MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN02

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013862	CTTG	2	8	177	184	0 %	50 %	25 %	25 %	288986932
2	NC_013862	AGCA	2	8	455	462	50 %	0 %	25 %	25 %	288986932
3	NC_013862	GATG	2	8	636	643	25 %	25 %	50 %	0 %	288986932
4	NC_013862	ATCC	2	8	1749	1756	25 %	25 %	0 %	50 %	288986936
5	NC_013862	AGTC	2	8	2006	2013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013862	GGCA	2	8	2679	2686	25 %	0 %	50 %	25 %	288986937
7	NC_013862	CGGA	2	8	3005	3012	25 %	0 %	50 %	25 %	288986937
8	NC_013862	GGAG	2	8	3064	3071	25 %	0 %	75 %	0 %	288986937
9	NC_013862	GATC	2	8	3639	3646	25 %	25 %	25 %	25 %	288986937
10	NC_013862	GATG	2	8	4112	4119	25 %	25 %	50 %	0 %	288986939
11	NC_013862	ACGC	2	8	5352	5359	25 %	0 %	25 %	50 %	288986940
12	NC_013862	CCGA	2	8	5886	5893	25 %	0 %	25 %	50 %	288986941
13	NC_013862	TGCG	2	8	6174	6181	0 %	25 %	50 %	25 %	288986942
14	NC_013862	ATCA	2	8	6903	6910	50 %	25 %	0 %	25 %	288986944
15	NC_013862	CTGG	2	8	7433	7440	0 %	25 %	50 %	25 %	288986944
16	NC_013862	CCTG	2	8	8180	8187	0 %	25 %	25 %	50 %	288986944
17	NC_013862	ATGT	2	8	8736	8743	25 %	50 %	25 %	0 %	288986944
18	NC_013862	CGAA	2	8	9631	9638	50 %	0 %	25 %	25 %	288986944
19	NC_013862	GATA	2	8	10030	10037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013862	AAAG	2	8	10136	10143	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013862	AGAA	2	8	10163	10170	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013862	GATA	2	8	10275	10282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013862	CGCA	2	8	11433	11440	25 %	0 %	25 %	50 %	288986946
24	NC_013862	CGAT	2	8	11535	11542	25 %	25 %	25 %	25 %	288986946
25	NC_013862	TGAA	2	8	11658	11665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013862	CGTG	2	8	11671	11678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013862	ATCG	2	8	11763	11770	25 %	25 %	25 %	25 %	288986947
28	NC_013862	ACGA	2	8	11965	11972	50 %	0 %	25 %	25 %	288986947
29	NC_013862	AGTG	2	8	12120	12127	25 %	25 %	50 %	0 %	288986947
30	NC_013862	GATT	2	8	12437	12444	25 %	50 %	25 %	0 %	288986948
31	NC_013862	CAAA	2	8	12565	12572	75 %	0 %	0 %	25 %	288986948
32	NC_013862	AGTT	2	8	13614	13621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013862	CGCC	2	8	13924	13931	0 %	0 %	25 %	75 %	288986949
34	NC_013862	GTCC	2	8	14952	14959	0 %	25 %	25 %	50 %	288986949
35	NC_013862	GTCG	2	8	15206	15213	0 %	25 %	50 %	25 %	288986950
36	NC_013862	ATCC	2	8	15273	15280	25 %	25 %	0 %	50 %	288986950
37	NC_013862	GATC	2	8	15391	15398	25 %	25 %	25 %	25 %	288986950
38	NC_013862	AGTC	2	8	16514	16521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013862	GGAT	2	8	16599	16606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013862	TGTA	2	8	16687	16694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013862	ATGT	2	8	16889	16896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013862	ATGA	2	8	16960	16967	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013862	AACG	2	8	18436	18443	50 %	0 %	25 %	25 %	288986953
44	NC_013862	CGGG	2	8	18573	18580	0 %	0 %	75 %	25 %	288986953
45	NC_013862	CCGT	2	8	18749	18756	0 %	25 %	25 %	50 %	288986953
46	NC_013862	CGAC	2	8	18759	18766	25 %	0 %	25 %	50 %	288986953
47	NC_013862	GTCA	2	8	19026	19033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013862	CGAT	2	8	19082	19089	25 %	25 %	25 %	25 %	288986954
49	NC_013862	TGGT	2	8	19528	19535	0 %	50 %	50 %	0 %	288986954
50	NC_013862	TCTG	2	8	19574	19581	0 %	50 %	25 %	25 %	288986954
51	NC_013862	TTCA	2	8	19597	19604	25 %	50 %	0 %	25 %	288986954
52	NC_013862	CTGG	2	8	20596	20603	0 %	25 %	50 %	25 %	288986955
53	NC_013862	GGTC	2	8	21162	21169	0 %	25 %	50 %	25 %	288986956
54	NC_013862	CCGA	2	8	21420	21427	25 %	0 %	25 %	50 %	288986956
55	NC_013862	CGGT	2	8	21965	21972	0 %	25 %	50 %	25 %	288986957
56	NC_013862	CTGT	2	8	22172	22179	0 %	50 %	25 %	25 %	288986957
57	NC_013862	GTTC	2	8	22394	22401	0 %	50 %	25 %	25 %	288986957
58	NC_013862	GCGG	2	8	22424	22431	0 %	0 %	75 %	25 %	288986957
59	NC_013862	CGTT	2	8	22521	22528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013862	GCAC	2	8	23049	23056	25 %	0 %	25 %	50 %	288986958
61	NC_013862	AGCG	2	8	23705	23712	25 %	0 %	50 %	25 %	288986958
62	NC_013862	CATC	2	8	24410	24417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013862	CCAT	2	8	24825	24832	25 %	25 %	0 %	50 %	288986959
64	NC_013862	AAGA	2	8	25357	25364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013862	AAAG	2	8	25405	25412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013862	CGAC	2	8	25975	25982	25 %	0 %	25 %	50 %	288986960
67	NC_013862	CTTG	2	8	27217	27224	0 %	50 %	25 %	25 %	288986963
68	NC_013862	ATTC	2	8	27773	27780	25 %	50 %	0 %	25 %	288986964
69	NC_013862	TAAA	2	8	29514	29521	75 %	25 %	0 %	0 %	288986965
70	NC_013862	TAAC	2	8	29669	29676	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013862	GTTG	2	8	30293	30300	0 %	50 %	50 %	0 %	288986966
72	NC_013862	TAGC	2	8	30800	30807	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013862	GACA	2	8	32706	32713	50 %	0 %	25 %	25 %	288986970
74	NC_013862	GTGC	2	8	32958	32965	0 %	25 %	50 %	25 %	288986970
75	NC_013862	GGCC	2	8	33301	33308	0 %	0 %	50 %	50 %	288986970
76	NC_013862	ACCG	2	8	33428	33435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013862	GTTT	2	8	33469	33476	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013862	TTTG	2	8	33498	33505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013862	TCGA	2	8	33790	33797	25 %	25 %	25 %	25 %	288986971
80	NC_013862	TGGC	2	8	34563	34570	0 %	25 %	50 %	25 %	288986972
81	NC_013862	GACG	2	8	34914	34921	25 %	0 %	50 %	25 %	288986973
82	NC_013862	ACCT	2	8	35017	35024	25 %	25 %	0 %	50 %	288986973
83	NC_013862	CGAT	2	8	35317	35324	25 %	25 %	25 %	25 %	288986974
84	NC_013862	TTGA	2	8	35396	35403	25 %	50 %	25 %	0 %	288986974
85	NC_013862	GGTA	2	8	35845	35852	25 %	25 %	50 %	0 %	288986974
86	NC_013862	TAAA	2	8	36397	36404	75 %	25 %	0 %	0 %	288986975
87	NC_013862	GTTT	2	8	36841	36848	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013862	TGAT	2	8	36853	36860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013862	CTGC	2	8	37483	37490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013862	GCTC	2	8	38276	38283	0 %	25 %	25 %	50 %	288986978
91	NC_013862	GGTT	2	8	38797	38804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013862	CAAG	2	8	39253	39260	50 %	0 %	25 %	25 %	288986979
93	NC_013862	TGAT	2	8	39870	39877	25 %	50 %	25 %	0 %	288986979

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.