MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV6

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015181	AAC	2	6	42	47	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168263
2	NC_015181	GCG	2	6	64	69	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168263
3	NC_015181	GTT	2	6	96	101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168263
4	NC_015181	AGG	2	6	152	157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168263
5	NC_015181	CGA	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168263
6	NC_015181	GCC	2	6	252	257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168263
7	NC_015181	ACG	2	6	332	337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168263
8	NC_015181	GCT	2	6	343	348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168263
9	NC_015181	GAG	2	6	349	354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168263
10	NC_015181	GAA	2	6	370	375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168263
11	NC_015181	GTG	2	6	514	519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168263
12	NC_015181	CGC	2	6	888	893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015181	GTG	2	6	945	950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015181	GCC	2	6	1030	1035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168265
15	NC_015181	AGA	2	6	1071	1076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168265
16	NC_015181	ACA	2	6	1204	1209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168265
17	NC_015181	CCT	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168265
18	NC_015181	AAT	2	6	1598	1603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168266
19	NC_015181	GCG	2	6	1620	1625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168266
20	NC_015181	TGT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168266
21	NC_015181	GAA	2	6	1764	1769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168266
22	NC_015181	CCG	2	6	1925	1930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168266
23	NC_015181	GCG	2	6	2038	2043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168266
24	NC_015181	CCA	2	6	2179	2184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015181	TCA	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015181	AAC	2	6	2298	2303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168267
27	NC_015181	TGC	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
28	NC_015181	TTG	2	6	2502	2507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168267
29	NC_015181	TGT	2	6	2532	2537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168267
30	NC_015181	CAT	2	6	2689	2694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168267
31	NC_015181	GCC	2	6	2771	2776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
32	NC_015181	GCT	2	6	2854	2859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
33	NC_015181	ATT	2	6	2907	2912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325168267
34	NC_015181	TGC	2	6	3010	3015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
35	NC_015181	CGA	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168267
36	NC_015181	GCA	2	6	3058	3063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168267
37	NC_015181	CTG	2	6	3251	3256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
38	NC_015181	CCG	2	6	3259	3264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
39	NC_015181	CGC	2	6	3271	3276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
40	NC_015181	AGG	2	6	3291	3296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168267
41	NC_015181	TGC	2	6	3357	3362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
42	NC_015181	ATC	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168267
43	NC_015181	CGG	2	6	3411	3416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168267
44	NC_015181	CCG	2	6	3436	3441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
45	NC_015181	GCC	2	6	3461	3466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
46	NC_015181	GCC	2	6	3565	3570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
47	NC_015181	GCC	2	6	3583	3588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
48	NC_015181	CGG	2	6	3613	3618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168267
49	NC_015181	CGG	2	6	3629	3634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168267
50	NC_015181	TGC	2	6	3660	3665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
51	NC_015181	TGC	2	6	3816	3821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
52	NC_015181	GCC	2	6	3842	3847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
53	NC_015181	CGC	2	6	3912	3917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
54	NC_015181	TGC	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
55	NC_015181	CTG	2	6	4079	4084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
56	NC_015181	CAC	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168267
57	NC_015181	CGC	2	6	4207	4212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
58	NC_015181	CGC	2	6	4216	4221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
59	NC_015181	CAT	2	6	4222	4227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168267
60	NC_015181	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168267
61	NC_015181	GAT	2	6	4265	4270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168267
62	NC_015181	CGG	2	6	4327	4332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168267
63	NC_015181	CGA	2	6	4428	4433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168267
64	NC_015181	GCT	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
65	NC_015181	CAT	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168267
66	NC_015181	CCA	2	6	4477	4482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168267
67	NC_015181	CCG	2	6	4518	4523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
68	NC_015181	CTG	2	6	4556	4561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
69	NC_015181	GCT	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
70	NC_015181	ACC	2	6	4673	4678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168267
71	NC_015181	GCC	3	9	4769	4777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
72	NC_015181	GGA	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168267
73	NC_015181	TTC	2	6	4934	4939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168267
74	NC_015181	TCA	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168267
75	NC_015181	CCG	2	6	5013	5018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
76	NC_015181	GAT	2	6	5093	5098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168267
77	NC_015181	CGC	2	6	5115	5120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
78	NC_015181	CGC	2	6	5227	5232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
79	NC_015181	GTT	2	6	5307	5312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168268
80	NC_015181	AGC	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168268
81	NC_015181	TTC	2	6	5557	5562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168268
82	NC_015181	CGC	2	6	5577	5582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168268
83	NC_015181	TGG	2	6	5597	5602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168268
84	NC_015181	GTC	2	6	5641	5646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168268
85	NC_015181	CGA	2	6	5682	5687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168268
86	NC_015181	ACA	2	6	5720	5725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168268
87	NC_015181	CGA	2	6	5814	5819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168268
88	NC_015181	TCC	2	6	5860	5865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168268
89	NC_015181	GCG	2	6	5898	5903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168268
90	NC_015181	GCC	2	6	6050	6055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168268
91	NC_015181	GCG	2	6	6072	6077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168268
92	NC_015181	ACG	2	6	6182	6187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168268
93	NC_015181	GGC	2	6	6238	6243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168268
94	NC_015181	CGT	2	6	6252	6257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168268
95	NC_015181	TAG	2	6	6343	6348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015181	GAC	2	6	6452	6457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015181	GCT	2	6	6544	6549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015181	ACT	2	6	6674	6679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015181	ATT	2	6	6815	6820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015181	GCC	2	6	6865	6870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168269
101	NC_015181	TCG	2	6	6949	6954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168269
102	NC_015181	GCC	2	6	7148	7153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168269
103	NC_015181	CAG	2	6	7157	7162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168269
104	NC_015181	GAC	2	6	7379	7384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168269
105	NC_015181	TAA	2	6	7539	7544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015181	GCA	2	6	7690	7695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015181	GTC	2	6	7768	7773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015181	CGC	2	6	7781	7786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015181	CGC	2	6	7861	7866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015181	CAG	2	6	8008	8013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168270
111	NC_015181	GCT	2	6	8048	8053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168270
112	NC_015181	GGA	2	6	8170	8175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168271
113	NC_015181	CGA	2	6	8302	8307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168271
114	NC_015181	CGG	2	6	8579	8584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168273
115	NC_015181	GAC	2	6	8601	8606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168273
116	NC_015181	TGA	2	6	8681	8686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168273
117	NC_015181	TCT	2	6	8801	8806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168273
118	NC_015181	CAA	2	6	8847	8852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168273
119	NC_015181	GCC	2	6	8949	8954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168273
120	NC_015181	GAA	2	6	8958	8963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168273
121	NC_015181	GGC	2	6	9030	9035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168273
122	NC_015181	GCC	2	6	9082	9087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168273
123	NC_015181	TCC	2	6	9253	9258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168273
124	NC_015181	CGC	2	6	9271	9276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168273
125	NC_015181	CGT	2	6	9604	9609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015181	GAA	2	6	9734	9739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015181	GTC	2	6	9749	9754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015181	GGC	2	6	9791	9796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168274
129	NC_015181	GCG	2	6	9919	9924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168274
130	NC_015181	AGC	2	6	10106	10111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168275
131	NC_015181	GAT	2	6	10124	10129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168275
132	NC_015181	GAC	2	6	10272	10277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015181	GCC	2	6	10458	10463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168276
134	NC_015181	GTC	2	6	10538	10543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168276
135	NC_015181	TCG	2	6	10549	10554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168276
136	NC_015181	CGG	2	6	10669	10674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168276
137	NC_015181	GTG	2	6	10725	10730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168276
138	NC_015181	GTG	2	6	10743	10748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168276
139	NC_015181	GCG	2	6	10827	10832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168276
140	NC_015181	GCC	2	6	10935	10940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168276
141	NC_015181	GCG	2	6	11048	11053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168276
142	NC_015181	GAG	2	6	11103	11108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168276
143	NC_015181	CGG	2	6	11169	11174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168276
144	NC_015181	CAG	2	6	11187	11192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168276
145	NC_015181	GGC	2	6	11261	11266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168276
146	NC_015181	GGC	2	6	11663	11668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168276
147	NC_015181	CCG	2	6	11702	11707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168276
148	NC_015181	GCC	2	6	11712	11717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168276
149	NC_015181	GCG	2	6	11927	11932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168276
150	NC_015181	AGG	2	6	11980	11985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168276
151	NC_015181	ACA	2	6	12102	12107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015181	ATC	2	6	12109	12114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.