MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Arthrobacter arilaitensis Re117 plasmid pRE117-1

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014549	ATCC	2	8	6	13	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014549	GGCG	2	8	1149	1156	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014549	GAAC	2	8	1177	1184	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014549	GCCG	2	8	1493	1500	0 %	0 %	50 %	50 %	308171845
5	NC_014549	CCGA	2	8	1536	1543	25 %	0 %	25 %	50 %	308171845
6	NC_014549	TGGC	2	8	1828	1835	0 %	25 %	50 %	25 %	308171846
7	NC_014549	GCCA	2	8	2004	2011	25 %	0 %	25 %	50 %	308171846
8	NC_014549	ATGG	2	8	2027	2034	25 %	25 %	50 %	0 %	308171846
9	NC_014549	CGGG	2	8	2181	2188	0 %	0 %	75 %	25 %	308171846
10	NC_014549	CCGC	2	8	2970	2977	0 %	0 %	25 %	75 %	308171847
11	NC_014549	AGGA	2	8	3019	3026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014549	GGCC	2	8	3347	3354	0 %	0 %	50 %	50 %	308171849
13	NC_014549	CCCG	2	8	3496	3503	0 %	0 %	25 %	75 %	308171849
14	NC_014549	GCTG	2	8	3604	3611	0 %	25 %	50 %	25 %	308171849
15	NC_014549	TCGG	2	8	3741	3748	0 %	25 %	50 %	25 %	308171849
16	NC_014549	AGAT	2	8	5270	5277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014549	GCGA	2	8	6526	6533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014549	CGGG	2	8	7076	7083	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014549	CGAT	2	8	7173	7180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014549	TGGC	2	8	7965	7972	0 %	25 %	50 %	25 %	308171851
21	NC_014549	CCAC	2	8	8010	8017	25 %	0 %	0 %	75 %	308171851
22	NC_014549	TGGA	2	8	8114	8121	25 %	25 %	50 %	0 %	308171851
23	NC_014549	CGGC	2	8	8567	8574	0 %	0 %	50 %	50 %	308171851
24	NC_014549	GCTT	2	8	8795	8802	0 %	50 %	25 %	25 %	308171851
25	NC_014549	GCCG	2	8	8847	8854	0 %	0 %	50 %	50 %	308171851
26	NC_014549	GGGT	2	8	9524	9531	0 %	25 %	75 %	0 %	308171851
27	NC_014549	GGCT	2	8	9997	10004	0 %	25 %	50 %	25 %	308171851
28	NC_014549	CCAT	2	8	10276	10283	25 %	25 %	0 %	50 %	308171851
29	NC_014549	AAGG	2	8	11187	11194	50 %	0 %	50 %	0 %	308171852
30	NC_014549	TTGG	2	8	11240	11247	0 %	50 %	50 %	0 %	308171852
31	NC_014549	TAGA	2	8	11458	11465	50 %	25 %	25 %	0 %	308171852
32	NC_014549	CCTT	2	8	11801	11808	0 %	50 %	0 %	50 %	308171853
33	NC_014549	TCCG	2	8	12670	12677	0 %	25 %	25 %	50 %	308171853
34	NC_014549	CGGC	2	8	12704	12711	0 %	0 %	50 %	50 %	308171853
35	NC_014549	GACT	2	8	12856	12863	25 %	25 %	25 %	25 %	308171853
36	NC_014549	GGCC	2	8	12921	12928	0 %	0 %	50 %	50 %	308171853
37	NC_014549	AATG	2	8	13612	13619	50 %	25 %	25 %	0 %	308171853
38	NC_014549	TGCT	2	8	13625	13632	0 %	50 %	25 %	25 %	308171853
39	NC_014549	GCTG	2	8	15263	15270	0 %	25 %	50 %	25 %	308171854
40	NC_014549	TGAT	2	8	15286	15293	25 %	50 %	25 %	0 %	308171854
41	NC_014549	CTGG	2	8	15473	15480	0 %	25 %	50 %	25 %	308171854
42	NC_014549	GCAC	2	8	16185	16192	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014549	AGTA	2	8	16452	16459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014549	ATCT	2	8	17307	17314	25 %	50 %	0 %	25 %	308171856
45	NC_014549	TGCC	2	8	17874	17881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014549	GCAA	2	8	18252	18259	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014549	CGCT	2	8	18269	18276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014549	GAAC	2	8	18527	18534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014549	GCGA	2	8	18855	18862	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014549	AGAC	2	8	18980	18987	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014549	GAAA	2	8	19381	19388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014549	GCCC	2	8	19805	19812	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_014549	AAAC	2	8	19821	19828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014549	CCAT	2	8	19888	19895	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014549	GACC	2	8	20018	20025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014549	ATGA	2	8	20216	20223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014549	CAGC	2	8	21661	21668	25 %	0 %	25 %	50 %	308171858
58	NC_014549	CAGC	2	8	21874	21881	25 %	0 %	25 %	50 %	308171858
59	NC_014549	TAAC	2	8	22942	22949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014549	TAAC	2	8	23012	23019	50 %	25 %	0 %	25 %	308171860
61	NC_014549	CATC	2	8	23588	23595	25 %	25 %	0 %	50 %	308171860
62	NC_014549	CCAT	2	8	25626	25633	25 %	25 %	0 %	50 %	308171863
63	NC_014549	GATG	2	8	26183	26190	25 %	25 %	50 %	0 %	308171864
64	NC_014549	GCGG	2	8	26896	26903	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014549	TCAG	2	8	26904	26911	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014549	CCAA	2	8	27300	27307	50 %	0 %	0 %	50 %	308171865
67	NC_014549	AAGC	2	8	27852	27859	50 %	0 %	25 %	25 %	308171866
68	NC_014549	CTGG	2	8	28088	28095	0 %	25 %	50 %	25 %	308171867
69	NC_014549	GACG	2	8	28862	28869	25 %	0 %	50 %	25 %	308171867
70	NC_014549	TGGC	2	8	28984	28991	0 %	25 %	50 %	25 %	308171867
71	NC_014549	CGTG	2	8	30337	30344	0 %	25 %	50 %	25 %	308171868
72	NC_014549	CATT	2	8	30654	30661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014549	GCTC	2	8	32219	32226	0 %	25 %	25 %	50 %	308171870
74	NC_014549	GCCA	2	8	32574	32581	25 %	0 %	25 %	50 %	308171871
75	NC_014549	TGCG	2	8	32590	32597	0 %	25 %	50 %	25 %	308171871
76	NC_014549	CCTT	2	8	33106	33113	0 %	50 %	0 %	50 %	308171871
77	NC_014549	ACGA	2	8	33141	33148	50 %	0 %	25 %	25 %	308171871
78	NC_014549	CAGC	2	8	33416	33423	25 %	0 %	25 %	50 %	308171871
79	NC_014549	GTCA	2	8	34340	34347	25 %	25 %	25 %	25 %	308171872
80	NC_014549	CGCC	2	8	34950	34957	0 %	0 %	25 %	75 %	308171872
81	NC_014549	TGAG	2	8	34972	34979	25 %	25 %	50 %	0 %	308171872
82	NC_014549	CTTC	2	8	35245	35252	0 %	50 %	0 %	50 %	308171872
83	NC_014549	CCAG	2	8	35424	35431	25 %	0 %	25 %	50 %	308171872
84	NC_014549	ACCA	2	8	35588	35595	50 %	0 %	0 %	50 %	308171872
85	NC_014549	ACTG	2	8	35682	35689	25 %	25 %	25 %	25 %	308171872
86	NC_014549	CCAC	2	8	35708	35715	25 %	0 %	0 %	75 %	308171872
87	NC_014549	GAGC	2	8	36282	36289	25 %	0 %	50 %	25 %	308171873
88	NC_014549	CCAC	2	8	36873	36880	25 %	0 %	0 %	75 %	308171873
89	NC_014549	GCCT	2	8	37448	37455	0 %	25 %	25 %	50 %	308171874
90	NC_014549	GGCA	2	8	37985	37992	25 %	0 %	50 %	25 %	308171874
91	NC_014549	AGCC	2	8	38142	38149	25 %	0 %	25 %	50 %	308171874
92	NC_014549	TGAA	2	8	38191	38198	50 %	25 %	25 %	0 %	308171874
93	NC_014549	CGCA	2	8	38762	38769	25 %	0 %	25 %	50 %	308171874
94	NC_014549	CAGC	2	8	39054	39061	25 %	0 %	25 %	50 %	308171874
95	NC_014549	CCAT	2	8	40527	40534	25 %	25 %	0 %	50 %	308171878
96	NC_014549	TGAC	2	8	40965	40972	25 %	25 %	25 %	25 %	308171879
97	NC_014549	GACC	2	8	42477	42484	25 %	0 %	25 %	50 %	308171881
98	NC_014549	TGGC	2	8	42589	42596	0 %	25 %	50 %	25 %	308171881
99	NC_014549	TCCT	2	8	43330	43337	0 %	50 %	0 %	50 %	308171882
100	NC_014549	TCCA	2	8	43816	43823	25 %	25 %	0 %	50 %	308171882
101	NC_014549	CTGG	2	8	44196	44203	0 %	25 %	50 %	25 %	308171882
102	NC_014549	TGCC	2	8	44345	44352	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014549	CGGG	2	8	44988	44995	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014549	GGCT	2	8	45065	45072	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014549	CGCC	2	8	45794	45801	0 %	0 %	25 %	75 %	308171884
106	NC_014549	CTGG	2	8	45807	45814	0 %	25 %	50 %	25 %	308171884
107	NC_014549	CTGC	2	8	45828	45835	0 %	25 %	25 %	50 %	308171884
108	NC_014549	TGGC	2	8	46303	46310	0 %	25 %	50 %	25 %	308171884
109	NC_014549	GAAC	2	8	46374	46381	50 %	0 %	25 %	25 %	308171884
110	NC_014549	GGTC	2	8	46452	46459	0 %	25 %	50 %	25 %	308171884
111	NC_014549	AGAA	2	8	46496	46503	75 %	0 %	25 %	0 %	308171884
112	NC_014549	CCGC	2	8	46525	46532	0 %	0 %	25 %	75 %	308171884
113	NC_014549	GGCA	2	8	46586	46593	25 %	0 %	50 %	25 %	308171884
114	NC_014549	TGGC	2	8	46727	46734	0 %	25 %	50 %	25 %	308171884
115	NC_014549	GACG	2	8	47367	47374	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014549	GCCG	2	8	47433	47440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014549	GACC	2	8	48032	48039	25 %	0 %	25 %	50 %	308171885
118	NC_014549	GGCA	2	8	48655	48662	25 %	0 %	50 %	25 %	308171886
119	NC_014549	TGGA	2	8	48708	48715	25 %	25 %	50 %	0 %	308171886

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.