	CTT	2	6	1904649	1904654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293354
41109	NC_015183	CAG	2	6	1904790	1904795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293354
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41115	NC_015183	CGT	2	6	1904952	1904957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293354
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41118	NC_015183	AGCA	2	8	1905013	1905020	50 %	0 %	25 %	25 %	325293354
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41237	NC_015183	CCA	2	6	1910934	1910939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293362
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41239	NC_015183	TTC	2	6	1911080	1911085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293362
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41353	NC_015183	GCT	2	6	1917210	1917215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293370
41354	NC_015183	CCT	2	6	1917317	1917322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293370
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41453	NC_015183	TGG	2	6	1922386	1922391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41471	NC_015183	TGC	2	6	1923531	1923536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293377
41472	NC_015183	CGCA	2	8	1923549	1923556	25 %	0 %	25 %	50 %	325293377
41473	NC_015183	GGC	2	6	1923597	1923602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293377
41474	NC_015183	TGC	2	6	1923617	1923622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293377
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41476	NC_015183	ATC	2	6	1923643	1923648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293377
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41479	NC_015183	TCG	2	6	1923826	1923831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293377
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41491	NC_015183	GCT	2	6	1924252	1924257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293377
41492	NC_015183	GAA	2	6	1924266	1924271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293377
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41495	NC_015183	AGC	2	6	1924331	1924336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293377
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