MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_015183	GCC	2	6	2645613	2645618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294051
57002	NC_015183	ATG	2	6	2645638	2645643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294051
57003	NC_015183	CTG	2	6	2645679	2645684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294051
57004	NC_015183	AT	3	6	2645705	2645710	50 %	50 %	0 %	0 %	325294051
57005	NC_015183	CCG	2	6	2645728	2645733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294051
57006	NC_015183	CGG	2	6	2645750	2645755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294051
57007	NC_015183	CAT	2	6	2645783	2645788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294051
57008	NC_015183	GTC	3	9	2645832	2645840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294051
57009	NC_015183	AAT	2	6	2645929	2645934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325294051
57010	NC_015183	GCT	2	6	2645947	2645952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57011	NC_015183	CAT	2	6	2646058	2646063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57012	NC_015183	GCG	2	6	2646094	2646099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57013	NC_015183	GAT	2	6	2646211	2646216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294052
57014	NC_015183	TCA	2	6	2646276	2646281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294052
57015	NC_015183	GCG	2	6	2646290	2646295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294052
57016	NC_015183	ACC	2	6	2646317	2646322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294052
57017	NC_015183	TTCT	2	8	2646398	2646405	0 %	75 %	0 %	25 %	325294052
57018	NC_015183	GCC	2	6	2646437	2646442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294052
57019	NC_015183	GCG	2	6	2646464	2646469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294052
57020	NC_015183	CGT	2	6	2646520	2646525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294052
57021	NC_015183	TTC	2	6	2646533	2646538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294052
57022	NC_015183	GC	3	6	2646558	2646563	0 %	0 %	50 %	50 %	325294052
57023	NC_015183	GAA	2	6	2646586	2646591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294052
57024	NC_015183	GTTC	2	8	2646609	2646616	0 %	50 %	25 %	25 %	325294052
57025	NC_015183	ATC	2	6	2646641	2646646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294052
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57027	NC_015183	CGA	2	6	2646775	2646780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294052
57028	NC_015183	TGGC	2	8	2646789	2646796	0 %	25 %	50 %	25 %	325294052
57029	NC_015183	TCA	2	6	2646837	2646842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294052
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57031	NC_015183	GGC	2	6	2646921	2646926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57032	NC_015183	GCC	2	6	2646933	2646938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57033	NC_015183	TCTCA	2	10	2647018	2647027	20 %	40 %	0 %	40 %	325294053
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57035	NC_015183	TTC	2	6	2647152	2647157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294053
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57041	NC_015183	GGA	2	6	2647517	2647522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57042	NC_015183	A	6	6	2647610	2647615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57043	NC_015183	A	6	6	2647624	2647629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57044	NC_015183	CGGAT	2	10	2647784	2647793	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57045	NC_015183	CGA	2	6	2647850	2647855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294054
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57049	NC_015183	CCA	2	6	2647925	2647930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294054
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57051	NC_015183	CG	3	6	2648060	2648065	0 %	0 %	50 %	50 %	325294054
57052	NC_015183	TCA	2	6	2648125	2648130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294054
57053	NC_015183	GCG	2	6	2648255	2648260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294054
57054	NC_015183	GC	3	6	2648284	2648289	0 %	0 %	50 %	50 %	325294054
57055	NC_015183	AGT	2	6	2648357	2648362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294054
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57058	NC_015183	AAC	2	6	2648458	2648463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294054
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57060	NC_015183	CAACC	2	10	2648603	2648612	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
57061	NC_015183	A	7	7	2648682	2648688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57062	NC_015183	GAT	2	6	2648691	2648696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57063	NC_015183	TTG	2	6	2648733	2648738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57064	NC_015183	GAA	2	6	2648768	2648773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294055
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57068	NC_015183	CGA	2	6	2648930	2648935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294055
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57076	NC_015183	CCTT	2	8	2649223	2649230	0 %	50 %	0 %	50 %	325294055
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57083	NC_015183	GTC	2	6	2649531	2649536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294055
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57105	NC_015183	CCTT	2	8	2650654	2650661	0 %	50 %	0 %	50 %	325294055
57106	NC_015183	CAGG	2	8	2650694	2650701	25 %	0 %	50 %	25 %	325294055
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57114	NC_015183	CTC	2	6	2651556	2651561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57115	NC_015183	GAT	2	6	2651584	2651589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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57117	NC_015183	AAATC	2	10	2651661	2651670	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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57119	NC_015183	GCA	2	6	2651711	2651716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294056
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57226	NC_015183	GCG	2	6	2656429	2656434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294062
57227	NC_015183	AAAG	2	8	2656476	2656483	75 %	0 %	25 %	0 %	325294062
57228	NC_015183	CAG	2	6	2656511	2656516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294062
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57230	NC_015183	GAA	2	6	2656687	2656692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294062
57231	NC_015183	CGG	2	6	2656696	2656701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294062
57232	NC_015183	GAT	2	6	2656825	2656830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294063
57233	NC_015183	ACC	2	6	2656895	2656900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294063
57234	NC_015183	GAA	2	6	2656924	2656929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294063
57235	NC_015183	CAGCG	2	10	2656937	2656946	20 %	0 %	40 %	40 %	325294063
57236	NC_015183	AGC	2	6	2657003	2657008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294063
57237	NC_015183	CAG	2	6	2657032	2657037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294063
57238	NC_015183	TGA	2	6	2657079	2657084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294063
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57252	NC_015183	CGA	3	9	2657999	2658007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294064
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57285	NC_015183	CCA	2	6	2659628	2659633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294065
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57338	NC_015183	AAG	2	6	2662216	2662221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294067
57339	NC_015183	AAG	2	6	2662247	2662252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294067
57340	NC_015183	GCC	2	6	2662409	2662414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57341	NC_015183	GAA	2	6	2662547	2662552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57342	NC_015183	GAA	2	6	2662554	2662559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57343	NC_015183	GC	3	6	2662621	2662626	0 %	0 %	50 %	50 %	325294068
57344	NC_015183	GCC	3	9	2662644	2662652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294068
57345	NC_015183	GTC	2	6	2662782	2662787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294068
57346	NC_015183	TCGA	2	8	2662836	2662843	25 %	25 %	25 %	25 %	325294068
57347	NC_015183	GCC	2	6	2662854	2662859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294068
57348	NC_015183	CGT	2	6	2662862	2662867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294068
57349	NC_015183	ATG	2	6	2662872	2662877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294068
57350	NC_015183	GACCAC	2	12	2662901	2662912	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325294068
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57352	NC_015183	AAG	3	9	2662947	2662955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294068
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57357	NC_015183	CGT	2	6	2663117	2663122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294068
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57467	NC_015183	GCAA	2	8	2667239	2667246	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57468	NC_015183	AGA	2	6	2667330	2667335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57469	NC_015183	CAG	2	6	2667365	2667370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294074
57470	NC_015183	CCTG	2	8	2667412	2667419	0 %	25 %	25 %	50 %	325294074
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57472	NC_015183	CGC	2	6	2667626	2667631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294074
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57482	NC_015183	GCA	2	6	2667857	2667862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294074
57483	NC_015183	T	6	6	2667937	2667942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57484	NC_015183	TGG	2	6	2667968	2667973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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57487	NC_015183	T	9	9	2668142	2668150	0 %	100 %	0 %	0 %	325294075
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57499	NC_015183	CCGGG	2	10	2668509	2668518	0 %	0 %	60 %	40 %	325294075
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