MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Arthrobacter arilaitensis Re117 chromosome

Total Repeats: 2713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014550	CTCGC	2	10	3531710	3531719	0 %	20 %	20 %	60 %	308178923
2502	NC_014550	GCCGA	2	10	3532211	3532220	20 %	0 %	40 %	40 %	308178924
2503	NC_014550	GACGT	2	10	3532494	3532503	20 %	20 %	40 %	20 %	308178924
2504	NC_014550	TTGCG	2	10	3533052	3533061	0 %	40 %	40 %	20 %	308178925
2505	NC_014550	GCCTG	2	10	3533991	3534000	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2506	NC_014550	GCAGT	2	10	3535237	3535246	20 %	20 %	40 %	20 %	308178927
2507	NC_014550	CGTGG	2	10	3539623	3539632	0 %	20 %	60 %	20 %	308178930
2508	NC_014550	AAGGA	2	10	3540386	3540395	60 %	0 %	40 %	0 %	308178931
2509	NC_014550	TCGAA	2	10	3543767	3543776	40 %	20 %	20 %	20 %	308178934
2510	NC_014550	TTGTC	2	10	3544740	3544749	0 %	60 %	20 %	20 %	308178934
2511	NC_014550	AAACG	2	10	3546242	3546251	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2512	NC_014550	AGGCC	2	10	3546512	3546521	20 %	0 %	40 %	40 %	308178936
2513	NC_014550	TGCTG	2	10	3547420	3547429	0 %	40 %	40 %	20 %	308178936
2514	NC_014550	CCGCT	2	10	3548002	3548011	0 %	20 %	20 %	60 %	308178937
2515	NC_014550	CTCAT	2	10	3548765	3548774	20 %	40 %	0 %	40 %	308178938
2516	NC_014550	TTTCA	2	10	3550440	3550449	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2517	NC_014550	TCTGG	2	10	3554126	3554135	0 %	40 %	40 %	20 %	308178943
2518	NC_014550	CGCTG	2	10	3554546	3554555	0 %	20 %	40 %	40 %	308178943
2519	NC_014550	GCCCT	2	10	3554796	3554805	0 %	20 %	20 %	60 %	308178943
2520	NC_014550	GCTCG	2	10	3556205	3556214	0 %	20 %	40 %	40 %	308178944
2521	NC_014550	GGCGT	2	10	3559835	3559844	0 %	20 %	60 %	20 %	308178947
2522	NC_014550	GCCTG	2	10	3560484	3560493	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2523	NC_014550	CCCTG	2	10	3562640	3562649	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2524	NC_014550	TTGGC	2	10	3563152	3563161	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2525	NC_014550	TTGCC	2	10	3564641	3564650	0 %	40 %	20 %	40 %	308178954
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2529	NC_014550	GCTTC	2	10	3569074	3569083	0 %	40 %	20 %	40 %	308178958
2530	NC_014550	GGAAG	2	10	3569420	3569429	40 %	0 %	60 %	0 %	308178958
2531	NC_014550	GGGCT	2	10	3570657	3570666	0 %	20 %	60 %	20 %	308178959
2532	NC_014550	TCAGC	2	10	3573296	3573305	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2533	NC_014550	TTTTC	2	10	3577014	3577023	0 %	80 %	0 %	20 %	308178968
2534	NC_014550	CGCTG	2	10	3582340	3582349	0 %	20 %	40 %	40 %	308178972
2535	NC_014550	ATCCA	2	10	3585045	3585054	40 %	20 %	0 %	40 %	308178974
2536	NC_014550	TTCGC	2	10	3589514	3589523	0 %	40 %	20 %	40 %	308178977
2537	NC_014550	TCGCT	2	10	3590318	3590327	0 %	40 %	20 %	40 %	308178978
2538	NC_014550	CCAAG	2	10	3594119	3594128	40 %	0 %	20 %	40 %	308178980
2539	NC_014550	GCTTC	2	10	3594343	3594352	0 %	40 %	20 %	40 %	308178981
2540	NC_014550	GCCAG	2	10	3594412	3594421	20 %	0 %	40 %	40 %	308178981
2541	NC_014550	TGCGC	2	10	3594718	3594727	0 %	20 %	40 %	40 %	308178981
2542	NC_014550	CCGCT	2	10	3598143	3598152	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2543	NC_014550	TCGGT	2	10	3599090	3599099	0 %	40 %	40 %	20 %	308178984
2544	NC_014550	CCGCG	2	10	3599759	3599768	0 %	0 %	40 %	60 %	308178985
2545	NC_014550	GCGCC	2	10	3600196	3600205	0 %	0 %	40 %	60 %	308178985
2546	NC_014550	GCTCG	2	10	3600895	3600904	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2547	NC_014550	GGTGC	2	10	3602618	3602627	0 %	20 %	60 %	20 %	308178987
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2549	NC_014550	ACCGG	2	10	3606099	3606108	20 %	0 %	40 %	40 %	308178989
2550	NC_014550	TGCCG	2	10	3610300	3610309	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2551	NC_014550	ATGGA	2	10	3611354	3611363	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_014550	TGGCG	2	10	3611811	3611820	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2553	NC_014550	ATGGA	2	10	3612529	3612538	40 %	20 %	40 %	0 %	308178993
2554	NC_014550	TGGCG	2	10	3612986	3612995	0 %	20 %	60 %	20 %	308178993
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2556	NC_014550	TCGCT	2	10	3616125	3616134	0 %	40 %	20 %	40 %	308178994
2557	NC_014550	GCCCG	2	10	3616645	3616654	0 %	0 %	40 %	60 %	308178994
2558	NC_014550	ACCGA	2	10	3618128	3618137	40 %	0 %	20 %	40 %	308178994
2559	NC_014550	CGGGC	2	10	3618924	3618933	0 %	0 %	60 %	40 %	308178995
2560	NC_014550	GCGCT	2	10	3620955	3620964	0 %	20 %	40 %	40 %	308178996
2561	NC_014550	GCGCG	2	10	3621240	3621249	0 %	0 %	60 %	40 %	308178997
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2570	NC_014550	GCTAA	2	10	3633747	3633756	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2571	NC_014550	GCCGA	2	10	3638375	3638384	20 %	0 %	40 %	40 %	308179015
2572	NC_014550	GGCGC	2	10	3639246	3639255	0 %	0 %	60 %	40 %	308179015
2573	NC_014550	TGCCC	2	10	3640372	3640381	0 %	20 %	20 %	60 %	308179016
2574	NC_014550	AGTCT	2	10	3640598	3640607	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2575	NC_014550	TTTCC	2	10	3643319	3643328	0 %	60 %	0 %	40 %	308179019
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2585	NC_014550	CCTGG	2	10	3661696	3661705	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2586	NC_014550	ACCGC	2	10	3661962	3661971	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2587	NC_014550	AGCCC	2	10	3662700	3662709	20 %	0 %	20 %	60 %	308179035
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2593	NC_014550	GCCCG	2	10	3671687	3671696	0 %	0 %	40 %	60 %	308179044
2594	NC_014550	GCGAG	2	10	3671992	3672001	20 %	0 %	60 %	20 %	308179044
2595	NC_014550	TCGGT	2	10	3673049	3673058	0 %	40 %	40 %	20 %	308179045
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2597	NC_014550	CCAGC	2	10	3673703	3673712	20 %	0 %	20 %	60 %	308179046
2598	NC_014550	GCGCG	2	10	3674641	3674650	0 %	0 %	60 %	40 %	308179046
2599	NC_014550	CGGCG	2	10	3676967	3676976	0 %	0 %	60 %	40 %	308179046
2600	NC_014550	CGGCG	2	10	3677275	3677284	0 %	0 %	60 %	40 %	308179047
2601	NC_014550	CCGCG	2	10	3677505	3677514	0 %	0 %	40 %	60 %	308179047
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2607	NC_014550	CCGGG	2	10	3683815	3683824	0 %	0 %	60 %	40 %	308179048
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2609	NC_014550	TGCGC	2	10	3686842	3686851	0 %	20 %	40 %	40 %	308179049
2610	NC_014550	TGCCG	2	10	3687505	3687514	0 %	20 %	40 %	40 %	308179049
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2626	NC_014550	GGTCA	2	10	3716161	3716170	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2627	NC_014550	GTTCA	2	10	3716351	3716360	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2628	NC_014550	ATCCG	2	10	3717760	3717769	20 %	20 %	20 %	40 %	308179074
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2647	NC_014550	TCCCG	2	10	3750630	3750639	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.