MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40502	NC_015183	ACG	2	6	1874711	1874716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293319
40503	NC_015183	GCG	2	6	1874720	1874725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293319
40504	NC_015183	AAC	2	6	1874749	1874754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293319
40505	NC_015183	CGA	2	6	1874787	1874792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293319
40506	NC_015183	TTC	2	6	1874806	1874811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293319
40507	NC_015183	GTC	2	6	1874824	1874829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293319
40508	NC_015183	T	6	6	1874841	1874846	0 %	100 %	0 %	0 %	325293319
40509	NC_015183	TTGTCC	2	12	1874856	1874867	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325293319
40510	NC_015183	ACC	2	6	1874902	1874907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40511	NC_015183	GTG	2	6	1875024	1875029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40512	NC_015183	CTTT	2	8	1875037	1875044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40513	NC_015183	GCT	3	9	1875214	1875222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293320
40514	NC_015183	GAGC	2	8	1875243	1875250	25 %	0 %	50 %	25 %	325293320
40515	NC_015183	GAT	2	6	1875309	1875314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293320
40516	NC_015183	TTC	2	6	1875328	1875333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293320
40517	NC_015183	GCGG	2	8	1875356	1875363	0 %	0 %	75 %	25 %	325293320
40518	NC_015183	GGC	2	6	1875386	1875391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293320
40519	NC_015183	CG	3	6	1875402	1875407	0 %	0 %	50 %	50 %	325293320
40520	NC_015183	CTT	2	6	1875419	1875424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293320
40521	NC_015183	CTT	3	9	1875453	1875461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293321
40522	NC_015183	CTT	2	6	1875464	1875469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293321
40523	NC_015183	GCCCTT	2	12	1875501	1875512	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325293321
40524	NC_015183	CTG	2	6	1875564	1875569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293321
40525	NC_015183	TTG	2	6	1875571	1875576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293321
40526	NC_015183	GAT	2	6	1875588	1875593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293321
40527	NC_015183	GGC	2	6	1875693	1875698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293321
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40530	NC_015183	GTC	2	6	1875864	1875869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293321
40531	NC_015183	CGA	2	6	1875875	1875880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293321
40532	NC_015183	CTG	2	6	1875944	1875949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293321
40533	NC_015183	CTGT	2	8	1875993	1876000	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40534	NC_015183	AGA	2	6	1876029	1876034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293322
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40538	NC_015183	GCA	2	6	1876305	1876310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293322
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40540	NC_015183	GTCATG	2	12	1876415	1876426	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325293322
40541	NC_015183	CG	4	8	1876528	1876535	0 %	0 %	50 %	50 %	325293323
40542	NC_015183	AGCGA	2	10	1876592	1876601	40 %	0 %	40 %	20 %	325293323
40543	NC_015183	TCA	2	6	1876647	1876652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293323
40544	NC_015183	TGG	2	6	1876677	1876682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293323
40545	NC_015183	CTG	2	6	1876684	1876689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293323
40546	NC_015183	CGAC	2	8	1876692	1876699	25 %	0 %	25 %	50 %	325293323
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40549	NC_015183	TCG	2	6	1876823	1876828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293324
40550	NC_015183	CGT	2	6	1876840	1876845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293324
40551	NC_015183	GAT	2	6	1876852	1876857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293324
40552	NC_015183	CG	3	6	1876986	1876991	0 %	0 %	50 %	50 %	325293324
40553	NC_015183	AAC	2	6	1877116	1877121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293324
40554	NC_015183	GCA	2	6	1877156	1877161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293324
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40570	NC_015183	AAT	2	6	1877897	1877902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293326
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40575	NC_015183	GTT	2	6	1878030	1878035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40577	NC_015183	GGT	2	6	1878123	1878128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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40585	NC_015183	ACG	2	6	1878456	1878461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293327
40586	NC_015183	ATT	2	6	1878485	1878490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40587	NC_015183	GCC	2	6	1878512	1878517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293328
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40602	NC_015183	CGG	2	6	1879498	1879503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293330
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40606	NC_015183	CTT	2	6	1879653	1879658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293330
40607	NC_015183	GAT	2	6	1879662	1879667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293330
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40612	NC_015183	AAC	2	6	1879925	1879930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293331
40613	NC_015183	GTGAG	2	10	1879935	1879944	20 %	20 %	60 %	0 %	325293331
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40615	NC_015183	CGTCGA	2	12	1880044	1880055	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325293331
40616	NC_015183	GTT	2	6	1880063	1880068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293331
40617	NC_015183	TCT	2	6	1880098	1880103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293331
40618	NC_015183	CTT	2	6	1880162	1880167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293331
40619	NC_015183	CTT	2	6	1880299	1880304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293332
40620	NC_015183	GA	3	6	1880337	1880342	50 %	0 %	50 %	0 %	325293332
40621	NC_015183	TGCT	2	8	1880393	1880400	0 %	50 %	25 %	25 %	325293332
40622	NC_015183	CGA	2	6	1880427	1880432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293332
40623	NC_015183	CAA	2	6	1880529	1880534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293332
40624	NC_015183	CTT	2	6	1880581	1880586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293333
40625	NC_015183	ATG	2	6	1880606	1880611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293333
40626	NC_015183	GTCG	2	8	1880617	1880624	0 %	25 %	50 %	25 %	325293333
40627	NC_015183	GAC	2	6	1880682	1880687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293333
40628	NC_015183	CAC	3	9	1880706	1880714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293333
40629	NC_015183	GGT	2	6	1880721	1880726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293333
40630	NC_015183	GAC	2	6	1880740	1880745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293333
40631	NC_015183	CGT	2	6	1880796	1880801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293333
40632	NC_015183	CGAT	2	8	1880835	1880842	25 %	25 %	25 %	25 %	325293333
40633	NC_015183	CGA	2	6	1880916	1880921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293333
40634	NC_015183	ACGT	2	8	1880927	1880934	25 %	25 %	25 %	25 %	325293333
40635	NC_015183	CGG	2	6	1880937	1880942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293333
40636	NC_015183	GAT	2	6	1880989	1880994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293333
40637	NC_015183	ACCG	2	8	1880998	1881005	25 %	0 %	25 %	50 %	325293333
40638	NC_015183	CCA	2	6	1881219	1881224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293333
40639	NC_015183	ACC	3	9	1881244	1881252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293333
40640	NC_015183	GTT	2	6	1881280	1881285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293333
40641	NC_015183	ACG	2	6	1881504	1881509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293334
40642	NC_015183	ACG	2	6	1881551	1881556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293334
40643	NC_015183	AG	3	6	1881607	1881612	50 %	0 %	50 %	0 %	325293334
40644	NC_015183	CTC	2	6	1881760	1881765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325293335
40645	NC_015183	CAG	2	6	1881777	1881782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293335
40646	NC_015183	ACG	2	6	1881805	1881810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293335
40647	NC_015183	AAGCG	2	10	1881934	1881943	40 %	0 %	40 %	20 %	325293335
40648	NC_015183	CAG	2	6	1881952	1881957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293335
40649	NC_015183	CGA	2	6	1881993	1881998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293335
40650	NC_015183	GC	3	6	1882050	1882055	0 %	0 %	50 %	50 %	325293335
40651	NC_015183	CTT	2	6	1882060	1882065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293335
40652	NC_015183	GCC	3	9	1882111	1882119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293335
40653	NC_015183	GTCTTG	2	12	1882214	1882225	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325293335
40654	NC_015183	CTG	2	6	1882234	1882239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293335
40655	NC_015183	CTT	2	6	1882240	1882245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293335
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40657	NC_015183	CG	3	6	1882512	1882517	0 %	0 %	50 %	50 %	325293336
40658	NC_015183	GTT	2	6	1882573	1882578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293336
40659	NC_015183	ACC	3	9	1882630	1882638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293336
40660	NC_015183	GGCC	2	8	1882707	1882714	0 %	0 %	50 %	50 %	325293336
40661	NC_015183	ATCA	2	8	1882747	1882754	50 %	25 %	0 %	25 %	325293336
40662	NC_015183	CGA	2	6	1882779	1882784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293336
40663	NC_015183	GCTTT	2	10	1882785	1882794	0 %	60 %	20 %	20 %	325293336
40664	NC_015183	TCG	2	6	1882836	1882841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293336
40665	NC_015183	ATCC	2	8	1882930	1882937	25 %	25 %	0 %	50 %	325293336
40666	NC_015183	CGT	2	6	1882968	1882973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293336
40667	NC_015183	CCTT	2	8	1883144	1883151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40668	NC_015183	TCAACG	2	12	1883202	1883213	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325293337
40669	NC_015183	TCA	2	6	1883233	1883238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293337
40670	NC_015183	GGGGT	2	10	1883256	1883265	0 %	20 %	80 %	0 %	325293337
40671	NC_015183	CTT	2	6	1883318	1883323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293337
40672	NC_015183	GAG	2	6	1883332	1883337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293337
40673	NC_015183	CGGATA	2	12	1883472	1883483	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325293337
40674	NC_015183	AGT	2	6	1883619	1883624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40675	NC_015183	TTGC	2	8	1883654	1883661	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40676	NC_015183	CGC	2	6	1883732	1883737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40677	NC_015183	T	6	6	1883743	1883748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40678	NC_015183	CGG	3	9	1883759	1883767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40679	NC_015183	CCG	3	9	1883779	1883787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40680	NC_015183	CGT	2	6	1883801	1883806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40681	NC_015183	CGA	2	6	1883816	1883821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293338
40682	NC_015183	CGA	2	6	1883828	1883833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293338
40683	NC_015183	GCC	2	6	1883853	1883858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293338
40684	NC_015183	TTC	2	6	1883883	1883888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293338
40685	NC_015183	GAA	2	6	1884024	1884029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325293338
40686	NC_015183	GCC	2	6	1884042	1884047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293338
40687	NC_015183	TTC	2	6	1884048	1884053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293338
40688	NC_015183	CTT	2	6	1884084	1884089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293338
40689	NC_015183	CGC	2	6	1884152	1884157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293338
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40692	NC_015183	CGT	2	6	1884231	1884236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293338
40693	NC_015183	CGA	2	6	1884257	1884262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293338
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40700	NC_015183	CGA	2	6	1884551	1884556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293338
40701	NC_015183	CGT	2	6	1884572	1884577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293338
40702	NC_015183	TTG	2	6	1884592	1884597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293338
40703	NC_015183	ACG	2	6	1884604	1884609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293338
40704	NC_015183	AGCA	2	8	1884633	1884640	50 %	0 %	25 %	25 %	325293338
40705	NC_015183	CG	3	6	1884650	1884655	0 %	0 %	50 %	50 %	325293338
40706	NC_015183	GCA	2	6	1884712	1884717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293338
40707	NC_015183	TTC	2	6	1884730	1884735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293338
40708	NC_015183	TTC	2	6	1884834	1884839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293338
40709	NC_015183	AGC	2	6	1884843	1884848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293338
40710	NC_015183	GCA	2	6	1884895	1884900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293338
40711	NC_015183	ACG	2	6	1884905	1884910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293338
40712	NC_015183	AAT	2	6	1885018	1885023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40713	NC_015183	GC	3	6	1885139	1885144	0 %	0 %	50 %	50 %	325293339
40714	NC_015183	CGCGA	2	10	1885256	1885265	20 %	0 %	40 %	40 %	325293339
40715	NC_015183	TCA	2	6	1885322	1885327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293339
40716	NC_015183	CTT	2	6	1885353	1885358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293339
40717	NC_015183	TGC	2	6	1885359	1885364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293339
40718	NC_015183	GAG	2	6	1885408	1885413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293339
40719	NC_015183	AGCG	2	8	1885473	1885480	25 %	0 %	50 %	25 %	325293339
40720	NC_015183	CCG	2	6	1885546	1885551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293339
40721	NC_015183	TTC	2	6	1885575	1885580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293339
40722	NC_015183	GTTCG	2	10	1885590	1885599	0 %	40 %	40 %	20 %	325293339
40723	NC_015183	GAT	2	6	1885602	1885607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293339
40724	NC_015183	ACC	2	6	1885632	1885637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293339
40725	NC_015183	TCT	2	6	1885660	1885665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293339
40726	NC_015183	GAT	2	6	1885788	1885793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293339
40727	NC_015183	TTC	2	6	1885806	1885811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293339
40728	NC_015183	CAG	2	6	1885841	1885846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293339
40729	NC_015183	GTG	2	6	1885984	1885989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293339
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40732	NC_015183	GCA	2	6	1886069	1886074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293339
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40848	NC_015183	TCA	2	6	1892089	1892094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293345
40849	NC_015183	CGAG	2	8	1892123	1892130	25 %	0 %	50 %	25 %	325293345
40850	NC_015183	CGA	2	6	1892225	1892230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293345
40851	NC_015183	CGG	2	6	1892233	1892238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293345
40852	NC_015183	CCTT	2	8	1892332	1892339	0 %	50 %	0 %	50 %	325293345
40853	NC_015183	GAT	2	6	1892349	1892354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293345
40854	NC_015183	GAT	2	6	1892364	1892369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293345
40855	NC_015183	GCC	2	6	1892403	1892408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293345
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40859	NC_015183	CAT	2	6	1892526	1892531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293345
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40861	NC_015183	TTG	2	6	1892578	1892583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293345
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40864	NC_015183	CTG	2	6	1892619	1892624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293345
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