MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 2386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014908	CGA	2	6	100701	100706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760132
2002	NC_014908	GGT	2	6	100835	100840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760132
2003	NC_014908	AAG	2	6	100854	100859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760132
2004	NC_014908	GTC	2	6	100871	100876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760132
2005	NC_014908	GGCT	2	8	100882	100889	0 %	25 %	50 %	25 %	319760132
2006	NC_014908	TGA	2	6	100906	100911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760132
2007	NC_014908	TCA	2	6	100965	100970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760132
2008	NC_014908	CAT	2	6	101000	101005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760132
2009	NC_014908	TCG	3	9	101010	101018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760132
2010	NC_014908	GTCC	2	8	101090	101097	0 %	25 %	25 %	50 %	319760132
2011	NC_014908	GAC	2	6	101116	101121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760132
2012	NC_014908	T	7	7	101185	101191	0 %	100 %	0 %	0 %	319760132
2013	NC_014908	TGCC	2	8	101212	101219	0 %	25 %	25 %	50 %	319760132
2014	NC_014908	GAA	2	6	101252	101257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760132
2015	NC_014908	CGG	2	6	101356	101361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760132
2016	NC_014908	CGT	2	6	101379	101384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760132
2017	NC_014908	GTA	2	6	101465	101470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760132
2018	NC_014908	TCAA	2	8	101484	101491	50 %	25 %	0 %	25 %	319760132
2019	NC_014908	TTG	2	6	101496	101501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760132
2020	NC_014908	C	6	6	101527	101532	0 %	0 %	0 %	100 %	319760132
2021	NC_014908	TGC	2	6	101560	101565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760132
2022	NC_014908	GCC	3	9	101692	101700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760132
2023	NC_014908	CAG	2	6	101720	101725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760132
2024	NC_014908	TCG	2	6	101745	101750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760132
2025	NC_014908	TCA	2	6	101782	101787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760132
2026	NC_014908	CGA	2	6	101860	101865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760132
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2030	NC_014908	GC	3	6	102073	102078	0 %	0 %	50 %	50 %	319760132
2031	NC_014908	GCA	2	6	102187	102192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760132
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2033	NC_014908	GC	4	8	102240	102247	0 %	0 %	50 %	50 %	319760133
2034	NC_014908	TTG	2	6	102299	102304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760133
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2037	NC_014908	CAA	2	6	102513	102518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760133
2038	NC_014908	CGC	2	6	102522	102527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760133
2039	NC_014908	TTC	2	6	102588	102593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760134
2040	NC_014908	GC	3	6	102697	102702	0 %	0 %	50 %	50 %	319760134
2041	NC_014908	GC	3	6	102717	102722	0 %	0 %	50 %	50 %	319760134
2042	NC_014908	AAT	2	6	102799	102804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_014908	GCG	2	6	102824	102829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2044	NC_014908	GCG	2	6	102879	102884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760135
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2047	NC_014908	CAC	2	6	102939	102944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760135
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2049	NC_014908	ATC	2	6	103000	103005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760135
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2052	NC_014908	GC	3	6	103145	103150	0 %	0 %	50 %	50 %	319760135
2053	NC_014908	TGG	2	6	103177	103182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760135
2054	NC_014908	ACG	2	6	103207	103212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760135
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2057	NC_014908	GCGA	2	8	103269	103276	25 %	0 %	50 %	25 %	319760135
2058	NC_014908	GTGCA	2	10	103287	103296	20 %	20 %	40 %	20 %	319760135
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2065	NC_014908	ACG	2	6	103530	103535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760135
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2093	NC_014908	ACCCG	2	10	104916	104925	20 %	0 %	20 %	60 %	319760138
2094	NC_014908	CG	4	8	105057	105064	0 %	0 %	50 %	50 %	319760138
2095	NC_014908	GC	3	6	105112	105117	0 %	0 %	50 %	50 %	319760138
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2102	NC_014908	CA	3	6	105514	105519	50 %	0 %	0 %	50 %	319760139
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2107	NC_014908	CGA	2	6	105891	105896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760139
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2121	NC_014908	GGTGC	2	10	106507	106516	0 %	20 %	60 %	20 %	319760139
2122	NC_014908	ACC	2	6	106575	106580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760139
2123	NC_014908	GATT	2	8	106607	106614	25 %	50 %	25 %	0 %	319760139
2124	NC_014908	TCG	2	6	106643	106648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760139
2125	NC_014908	GTG	2	6	106756	106761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760139
2126	NC_014908	CG	3	6	106861	106866	0 %	0 %	50 %	50 %	319760139
2127	NC_014908	GC	3	6	106918	106923	0 %	0 %	50 %	50 %	319760139
2128	NC_014908	TTC	2	6	106927	106932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760139
2129	NC_014908	GGCA	2	8	106946	106953	25 %	0 %	50 %	25 %	319760139
2130	NC_014908	GAT	2	6	107086	107091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760139
2131	NC_014908	GC	3	6	107148	107153	0 %	0 %	50 %	50 %	319760139
2132	NC_014908	CCG	2	6	107255	107260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2133	NC_014908	GCC	2	6	107335	107340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2134	NC_014908	ACGTC	2	10	107367	107376	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2135	NC_014908	CTG	2	6	107435	107440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2136	NC_014908	G	6	6	107452	107457	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2137	NC_014908	ACCCG	2	10	107537	107546	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2138	NC_014908	CGGCG	2	10	107596	107605	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2139	NC_014908	GATG	2	8	107632	107639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2140	NC_014908	CT	3	6	107648	107653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2141	NC_014908	CA	3	6	107658	107663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2142	NC_014908	GCC	2	6	107819	107824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760140
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2144	NC_014908	CTG	2	6	107932	107937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760140
2145	NC_014908	GACG	2	8	107982	107989	25 %	0 %	50 %	25 %	319760140
2146	NC_014908	AT	3	6	107991	107996	50 %	50 %	0 %	0 %	319760140
2147	NC_014908	TTCCAT	2	12	108020	108031	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319760140
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2149	NC_014908	AAC	2	6	108073	108078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2150	NC_014908	CGG	2	6	108119	108124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2151	NC_014908	CGC	2	6	108132	108137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2152	NC_014908	CGG	2	6	108158	108163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760141
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2154	NC_014908	AGC	2	6	108245	108250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760141
2155	NC_014908	GTG	2	6	108334	108339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760141
2156	NC_014908	GC	3	6	108346	108351	0 %	0 %	50 %	50 %	319760141
2157	NC_014908	CCA	2	6	108433	108438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760141
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2160	NC_014908	TGC	2	6	108500	108505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760141
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2162	NC_014908	GC	3	6	108530	108535	0 %	0 %	50 %	50 %	319760141
2163	NC_014908	ACG	2	6	108614	108619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760141
2164	NC_014908	CAGG	2	8	108636	108643	25 %	0 %	50 %	25 %	319760141
2165	NC_014908	CGA	2	6	108699	108704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760141
2166	NC_014908	AAT	2	6	108710	108715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760141
2167	NC_014908	TG	3	6	108739	108744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2168	NC_014908	GAA	2	6	108768	108773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2169	NC_014908	CAT	2	6	108799	108804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2171	NC_014908	CCGC	2	8	108827	108834	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2172	NC_014908	TCGAA	2	10	108853	108862	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2173	NC_014908	CTG	2	6	108864	108869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2174	NC_014908	CGGA	2	8	108912	108919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2175	NC_014908	GCC	2	6	109057	109062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2176	NC_014908	GCC	2	6	109064	109069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2177	NC_014908	TTG	2	6	109114	109119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2184	NC_014908	TGC	2	6	109386	109391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760142
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2192	NC_014908	GAAC	2	8	109566	109573	50 %	0 %	25 %	25 %	319760143
2193	NC_014908	GCA	2	6	109590	109595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760143
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2198	NC_014908	GGCG	2	8	109771	109778	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2199	NC_014908	GTC	2	6	109954	109959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760144
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2203	NC_014908	TTCG	2	8	110093	110100	0 %	50 %	25 %	25 %	319760144
2204	NC_014908	CGTT	2	8	110144	110151	0 %	50 %	25 %	25 %	319760144
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2219	NC_014908	GGC	2	6	110880	110885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2220	NC_014908	GCA	2	6	110907	110912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2222	NC_014908	CGC	2	6	110955	110960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2224	NC_014908	ACC	2	6	111010	111015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2227	NC_014908	CTGG	2	8	111061	111068	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2228	NC_014908	CTG	2	6	111070	111075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2229	NC_014908	GAC	2	6	111130	111135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2230	NC_014908	GGC	2	6	111150	111155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2231	NC_014908	TGGC	2	8	111180	111187	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2232	NC_014908	CGCGAA	2	12	111199	111210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2233	NC_014908	GC	3	6	111213	111218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2234	NC_014908	GCT	2	6	111252	111257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2237	NC_014908	TAC	2	6	111292	111297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2238	NC_014908	ACCT	2	8	111355	111362	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2239	NC_014908	CGATG	2	10	111417	111426	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2240	NC_014908	GGA	2	6	111447	111452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2241	NC_014908	AC	3	6	111512	111517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2242	NC_014908	GCC	2	6	111528	111533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2243	NC_014908	CGA	2	6	111550	111555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2244	NC_014908	GC	3	6	111595	111600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2245	NC_014908	ACC	2	6	111632	111637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2246	NC_014908	GCGCA	2	10	111638	111647	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2247	NC_014908	CCG	2	6	111715	111720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2248	NC_014908	CAG	2	6	111821	111826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2249	NC_014908	CTG	2	6	111893	111898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2250	NC_014908	CGA	2	6	112003	112008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2251	NC_014908	GCA	2	6	112015	112020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2252	NC_014908	CGA	2	6	112033	112038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2253	NC_014908	GCC	2	6	112061	112066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2254	NC_014908	GC	3	6	112141	112146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2255	NC_014908	TGGC	2	8	112151	112158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2256	NC_014908	GC	3	6	112259	112264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2257	NC_014908	GCCAGT	2	12	112329	112340	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2259	NC_014908	CGCCGA	2	12	112387	112398	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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2265	NC_014908	GCT	2	6	112711	112716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2375	NC_014908	CGGCAG	2	12	119012	119023	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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2377	NC_014908	GGA	2	6	119110	119115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2378	NC_014908	CTC	2	6	119149	119154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2379	NC_014908	TCCA	2	8	119195	119202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2380	NC_014908	TGCC	2	8	119226	119233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2381	NC_014908	CA	3	6	119266	119271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2382	NC_014908	CA	3	6	119427	119432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2383	NC_014908	CAT	2	6	119565	119570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2384	NC_014908	CTGT	2	8	119632	119639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2385	NC_014908	AAC	2	6	119657	119662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2386	NC_014908	CG	4	8	119667	119674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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