MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510d

Total Repeats: 563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013858	CCGGC	2	10	1380	1389	0 %	0 %	40 %	60 %	288962076
2	NC_013858	CCCGC	2	10	1877	1886	0 %	0 %	20 %	80 %	288962076
3	NC_013858	TCGGC	2	10	2590	2599	0 %	20 %	40 %	40 %	288962077
4	NC_013858	GGCCG	2	10	5703	5712	0 %	0 %	60 %	40 %	288962081
5	NC_013858	GGGGT	2	10	5806	5815	0 %	20 %	80 %	0 %	288962081
6	NC_013858	GGAGC	2	10	6664	6673	20 %	0 %	60 %	20 %	288962081
7	NC_013858	GAGCG	2	10	6891	6900	20 %	0 %	60 %	20 %	288962081
8	NC_013858	CTGCC	2	10	7190	7199	0 %	20 %	20 %	60 %	288962082
9	NC_013858	CTCCG	2	10	8036	8045	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_013858	GCGGG	2	10	8207	8216	0 %	0 %	80 %	20 %	288962083
11	NC_013858	CGGTG	2	10	12419	12428	0 %	20 %	60 %	20 %	288962087
12	NC_013858	GGGCG	2	10	13866	13875	0 %	0 %	80 %	20 %	288962089
13	NC_013858	GGGTT	2	10	14715	14724	0 %	40 %	60 %	0 %	288962090
14	NC_013858	TGGAT	2	10	17044	17053	20 %	40 %	40 %	0 %	288962093
15	NC_013858	TTAAT	2	10	19068	19077	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013858	GCCAA	2	10	20767	20776	40 %	0 %	20 %	40 %	288962094
17	NC_013858	TCGCG	2	10	22597	22606	0 %	20 %	40 %	40 %	288962095
18	NC_013858	CGGGC	2	10	22953	22962	0 %	0 %	60 %	40 %	288962095
19	NC_013858	GCGCG	2	10	23167	23176	0 %	0 %	60 %	40 %	288962095
20	NC_013858	GGTCG	2	10	23786	23795	0 %	20 %	60 %	20 %	288962095
21	NC_013858	GGCAC	2	10	24690	24699	20 %	0 %	40 %	40 %	288962096
22	NC_013858	TGCCG	2	10	26080	26089	0 %	20 %	40 %	40 %	288962097
23	NC_013858	TCCGC	2	10	26250	26259	0 %	20 %	20 %	60 %	288962098
24	NC_013858	CGGCG	2	10	26585	26594	0 %	0 %	60 %	40 %	288962098
25	NC_013858	GGCCA	2	10	26649	26658	20 %	0 %	40 %	40 %	288962098
26	NC_013858	ACTGG	2	10	26909	26918	20 %	20 %	40 %	20 %	288962098
27	NC_013858	ACCCG	5	25	28255	28279	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_013858	GTTGT	2	10	29586	29595	0 %	60 %	40 %	0 %	288962100
29	NC_013858	GCGGA	2	10	31292	31301	20 %	0 %	60 %	20 %	288962102
30	NC_013858	TGGCG	2	10	31938	31947	0 %	20 %	60 %	20 %	288962102
31	NC_013858	CCCCG	2	10	38853	38862	0 %	0 %	20 %	80 %	288962109
32	NC_013858	CGTGC	2	10	39255	39264	0 %	20 %	40 %	40 %	288962109
33	NC_013858	GCGCG	2	10	42428	42437	0 %	0 %	60 %	40 %	288962110
34	NC_013858	TCGCG	2	10	45739	45748	0 %	20 %	40 %	40 %	288962113
35	NC_013858	AGCCC	2	10	46513	46522	20 %	0 %	20 %	60 %	288962114
36	NC_013858	CGACC	2	10	47608	47617	20 %	0 %	20 %	60 %	288962115
37	NC_013858	TCCCG	2	10	49789	49798	0 %	20 %	20 %	60 %	288962117
38	NC_013858	CTTCC	2	10	51324	51333	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_013858	AGCGC	2	10	55119	55128	20 %	0 %	40 %	40 %	288962122
40	NC_013858	CAGGG	2	10	56075	56084	20 %	0 %	60 %	20 %	288962123
41	NC_013858	GGCCG	2	10	57971	57980	0 %	0 %	60 %	40 %	288962125
42	NC_013858	ATCGA	2	10	58846	58855	40 %	20 %	20 %	20 %	288962126
43	NC_013858	CGGGA	2	10	62594	62603	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013858	TCGGC	2	10	63343	63352	0 %	20 %	40 %	40 %	288962130
45	NC_013858	GGGCT	2	10	65513	65522	0 %	20 %	60 %	20 %	288962133
46	NC_013858	GCCGG	2	10	65903	65912	0 %	0 %	60 %	40 %	288962133
47	NC_013858	GGCGG	2	10	68814	68823	0 %	0 %	80 %	20 %	288962135
48	NC_013858	GGCGC	2	10	69249	69258	0 %	0 %	60 %	40 %	288962135
49	NC_013858	TCTTT	2	10	69471	69480	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013858	CCCGG	2	10	70005	70014	0 %	0 %	40 %	60 %	288962136
51	NC_013858	GGCTC	2	10	72420	72429	0 %	20 %	40 %	40 %	288962138
52	NC_013858	GCCCG	2	10	75218	75227	0 %	0 %	40 %	60 %	288962141
53	NC_013858	AGCCG	2	10	75627	75636	20 %	0 %	40 %	40 %	288962141
54	NC_013858	CGCGC	2	10	78241	78250	0 %	0 %	40 %	60 %	288962144
55	NC_013858	ATCCG	2	10	79428	79437	20 %	20 %	20 %	40 %	288962145
56	NC_013858	CGGCC	2	10	81207	81216	0 %	0 %	40 %	60 %	288962146
57	NC_013858	GGACG	2	10	81818	81827	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013858	GCTGG	2	10	84236	84245	0 %	20 %	60 %	20 %	288962149
59	NC_013858	GCGCA	2	10	84297	84306	20 %	0 %	40 %	40 %	288962149
60	NC_013858	CCGGT	2	10	84784	84793	0 %	20 %	40 %	40 %	288962149
61	NC_013858	CCCGG	2	10	85113	85122	0 %	0 %	40 %	60 %	288962149
62	NC_013858	CGGCC	2	10	87497	87506	0 %	0 %	40 %	60 %	288962150
63	NC_013858	GCCGC	2	10	87798	87807	0 %	0 %	40 %	60 %	288962151
64	NC_013858	TGGCT	2	10	88330	88339	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013858	CGACG	2	10	89740	89749	20 %	0 %	40 %	40 %	288962153
66	NC_013858	GGCGG	2	10	90320	90329	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013858	CCCGT	2	10	90340	90349	0 %	20 %	20 %	60 %	288962154
68	NC_013858	CGCCA	2	10	91089	91098	20 %	0 %	20 %	60 %	288962154
69	NC_013858	GCCCA	2	10	92847	92856	20 %	0 %	20 %	60 %	288962156
70	NC_013858	GACCA	2	10	93231	93240	40 %	0 %	20 %	40 %	288962156
71	NC_013858	CGTTT	2	10	100036	100045	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013858	CATGG	2	10	100777	100786	20 %	20 %	40 %	20 %	288962161
73	NC_013858	ACCGA	2	10	102496	102505	40 %	0 %	20 %	40 %	288962162
74	NC_013858	AGGGC	2	10	103409	103418	20 %	0 %	60 %	20 %	288962163
75	NC_013858	GCGAC	2	10	106522	106531	20 %	0 %	40 %	40 %	288962165
76	NC_013858	CGATC	2	10	107253	107262	20 %	20 %	20 %	40 %	288962166
77	NC_013858	GCCCG	2	10	107366	107375	0 %	0 %	40 %	60 %	288962167
78	NC_013858	CGGAA	2	10	109341	109350	40 %	0 %	40 %	20 %	288962169
79	NC_013858	CGAGG	2	10	109839	109848	20 %	0 %	60 %	20 %	288962170
80	NC_013858	GCCGC	2	10	110093	110102	0 %	0 %	40 %	60 %	288962170
81	NC_013858	GGGTC	2	10	111146	111155	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013858	GCCGC	2	10	111222	111231	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_013858	CCGGC	2	10	112155	112164	0 %	0 %	40 %	60 %	288962172
84	NC_013858	AGGGT	2	10	112740	112749	20 %	20 %	60 %	0 %	288962172
85	NC_013858	GGACG	2	10	113800	113809	20 %	0 %	60 %	20 %	288962173
86	NC_013858	GCCGC	2	10	114510	114519	0 %	0 %	40 %	60 %	288962173
87	NC_013858	CCAGC	2	10	115549	115558	20 %	0 %	20 %	60 %	288962174
88	NC_013858	GCCGC	2	10	115824	115833	0 %	0 %	40 %	60 %	288962174
89	NC_013858	CGCAG	2	10	117071	117080	20 %	0 %	40 %	40 %	288962175
90	NC_013858	GGGGC	2	10	118284	118293	0 %	0 %	80 %	20 %	288962176
91	NC_013858	CATGG	2	10	118521	118530	20 %	20 %	40 %	20 %	288962176
92	NC_013858	GATGG	2	10	120129	120138	20 %	20 %	60 %	0 %	288962178
93	NC_013858	CGGAC	2	10	121432	121441	20 %	0 %	40 %	40 %	288962179
94	NC_013858	CGATC	2	10	122180	122189	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_013858	CCGTC	2	10	122213	122222	0 %	20 %	20 %	60 %	288962180
96	NC_013858	GCGCG	2	10	123341	123350	0 %	0 %	60 %	40 %	288962181
97	NC_013858	GCACC	2	10	123945	123954	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_013858	GTCGG	2	10	125555	125564	0 %	20 %	60 %	20 %	288962183
99	NC_013858	GGCGG	2	10	125596	125605	0 %	0 %	80 %	20 %	288962183
100	NC_013858	GCCGT	2	10	126103	126112	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_013858	CCGGT	2	10	126308	126317	0 %	20 %	40 %	40 %	288962184
102	NC_013858	CCCGC	2	10	128539	128548	0 %	0 %	20 %	80 %	288962184
103	NC_013858	CGGTG	2	10	128781	128790	0 %	20 %	60 %	20 %	288962184
104	NC_013858	CTTCG	2	10	129387	129396	0 %	40 %	20 %	40 %	288962185
105	NC_013858	CCCGT	2	10	129487	129496	0 %	20 %	20 %	60 %	288962185
106	NC_013858	GCGCG	2	10	129858	129867	0 %	0 %	60 %	40 %	288962185
107	NC_013858	CGGTC	2	10	129961	129970	0 %	20 %	40 %	40 %	288962185
108	NC_013858	CCGAG	2	10	130515	130524	20 %	0 %	40 %	40 %	288962186
109	NC_013858	CGCGG	2	10	132546	132555	0 %	0 %	60 %	40 %	288962188
110	NC_013858	AGCGC	2	10	135765	135774	20 %	0 %	40 %	40 %	288962191
111	NC_013858	CGGCA	2	10	137472	137481	20 %	0 %	40 %	40 %	288962192
112	NC_013858	GGCGG	2	10	140332	140341	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013858	GGCGC	2	10	140816	140825	0 %	0 %	60 %	40 %	288962195
114	NC_013858	CCGGC	2	10	141726	141735	0 %	0 %	40 %	60 %	288962195
115	NC_013858	GCACC	2	10	143568	143577	20 %	0 %	20 %	60 %	288962196
116	NC_013858	CCGGT	2	10	145158	145167	0 %	20 %	40 %	40 %	288962197
117	NC_013858	GCCAT	2	10	145858	145867	20 %	20 %	20 %	40 %	288962198
118	NC_013858	CCGCT	2	10	145943	145952	0 %	20 %	20 %	60 %	288962198
119	NC_013858	CGTGA	2	10	146946	146955	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_013858	CGGAG	2	10	147877	147886	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_013858	GCGTC	2	10	148457	148466	0 %	20 %	40 %	40 %	288962200
122	NC_013858	TCGCC	2	10	149379	149388	0 %	20 %	20 %	60 %	288962200
123	NC_013858	GGATT	2	10	150621	150630	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013858	GGCGG	2	10	150702	150711	0 %	0 %	80 %	20 %	288962201
125	NC_013858	GGCGT	2	10	156526	156535	0 %	20 %	60 %	20 %	288962205
126	NC_013858	ACCGC	2	10	157272	157281	20 %	0 %	20 %	60 %	288962206
127	NC_013858	TGGAC	2	10	157338	157347	20 %	20 %	40 %	20 %	288962206
128	NC_013858	CGGCG	2	10	158991	159000	0 %	0 %	60 %	40 %	288962208
129	NC_013858	AGCAC	2	10	161517	161526	40 %	0 %	20 %	40 %	288962211
130	NC_013858	TCGGC	2	10	161610	161619	0 %	20 %	40 %	40 %	288962211
131	NC_013858	CGGCG	2	10	161814	161823	0 %	0 %	60 %	40 %	288962211
132	NC_013858	TCCCG	2	10	162807	162816	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_013858	GGCCG	2	10	163228	163237	0 %	0 %	60 %	40 %	288962212
134	NC_013858	GGGTC	2	10	164328	164337	0 %	20 %	60 %	20 %	288962212
135	NC_013858	GCGCC	2	10	164729	164738	0 %	0 %	40 %	60 %	288962213
136	NC_013858	GCCGC	3	15	164765	164779	0 %	0 %	40 %	60 %	288962213
137	NC_013858	GAGCG	2	10	167317	167326	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013858	GCGCT	2	10	167916	167925	0 %	20 %	40 %	40 %	288962219
139	NC_013858	CGGCG	2	10	168277	168286	0 %	0 %	60 %	40 %	288962219
140	NC_013858	TGGCC	2	10	168982	168991	0 %	20 %	40 %	40 %	288962220
141	NC_013858	GCGTT	2	10	169599	169608	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_013858	CGGCC	2	10	181555	181564	0 %	0 %	40 %	60 %	288962232
152	NC_013858	GGGCG	2	10	183278	183287	0 %	0 %	80 %	20 %	288962234
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155	NC_013858	GGGCC	2	10	187092	187101	0 %	0 %	60 %	40 %	288962239
156	NC_013858	GCCGG	2	10	187417	187426	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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161	NC_013858	GGCCG	2	10	191073	191082	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
162	NC_013858	TCGCC	2	10	193262	193271	0 %	20 %	20 %	60 %	288962243
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172	NC_013858	CCGGC	2	10	201813	201822	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
173	NC_013858	CTCGC	2	10	202113	202122	0 %	20 %	20 %	60 %	288962249
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209	NC_013858	GCCCG	2	10	235944	235953	0 %	0 %	40 %	60 %	288962282
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247	NC_013858	GCGGG	2	10	281356	281365	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
248	NC_013858	GGCAG	2	10	283507	283516	20 %	0 %	60 %	20 %	288962322
249	NC_013858	CGCGG	2	10	284780	284789	0 %	0 %	60 %	40 %	288962323
250	NC_013858	GTTCC	2	10	285304	285313	0 %	40 %	20 %	40 %	288962323
251	NC_013858	GCGCT	2	10	285406	285415	0 %	20 %	40 %	40 %	288962324
252	NC_013858	CGACC	2	10	286437	286446	20 %	0 %	20 %	60 %	288962324
253	NC_013858	CACGC	2	10	288516	288525	20 %	0 %	20 %	60 %	288962326
254	NC_013858	CCCCA	2	10	288844	288853	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
255	NC_013858	TGGGG	2	10	288883	288892	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
256	NC_013858	GGCCG	2	10	289068	289077	0 %	0 %	60 %	40 %	288962327
257	NC_013858	CCGGG	2	10	290516	290525	0 %	0 %	60 %	40 %	288962328
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260	NC_013858	GGCCC	2	10	296262	296271	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
261	NC_013858	GCGCC	2	10	298019	298028	0 %	0 %	40 %	60 %	288962333
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264	NC_013858	GCGCC	2	10	303250	303259	0 %	0 %	40 %	60 %	288962338
265	NC_013858	TCCTG	2	10	305111	305120	0 %	40 %	20 %	40 %	288962340
266	NC_013858	CGATC	2	10	308535	308544	20 %	20 %	20 %	40 %	288962342
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269	NC_013858	TCCCG	2	10	314034	314043	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
270	NC_013858	GACGA	2	10	314167	314176	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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399	NC_013858	ATGGG	2	10	458161	458170	20 %	20 %	60 %	0 %	288962472
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402	NC_013858	CGATG	2	10	459279	459288	20 %	20 %	40 %	20 %	288962472
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500	NC_013858	CATGT	2	10	565293	565302	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

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