MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidilobus saccharovorans 345-15 chromosome

Total Repeats: 1010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014374	CCCCT	2	10	1726	1735	0 %	20 %	0 %	80 %	302347804
2	NC_014374	CCAGG	2	10	2298	2307	20 %	0 %	40 %	40 %	302347805
3	NC_014374	GGCCC	2	10	2533	2542	0 %	0 %	40 %	60 %	302347805
4	NC_014374	AGTCG	2	10	3420	3429	20 %	20 %	40 %	20 %	302347807
5	NC_014374	CTGGC	2	10	4796	4805	0 %	20 %	40 %	40 %	302347809
6	NC_014374	GCCTC	2	10	5196	5205	0 %	20 %	20 %	60 %	302347809
7	NC_014374	CTCAG	2	10	5306	5315	20 %	20 %	20 %	40 %	302347809
8	NC_014374	GCTGA	2	10	5323	5332	20 %	20 %	40 %	20 %	302347809
9	NC_014374	GCCCT	2	10	7190	7199	0 %	20 %	20 %	60 %	302347810
10	NC_014374	TTGCC	2	10	12569	12578	0 %	40 %	20 %	40 %	302347814
11	NC_014374	CTCAC	2	10	12804	12813	20 %	20 %	0 %	60 %	302347815
12	NC_014374	TTTTG	2	10	16314	16323	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014374	AGTTC	2	10	16804	16813	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014374	GCACG	2	10	17854	17863	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014374	TGGCG	2	10	18436	18445	0 %	20 %	60 %	20 %	302347818
16	NC_014374	ACGCC	2	10	24394	24403	20 %	0 %	20 %	60 %	302347822
17	NC_014374	GCCTC	2	10	26228	26237	0 %	20 %	20 %	60 %	302347823
18	NC_014374	CCTCT	2	10	27978	27987	0 %	40 %	0 %	60 %	302347824
19	NC_014374	ACCCT	2	10	29019	29028	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_014374	AGGCC	2	10	29580	29589	20 %	0 %	40 %	40 %	302347825
21	NC_014374	GAGCA	2	10	35844	35853	40 %	0 %	40 %	20 %	302347831
22	NC_014374	GGAGG	2	10	37272	37281	20 %	0 %	80 %	0 %	302347832
23	NC_014374	GGTCA	2	10	38941	38950	20 %	20 %	40 %	20 %	302347835
24	NC_014374	CTCAG	2	10	39608	39617	20 %	20 %	20 %	40 %	302347837
25	NC_014374	GGGGC	2	10	41711	41720	0 %	0 %	80 %	20 %	302347839
26	NC_014374	CCTGG	2	10	44416	44425	0 %	20 %	40 %	40 %	302347842
27	NC_014374	CAGGG	2	10	44567	44576	20 %	0 %	60 %	20 %	302347842
28	NC_014374	GGCCT	2	10	49475	49484	0 %	20 %	40 %	40 %	302347848
29	NC_014374	CGAGG	2	10	51271	51280	20 %	0 %	60 %	20 %	302347850
30	NC_014374	CCAGG	2	10	51892	51901	20 %	0 %	40 %	40 %	302347850
31	NC_014374	GTATG	2	10	54323	54332	20 %	40 %	40 %	0 %	302347851
32	NC_014374	CCTGG	2	10	55689	55698	0 %	20 %	40 %	40 %	302347852
33	NC_014374	TGGCG	2	10	55797	55806	0 %	20 %	60 %	20 %	302347852
34	NC_014374	ACGGC	2	10	56761	56770	20 %	0 %	40 %	40 %	302347853
35	NC_014374	CCGAG	2	10	58704	58713	20 %	0 %	40 %	40 %	302347854
36	NC_014374	TCGGC	2	10	59336	59345	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014374	TAAAA	2	10	60530	60539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014374	CGTTG	2	10	63001	63010	0 %	40 %	40 %	20 %	302347861
39	NC_014374	AGGCC	2	10	63894	63903	20 %	0 %	40 %	40 %	302347862
40	NC_014374	GCCGT	2	10	66331	66340	0 %	20 %	40 %	40 %	302347863
41	NC_014374	CCAGG	2	10	69494	69503	20 %	0 %	40 %	40 %	302347866
42	NC_014374	TGGCC	2	10	70877	70886	0 %	20 %	40 %	40 %	302347867
43	NC_014374	GGGCG	2	10	73112	73121	0 %	0 %	80 %	20 %	302347870
44	NC_014374	CTGGA	2	10	76157	76166	20 %	20 %	40 %	20 %	302347874
45	NC_014374	GTTGA	2	10	77322	77331	20 %	40 %	40 %	0 %	302347875
46	NC_014374	GTTGA	2	10	77472	77481	20 %	40 %	40 %	0 %	302347875
47	NC_014374	AGCTC	2	10	81982	81991	20 %	20 %	20 %	40 %	302347876
48	NC_014374	GACGT	2	10	83193	83202	20 %	20 %	40 %	20 %	302347876
49	NC_014374	GCCCG	2	10	84163	84172	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_014374	TCGCT	2	10	86241	86250	0 %	40 %	20 %	40 %	302347879
51	NC_014374	GGCCA	2	10	89641	89650	20 %	0 %	40 %	40 %	302347882
52	NC_014374	AGGAG	2	10	90120	90129	40 %	0 %	60 %	0 %	302347882
53	NC_014374	GGCCT	2	10	93353	93362	0 %	20 %	40 %	40 %	302347885
54	NC_014374	GGCCT	2	10	93994	94003	0 %	20 %	40 %	40 %	302347885
55	NC_014374	AGTTG	2	10	98817	98826	20 %	40 %	40 %	0 %	302347889
56	NC_014374	GGTTG	2	10	99096	99105	0 %	40 %	60 %	0 %	302347889
57	NC_014374	CCACG	2	10	101778	101787	20 %	0 %	20 %	60 %	302347892
58	NC_014374	GTCAA	2	10	102217	102226	40 %	20 %	20 %	20 %	302347892
59	NC_014374	TGCCA	2	10	102240	102249	20 %	20 %	20 %	40 %	302347892
60	NC_014374	GAGGT	2	10	102325	102334	20 %	20 %	60 %	0 %	302347892
61	NC_014374	CCTCC	2	10	102880	102889	0 %	20 %	0 %	80 %	302347893
62	NC_014374	GCCCT	2	10	104820	104829	0 %	20 %	20 %	60 %	302347896
63	NC_014374	GAGAG	2	10	105770	105779	40 %	0 %	60 %	0 %	302347897
64	NC_014374	GTCAA	2	10	106073	106082	40 %	20 %	20 %	20 %	302347897
65	NC_014374	CCACA	2	10	107074	107083	40 %	0 %	0 %	60 %	302347899
66	NC_014374	GCCTG	2	10	107667	107676	0 %	20 %	40 %	40 %	302347899
67	NC_014374	GCAGG	2	10	108579	108588	20 %	0 %	60 %	20 %	302347900
68	NC_014374	GGCCA	2	10	108767	108776	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014374	GCCCT	2	10	110411	110420	0 %	20 %	20 %	60 %	302347901
70	NC_014374	CCCCT	2	10	111468	111477	0 %	20 %	0 %	80 %	302347902
71	NC_014374	ACCTC	2	10	112011	112020	20 %	20 %	0 %	60 %	302347902
72	NC_014374	CCTGG	2	10	112030	112039	0 %	20 %	40 %	40 %	302347902
73	NC_014374	CCCTC	2	10	112962	112971	0 %	20 %	0 %	80 %	302347903
74	NC_014374	TGGCA	2	10	113802	113811	20 %	20 %	40 %	20 %	302347904
75	NC_014374	AGGGC	2	10	115775	115784	20 %	0 %	60 %	20 %	302347906
76	NC_014374	GCGTC	2	10	115883	115892	0 %	20 %	40 %	40 %	302347906
77	NC_014374	GAGCC	2	10	116032	116041	20 %	0 %	40 %	40 %	302347906
78	NC_014374	TCCCC	2	10	117279	117288	0 %	20 %	0 %	80 %	302347907
79	NC_014374	CTGGT	2	10	117421	117430	0 %	40 %	40 %	20 %	302347907
80	NC_014374	CTCAT	2	10	119442	119451	20 %	40 %	0 %	40 %	302347908
81	NC_014374	AGAGG	2	10	120484	120493	40 %	0 %	60 %	0 %	302347910
82	NC_014374	TGAGG	2	10	124718	124727	20 %	20 %	60 %	0 %	302347915
83	NC_014374	CAGCT	2	10	125847	125856	20 %	20 %	20 %	40 %	302347917
84	NC_014374	AGGCT	2	10	126746	126755	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014374	TAAGG	2	10	127009	127018	40 %	20 %	40 %	0 %	302347918
86	NC_014374	TCAGG	2	10	127062	127071	20 %	20 %	40 %	20 %	302347918
87	NC_014374	GCCCT	2	10	127598	127607	0 %	20 %	20 %	60 %	302347918
88	NC_014374	CTCCC	2	10	127707	127716	0 %	20 %	0 %	80 %	302347919
89	NC_014374	GGCCC	2	10	128305	128314	0 %	0 %	40 %	60 %	302347919
90	NC_014374	CAGGT	2	10	129680	129689	20 %	20 %	40 %	20 %	302347920
91	NC_014374	GCAGG	2	10	130967	130976	20 %	0 %	60 %	20 %	302347921
92	NC_014374	GCTCG	2	10	135155	135164	0 %	20 %	40 %	40 %	302347925
93	NC_014374	GCCTC	2	10	136079	136088	0 %	20 %	20 %	60 %	302347926
94	NC_014374	GGCCT	2	10	136171	136180	0 %	20 %	40 %	40 %	302347926
95	NC_014374	GAAGA	2	10	138833	138842	60 %	0 %	40 %	0 %	302347930
96	NC_014374	GAGGG	2	10	139154	139163	20 %	0 %	80 %	0 %	302347930
97	NC_014374	CCTGA	2	10	139508	139517	20 %	20 %	20 %	40 %	302347930
98	NC_014374	GCAGG	2	10	139978	139987	20 %	0 %	60 %	20 %	302347931
99	NC_014374	GAAGG	2	10	140027	140036	40 %	0 %	60 %	0 %	302347931
100	NC_014374	AGGTA	2	10	140424	140433	40 %	20 %	40 %	0 %	302347931
101	NC_014374	GATGA	2	10	142835	142844	40 %	20 %	40 %	0 %	302347931
102	NC_014374	TCCCT	2	10	143479	143488	0 %	40 %	0 %	60 %	302347932
103	NC_014374	GAGCT	2	10	146703	146712	20 %	20 %	40 %	20 %	302347938
104	NC_014374	CCGGC	2	10	148618	148627	0 %	0 %	40 %	60 %	302347939
105	NC_014374	TGGGC	2	10	151657	151666	0 %	20 %	60 %	20 %	302347943
106	NC_014374	GGTGG	2	10	155073	155082	0 %	20 %	80 %	0 %	302347947
107	NC_014374	GCCCT	2	10	156763	156772	0 %	20 %	20 %	60 %	302347949
108	NC_014374	CTGCC	2	10	159353	159362	0 %	20 %	20 %	60 %	302347953
109	NC_014374	AGCCC	2	10	162820	162829	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_014374	CCTGA	2	10	164018	164027	20 %	20 %	20 %	40 %	302347957
111	NC_014374	GCTTT	2	10	165536	165545	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014374	TACTT	2	10	166516	166525	20 %	60 %	0 %	20 %	302347960
113	NC_014374	TGCCC	2	10	168000	168009	0 %	20 %	20 %	60 %	302347962
114	NC_014374	GGCCT	2	10	169135	169144	0 %	20 %	40 %	40 %	302347963
115	NC_014374	GAGCC	2	10	171654	171663	20 %	0 %	40 %	40 %	302347966
116	NC_014374	GGAAA	2	10	172914	172923	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014374	GGGGT	2	10	173162	173171	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014374	CTACG	2	10	173808	173817	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014374	CCTGG	2	10	174238	174247	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014374	AGGCC	2	10	174488	174497	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_014374	CACGG	2	10	174522	174531	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_014374	CGCGG	2	10	175668	175677	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014374	CGAGC	2	10	176047	176056	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_014374	GCGCC	2	10	177688	177697	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_014374	CTCAC	2	10	179056	179065	20 %	20 %	0 %	60 %	302347971
126	NC_014374	AAGCT	2	10	180475	180484	40 %	20 %	20 %	20 %	302347972
127	NC_014374	CCAGC	2	10	180767	180776	20 %	0 %	20 %	60 %	302347972
128	NC_014374	CCTCT	2	10	182270	182279	0 %	40 %	0 %	60 %	302347974
129	NC_014374	GGCCT	2	10	183053	183062	0 %	20 %	40 %	40 %	302347975
130	NC_014374	CCGAG	2	10	183744	183753	20 %	0 %	40 %	40 %	302347975
131	NC_014374	TGAGG	2	10	183819	183828	20 %	20 %	60 %	0 %	302347975
132	NC_014374	CCGCC	2	10	185585	185594	0 %	0 %	20 %	80 %	302347977
133	NC_014374	CTTCT	2	10	188316	188325	0 %	60 %	0 %	40 %	302347980
134	NC_014374	CCCTC	2	10	194156	194165	0 %	20 %	0 %	80 %	302347986
135	NC_014374	CCCCA	2	10	194244	194253	20 %	0 %	0 %	80 %	302347986
136	NC_014374	AGCCT	2	10	196229	196238	20 %	20 %	20 %	40 %	302347988
137	NC_014374	AGCCC	2	10	199070	199079	20 %	0 %	20 %	60 %	302347993
138	NC_014374	GGCCT	2	10	200865	200874	0 %	20 %	40 %	40 %	302347995
139	NC_014374	TAGCT	2	10	204209	204218	20 %	40 %	20 %	20 %	302347999
140	NC_014374	ATCAT	2	10	204868	204877	40 %	40 %	0 %	20 %	302348000
141	NC_014374	CGCCT	2	10	205584	205593	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
142	NC_014374	GCCAC	2	10	206267	206276	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_014374	AGGCA	2	10	206328	206337	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014374	TCTAT	2	10	206725	206734	20 %	60 %	0 %	20 %	302348003
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146	NC_014374	TATCA	2	10	208513	208522	40 %	40 %	0 %	20 %	302348006
147	NC_014374	TAGTT	2	10	212545	212554	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_014374	CCGAG	2	10	218950	218959	20 %	0 %	40 %	40 %	302348016
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160	NC_014374	CTTCA	2	10	234032	234041	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
161	NC_014374	AGCCT	2	10	235166	235175	20 %	20 %	20 %	40 %	302348038
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163	NC_014374	GAACT	2	10	237251	237260	40 %	20 %	20 %	20 %	302348040
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175	NC_014374	TGGCT	2	10	248142	248151	0 %	40 %	40 %	20 %	302348048
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180	NC_014374	GGACG	2	10	250838	250847	20 %	0 %	60 %	20 %	302348051
181	NC_014374	CTCAG	2	10	250863	250872	20 %	20 %	20 %	40 %	302348051
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232	NC_014374	TGGTG	2	10	308994	309003	0 %	40 %	60 %	0 %	302348114
233	NC_014374	CTGAG	2	10	311951	311960	20 %	20 %	40 %	20 %	302348117
234	NC_014374	TAACT	2	10	314510	314519	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
235	NC_014374	GCGCT	2	10	319125	319134	0 %	20 %	40 %	40 %	302348123
236	NC_014374	ATGTA	2	10	320657	320666	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
237	NC_014374	TCATG	2	10	321230	321239	20 %	40 %	20 %	20 %	302348125
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241	NC_014374	TAGCA	2	10	327739	327748	40 %	20 %	20 %	20 %	302348131
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245	NC_014374	TACGT	2	10	335213	335222	20 %	40 %	20 %	20 %	302348137
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248	NC_014374	AGGCG	2	10	335878	335887	20 %	0 %	60 %	20 %	302348137
249	NC_014374	TCCTC	2	10	336055	336064	0 %	40 %	0 %	60 %	302348137
250	NC_014374	TAGAG	2	10	336856	336865	40 %	20 %	40 %	0 %	302348138
251	NC_014374	AGCAG	2	10	338881	338890	40 %	0 %	40 %	20 %	302348139
252	NC_014374	CTTGA	2	10	341452	341461	20 %	40 %	20 %	20 %	302348141
253	NC_014374	TCAAG	2	10	342466	342475	40 %	20 %	20 %	20 %	302348142
254	NC_014374	CAAAA	2	10	344169	344178	80 %	0 %	0 %	20 %	302348143
255	NC_014374	TCCTT	2	10	344839	344848	0 %	60 %	0 %	40 %	302348144
256	NC_014374	CATGG	2	10	345001	345010	20 %	20 %	40 %	20 %	302348144
257	NC_014374	CCCTG	2	10	346514	346523	0 %	20 %	20 %	60 %	302348145
258	NC_014374	CCTTA	2	10	347124	347133	20 %	40 %	0 %	40 %	302348145
259	NC_014374	TAAGG	2	10	353868	353877	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
260	NC_014374	CTGGC	2	10	354130	354139	0 %	20 %	40 %	40 %	302348151
261	NC_014374	GGCCT	2	10	355593	355602	0 %	20 %	40 %	40 %	302348152
262	NC_014374	CCATC	2	10	356589	356598	20 %	20 %	0 %	60 %	302348153
263	NC_014374	TCCAT	2	10	361281	361290	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
264	NC_014374	CCCTG	2	10	363683	363692	0 %	20 %	20 %	60 %	302348161
265	NC_014374	TTTCA	2	10	364384	364393	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
266	NC_014374	CTTTA	2	10	368696	368705	20 %	60 %	0 %	20 %	302348165
267	NC_014374	GCTTC	2	10	369110	369119	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
268	NC_014374	AGGGA	2	10	374275	374284	40 %	0 %	60 %	0 %	302348168
269	NC_014374	ACGTA	2	10	375473	375482	40 %	20 %	20 %	20 %	302348169
270	NC_014374	CCTTA	2	10	375700	375709	20 %	40 %	0 %	40 %	302348169
271	NC_014374	CCATG	2	10	380057	380066	20 %	20 %	20 %	40 %	302348174
272	NC_014374	CAGGC	2	10	385170	385179	20 %	0 %	40 %	40 %	302348179
273	NC_014374	AGCTG	2	10	388462	388471	20 %	20 %	40 %	20 %	302348182
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278	NC_014374	TGTAG	2	10	394055	394064	20 %	40 %	40 %	0 %	302348189
279	NC_014374	GCTGA	2	10	398659	398668	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
280	NC_014374	TTACC	2	10	399336	399345	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
281	NC_014374	GCTGC	2	10	402566	402575	0 %	20 %	40 %	40 %	302348199
282	NC_014374	GCTCC	2	10	403182	403191	0 %	20 %	20 %	60 %	302348200
283	NC_014374	AGAGC	2	10	407004	407013	40 %	0 %	40 %	20 %	302348203
284	NC_014374	GCCCT	2	10	407188	407197	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
285	NC_014374	GTCAG	2	10	408575	408584	20 %	20 %	40 %	20 %	302348205
286	NC_014374	CCCCT	2	10	410143	410152	0 %	20 %	0 %	80 %	302348206
287	NC_014374	CTTGG	2	10	410632	410641	0 %	40 %	40 %	20 %	302348206
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289	NC_014374	GTTAA	2	10	414115	414124	40 %	40 %	20 %	0 %	302348210
290	NC_014374	TTAAG	2	10	417308	417317	40 %	40 %	20 %	0 %	302348213
291	NC_014374	CTTGA	2	10	421614	421623	20 %	40 %	20 %	20 %	302348216
292	NC_014374	TAAAA	3	15	421889	421903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_014374	TACCC	2	10	422713	422722	20 %	20 %	0 %	60 %	302348218
294	NC_014374	GGAAG	2	10	425577	425586	40 %	0 %	60 %	0 %	302348220
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296	NC_014374	GCTGG	2	10	429999	430008	0 %	20 %	60 %	20 %	302348228
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299	NC_014374	TCAGA	2	10	432047	432056	40 %	20 %	20 %	20 %	302348230
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312	NC_014374	TCCTC	2	10	445330	445339	0 %	40 %	0 %	60 %	302348238
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330	NC_014374	AGGAA	2	10	484386	484395	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
331	NC_014374	CGTGA	2	10	484526	484535	20 %	20 %	40 %	20 %	302348284
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339	NC_014374	CCTTG	2	10	494250	494259	0 %	40 %	20 %	40 %	302348294
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382	NC_014374	AGGAG	2	10	541908	541917	40 %	0 %	60 %	0 %	302348346
383	NC_014374	CTTTT	2	10	543097	543106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
384	NC_014374	CGGCG	2	10	546414	546423	0 %	0 %	60 %	40 %	302348351
385	NC_014374	CTCGC	2	10	547072	547081	0 %	20 %	20 %	60 %	302348351
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388	NC_014374	CCCTG	2	10	549697	549706	0 %	20 %	20 %	60 %	302348352
389	NC_014374	GCTCA	2	10	549962	549971	20 %	20 %	20 %	40 %	302348352
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392	NC_014374	CTCGT	2	10	553425	553434	0 %	40 %	20 %	40 %	302348356
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396	NC_014374	GGCAG	2	10	563298	563307	20 %	0 %	60 %	20 %	302348367
397	NC_014374	GATGA	2	10	563544	563553	40 %	20 %	40 %	0 %	302348367
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499	NC_014374	CCTCC	2	10	714161	714170	0 %	20 %	0 %	80 %	302348505
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