MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaerolinea thermophila UNI-1

Total Repeats: 69496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_014960	ACA	2	6	2168359	2168364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320161334
42003	NC_014960	GCTC	2	8	2168401	2168408	0 %	25 %	25 %	50 %	320161334
42004	NC_014960	CCT	2	6	2168433	2168438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320161334
42005	NC_014960	CT	3	6	2168437	2168442	0 %	50 %	0 %	50 %	320161334
42006	NC_014960	CGC	2	6	2168461	2168466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320161334
42007	NC_014960	GCC	2	6	2168544	2168549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320161334
42008	NC_014960	GCC	3	9	2168574	2168582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320161334
42009	NC_014960	TCC	2	6	2168696	2168701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320161334
42010	NC_014960	A	6	6	2168722	2168727	100 %	0 %	0 %	0 %	320161334
42011	NC_014960	GGC	2	6	2168741	2168746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320161334
42012	NC_014960	ACT	3	9	2168815	2168823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320161334
42013	NC_014960	TGCGC	2	10	2168840	2168849	0 %	20 %	40 %	40 %	320161334
42014	NC_014960	GAC	2	6	2168859	2168864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161334
42015	NC_014960	AGGTG	2	10	2168905	2168914	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42016	NC_014960	CT	3	6	2168949	2168954	0 %	50 %	0 %	50 %	320161335
42017	NC_014960	GTT	3	9	2169026	2169034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320161335
42018	NC_014960	CAT	2	6	2169065	2169070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320161335
42019	NC_014960	CTGG	2	8	2169077	2169084	0 %	25 %	50 %	25 %	320161335
42020	NC_014960	ACT	2	6	2169145	2169150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320161335
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42022	NC_014960	TGC	2	6	2169164	2169169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320161335
42023	NC_014960	GC	3	6	2169327	2169332	0 %	0 %	50 %	50 %	320161335
42024	NC_014960	CGC	2	6	2169350	2169355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320161335
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42028	NC_014960	CAAA	2	8	2169619	2169626	75 %	0 %	0 %	25 %	320161335
42029	NC_014960	GAC	2	6	2169636	2169641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161335
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42032	NC_014960	TGG	2	6	2169757	2169762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320161335
42033	NC_014960	CACCAA	2	12	2169856	2169867	50 %	0 %	0 %	50 %	320161335
42034	NC_014960	CCT	2	6	2169997	2170002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320161335
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42036	NC_014960	CGA	2	6	2170100	2170105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161335
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42046	NC_014960	CTGG	2	8	2170604	2170611	0 %	25 %	50 %	25 %	320161335
42047	NC_014960	CGA	2	6	2170616	2170621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161335
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42053	NC_014960	GGC	2	6	2170800	2170805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320161335
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42082	NC_014960	TTG	2	6	2172106	2172111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42083	NC_014960	TAA	2	6	2172145	2172150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42084	NC_014960	GATT	2	8	2172192	2172199	25 %	50 %	25 %	0 %	320161336
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42101	NC_014960	TATT	2	8	2173078	2173085	25 %	75 %	0 %	0 %	320161337
42102	NC_014960	TTTC	2	8	2173104	2173111	0 %	75 %	0 %	25 %	320161337
42103	NC_014960	TA	3	6	2173193	2173198	50 %	50 %	0 %	0 %	320161337
42104	NC_014960	CTTC	2	8	2173210	2173217	0 %	50 %	0 %	50 %	320161337
42105	NC_014960	CCG	2	6	2173227	2173232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320161337
42106	NC_014960	TGG	2	6	2173267	2173272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320161337
42107	NC_014960	T	6	6	2173281	2173286	0 %	100 %	0 %	0 %	320161337
42108	NC_014960	CAC	2	6	2173310	2173315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320161337
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42110	NC_014960	GGCA	2	8	2173368	2173375	25 %	0 %	50 %	25 %	320161337
42111	NC_014960	TCAG	2	8	2173405	2173412	25 %	25 %	25 %	25 %	320161337
42112	NC_014960	TGGA	2	8	2173426	2173433	25 %	25 %	50 %	0 %	320161337
42113	NC_014960	TC	3	6	2173464	2173469	0 %	50 %	0 %	50 %	320161337
42114	NC_014960	TCC	2	6	2173478	2173483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320161337
42115	NC_014960	TCACTG	2	12	2173505	2173516	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320161337
42116	NC_014960	TA	3	6	2173699	2173704	50 %	50 %	0 %	0 %	320161337
42117	NC_014960	TTATC	2	10	2173751	2173760	20 %	60 %	0 %	20 %	320161337
42118	NC_014960	GCTTC	2	10	2173815	2173824	0 %	40 %	20 %	40 %	320161337
42119	NC_014960	CAG	2	6	2174002	2174007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161337
42120	NC_014960	T	6	6	2174088	2174093	0 %	100 %	0 %	0 %	320161337
42121	NC_014960	ATTG	2	8	2174097	2174104	25 %	50 %	25 %	0 %	320161337
42122	NC_014960	A	6	6	2174120	2174125	100 %	0 %	0 %	0 %	320161337
42123	NC_014960	CAA	2	6	2174143	2174148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320161337
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42125	NC_014960	ATC	2	6	2174196	2174201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320161337
42126	NC_014960	TGGA	2	8	2174202	2174209	25 %	25 %	50 %	0 %	320161337
42127	NC_014960	ACA	3	9	2174331	2174339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320161337
42128	NC_014960	GAA	2	6	2174362	2174367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320161337
42129	NC_014960	GAAT	2	8	2174396	2174403	50 %	25 %	25 %	0 %	320161337
42130	NC_014960	A	6	6	2174429	2174434	100 %	0 %	0 %	0 %	320161337
42131	NC_014960	CAA	2	6	2174458	2174463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320161337
42132	NC_014960	TC	3	6	2174519	2174524	0 %	50 %	0 %	50 %	320161337
42133	NC_014960	ATCC	2	8	2174673	2174680	25 %	25 %	0 %	50 %	320161337
42134	NC_014960	GTT	2	6	2174755	2174760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320161337
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42139	NC_014960	G	6	6	2175132	2175137	0 %	0 %	100 %	0 %	320161337
42140	NC_014960	CT	3	6	2175153	2175158	0 %	50 %	0 %	50 %	320161337
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42143	NC_014960	GCTTC	2	10	2175232	2175241	0 %	40 %	20 %	40 %	320161338
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42146	NC_014960	ATGG	3	12	2175365	2175376	25 %	25 %	50 %	0 %	320161338
42147	NC_014960	CAT	2	6	2175415	2175420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320161338
42148	NC_014960	GAT	2	6	2175479	2175484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320161338
42149	NC_014960	GCA	2	6	2175518	2175523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161338
42150	NC_014960	CTGC	2	8	2175560	2175567	0 %	25 %	25 %	50 %	320161338
42151	NC_014960	TAT	2	6	2175601	2175606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320161338
42152	NC_014960	CCT	2	6	2175676	2175681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320161338
42153	NC_014960	TC	3	6	2175754	2175759	0 %	50 %	0 %	50 %	320161338
42154	NC_014960	AT	3	6	2175784	2175789	50 %	50 %	0 %	0 %	320161338
42155	NC_014960	A	6	6	2175804	2175809	100 %	0 %	0 %	0 %	320161338
42156	NC_014960	CA	3	6	2175823	2175828	50 %	0 %	0 %	50 %	320161338
42157	NC_014960	CGGTTA	2	12	2175853	2175864	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	320161338
42158	NC_014960	TTC	2	6	2175888	2175893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320161338
42159	NC_014960	AG	3	6	2175926	2175931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42160	NC_014960	CAT	2	6	2175932	2175937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320161339
42161	NC_014960	TC	3	6	2175967	2175972	0 %	50 %	0 %	50 %	320161339
42162	NC_014960	ACT	2	6	2175998	2176003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320161339
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42173	NC_014960	AGC	3	9	2176727	2176735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161339
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42180	NC_014960	TGA	2	6	2177426	2177431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320161341
42181	NC_014960	TCA	2	6	2177479	2177484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320161341
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42183	NC_014960	CCA	2	6	2177711	2177716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320161341
42184	NC_014960	CCCA	2	8	2177731	2177738	25 %	0 %	0 %	75 %	320161341
42185	NC_014960	AG	3	6	2177840	2177845	50 %	0 %	50 %	0 %	320161341
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42189	NC_014960	CAG	2	6	2178024	2178029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161342
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42192	NC_014960	GCA	2	6	2178227	2178232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161342
42193	NC_014960	CAG	2	6	2178301	2178306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161342
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42197	NC_014960	CAG	2	6	2178618	2178623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161343
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42200	NC_014960	TCA	2	6	2178731	2178736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320161343
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42212	NC_014960	ATC	2	6	2179406	2179411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320161344
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42215	NC_014960	CTG	2	6	2179475	2179480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320161344
42216	NC_014960	TCC	2	6	2179589	2179594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320161344
42217	NC_014960	AG	3	6	2179604	2179609	50 %	0 %	50 %	0 %	320161344
42218	NC_014960	TTGC	2	8	2179703	2179710	0 %	50 %	25 %	25 %	320161344
42219	NC_014960	CGG	2	6	2179750	2179755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320161344
42220	NC_014960	AAAAC	2	10	2179816	2179825	80 %	0 %	0 %	20 %	320161344
42221	NC_014960	CCCTG	2	10	2179836	2179845	0 %	20 %	20 %	60 %	320161344
42222	NC_014960	CAC	2	6	2179982	2179987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320161344
42223	NC_014960	GTC	2	6	2180103	2180108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320161344
42224	NC_014960	CAGTT	2	10	2180132	2180141	20 %	40 %	20 %	20 %	320161344
42225	NC_014960	TTG	2	6	2180216	2180221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320161344
42226	NC_014960	AGT	2	6	2180267	2180272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320161344
42227	NC_014960	TA	3	6	2180305	2180310	50 %	50 %	0 %	0 %	320161344
42228	NC_014960	GA	3	6	2180385	2180390	50 %	0 %	50 %	0 %	320161344
42229	NC_014960	AGA	2	6	2180411	2180416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320161344
42230	NC_014960	TTC	2	6	2180447	2180452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320161344
42231	NC_014960	AGG	2	6	2180531	2180536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320161344
42232	NC_014960	GA	3	6	2180579	2180584	50 %	0 %	50 %	0 %	320161344
42233	NC_014960	AAT	2	6	2180595	2180600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320161344
42234	NC_014960	GTTT	2	8	2180615	2180622	0 %	75 %	25 %	0 %	320161344
42235	NC_014960	TCT	2	6	2180643	2180648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320161344
42236	NC_014960	CCA	2	6	2180734	2180739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320161344
42237	NC_014960	CAC	2	6	2180810	2180815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320161344
42238	NC_014960	ATAA	2	8	2180951	2180958	75 %	25 %	0 %	0 %	320161344
42239	NC_014960	AGG	2	6	2180978	2180983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320161344
42240	NC_014960	ACG	2	6	2180998	2181003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161344
42241	NC_014960	CGG	2	6	2181056	2181061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320161344
42242	NC_014960	GCC	2	6	2181075	2181080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320161344
42243	NC_014960	AAG	2	6	2181104	2181109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320161344
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42245	NC_014960	ATC	2	6	2181309	2181314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320161345
42246	NC_014960	GCTT	2	8	2181421	2181428	0 %	50 %	25 %	25 %	320161345
42247	NC_014960	AGC	2	6	2181435	2181440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161345
42248	NC_014960	GC	3	6	2181439	2181444	0 %	0 %	50 %	50 %	320161345
42249	NC_014960	TCT	2	6	2181457	2181462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320161345
42250	NC_014960	TCT	2	6	2181590	2181595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320161345
42251	NC_014960	A	7	7	2181603	2181609	100 %	0 %	0 %	0 %	320161345
42252	NC_014960	CAA	2	6	2181657	2181662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320161345
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42255	NC_014960	AT	3	6	2181761	2181766	50 %	50 %	0 %	0 %	320161346
42256	NC_014960	AAT	2	6	2181787	2181792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320161346
42257	NC_014960	C	6	6	2181807	2181812	0 %	0 %	0 %	100 %	320161346
42258	NC_014960	T	6	6	2181878	2181883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42259	NC_014960	CT	3	6	2181889	2181894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42260	NC_014960	GTA	2	6	2181948	2181953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320161347
42261	NC_014960	GGT	2	6	2182074	2182079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320161347
42262	NC_014960	CCCA	2	8	2182142	2182149	25 %	0 %	0 %	75 %	320161347
42263	NC_014960	AAT	2	6	2182191	2182196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320161347
42264	NC_014960	TCC	2	6	2182246	2182251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320161348
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42266	NC_014960	CTT	2	6	2182274	2182279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320161348
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42273	NC_014960	ACAT	2	8	2182569	2182576	50 %	25 %	0 %	25 %	320161348
42274	NC_014960	CA	3	6	2182592	2182597	50 %	0 %	0 %	50 %	320161348
42275	NC_014960	TCA	2	6	2182633	2182638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320161348
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42277	NC_014960	CAA	2	6	2182750	2182755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42278	NC_014960	TTCT	2	8	2182814	2182821	0 %	75 %	0 %	25 %	320161349
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42306	NC_014960	TCC	2	6	2184708	2184713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320161350
42307	NC_014960	CGG	2	6	2184718	2184723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320161350
42308	NC_014960	TTC	2	6	2184727	2184732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320161350
42309	NC_014960	GCCC	2	8	2184796	2184803	0 %	0 %	25 %	75 %	320161350
42310	NC_014960	ACC	2	6	2184835	2184840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320161350
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42312	NC_014960	AGGG	2	8	2185040	2185047	25 %	0 %	75 %	0 %	320161350
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42324	NC_014960	AAAG	2	8	2185546	2185553	75 %	0 %	25 %	0 %	320161350
42325	NC_014960	CGG	2	6	2185579	2185584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320161350
42326	NC_014960	GCA	2	6	2185627	2185632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161350
42327	NC_014960	ACA	2	6	2185676	2185681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320161350
42328	NC_014960	ATGA	2	8	2185689	2185696	50 %	25 %	25 %	0 %	320161350
42329	NC_014960	GAA	2	6	2185851	2185856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320161350
42330	NC_014960	CGATCC	2	12	2185903	2185914	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320161350
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42332	NC_014960	AGA	2	6	2185964	2185969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320161350
42333	NC_014960	CG	3	6	2186140	2186145	0 %	0 %	50 %	50 %	320161350
42334	NC_014960	T	7	7	2186166	2186172	0 %	100 %	0 %	0 %	320161350
42335	NC_014960	AAT	2	6	2186193	2186198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320161350
42336	NC_014960	ATA	2	6	2186321	2186326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42337	NC_014960	CCT	2	6	2186394	2186399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320161351
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42339	NC_014960	TCT	2	6	2186450	2186455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320161351
42340	NC_014960	ATA	2	6	2186471	2186476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320161351
42341	NC_014960	GAC	2	6	2186521	2186526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161351
42342	NC_014960	GCC	2	6	2186573	2186578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320161351
42343	NC_014960	CTT	2	6	2186598	2186603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320161351
42344	NC_014960	CCA	2	6	2186625	2186630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320161351
42345	NC_014960	C	6	6	2186721	2186726	0 %	0 %	0 %	100 %	320161351
42346	NC_014960	TCC	2	6	2186738	2186743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320161351
42347	NC_014960	AAT	2	6	2186806	2186811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320161351
42348	NC_014960	CAA	2	6	2186812	2186817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320161351
42349	NC_014960	ACC	2	6	2186818	2186823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320161351
42350	NC_014960	TTTG	2	8	2186839	2186846	0 %	75 %	25 %	0 %	320161351
42351	NC_014960	TCC	2	6	2186910	2186915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42352	NC_014960	TGA	2	6	2186916	2186921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42353	NC_014960	TAA	2	6	2186961	2186966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42354	NC_014960	ATT	2	6	2187000	2187005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42355	NC_014960	CACAGG	2	12	2187007	2187018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42356	NC_014960	CGC	2	6	2187361	2187366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320161352
42357	NC_014960	AACA	2	8	2187422	2187429	75 %	0 %	0 %	25 %	320161352
42358	NC_014960	TCTT	2	8	2187454	2187461	0 %	75 %	0 %	25 %	320161352
42359	NC_014960	A	6	6	2187499	2187504	100 %	0 %	0 %	0 %	320161352
42360	NC_014960	CTT	2	6	2187578	2187583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320161352
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42363	NC_014960	TTC	2	6	2187663	2187668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320161353
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42365	NC_014960	AAT	2	6	2187731	2187736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320161353
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42401	NC_014960	CAC	2	6	2189974	2189979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42402	NC_014960	ATC	3	9	2190078	2190086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320161355
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42451	NC_014960	TAA	2	6	2192572	2192577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320161357
42452	NC_014960	AT	3	6	2192684	2192689	50 %	50 %	0 %	0 %	320161357
42453	NC_014960	GCCA	2	8	2192703	2192710	25 %	0 %	25 %	50 %	320161357
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42460	NC_014960	CG	3	6	2193195	2193200	0 %	0 %	50 %	50 %	320161357
42461	NC_014960	GGGT	2	8	2193251	2193258	0 %	25 %	75 %	0 %	320161357
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42463	NC_014960	TCTT	2	8	2193292	2193299	0 %	75 %	0 %	25 %	320161357
42464	NC_014960	AAAG	2	8	2193401	2193408	75 %	0 %	25 %	0 %	320161357
42465	NC_014960	TCT	2	6	2193470	2193475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320161357
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42467	NC_014960	TCT	2	6	2193634	2193639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320161357
42468	NC_014960	AGC	2	6	2193702	2193707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320161357
42469	NC_014960	CAT	2	6	2193845	2193850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320161357
42470	NC_014960	ACC	2	6	2193875	2193880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320161357
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