MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC chromosome

Total Repeats: 4237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014910	ACCAC	2	10	1521	1530	40 %	0 %	0 %	60 %	319760739
2	NC_014910	ACAAG	2	10	1774	1783	60 %	0 %	20 %	20 %	319760740
3	NC_014910	CCACG	2	10	3800	3809	20 %	0 %	20 %	60 %	319760741
4	NC_014910	CGCGC	2	10	4853	4862	0 %	0 %	40 %	60 %	319760741
5	NC_014910	CAGGC	2	10	5034	5043	20 %	0 %	40 %	40 %	319760741
6	NC_014910	TGCGC	2	10	5531	5540	0 %	20 %	40 %	40 %	319760741
7	NC_014910	GGCGC	2	10	5887	5896	0 %	0 %	60 %	40 %	319760742
8	NC_014910	CAGGC	2	10	7752	7761	20 %	0 %	40 %	40 %	319760744
9	NC_014910	CCAGG	2	10	9561	9570	20 %	0 %	40 %	40 %	319760746
10	NC_014910	TGCGC	2	10	10857	10866	0 %	20 %	40 %	40 %	319760747
11	NC_014910	GCGCC	2	10	11409	11418	0 %	0 %	40 %	60 %	319760747
12	NC_014910	CTGCC	2	10	12088	12097	0 %	20 %	20 %	60 %	319760748
13	NC_014910	TGCAT	2	10	12368	12377	20 %	40 %	20 %	20 %	319760748
14	NC_014910	CCGGC	2	10	12437	12446	0 %	0 %	40 %	60 %	319760748
15	NC_014910	GCGCC	2	10	13416	13425	0 %	0 %	40 %	60 %	319760748
16	NC_014910	GGCCG	2	10	15816	15825	0 %	0 %	60 %	40 %	319760750
17	NC_014910	CGGCC	2	10	16137	16146	0 %	0 %	40 %	60 %	319760750
18	NC_014910	TGCGC	2	10	16739	16748	0 %	20 %	40 %	40 %	319760750
19	NC_014910	CGGGG	2	10	17034	17043	0 %	0 %	80 %	20 %	319760751
20	NC_014910	GCACT	2	10	17206	17215	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014910	CCGCC	2	10	17627	17636	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
22	NC_014910	CAGCC	2	10	17849	17858	20 %	0 %	20 %	60 %	319760753
23	NC_014910	CCCTG	2	10	17896	17905	0 %	20 %	20 %	60 %	319760753
24	NC_014910	CGCGG	2	10	18659	18668	0 %	0 %	60 %	40 %	319760753
25	NC_014910	GCGCC	2	10	19045	19054	0 %	0 %	40 %	60 %	319760753
26	NC_014910	CGCGG	2	10	20365	20374	0 %	0 %	60 %	40 %	319760754
27	NC_014910	CGCCC	2	10	21304	21313	0 %	0 %	20 %	80 %	319760754
28	NC_014910	GCGCG	2	10	21349	21358	0 %	0 %	60 %	40 %	319760754
29	NC_014910	CGCGC	2	10	24907	24916	0 %	0 %	40 %	60 %	319760758
30	NC_014910	GGGCG	2	10	26869	26878	0 %	0 %	80 %	20 %	319760758
31	NC_014910	TCCCG	2	10	29134	29143	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_014910	GACCC	2	10	29155	29164	20 %	0 %	20 %	60 %	319760760
33	NC_014910	GCGCC	2	10	30704	30713	0 %	0 %	40 %	60 %	319760761
34	NC_014910	CAGGG	2	10	31060	31069	20 %	0 %	60 %	20 %	319760761
35	NC_014910	GCGCA	2	10	31420	31429	20 %	0 %	40 %	40 %	319760762
36	NC_014910	CCGGC	2	10	32195	32204	0 %	0 %	40 %	60 %	319760762
37	NC_014910	GGCGC	2	10	32221	32230	0 %	0 %	60 %	40 %	319760762
38	NC_014910	GCGCC	2	10	35159	35168	0 %	0 %	40 %	60 %	319760764
39	NC_014910	GGGTT	2	10	37475	37484	0 %	40 %	60 %	0 %	319760767
40	NC_014910	GCGCC	2	10	38267	38276	0 %	0 %	40 %	60 %	319760768
41	NC_014910	CAGGC	2	10	38711	38720	20 %	0 %	40 %	40 %	319760768
42	NC_014910	GCCGC	2	10	38858	38867	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_014910	CGCGC	2	10	38869	38878	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44	NC_014910	GGCCG	2	10	40153	40162	0 %	0 %	60 %	40 %	319760770
45	NC_014910	AGGCC	2	10	40321	40330	20 %	0 %	40 %	40 %	319760770
46	NC_014910	GCTGG	2	10	40879	40888	0 %	20 %	60 %	20 %	319760770
47	NC_014910	GGCCC	2	10	41327	41336	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_014910	TTCGC	2	10	43036	43045	0 %	40 %	20 %	40 %	319760772
49	NC_014910	AGGTA	2	10	43574	43583	40 %	20 %	40 %	0 %	319760772
50	NC_014910	CGTGG	2	10	43587	43596	0 %	20 %	60 %	20 %	319760772
51	NC_014910	CCGGC	2	10	43863	43872	0 %	0 %	40 %	60 %	319760773
52	NC_014910	GCTGC	2	10	43939	43948	0 %	20 %	40 %	40 %	319760773
53	NC_014910	CGCGG	2	10	46420	46429	0 %	0 %	60 %	40 %	319760775
54	NC_014910	CGCAC	2	10	46703	46712	20 %	0 %	20 %	60 %	319760775
55	NC_014910	AGCCC	2	10	47157	47166	20 %	0 %	20 %	60 %	319760776
56	NC_014910	GCGCA	2	10	47728	47737	20 %	0 %	40 %	40 %	319760776
57	NC_014910	GCAGG	2	10	48189	48198	20 %	0 %	60 %	20 %	319760776
58	NC_014910	CGCAG	3	15	48236	48250	20 %	0 %	40 %	40 %	319760776
59	NC_014910	GCGCG	2	10	48858	48867	0 %	0 %	60 %	40 %	319760777
60	NC_014910	TGGCG	2	10	51516	51525	0 %	20 %	60 %	20 %	319760777
61	NC_014910	CCTGG	2	10	52480	52489	0 %	20 %	40 %	40 %	319760778
62	NC_014910	GGCCG	2	10	53104	53113	0 %	0 %	60 %	40 %	319760778
63	NC_014910	GCCGG	2	10	53752	53761	0 %	0 %	60 %	40 %	319760779
64	NC_014910	GCAGC	2	10	54614	54623	20 %	0 %	40 %	40 %	319760780
65	NC_014910	GCGCG	2	10	54793	54802	0 %	0 %	60 %	40 %	319760780
66	NC_014910	ACCGT	2	10	54973	54982	20 %	20 %	20 %	40 %	319760780
67	NC_014910	GCCGC	2	10	55263	55272	0 %	0 %	40 %	60 %	319760780
68	NC_014910	CGTGC	2	10	55688	55697	0 %	20 %	40 %	40 %	319760781
69	NC_014910	GCCGT	2	10	55962	55971	0 %	20 %	40 %	40 %	319760781
70	NC_014910	GGGCT	2	10	56576	56585	0 %	20 %	60 %	20 %	319760781
71	NC_014910	GCAGG	2	10	56647	56656	20 %	0 %	60 %	20 %	319760781
72	NC_014910	GCGCC	2	10	56956	56965	0 %	0 %	40 %	60 %	319760782
73	NC_014910	CGGCC	2	10	57515	57524	0 %	0 %	40 %	60 %	319760782
74	NC_014910	GCGGG	2	10	57960	57969	0 %	0 %	80 %	20 %	319760783
75	NC_014910	TAGGC	2	10	58455	58464	20 %	20 %	40 %	20 %	319760783
76	NC_014910	GCCGC	2	10	61778	61787	0 %	0 %	40 %	60 %	319760788
77	NC_014910	GGGCG	3	15	61987	62001	0 %	0 %	80 %	20 %	319760788
78	NC_014910	CGGGC	2	10	62515	62524	0 %	0 %	60 %	40 %	319760789
79	NC_014910	GCGTG	2	10	65461	65470	0 %	20 %	60 %	20 %	319760793
80	NC_014910	GCGCG	2	10	66571	66580	0 %	0 %	60 %	40 %	319760794
81	NC_014910	GGCGC	2	10	67722	67731	0 %	0 %	60 %	40 %	319760795
82	NC_014910	GGCGG	2	10	68263	68272	0 %	0 %	80 %	20 %	319760795
83	NC_014910	CTGGG	2	10	68795	68804	0 %	20 %	60 %	20 %	319760796
84	NC_014910	AAAGG	2	10	72319	72328	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014910	GGGCC	2	10	72376	72385	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014910	CGCTG	2	10	74047	74056	0 %	20 %	40 %	40 %	319760802
87	NC_014910	CACCC	2	10	77812	77821	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
88	NC_014910	GCGCT	2	10	78457	78466	0 %	20 %	40 %	40 %	319760807
89	NC_014910	GCGCG	2	10	78843	78852	0 %	0 %	60 %	40 %	319760808
90	NC_014910	CACGC	2	10	79782	79791	20 %	0 %	20 %	60 %	319760808
91	NC_014910	GGCCG	2	10	80360	80369	0 %	0 %	60 %	40 %	319760809
92	NC_014910	GCCGC	2	10	81258	81267	0 %	0 %	40 %	60 %	319760811
93	NC_014910	CGCGC	2	10	84054	84063	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_014910	CGCGC	3	15	84735	84749	0 %	0 %	40 %	60 %	319760814
95	NC_014910	GCCGT	2	10	86393	86402	0 %	20 %	40 %	40 %	319760816
96	NC_014910	GCGCG	2	10	87423	87432	0 %	0 %	60 %	40 %	319760817
97	NC_014910	GCCGC	2	10	87657	87666	0 %	0 %	40 %	60 %	319760817
98	NC_014910	TCGGC	2	10	89011	89020	0 %	20 %	40 %	40 %	319760819
99	NC_014910	GCCGT	2	10	90085	90094	0 %	20 %	40 %	40 %	319760820
100	NC_014910	GGCGG	2	10	91194	91203	0 %	0 %	80 %	20 %	319760821
101	NC_014910	CGTTG	2	10	91545	91554	0 %	40 %	40 %	20 %	319760821
102	NC_014910	TGATG	2	10	93602	93611	20 %	40 %	40 %	0 %	319760824
103	NC_014910	CCGCG	2	10	94631	94640	0 %	0 %	40 %	60 %	319760825
104	NC_014910	GCGCC	2	10	95368	95377	0 %	0 %	40 %	60 %	319760825
105	NC_014910	GGCCG	2	10	95601	95610	0 %	0 %	60 %	40 %	319760825
106	NC_014910	CGCTG	2	10	97695	97704	0 %	20 %	40 %	40 %	319760826
107	NC_014910	GCCGA	2	10	98571	98580	20 %	0 %	40 %	40 %	319760827
108	NC_014910	TGGCC	2	10	98683	98692	0 %	20 %	40 %	40 %	319760827
109	NC_014910	GCGCC	2	10	99868	99877	0 %	0 %	40 %	60 %	319760828
110	NC_014910	CCGCG	2	10	101266	101275	0 %	0 %	40 %	60 %	319760830
111	NC_014910	CTGCG	2	10	101528	101537	0 %	20 %	40 %	40 %	319760830
112	NC_014910	CGGCG	2	10	101761	101770	0 %	0 %	60 %	40 %	319760830
113	NC_014910	CGGCC	2	10	102634	102643	0 %	0 %	40 %	60 %	319760831
114	NC_014910	GACCT	2	10	102659	102668	20 %	20 %	20 %	40 %	319760831
115	NC_014910	TGCGC	2	10	104661	104670	0 %	20 %	40 %	40 %	319760833
116	NC_014910	CGGCG	2	10	105309	105318	0 %	0 %	60 %	40 %	319760833
117	NC_014910	ATCGC	2	10	106237	106246	20 %	20 %	20 %	40 %	319760834
118	NC_014910	CCCGC	2	10	106780	106789	0 %	0 %	20 %	80 %	319760834
119	NC_014910	CGTGG	2	10	107410	107419	0 %	20 %	60 %	20 %	319760835
120	NC_014910	GGCGA	2	10	109546	109555	20 %	0 %	60 %	20 %	319760839
121	NC_014910	TGGCC	2	10	109573	109582	0 %	20 %	40 %	40 %	319760839
122	NC_014910	CGCGC	2	10	109618	109627	0 %	0 %	40 %	60 %	319760839
123	NC_014910	CCACG	2	10	109772	109781	20 %	0 %	20 %	60 %	319760839
124	NC_014910	CGATC	2	10	110919	110928	20 %	20 %	20 %	40 %	319760840
125	NC_014910	CCCAT	2	10	112211	112220	20 %	20 %	0 %	60 %	319760841
126	NC_014910	GATCC	2	10	112231	112240	20 %	20 %	20 %	40 %	319760841
127	NC_014910	CCGCG	2	10	113217	113226	0 %	0 %	40 %	60 %	319760842
128	NC_014910	TGCGG	2	10	113658	113667	0 %	20 %	60 %	20 %	319760843
129	NC_014910	GCGCC	2	10	113807	113816	0 %	0 %	40 %	60 %	319760843
130	NC_014910	TGCCC	2	10	113887	113896	0 %	20 %	20 %	60 %	319760843
131	NC_014910	ATTGA	2	10	114204	114213	40 %	40 %	20 %	0 %	319760843
132	NC_014910	TGGCG	2	10	116269	116278	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014910	GCGCG	2	10	117675	117684	0 %	0 %	60 %	40 %	319760848
134	NC_014910	ATGCG	2	10	119113	119122	20 %	20 %	40 %	20 %	319760849
135	NC_014910	CTGGT	2	10	119241	119250	0 %	40 %	40 %	20 %	319760849
136	NC_014910	GCGGG	2	10	123266	123275	0 %	0 %	80 %	20 %	319760852
137	NC_014910	TCCTG	2	10	124996	125005	0 %	40 %	20 %	40 %	319760853
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151	NC_014910	GCCGC	2	10	143932	143941	0 %	0 %	40 %	60 %	319760866
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179	NC_014910	GCGCC	2	10	175556	175565	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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239	NC_014910	GCGCT	2	10	224489	224498	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
240	NC_014910	CCCCG	2	10	226455	226464	0 %	0 %	20 %	80 %	319760939
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263	NC_014910	TGCGC	2	10	263421	263430	0 %	20 %	40 %	40 %	319760970
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268	NC_014910	GCAAC	2	10	266397	266406	40 %	0 %	20 %	40 %	319760975
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401	NC_014910	GCCGT	2	10	382213	382222	0 %	20 %	40 %	40 %	319761082
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