MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Aciduliprofundum boonei T469 chromosome

Total Repeats: 576

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013926	TTTACT	2	12	1285355	1285366	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	289597014
502	NC_013926	ATGGAT	2	12	1287710	1287721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597016
503	NC_013926	ATACAA	2	12	1291260	1291271	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	289597018
504	NC_013926	CCCTAT	3	18	1291306	1291323	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	289597018
505	NC_013926	AGGGAG	2	12	1291451	1291462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289597018
506	NC_013926	GCAATA	2	12	1297702	1297713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289597025
507	NC_013926	CATTAT	2	12	1302059	1302070	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289597032
508	NC_013926	TAGAAT	2	12	1303517	1303528	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289597034
509	NC_013926	CTATGG	2	12	1304926	1304937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289597036
510	NC_013926	GTGGAT	2	12	1305360	1305371	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	289597036
511	NC_013926	GGCCCT	2	12	1305650	1305661	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289597036
512	NC_013926	AATGTT	2	12	1309649	1309660	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289597040
513	NC_013926	ATCAAA	2	12	1315701	1315712	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	289597049
514	NC_013926	ATGGGC	2	12	1318580	1318591	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289597053
515	NC_013926	GGATGA	2	12	1319805	1319816	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	289597054
516	NC_013926	GGAAAA	2	12	1322535	1322546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597054
517	NC_013926	GCAATA	2	12	1323191	1323202	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289597055
518	NC_013926	AAATTC	2	12	1323608	1323619	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289597055
519	NC_013926	CAGGTA	2	12	1324817	1324828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289597057
520	NC_013926	GAAGTT	2	12	1325487	1325498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597058
521	NC_013926	TTTCTT	2	12	1330364	1330375	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	289597062
522	NC_013926	GCCACC	2	12	1338734	1338745	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	289597073
523	NC_013926	ATACGC	2	12	1338839	1338850	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289597073
524	NC_013926	AAAGAT	2	12	1339233	1339244	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289597074
525	NC_013926	TAGAAA	2	12	1340083	1340094	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289597074
526	NC_013926	TTTTAA	2	12	1344736	1344747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289597080
527	NC_013926	TTAAAA	2	12	1344771	1344782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597080
528	NC_013926	ATGAGC	2	12	1344925	1344936	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289597080
529	NC_013926	CAAGCA	2	12	1345446	1345457	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	289597080
530	NC_013926	AAAGAA	2	12	1345863	1345874	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289597081
531	NC_013926	AAACGA	2	12	1357828	1357839	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	289597095
532	NC_013926	TTCTAT	2	12	1358219	1358230	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	289597096
533	NC_013926	AATTCT	2	12	1358734	1358745	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289597096
534	NC_013926	AGGAAT	2	12	1359073	1359084	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013926	AAAAGA	2	12	1359975	1359986	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289597097
536	NC_013926	ATAGCC	2	12	1367311	1367322	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289597104
537	NC_013926	GAGAAT	2	12	1368168	1368179	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289597105
538	NC_013926	TGAATT	2	12	1371254	1371265	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289597108
539	NC_013926	ATAGAA	2	12	1372956	1372967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289597109
540	NC_013926	GCAGCG	2	12	1374024	1374035	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289597110
541	NC_013926	ACAAAA	2	12	1381014	1381025	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	289597117
542	NC_013926	AAATTT	2	12	1381430	1381441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013926	TAAAAA	2	12	1381961	1381972	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289597118
544	NC_013926	TCTCAA	2	12	1385531	1385542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289597120
545	NC_013926	ATCCAC	2	12	1386036	1386047	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	289597120
546	NC_013926	TTCAAA	2	12	1390638	1390649	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289597126
547	NC_013926	TTTCAA	2	12	1396880	1396891	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289597132
548	NC_013926	ACAATA	2	12	1400066	1400077	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	289597134
549	NC_013926	AACCAT	2	12	1400628	1400639	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	289597134
550	NC_013926	ATTCTC	2	12	1410431	1410442	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	289597141
551	NC_013926	AACTTT	2	12	1410802	1410813	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289597141
552	NC_013926	GTTCTT	2	12	1413879	1413890	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	289597142
553	NC_013926	GTTAAA	2	12	1418875	1418886	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289597148
554	NC_013926	GGGGTA	2	12	1422967	1422978	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_013926	TTGCAA	2	12	1426567	1426578	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289597153
556	NC_013926	CCATAT	2	12	1427067	1427078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289597154
557	NC_013926	TACATA	2	12	1431927	1431938	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289597155
558	NC_013926	GATGTG	2	12	1432072	1432083	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	289597155
559	NC_013926	AGCATA	2	12	1437576	1437587	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289597161
560	NC_013926	GTCAAA	2	12	1439049	1439060	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289597164
561	NC_013926	ATAGCC	2	12	1439409	1439420	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289597165
562	NC_013926	ATAATT	2	12	1442745	1442756	50 %	50 %	0 %	0 %	289597168
563	NC_013926	GTAAAT	2	12	1444891	1444902	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289597170
564	NC_013926	TTTAAC	2	12	1445318	1445329	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289597171
565	NC_013926	CTTTAC	2	12	1445347	1445358	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	289597171
566	NC_013926	CCGCAT	2	12	1446433	1446444	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289597173
567	NC_013926	TCTTCC	2	12	1453704	1453715	0 %	50 %	0 %	50 %	289597189
568	NC_013926	ATCCGC	2	12	1454214	1454225	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289597190
569	NC_013926	TTCTCT	2	12	1454666	1454677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597191
570	NC_013926	ACCCTT	2	12	1455918	1455929	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	289597193
571	NC_013926	TGATAA	2	12	1468549	1468560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013926	TTCTTT	2	12	1469820	1469831	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	289597209
573	NC_013926	TAATTT	2	12	1477646	1477657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289597217
574	NC_013926	GTAATA	2	12	1478402	1478413	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289597218
575	NC_013926	ATTATC	2	12	1480428	1480439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289597218
576	NC_013926	AAAATT	2	12	1486455	1486466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597222

< Previous 12Next >