MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 150496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015138	GC	3	6	127314	127319	0 %	0 %	50 %	50 %	326314937
3502	NC_015138	GAC	2	6	127396	127401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314937
3503	NC_015138	TGA	2	6	127513	127518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314937
3504	NC_015138	TCG	2	6	127530	127535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314937
3505	NC_015138	GCA	3	9	127540	127548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314937
3506	NC_015138	GTG	2	6	127553	127558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_015138	CGGT	2	8	127561	127568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3508	NC_015138	GGCT	2	8	127606	127613	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_015138	TCT	2	6	127644	127649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_015138	AG	3	6	127652	127657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_015138	CAA	2	6	127666	127671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_015138	GTG	2	6	127693	127698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_015138	AGC	2	6	127764	127769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_015138	GCG	2	6	127821	127826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_015138	CCG	2	6	127866	127871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_015138	GCG	3	9	127872	127880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_015138	T	6	6	127904	127909	0 %	100 %	0 %	0 %	326314938
3518	NC_015138	GAT	2	6	127923	127928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314938
3519	NC_015138	TAT	2	6	127941	127946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326314938
3520	NC_015138	TA	3	6	127948	127953	50 %	50 %	0 %	0 %	326314938
3521	NC_015138	ATAA	2	8	127966	127973	75 %	25 %	0 %	0 %	326314938
3522	NC_015138	C	6	6	128021	128026	0 %	0 %	0 %	100 %	326314938
3523	NC_015138	CTGC	2	8	128055	128062	0 %	25 %	25 %	50 %	326314938
3524	NC_015138	AGC	2	6	128086	128091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314938
3525	NC_015138	AGT	2	6	128099	128104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314938
3526	NC_015138	GCG	2	6	128145	128150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314938
3527	NC_015138	T	6	6	128171	128176	0 %	100 %	0 %	0 %	326314938
3528	NC_015138	T	6	6	128190	128195	0 %	100 %	0 %	0 %	326314938
3529	NC_015138	AGT	2	6	128384	128389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314938
3530	NC_015138	CGG	2	6	128505	128510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314938
3531	NC_015138	GC	3	6	128576	128581	0 %	0 %	50 %	50 %	326314938
3532	NC_015138	GCG	2	6	128628	128633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314938
3533	NC_015138	AAG	2	6	128687	128692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314938
3534	NC_015138	GCG	2	6	128771	128776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314938
3535	NC_015138	GCG	2	6	128835	128840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314938
3536	NC_015138	TTG	2	6	128903	128908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_015138	CCAG	2	8	128921	128928	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_015138	CTA	2	6	128934	128939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_015138	TAGAA	2	10	128942	128951	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_015138	TTGCA	2	10	128959	128968	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3541	NC_015138	GC	3	6	128992	128997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_015138	TGT	2	6	129014	129019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326314939
3543	NC_015138	TGG	3	9	129072	129080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314939
3544	NC_015138	GGA	2	6	129087	129092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326314939
3545	NC_015138	TCG	2	6	129184	129189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314939
3546	NC_015138	CCA	2	6	129191	129196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314939
3547	NC_015138	ACG	2	6	129241	129246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314939
3548	NC_015138	TC	4	8	129254	129261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_015138	TG	3	6	129285	129290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_015138	GAC	2	6	129306	129311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_015138	CAACA	2	10	129337	129346	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3552	NC_015138	TCGC	2	8	129441	129448	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_015138	GCT	2	6	129467	129472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_015138	CCA	2	6	129656	129661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_015138	CCAAG	2	10	129665	129674	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3556	NC_015138	GCG	2	6	129675	129680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_015138	CAAG	2	8	129695	129702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3558	NC_015138	GCT	2	6	129716	129721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_015138	TTGG	2	8	129722	129729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_015138	GGT	2	6	129734	129739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_015138	GCCG	2	8	129779	129786	0 %	0 %	50 %	50 %	326314940
3562	NC_015138	TGAA	2	8	129806	129813	50 %	25 %	25 %	0 %	326314940
3563	NC_015138	TCG	2	6	129827	129832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314940
3564	NC_015138	GAA	2	6	129945	129950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314941
3565	NC_015138	CCAC	2	8	130001	130008	25 %	0 %	0 %	75 %	326314941
3566	NC_015138	TGC	2	6	130075	130080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314941
3567	NC_015138	CCAA	2	8	130082	130089	50 %	0 %	0 %	50 %	326314941
3568	NC_015138	CTGG	2	8	130181	130188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3569	NC_015138	TTC	2	6	130223	130228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326314942
3570	NC_015138	CAT	2	6	130255	130260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326314942
3571	NC_015138	CCCGG	2	10	130271	130280	0 %	0 %	40 %	60 %	326314942
3572	NC_015138	CAG	2	6	130288	130293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314942
3573	NC_015138	GCC	2	6	130339	130344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314942
3574	NC_015138	CGA	2	6	130362	130367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314942
3575	NC_015138	TGG	2	6	130370	130375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314942
3576	NC_015138	CCA	2	6	130389	130394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314942
3577	NC_015138	TCG	3	9	130400	130408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314942
3578	NC_015138	CGA	2	6	130461	130466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314942
3579	NC_015138	GCAG	2	8	130512	130519	25 %	0 %	50 %	25 %	326314942
3580	NC_015138	GGC	2	6	130527	130532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314942
3581	NC_015138	CG	3	6	130561	130566	0 %	0 %	50 %	50 %	326314942
3582	NC_015138	CG	3	6	130610	130615	0 %	0 %	50 %	50 %	326314942
3583	NC_015138	GTG	2	6	130643	130648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314942
3584	NC_015138	CGG	2	6	130719	130724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314942
3585	NC_015138	CAG	2	6	130744	130749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314942
3586	NC_015138	CGG	2	6	130872	130877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314942
3587	NC_015138	GGC	2	6	130903	130908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314942
3588	NC_015138	TGA	2	6	130953	130958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314942
3589	NC_015138	CAG	2	6	130984	130989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314942
3590	NC_015138	CGG	2	6	131007	131012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314942
3591	NC_015138	CAC	2	6	131062	131067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314942
3592	NC_015138	GC	3	6	131126	131131	0 %	0 %	50 %	50 %	326314942
3593	NC_015138	GGC	2	6	131134	131139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314942
3594	NC_015138	GCC	2	6	131143	131148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314942
3595	NC_015138	GATC	2	8	131169	131176	25 %	25 %	25 %	25 %	326314942
3596	NC_015138	GAA	2	6	131179	131184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314942
3597	NC_015138	GCT	2	6	131214	131219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314942
3598	NC_015138	CACGGT	2	12	131239	131250	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326314942
3599	NC_015138	GTC	2	6	131254	131259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314942
3600	NC_015138	CAG	2	6	131272	131277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314942
3601	NC_015138	GCC	2	6	131308	131313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314942
3602	NC_015138	CGA	2	6	131341	131346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314942
3603	NC_015138	CGT	2	6	131373	131378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314942
3604	NC_015138	GCG	3	9	131445	131453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314942
3605	NC_015138	TGC	2	6	131480	131485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314942
3606	NC_015138	AG	3	6	131504	131509	50 %	0 %	50 %	0 %	326314942
3607	NC_015138	GCGGTG	2	12	131591	131602	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	326314942
3608	NC_015138	CTG	2	6	131655	131660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_015138	GCG	2	6	131661	131666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_015138	CGG	2	6	131738	131743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314943
3611	NC_015138	CAC	2	6	131875	131880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314943
3612	NC_015138	CCG	2	6	131881	131886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314943
3613	NC_015138	ACC	2	6	131926	131931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314943
3614	NC_015138	GAA	2	6	131934	131939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314943
3615	NC_015138	ACG	2	6	131954	131959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314943
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3617	NC_015138	GGC	2	6	131970	131975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314943
3618	NC_015138	CAG	2	6	132012	132017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314943
3619	NC_015138	TGG	2	6	132019	132024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314943
3620	NC_015138	GCG	2	6	132119	132124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314943
3621	NC_015138	AGC	3	9	132127	132135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314943
3622	NC_015138	TTC	2	6	132199	132204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326314943
3623	NC_015138	CCT	2	6	132298	132303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_015138	CGGGT	2	10	132310	132319	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3625	NC_015138	CAG	2	6	132374	132379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_015138	GCCT	2	8	132410	132417	0 %	25 %	25 %	50 %	326314944
3627	NC_015138	TGGT	2	8	132447	132454	0 %	50 %	50 %	0 %	326314944
3628	NC_015138	GCTG	2	8	132472	132479	0 %	25 %	50 %	25 %	326314944
3629	NC_015138	CCT	2	6	132499	132504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326314944
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3631	NC_015138	TGC	2	6	132598	132603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314944
3632	NC_015138	CCG	2	6	132670	132675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314944
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3635	NC_015138	CGT	2	6	132774	132779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314944
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3638	NC_015138	TGCCA	2	10	132851	132860	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3639	NC_015138	CGA	2	6	132992	132997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314945
3640	NC_015138	CTG	2	6	133095	133100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314945
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3651	NC_015138	GC	3	6	133349	133354	0 %	0 %	50 %	50 %	326314945
3652	NC_015138	GTG	2	6	133356	133361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314945
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3656	NC_015138	CAA	2	6	133613	133618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3657	NC_015138	GCC	2	6	133659	133664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3658	NC_015138	GCCCG	2	10	133693	133702	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3659	NC_015138	GAT	2	6	133722	133727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314946
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3665	NC_015138	CG	3	6	133951	133956	0 %	0 %	50 %	50 %	326314946
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3744	NC_015138	GCCG	2	8	136724	136731	0 %	0 %	50 %	50 %	326314949
3745	NC_015138	GATG	2	8	136735	136742	25 %	25 %	50 %	0 %	326314949
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3748	NC_015138	GCG	2	6	136846	136851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314949
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3871	NC_015138	GCC	2	6	141172	141177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314953
3872	NC_015138	GAA	2	6	141192	141197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314953
3873	NC_015138	CGGG	2	8	141256	141263	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3874	NC_015138	CGCC	2	8	141296	141303	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3875	NC_015138	GAC	2	6	141323	141328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3876	NC_015138	TCC	2	6	141390	141395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3877	NC_015138	CCG	2	6	141409	141414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3878	NC_015138	GCG	2	6	141457	141462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
3879	NC_015138	GGGCC	2	10	141491	141500	0 %	0 %	60 %	40 %	326314954
3880	NC_015138	GCG	2	6	141517	141522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
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3885	NC_015138	CTG	2	6	141627	141632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314954
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3892	NC_015138	CTG	2	6	141768	141773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314954
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3895	NC_015138	GC	3	6	141917	141922	0 %	0 %	50 %	50 %	326314954
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3903	NC_015138	CGGC	2	8	142105	142112	0 %	0 %	50 %	50 %	326314954
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3908	NC_015138	GCCAG	2	10	142246	142255	20 %	0 %	40 %	40 %	326314954
3909	NC_015138	CGA	2	6	142283	142288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314954
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3932	NC_015138	CAT	2	6	142837	142842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3934	NC_015138	GTC	3	9	142880	142888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314955
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3986	NC_015138	GAT	3	9	144509	144517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314955
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3988	NC_015138	GCTG	2	8	144562	144569	0 %	25 %	50 %	25 %	326314955
3989	NC_015138	GTA	2	6	144584	144589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314955
3990	NC_015138	GCT	2	6	144601	144606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314955
3991	NC_015138	CAG	6	18	144662	144679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314955
3992	NC_015138	CGG	2	6	144717	144722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314955
3993	NC_015138	CGGGG	2	10	144750	144759	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3994	NC_015138	CG	3	6	144797	144802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3995	NC_015138	GT	3	6	144900	144905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3996	NC_015138	GC	4	8	144949	144956	0 %	0 %	50 %	50 %	326314956
3997	NC_015138	GGT	2	6	144977	144982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314956
3998	NC_015138	CTT	2	6	145058	145063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326314956
3999	NC_015138	CAT	2	6	145081	145086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326314956
4000	NC_015138	CGT	2	6	145117	145122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314956

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