MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58502	NC_015183	ACCA	2	8	2716456	2716463	50 %	0 %	0 %	50 %	325294108
58503	NC_015183	GAA	2	6	2716486	2716491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294108
58504	NC_015183	AGC	2	6	2716498	2716503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294108
58505	NC_015183	TCG	2	6	2716533	2716538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294108
58506	NC_015183	GAA	2	6	2716561	2716566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294108
58507	NC_015183	AGC	3	9	2716589	2716597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294108
58508	NC_015183	GCG	2	6	2716632	2716637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294108
58509	NC_015183	GCG	2	6	2716671	2716676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294108
58510	NC_015183	CGA	2	6	2716693	2716698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294108
58511	NC_015183	CG	3	6	2716710	2716715	0 %	0 %	50 %	50 %	325294108
58512	NC_015183	GCA	2	6	2716832	2716837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294108
58513	NC_015183	GGGC	2	8	2716856	2716863	0 %	0 %	75 %	25 %	325294108
58514	NC_015183	GC	4	8	2716907	2716914	0 %	0 %	50 %	50 %	325294108
58515	NC_015183	CGG	2	6	2716935	2716940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294108
58516	NC_015183	GCC	2	6	2716990	2716995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294108
58517	NC_015183	ATCC	2	8	2717001	2717008	25 %	25 %	0 %	50 %	325294108
58518	NC_015183	GCA	2	6	2717048	2717053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294108
58519	NC_015183	GAT	2	6	2717056	2717061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294108
58520	NC_015183	TCC	2	6	2717078	2717083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58521	NC_015183	A	6	6	2717113	2717118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58522	NC_015183	CAT	2	6	2717119	2717124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58523	NC_015183	TTGA	2	8	2717179	2717186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58524	NC_015183	T	6	6	2717195	2717200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58525	NC_015183	GAA	2	6	2717321	2717326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294109
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58552	NC_015183	CGC	2	6	2718747	2718752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58553	NC_015183	AGG	2	6	2718777	2718782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58554	NC_015183	A	6	6	2718800	2718805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58555	NC_015183	TCAG	2	8	2718852	2718859	25 %	25 %	25 %	25 %	325294110
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58570	NC_015183	AT	4	8	2719756	2719763	50 %	50 %	0 %	0 %	325294111
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58593	NC_015183	CTG	2	6	2721090	2721095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294112
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58615	NC_015183	CAT	3	9	2721876	2721884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294113
58616	NC_015183	GAT	2	6	2721945	2721950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294113
58617	NC_015183	ACA	2	6	2721965	2721970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294113
58618	NC_015183	CGG	2	6	2721981	2721986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294113
58619	NC_015183	GGC	2	6	2722000	2722005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294113
58620	NC_015183	CGC	2	6	2722056	2722061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294113
58621	NC_015183	ATC	2	6	2722129	2722134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294113
58622	NC_015183	TCA	2	6	2722244	2722249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294113
58623	NC_015183	GGC	2	6	2722255	2722260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294113
58624	NC_015183	AGGC	2	8	2722265	2722272	25 %	0 %	50 %	25 %	325294113
58625	NC_015183	GCC	2	6	2722291	2722296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294113
58626	NC_015183	TCG	2	6	2722322	2722327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294113
58627	NC_015183	CGG	2	6	2722355	2722360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294113
58628	NC_015183	TTC	2	6	2722373	2722378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294113
58629	NC_015183	GC	3	6	2722380	2722385	0 %	0 %	50 %	50 %	325294113
58630	NC_015183	ATC	2	6	2722402	2722407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294113
58631	NC_015183	TCA	2	6	2722445	2722450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294113
58632	NC_015183	GATC	2	8	2722497	2722504	25 %	25 %	25 %	25 %	325294113
58633	NC_015183	ATG	2	6	2722528	2722533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294113
58634	NC_015183	ATCCTG	2	12	2722579	2722590	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325294113
58635	NC_015183	GCAG	2	8	2722617	2722624	25 %	0 %	50 %	25 %	325294113
58636	NC_015183	TCA	3	9	2722655	2722663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294113
58637	NC_015183	CCG	2	6	2722687	2722692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294113
58638	NC_015183	CGT	2	6	2722698	2722703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294113
58639	NC_015183	CGT	2	6	2722710	2722715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294113
58640	NC_015183	GGA	2	6	2722878	2722883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58641	NC_015183	TAT	2	6	2722884	2722889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325294114
58642	NC_015183	CTT	2	6	2722897	2722902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294114
58643	NC_015183	ACC	2	6	2722906	2722911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294114
58644	NC_015183	ACC	2	6	2723003	2723008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294114
58645	NC_015183	GCCT	2	8	2723038	2723045	0 %	25 %	25 %	50 %	325294114
58646	NC_015183	CGA	2	6	2723046	2723051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294114
58647	NC_015183	AAGCTG	2	12	2723065	2723076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325294114
58648	NC_015183	GCG	2	6	2723090	2723095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294114
58649	NC_015183	CGG	2	6	2723100	2723105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294114
58650	NC_015183	GTT	2	6	2723152	2723157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325294114
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58652	NC_015183	ATG	2	6	2723272	2723277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294114
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58657	NC_015183	GAA	2	6	2723644	2723649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294114
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58659	NC_015183	CGT	2	6	2723847	2723852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294114
58660	NC_015183	GAA	2	6	2723874	2723879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294114
58661	NC_015183	T	6	6	2723942	2723947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58662	NC_015183	AGAAA	2	10	2723962	2723971	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58663	NC_015183	AGC	2	6	2723983	2723988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58664	NC_015183	ACC	2	6	2724045	2724050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294115
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58666	NC_015183	ATC	2	6	2724092	2724097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294115
58667	NC_015183	CGC	2	6	2724120	2724125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294115
58668	NC_015183	CTC	2	6	2724224	2724229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325294115
58669	NC_015183	CGC	2	6	2724244	2724249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294115
58670	NC_015183	TGCCC	2	10	2724283	2724292	0 %	20 %	20 %	60 %	325294115
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58673	NC_015183	CGACT	2	10	2724356	2724365	20 %	20 %	20 %	40 %	325294115
58674	NC_015183	CGG	2	6	2724367	2724372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294115
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58678	NC_015183	CGGC	2	8	2724577	2724584	0 %	0 %	50 %	50 %	325294115
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58683	NC_015183	CGA	2	6	2724727	2724732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294115
58684	NC_015183	CG	3	6	2724826	2724831	0 %	0 %	50 %	50 %	325294115
58685	NC_015183	CGCC	2	8	2724853	2724860	0 %	0 %	25 %	75 %	325294115
58686	NC_015183	CGGTG	2	10	2724884	2724893	0 %	20 %	60 %	20 %	325294115
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58693	NC_015183	GCA	2	6	2725132	2725137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294115
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58700	NC_015183	GCC	2	6	2725385	2725390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294115
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58702	NC_015183	TGA	2	6	2725411	2725416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294115
58703	NC_015183	CGA	2	6	2725435	2725440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294115
58704	NC_015183	CGGC	2	8	2725443	2725450	0 %	0 %	50 %	50 %	325294115
58705	NC_015183	GCC	2	6	2725469	2725474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294115
58706	NC_015183	GAAT	2	8	2725485	2725492	50 %	25 %	25 %	0 %	325294115
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58711	NC_015183	GGC	2	6	2725606	2725611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294115
58712	NC_015183	GAT	2	6	2725676	2725681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294115
58713	NC_015183	CCG	2	6	2725826	2725831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294115
58714	NC_015183	CTC	2	6	2725961	2725966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58715	NC_015183	ATG	2	6	2726094	2726099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58716	NC_015183	CGGA	2	8	2726166	2726173	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58717	NC_015183	CAA	2	6	2726196	2726201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294116
58718	NC_015183	ACA	2	6	2726239	2726244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294116
58719	NC_015183	GCG	2	6	2726322	2726327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294116
58720	NC_015183	CGA	2	6	2726375	2726380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294116
58721	NC_015183	CAAGCT	2	12	2726411	2726422	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325294116
58722	NC_015183	CTGG	2	8	2726516	2726523	0 %	25 %	50 %	25 %	325294116
58723	NC_015183	ATC	2	6	2726530	2726535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294116
58724	NC_015183	TTG	2	6	2726566	2726571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325294116
58725	NC_015183	CAC	2	6	2726573	2726578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294116
58726	NC_015183	CCA	2	6	2726584	2726589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294116
58727	NC_015183	GATC	2	8	2726672	2726679	25 %	25 %	25 %	25 %	325294116
58728	NC_015183	CG	3	6	2726704	2726709	0 %	0 %	50 %	50 %	325294116
58729	NC_015183	GCC	2	6	2726710	2726715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294116
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58848	NC_015183	GCC	2	6	2731990	2731995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294120
58849	NC_015183	CGG	2	6	2732063	2732068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294120
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58954	NC_015183	GGCGC	2	10	2736647	2736656	0 %	0 %	60 %	40 %	325294124
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58962	NC_015183	TCG	2	6	2737120	2737125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294124
58963	NC_015183	GCA	2	6	2737126	2737131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294124
58964	NC_015183	GAG	2	6	2737174	2737179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325294124
58965	NC_015183	TCC	2	6	2737231	2737236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325294124
58966	NC_015183	GGT	2	6	2737269	2737274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325294124
58967	NC_015183	CGA	2	6	2737380	2737385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294124
58968	NC_015183	CGG	2	6	2737421	2737426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294124
58969	NC_015183	CA	3	6	2737475	2737480	50 %	0 %	0 %	50 %	325294124
58970	NC_015183	CACC	2	8	2737493	2737500	25 %	0 %	0 %	75 %	325294124
58971	NC_015183	CTC	2	6	2737539	2737544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325294124
58972	NC_015183	CGG	2	6	2737586	2737591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294124
58973	NC_015183	ATC	2	6	2737609	2737614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294124
58974	NC_015183	GCC	2	6	2737681	2737686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294124
58975	NC_015183	CTT	2	6	2737713	2737718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294124
58976	NC_015183	ACC	2	6	2737744	2737749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294124
58977	NC_015183	CTGC	2	8	2737769	2737776	0 %	25 %	25 %	50 %	325294124
58978	NC_015183	CCG	2	6	2737810	2737815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294124
58979	NC_015183	CCA	3	9	2737820	2737828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294124
58980	NC_015183	CAT	2	6	2737866	2737871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58981	NC_015183	A	6	6	2737920	2737925	100 %	0 %	0 %	0 %	325294125
58982	NC_015183	GAA	2	6	2737994	2737999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294125
58983	NC_015183	CGG	2	6	2738047	2738052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294125
58984	NC_015183	ATTG	2	8	2738071	2738078	25 %	50 %	25 %	0 %	325294125
58985	NC_015183	GAT	3	9	2738096	2738104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294125
58986	NC_015183	TTCA	2	8	2738112	2738119	25 %	50 %	0 %	25 %	325294125
58987	NC_015183	TCT	2	6	2738244	2738249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294125
58988	NC_015183	CGT	2	6	2738259	2738264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294125
58989	NC_015183	TCG	2	6	2738271	2738276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294125
58990	NC_015183	ATC	2	6	2738289	2738294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294125
58991	NC_015183	CGC	2	6	2738316	2738321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294125
58992	NC_015183	TGA	2	6	2738331	2738336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294125
58993	NC_015183	AGATG	2	10	2738341	2738350	40 %	20 %	40 %	0 %	325294125
58994	NC_015183	GGC	2	6	2738353	2738358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294125
58995	NC_015183	CAA	2	6	2738401	2738406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294125
58996	NC_015183	CCGG	2	8	2738422	2738429	0 %	0 %	50 %	50 %	325294125
58997	NC_015183	GCA	2	6	2738470	2738475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294125
58998	NC_015183	TC	3	6	2738545	2738550	0 %	50 %	0 %	50 %	325294125
58999	NC_015183	GAC	2	6	2738590	2738595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294125
59000	NC_015183	GAC	2	6	2738666	2738671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294125

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