MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015183	AGC	2	6	377858	377863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291822
8002	NC_015183	CGT	2	6	377973	377978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291822
8003	NC_015183	GAC	2	6	377992	377997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291822
8004	NC_015183	CGG	2	6	378066	378071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291822
8005	NC_015183	GGC	2	6	378118	378123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291822
8006	NC_015183	CGC	2	6	378186	378191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291822
8007	NC_015183	CGC	2	6	378201	378206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291822
8008	NC_015183	GAA	2	6	378231	378236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_015183	CGC	2	6	378250	378255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_015183	GTA	2	6	378311	378316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_015183	TGC	2	6	378338	378343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_015183	CGAAA	2	10	378360	378369	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8013	NC_015183	CGCCA	2	10	378405	378414	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8014	NC_015183	GCAC	2	8	378433	378440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8015	NC_015183	TCA	2	6	378661	378666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_015183	T	6	6	378707	378712	0 %	100 %	0 %	0 %	325291823
8017	NC_015183	CGG	2	6	378787	378792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291823
8018	NC_015183	GCG	3	9	378793	378801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291823
8019	NC_015183	CGC	2	6	378828	378833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291823
8020	NC_015183	CCGC	2	8	378874	378881	0 %	0 %	25 %	75 %	325291823
8021	NC_015183	GCG	2	6	378928	378933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291823
8022	NC_015183	TGC	2	6	379002	379007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291823
8023	NC_015183	T	6	6	379042	379047	0 %	100 %	0 %	0 %	325291823
8024	NC_015183	CGAAG	2	10	379071	379080	40 %	0 %	40 %	20 %	325291823
8025	NC_015183	CGG	2	6	379095	379100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291823
8026	NC_015183	ATT	2	6	379103	379108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291823
8027	NC_015183	GAG	2	6	379132	379137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291823
8028	NC_015183	ATC	2	6	379139	379144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291823
8029	NC_015183	CGA	2	6	379185	379190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291823
8030	NC_015183	CCG	2	6	379192	379197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291823
8031	NC_015183	GTG	2	6	379247	379252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291823
8032	NC_015183	TC	3	6	379271	379276	0 %	50 %	0 %	50 %	325291823
8033	NC_015183	GTG	2	6	379279	379284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291823
8034	NC_015183	GCG	2	6	379297	379302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291823
8035	NC_015183	GC	3	6	379435	379440	0 %	0 %	50 %	50 %	325291823
8036	NC_015183	CGA	2	6	379449	379454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291823
8037	NC_015183	GTC	2	6	379456	379461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291823
8038	NC_015183	T	6	6	379580	379585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_015183	GATC	2	8	379786	379793	25 %	25 %	25 %	25 %	325291824
8040	NC_015183	TCG	2	6	379824	379829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291824
8041	NC_015183	GCT	2	6	379855	379860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291824
8042	NC_015183	CAT	2	6	379864	379869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291824
8043	NC_015183	CGG	2	6	379909	379914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291824
8044	NC_015183	GATC	2	8	379930	379937	25 %	25 %	25 %	25 %	325291824
8045	NC_015183	CGC	2	6	380016	380021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291824
8046	NC_015183	TGC	2	6	380044	380049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291824
8047	NC_015183	GCG	2	6	380075	380080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291824
8048	NC_015183	TGC	2	6	380107	380112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291824
8049	NC_015183	GGC	2	6	380122	380127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291824
8050	NC_015183	GGC	2	6	380180	380185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291824
8051	NC_015183	CAGCGC	2	12	380186	380197	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325291824
8052	NC_015183	GAG	2	6	380294	380299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291824
8053	NC_015183	CGG	2	6	380315	380320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291824
8054	NC_015183	GC	3	6	380465	380470	0 %	0 %	50 %	50 %	325291824
8055	NC_015183	CTG	2	6	380495	380500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291824
8056	NC_015183	CCGGC	2	10	380577	380586	0 %	0 %	40 %	60 %	325291824
8057	NC_015183	TCT	2	6	380692	380697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291824
8058	NC_015183	TGA	2	6	380769	380774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291824
8059	NC_015183	GAC	2	6	380833	380838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291824
8060	NC_015183	CGG	2	6	380864	380869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291825
8061	NC_015183	CGG	2	6	380926	380931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291825
8062	NC_015183	CTG	2	6	380971	380976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291825
8063	NC_015183	GC	4	8	381111	381118	0 %	0 %	50 %	50 %	325291825
8064	NC_015183	TCG	2	6	381260	381265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291825
8065	NC_015183	CTG	2	6	381289	381294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291825
8066	NC_015183	GCG	2	6	381319	381324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291825
8067	NC_015183	CCA	2	6	381383	381388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291825
8068	NC_015183	CGA	3	9	381548	381556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291825
8069	NC_015183	GTG	2	6	381562	381567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291825
8070	NC_015183	CAC	2	6	381570	381575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291825
8071	NC_015183	CGCTG	2	10	381699	381708	0 %	20 %	40 %	40 %	325291825
8072	NC_015183	GAT	2	6	381863	381868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291826
8073	NC_015183	TCG	2	6	382024	382029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291826
8074	NC_015183	GCT	3	9	382094	382102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291826
8075	NC_015183	TCA	2	6	382108	382113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291826
8076	NC_015183	TCG	2	6	382159	382164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291826
8077	NC_015183	CTG	2	6	382182	382187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291826
8078	NC_015183	GAT	3	9	382202	382210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291826
8079	NC_015183	TTC	2	6	382215	382220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291826
8080	NC_015183	CTGT	2	8	382221	382228	0 %	50 %	25 %	25 %	325291826
8081	NC_015183	ATC	2	6	382278	382283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291826
8082	NC_015183	ATGG	2	8	382296	382303	25 %	25 %	50 %	0 %	325291826
8083	NC_015183	TTG	2	6	382322	382327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291826
8084	NC_015183	TGC	2	6	382336	382341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291826
8085	NC_015183	TCGC	2	8	382356	382363	0 %	25 %	25 %	50 %	325291826
8086	NC_015183	TCT	2	6	382375	382380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291826
8087	NC_015183	TCG	2	6	382384	382389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291826
8088	NC_015183	GAT	2	6	382415	382420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291826
8089	NC_015183	CGC	3	9	382447	382455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291826
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8091	NC_015183	GGCG	2	8	382511	382518	0 %	0 %	75 %	25 %	325291826
8092	NC_015183	GTGCT	2	10	382542	382551	0 %	40 %	40 %	20 %	325291826
8093	NC_015183	TCC	2	6	382552	382557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291826
8094	NC_015183	CGG	2	6	382563	382568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291826
8095	NC_015183	CGT	2	6	382608	382613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_015183	CTC	3	9	382619	382627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8097	NC_015183	GAA	3	9	382808	382816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291827
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8100	NC_015183	ATC	2	6	383112	383117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291827
8101	NC_015183	GGC	2	6	383148	383153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291827
8102	NC_015183	CGA	2	6	383170	383175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291827
8103	NC_015183	AAG	2	6	383202	383207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291827
8104	NC_015183	TGGC	2	8	383255	383262	0 %	25 %	50 %	25 %	325291827
8105	NC_015183	GGC	2	6	383301	383306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291827
8106	NC_015183	AAGACC	2	12	383322	383333	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	325291827
8107	NC_015183	CAG	2	6	383433	383438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291827
8108	NC_015183	TGGT	2	8	383503	383510	0 %	50 %	50 %	0 %	325291827
8109	NC_015183	ACA	2	6	383548	383553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291827
8110	NC_015183	GCG	2	6	383563	383568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291827
8111	NC_015183	CGG	2	6	383576	383581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291827
8112	NC_015183	TGC	2	6	383624	383629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291827
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8114	NC_015183	GGT	2	6	383817	383822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291827
8115	NC_015183	TCCG	2	8	383826	383833	0 %	25 %	25 %	50 %	325291827
8116	NC_015183	ATC	2	6	383856	383861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291827
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8118	NC_015183	CTG	2	6	383931	383936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291827
8119	NC_015183	ATC	2	6	384015	384020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291828
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8121	NC_015183	GC	3	6	384089	384094	0 %	0 %	50 %	50 %	325291828
8122	NC_015183	TGA	2	6	384142	384147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291828
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8244	NC_015183	GAG	2	6	390281	390286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291832
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8349	NC_015183	CAGG	2	8	394845	394852	25 %	0 %	50 %	25 %	325291837
8350	NC_015183	CCTTG	2	10	394872	394881	0 %	40 %	20 %	40 %	325291837
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8352	NC_015183	ATC	2	6	394963	394968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8355	NC_015183	TGAGC	2	10	395301	395310	20 %	20 %	40 %	20 %	325291838
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8357	NC_015183	GGC	2	6	395416	395421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291838
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8363	NC_015183	GC	3	6	395745	395750	0 %	0 %	50 %	50 %	325291838
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8487	NC_015183	GCG	2	6	401921	401926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291842
8488	NC_015183	AGC	2	6	401929	401934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291842
8489	NC_015183	GTC	2	6	402104	402109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291842
8490	NC_015183	GGC	2	6	402306	402311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291842
8491	NC_015183	GACCA	2	10	402327	402336	40 %	0 %	20 %	40 %	325291842
8492	NC_015183	GGC	2	6	402435	402440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291842
8493	NC_015183	GCC	4	12	402558	402569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291842
8494	NC_015183	TCG	2	6	402580	402585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291842
8495	NC_015183	CCT	2	6	402611	402616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291842
8496	NC_015183	TCG	2	6	402712	402717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291842
8497	NC_015183	GCG	2	6	402758	402763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291842
8498	NC_015183	TGC	2	6	402893	402898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8499	NC_015183	TA	3	6	402908	402913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8500	NC_015183	GCC	2	6	402974	402979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291843

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