MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015183	GCCT	2	8	48299	48306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_015183	AGG	2	6	48337	48342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015183	TGA	2	6	48380	48385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291501
1004	NC_015183	T	6	6	48398	48403	0 %	100 %	0 %	0 %	325291501
1005	NC_015183	CTT	2	6	48446	48451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291501
1006	NC_015183	CTG	2	6	48612	48617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291501
1007	NC_015183	CGC	2	6	48728	48733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291501
1008	NC_015183	CAT	2	6	49145	49150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291501
1009	NC_015183	GCG	2	6	49228	49233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291501
1010	NC_015183	GGT	2	6	49257	49262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291501
1011	NC_015183	TTA	2	6	49295	49300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291501
1012	NC_015183	TGG	2	6	49313	49318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291501
1013	NC_015183	CGT	2	6	49436	49441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291501
1014	NC_015183	ATGT	2	8	49509	49516	25 %	50 %	25 %	0 %	325291501
1015	NC_015183	GGA	2	6	49541	49546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291501
1016	NC_015183	CAT	2	6	49622	49627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291501
1017	NC_015183	CGC	2	6	49638	49643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291501
1018	NC_015183	CG	3	6	49671	49676	0 %	0 %	50 %	50 %	325291501
1019	NC_015183	GTC	2	6	49689	49694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291501
1020	NC_015183	TCA	2	6	49696	49701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291501
1021	NC_015183	CGA	2	6	49727	49732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291501
1022	NC_015183	GAT	2	6	49760	49765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291501
1023	NC_015183	GGC	2	6	49787	49792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291501
1024	NC_015183	CCTGA	2	10	49887	49896	20 %	20 %	20 %	40 %	325291501
1025	NC_015183	GCC	2	6	49899	49904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291501
1026	NC_015183	AGA	2	6	49915	49920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291501
1027	NC_015183	AGGC	2	8	49933	49940	25 %	0 %	50 %	25 %	325291501
1028	NC_015183	GAC	2	6	50025	50030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291501
1029	NC_015183	GCCGGG	2	12	50038	50049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291501
1030	NC_015183	ACA	2	6	50128	50133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291501
1031	NC_015183	GCT	2	6	50185	50190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291501
1032	NC_015183	CAA	2	6	50207	50212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291501
1033	NC_015183	GGA	2	6	50225	50230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291501
1034	NC_015183	GCA	2	6	50255	50260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291501
1035	NC_015183	GCC	2	6	50328	50333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291501
1036	NC_015183	GCC	2	6	50412	50417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291501
1037	NC_015183	AGC	2	6	50443	50448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291501
1038	NC_015183	CCG	2	6	50477	50482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291501
1039	NC_015183	GGC	2	6	50507	50512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291501
1040	NC_015183	A	6	6	50616	50621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015183	GCC	2	6	50622	50627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_015183	CGG	2	6	50638	50643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_015183	TGC	2	6	50692	50697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291502
1044	NC_015183	GACG	2	8	50704	50711	25 %	0 %	50 %	25 %	325291502
1045	NC_015183	GGC	2	6	50765	50770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291502
1046	NC_015183	CGAT	2	8	50776	50783	25 %	25 %	25 %	25 %	325291502
1047	NC_015183	GC	5	10	50850	50859	0 %	0 %	50 %	50 %	325291502
1048	NC_015183	TGCC	2	8	50887	50894	0 %	25 %	25 %	50 %	325291502
1049	NC_015183	CGG	2	6	50939	50944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291502
1050	NC_015183	ATA	2	6	51056	51061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325291502
1051	NC_015183	GAT	2	6	51086	51091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291502
1052	NC_015183	CGTT	2	8	51102	51109	0 %	50 %	25 %	25 %	325291502
1053	NC_015183	CGA	2	6	51121	51126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291502
1054	NC_015183	GAC	2	6	51130	51135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291502
1055	NC_015183	CGC	2	6	51269	51274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291502
1056	NC_015183	GAT	2	6	51285	51290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291502
1057	NC_015183	TGC	2	6	51326	51331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291502
1058	NC_015183	GCT	2	6	51468	51473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_015183	CAA	2	6	51519	51524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015183	CAA	2	6	51574	51579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291503
1061	NC_015183	GAC	2	6	51696	51701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291503
1062	NC_015183	TCA	2	6	51711	51716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291503
1063	NC_015183	AAATC	2	10	51750	51759	60 %	20 %	0 %	20 %	325291503
1064	NC_015183	TCGA	2	8	51761	51768	25 %	25 %	25 %	25 %	325291503
1065	NC_015183	GAA	2	6	51866	51871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291503
1066	NC_015183	CCGC	2	8	51938	51945	0 %	0 %	25 %	75 %	325291503
1067	NC_015183	GAC	2	6	52012	52017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291503
1068	NC_015183	TGTAA	2	10	52084	52093	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015183	GC	3	6	52107	52112	0 %	0 %	50 %	50 %	325291504
1070	NC_015183	CGG	2	6	52157	52162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291504
1071	NC_015183	CGG	2	6	52347	52352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291504
1072	NC_015183	CGG	2	6	52356	52361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291504
1073	NC_015183	GAC	2	6	52387	52392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291504
1074	NC_015183	GCG	2	6	52485	52490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291504
1075	NC_015183	CGG	2	6	52527	52532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291504
1076	NC_015183	CGA	2	6	52536	52541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291504
1077	NC_015183	CGT	2	6	52590	52595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291504
1078	NC_015183	CGA	2	6	52599	52604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291504
1079	NC_015183	CAG	2	6	52606	52611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291504
1080	NC_015183	GTC	3	9	52633	52641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291504
1081	NC_015183	TCT	2	6	52670	52675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291504
1082	NC_015183	GTC	2	6	52676	52681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291504
1083	NC_015183	T	6	6	52712	52717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015183	CTT	2	6	52718	52723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_015183	CGC	2	6	52726	52731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_015183	GAT	2	6	52790	52795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291505
1087	NC_015183	CCCG	2	8	52902	52909	0 %	0 %	25 %	75 %	325291505
1088	NC_015183	CAT	2	6	52981	52986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291505
1089	NC_015183	CACGGT	2	12	53024	53035	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1090	NC_015183	TCG	2	6	53121	53126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1091	NC_015183	GTT	2	6	53132	53137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291505
1092	NC_015183	CGA	2	6	53143	53148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1093	NC_015183	GCG	2	6	53176	53181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291505
1094	NC_015183	CCT	2	6	53188	53193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291505
1095	NC_015183	GAG	2	6	53202	53207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291505
1096	NC_015183	GGC	2	6	53215	53220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291505
1097	NC_015183	CTC	2	6	53228	53233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291505
1098	NC_015183	ATC	2	6	53234	53239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291505
1099	NC_015183	GGC	2	6	53257	53262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291505
1100	NC_015183	GCA	2	6	53296	53301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1101	NC_015183	TCA	2	6	53325	53330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291505
1102	NC_015183	CGA	2	6	53359	53364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1103	NC_015183	GCG	2	6	53380	53385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291505
1104	NC_015183	GCG	2	6	53406	53411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291505
1105	NC_015183	GA	3	6	53430	53435	50 %	0 %	50 %	0 %	325291505
1106	NC_015183	CAGC	2	8	53467	53474	25 %	0 %	25 %	50 %	325291505
1107	NC_015183	GCA	2	6	53569	53574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1108	NC_015183	GCA	2	6	53587	53592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1109	NC_015183	AGGCGA	2	12	53695	53706	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325291505
1110	NC_015183	TGA	2	6	53707	53712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291505
1111	NC_015183	ACC	2	6	53750	53755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291505
1112	NC_015183	GCA	2	6	53782	53787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1113	NC_015183	CAG	2	6	53798	53803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1114	NC_015183	CAA	2	6	53935	53940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291505
1115	NC_015183	TCG	2	6	53947	53952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291505
1116	NC_015183	GCCA	2	8	53970	53977	25 %	0 %	25 %	50 %	325291505
1117	NC_015183	TTG	2	6	54031	54036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291505
1118	NC_015183	GCCA	2	8	54050	54057	25 %	0 %	25 %	50 %	325291505
1119	NC_015183	TCA	2	6	54085	54090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291506
1120	NC_015183	CG	3	6	54096	54101	0 %	0 %	50 %	50 %	325291506
1121	NC_015183	ATGCCG	2	12	54123	54134	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1122	NC_015183	ATGG	2	8	54147	54154	25 %	25 %	50 %	0 %	325291506
1123	NC_015183	CCGC	2	8	54177	54184	0 %	0 %	25 %	75 %	325291506
1124	NC_015183	GTC	2	6	54227	54232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291506
1125	NC_015183	CAG	3	9	54265	54273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291506
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1249	NC_015183	GCT	2	6	61144	61149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1251	NC_015183	TGG	2	6	61321	61326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1252	NC_015183	GT	3	6	61341	61346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1257	NC_015183	ATG	2	6	61537	61542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1390	NC_015183	TCG	2	6	68439	68444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291511
1391	NC_015183	CAG	2	6	68472	68477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291511
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1499	NC_015183	A	6	6	73996	74001	100 %	0 %	0 %	0 %	325291516
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