MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetohalobium arabaticum DSM 5501 chromosome

Total Repeats: 2151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014378	TAAAA	2	10	243	252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014378	TAATT	2	10	533	542	40 %	60 %	0 %	0 %	302390798
3	NC_014378	ATTAT	2	10	853	862	40 %	60 %	0 %	0 %	302390798
4	NC_014378	ATTAA	2	10	1422	1431	60 %	40 %	0 %	0 %	302390798
5	NC_014378	AAATA	2	10	1682	1691	80 %	20 %	0 %	0 %	302390798
6	NC_014378	GTAGA	2	10	2129	2138	40 %	20 %	40 %	0 %	302390799
7	NC_014378	AAATT	2	10	2723	2732	60 %	40 %	0 %	0 %	302390799
8	NC_014378	AAAGA	2	10	4494	4503	80 %	0 %	20 %	0 %	302390802
9	NC_014378	ATTTA	2	10	4757	4766	40 %	60 %	0 %	0 %	302390802
10	NC_014378	ACTAA	2	10	4809	4818	60 %	20 %	0 %	20 %	302390802
11	NC_014378	AAAAG	2	10	5129	5138	80 %	0 %	20 %	0 %	302390802
12	NC_014378	ATTGA	2	10	7560	7569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014378	ATGAA	2	10	7631	7640	60 %	20 %	20 %	0 %	302390805
14	NC_014378	ATGCA	2	10	7736	7745	40 %	20 %	20 %	20 %	302390805
15	NC_014378	GGAAT	2	10	8477	8486	40 %	20 %	40 %	0 %	302390805
16	NC_014378	ACTGG	2	10	8881	8890	20 %	20 %	40 %	20 %	302390805
17	NC_014378	AGAAC	2	10	9451	9460	60 %	0 %	20 %	20 %	302390805
18	NC_014378	AGGTT	2	10	9530	9539	20 %	40 %	40 %	0 %	302390805
19	NC_014378	CAAGT	2	10	11241	11250	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014378	AAGAG	2	10	11307	11316	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014378	TCGTG	2	10	11721	11730	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014378	GGGAG	2	10	13047	13056	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014378	CAGAG	2	10	15241	15250	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014378	GATAA	2	10	15268	15277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014378	TAGTT	2	10	15822	15831	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014378	AAAGC	2	10	16429	16438	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014378	TAATT	2	10	17305	17314	40 %	60 %	0 %	0 %	302390807
28	NC_014378	ATTAT	2	10	17425	17434	40 %	60 %	0 %	0 %	302390807
29	NC_014378	ATTTA	2	10	19525	19534	40 %	60 %	0 %	0 %	302390810
30	NC_014378	AGTTT	2	10	20934	20943	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014378	CAGAA	2	10	23745	23754	60 %	0 %	20 %	20 %	302390814
32	NC_014378	ATATT	2	10	24257	24266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014378	TTTTA	2	10	25661	25670	20 %	80 %	0 %	0 %	302390819
34	NC_014378	CTTTA	2	10	26211	26220	20 %	60 %	0 %	20 %	302390819
35	NC_014378	TATTC	2	10	26791	26800	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014378	AAAGA	2	10	27925	27934	80 %	0 %	20 %	0 %	302390823
37	NC_014378	CGGAG	2	10	27987	27996	20 %	0 %	60 %	20 %	302390823
38	NC_014378	AAAGG	2	10	28918	28927	60 %	0 %	40 %	0 %	302390823
39	NC_014378	GAGTT	2	10	29626	29635	20 %	40 %	40 %	0 %	302390824
40	NC_014378	TCAAT	2	10	31576	31585	40 %	40 %	0 %	20 %	302390825
41	NC_014378	GGGAT	2	10	34137	34146	20 %	20 %	60 %	0 %	302390827
42	NC_014378	AATTG	2	10	34405	34414	40 %	40 %	20 %	0 %	302390827
43	NC_014378	TCTAT	2	10	37059	37068	20 %	60 %	0 %	20 %	302390831
44	NC_014378	ATTGG	2	10	41254	41263	20 %	40 %	40 %	0 %	302390836
45	NC_014378	TAAAT	2	10	43973	43982	60 %	40 %	0 %	0 %	302390838
46	NC_014378	AAAAG	2	10	46868	46877	80 %	0 %	20 %	0 %	302390841
47	NC_014378	AGTTA	2	10	50064	50073	40 %	40 %	20 %	0 %	302390846
48	NC_014378	GAAGA	2	10	53234	53243	60 %	0 %	40 %	0 %	302390849
49	NC_014378	AATGG	2	10	56214	56223	40 %	20 %	40 %	0 %	302390850
50	NC_014378	GATTT	2	10	57100	57109	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014378	TAAAT	2	10	57116	57125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014378	ATGAA	2	10	57802	57811	60 %	20 %	20 %	0 %	302390853
53	NC_014378	ATATT	2	10	58911	58920	40 %	60 %	0 %	0 %	302390854
54	NC_014378	TTAAT	2	10	60345	60354	40 %	60 %	0 %	0 %	302390856
55	NC_014378	GAAAT	2	10	64293	64302	60 %	20 %	20 %	0 %	302390859
56	NC_014378	AATGG	2	10	66260	66269	40 %	20 %	40 %	0 %	302390861
57	NC_014378	GGAAT	2	10	66731	66740	40 %	20 %	40 %	0 %	302390862
58	NC_014378	TATTT	2	10	67192	67201	20 %	80 %	0 %	0 %	302390862
59	NC_014378	TCTAT	2	10	68207	68216	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014378	AGGAT	2	10	69720	69729	40 %	20 %	40 %	0 %	302390863
61	NC_014378	TCAGA	2	10	70439	70448	40 %	20 %	20 %	20 %	302390864
62	NC_014378	ATTTT	2	10	70907	70916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014378	TTAGT	2	10	71621	71630	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014378	ATTTA	2	10	71716	71725	40 %	60 %	0 %	0 %	302390865
65	NC_014378	ATTAT	2	10	75672	75681	40 %	60 %	0 %	0 %	302390868
66	NC_014378	ATATA	2	10	77842	77851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014378	TGAGG	2	10	78208	78217	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014378	GAATT	2	10	78238	78247	40 %	40 %	20 %	0 %	302390871
69	NC_014378	TACTT	2	10	78479	78488	20 %	60 %	0 %	20 %	302390871
70	NC_014378	ATAGA	2	10	79036	79045	60 %	20 %	20 %	0 %	302390871
71	NC_014378	CCTGG	2	10	79734	79743	0 %	20 %	40 %	40 %	302390872
72	NC_014378	ATTTT	2	10	80289	80298	20 %	80 %	0 %	0 %	302390872
73	NC_014378	ACTAT	2	10	80838	80847	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014378	TTCTG	2	10	83718	83727	0 %	60 %	20 %	20 %	302390875
75	NC_014378	TGAAT	2	10	84808	84817	40 %	40 %	20 %	0 %	302390876
76	NC_014378	GAGAA	2	10	85758	85767	60 %	0 %	40 %	0 %	302390877
77	NC_014378	ATAGT	2	10	86705	86714	40 %	40 %	20 %	0 %	302390878
78	NC_014378	TGCAG	2	10	87151	87160	20 %	20 %	40 %	20 %	302390878
79	NC_014378	CAGCC	2	10	88060	88069	20 %	0 %	20 %	60 %	302390879
80	NC_014378	TTTCT	2	10	88210	88219	0 %	80 %	0 %	20 %	302390880
81	NC_014378	CTGTG	2	10	89222	89231	0 %	40 %	40 %	20 %	302390880
82	NC_014378	TATTC	2	10	90236	90245	20 %	60 %	0 %	20 %	302390882
83	NC_014378	AGAAA	2	10	90424	90433	80 %	0 %	20 %	0 %	302390882
84	NC_014378	TAAAA	2	10	90922	90931	80 %	20 %	0 %	0 %	302390882
85	NC_014378	AAAGT	2	10	92808	92817	60 %	20 %	20 %	0 %	302390883
86	NC_014378	GAGAA	2	10	92901	92910	60 %	0 %	40 %	0 %	302390883
87	NC_014378	AAGCC	2	10	93452	93461	40 %	0 %	20 %	40 %	302390884
88	NC_014378	TTATT	2	10	93794	93803	20 %	80 %	0 %	0 %	302390884
89	NC_014378	GAAGA	2	10	94359	94368	60 %	0 %	40 %	0 %	302390885
90	NC_014378	TGAAA	2	10	95522	95531	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014378	GGAAT	2	10	95834	95843	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014378	AATTT	2	10	97015	97024	40 %	60 %	0 %	0 %	302390888
93	NC_014378	TAAGA	2	10	100257	100266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014378	AAAGA	2	10	103682	103691	80 %	0 %	20 %	0 %	302390892
95	NC_014378	TGGAC	2	10	103947	103956	20 %	20 %	40 %	20 %	302390892
96	NC_014378	AATCA	2	10	104887	104896	60 %	20 %	0 %	20 %	302390893
97	NC_014378	AGAGG	2	10	104974	104983	40 %	0 %	60 %	0 %	302390893
98	NC_014378	ATTTT	2	10	106053	106062	20 %	80 %	0 %	0 %	302390895
99	NC_014378	TGAAT	2	10	106779	106788	40 %	40 %	20 %	0 %	302390897
100	NC_014378	AGATA	2	10	108549	108558	60 %	20 %	20 %	0 %	302390897
101	NC_014378	TAACT	2	10	108898	108907	40 %	40 %	0 %	20 %	302390897
102	NC_014378	AAAGA	2	10	110787	110796	80 %	0 %	20 %	0 %	302390900
103	NC_014378	TAAAG	2	10	111071	111080	60 %	20 %	20 %	0 %	302390900
104	NC_014378	TTAGC	2	10	111253	111262	20 %	40 %	20 %	20 %	302390900
105	NC_014378	AAAAT	2	10	112626	112635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014378	TCTGT	2	10	112975	112984	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014378	GGACT	2	10	114463	114472	20 %	20 %	40 %	20 %	302390903
108	NC_014378	AAACT	2	10	114602	114611	60 %	20 %	0 %	20 %	302390903
109	NC_014378	GGTAA	2	10	115657	115666	40 %	20 %	40 %	0 %	302390904
110	NC_014378	TTATT	2	10	115841	115850	20 %	80 %	0 %	0 %	302390904
111	NC_014378	GAAGT	2	10	117091	117100	40 %	20 %	40 %	0 %	302390904
112	NC_014378	GAGTG	2	10	117295	117304	20 %	20 %	60 %	0 %	302390904
113	NC_014378	GAAAA	2	10	120644	120653	80 %	0 %	20 %	0 %	302390907
114	NC_014378	TAAAA	2	10	122319	122328	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014378	ATTTT	2	10	124536	124545	20 %	80 %	0 %	0 %	302390909
116	NC_014378	AGGAA	2	10	125882	125891	60 %	0 %	40 %	0 %	302390910
117	NC_014378	AATAT	2	10	128198	128207	60 %	40 %	0 %	0 %	302390913
118	NC_014378	ATTAA	2	10	130157	130166	60 %	40 %	0 %	0 %	302390915
119	NC_014378	CAAGT	2	10	138426	138435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014378	AAGAG	2	10	138492	138501	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014378	TCGTG	2	10	138906	138915	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014378	GGGAG	2	10	140232	140241	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014378	CAGAG	2	10	142426	142435	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014378	GATAA	2	10	142453	142462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014378	TTAAG	2	10	143159	143168	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014378	CCTGA	2	10	143928	143937	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_014378	ATATT	2	10	144105	144114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014378	ATAGA	2	10	144265	144274	60 %	20 %	20 %	0 %	302390924
129	NC_014378	AGGAT	2	10	146076	146085	40 %	20 %	40 %	0 %	302390926
130	NC_014378	CTGAA	2	10	148444	148453	40 %	20 %	20 %	20 %	302390927
131	NC_014378	TTACT	2	10	149388	149397	20 %	60 %	0 %	20 %	302390928
132	NC_014378	TGAAA	2	10	149724	149733	60 %	20 %	20 %	0 %	302390928
133	NC_014378	ATTAA	2	10	155015	155024	60 %	40 %	0 %	0 %	302390934
134	NC_014378	TTCTA	2	10	156796	156805	20 %	60 %	0 %	20 %	302390935
135	NC_014378	GATTT	2	10	157055	157064	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014378	TTAGA	2	10	159657	159666	40 %	40 %	20 %	0 %	302390938
137	NC_014378	AATAG	2	10	159703	159712	60 %	20 %	20 %	0 %	302390938
138	NC_014378	TCAAT	2	10	160027	160036	40 %	40 %	0 %	20 %	302390939
139	NC_014378	AAAAG	2	10	163632	163641	80 %	0 %	20 %	0 %	302390943
140	NC_014378	AGAGA	2	10	164488	164497	60 %	0 %	40 %	0 %	302390943
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270	NC_014378	GATTA	2	10	347559	347568	40 %	40 %	20 %	0 %	302391115
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