MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN01

Total Repeats: 243

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013852	CCGC	2	8	162	169	0 %	0 %	25 %	75 %	288947675
2	NC_013852	GTGC	2	8	463	470	0 %	25 %	50 %	25 %	288947675
3	NC_013852	AGTC	2	8	754	761	25 %	25 %	25 %	25 %	288947675
4	NC_013852	CGTC	2	8	1873	1880	0 %	25 %	25 %	50 %	288947676
5	NC_013852	GCGG	2	8	2498	2505	0 %	0 %	75 %	25 %	288947677
6	NC_013852	CTCG	2	8	2942	2949	0 %	25 %	25 %	50 %	288947677
7	NC_013852	GGCC	2	8	3065	3072	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
8	NC_013852	CAGG	2	8	3443	3450	25 %	0 %	50 %	25 %	288947677
9	NC_013852	CCGC	2	8	4165	4172	0 %	0 %	25 %	75 %	288947677
10	NC_013852	CCGC	2	8	4302	4309	0 %	0 %	25 %	75 %	288947678
11	NC_013852	GGCT	2	8	5204	5211	0 %	25 %	50 %	25 %	288947678
12	NC_013852	AAGA	2	8	5318	5325	75 %	0 %	25 %	0 %	288947678
13	NC_013852	TGGC	2	8	5417	5424	0 %	25 %	50 %	25 %	288947678
14	NC_013852	GTCG	2	8	5598	5605	0 %	25 %	50 %	25 %	288947679
15	NC_013852	CCGA	2	8	5950	5957	25 %	0 %	25 %	50 %	288947679
16	NC_013852	TCCG	2	8	6327	6334	0 %	25 %	25 %	50 %	288947679
17	NC_013852	TGAA	2	8	7632	7639	50 %	25 %	25 %	0 %	288947681
18	NC_013852	CCGG	2	8	10664	10671	0 %	0 %	50 %	50 %	288947682
19	NC_013852	GCAC	2	8	12069	12076	25 %	0 %	25 %	50 %	288947683
20	NC_013852	CGGC	2	8	12218	12225	0 %	0 %	50 %	50 %	288947684
21	NC_013852	CCCG	2	8	12386	12393	0 %	0 %	25 %	75 %	288947684
22	NC_013852	CGGT	2	8	12920	12927	0 %	25 %	50 %	25 %	288947685
23	NC_013852	GTCG	2	8	13224	13231	0 %	25 %	50 %	25 %	288947685
24	NC_013852	CCGA	2	8	13342	13349	25 %	0 %	25 %	50 %	288947685
25	NC_013852	CCGA	2	8	13486	13493	25 %	0 %	25 %	50 %	288947685
26	NC_013852	GATC	2	8	13887	13894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013852	TGGC	2	8	13990	13997	0 %	25 %	50 %	25 %	288947686
28	NC_013852	GCGA	2	8	14007	14014	25 %	0 %	50 %	25 %	288947686
29	NC_013852	ATCA	2	8	14376	14383	50 %	25 %	0 %	25 %	288947686
30	NC_013852	CACC	2	8	14572	14579	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_013852	TGGC	2	8	15396	15403	0 %	25 %	50 %	25 %	288947687
32	NC_013852	CGAC	2	8	15430	15437	25 %	0 %	25 %	50 %	288947687
33	NC_013852	GCGG	2	8	16444	16451	0 %	0 %	75 %	25 %	288947689
34	NC_013852	CCCG	2	8	16734	16741	0 %	0 %	25 %	75 %	288947690
35	NC_013852	TCCA	2	8	17526	17533	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013852	GATG	2	8	17721	17728	25 %	25 %	50 %	0 %	288947692
37	NC_013852	GGCG	2	8	17864	17871	0 %	0 %	75 %	25 %	288947692
38	NC_013852	CGAG	2	8	18098	18105	25 %	0 %	50 %	25 %	288947693
39	NC_013852	CCCG	2	8	18311	18318	0 %	0 %	25 %	75 %	288947693
40	NC_013852	GCTG	2	8	18433	18440	0 %	25 %	50 %	25 %	288947693
41	NC_013852	GATG	2	8	18732	18739	25 %	25 %	50 %	0 %	288947693
42	NC_013852	GAAG	2	8	18749	18756	50 %	0 %	50 %	0 %	288947693
43	NC_013852	GATT	2	8	19189	19196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013852	ATTA	2	8	19558	19565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013852	CAGG	2	8	20926	20933	25 %	0 %	50 %	25 %	288947696
46	NC_013852	TGCC	2	8	21251	21258	0 %	25 %	25 %	50 %	288947697
47	NC_013852	GAAC	2	8	21426	21433	50 %	0 %	25 %	25 %	288947697
48	NC_013852	CGAG	2	8	22932	22939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013852	CATC	2	8	23314	23321	25 %	25 %	0 %	50 %	288947699
50	NC_013852	CAAA	2	8	23913	23920	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013852	ACCG	2	8	24364	24371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013852	ACCG	2	8	24688	24695	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013852	ACCG	2	8	24791	24798	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013852	CAGC	2	8	25124	25131	25 %	0 %	25 %	50 %	288947701
55	NC_013852	TCGG	2	8	26037	26044	0 %	25 %	50 %	25 %	288947702
56	NC_013852	GATC	2	8	26837	26844	25 %	25 %	25 %	25 %	288947703
57	NC_013852	CCGC	2	8	26865	26872	0 %	0 %	25 %	75 %	288947704
58	NC_013852	CCTT	2	8	27238	27245	0 %	50 %	0 %	50 %	288947704
59	NC_013852	TCCG	2	8	27707	27714	0 %	25 %	25 %	50 %	288947704
60	NC_013852	CCGA	2	8	28153	28160	25 %	0 %	25 %	50 %	288947705
61	NC_013852	CGGT	2	8	28589	28596	0 %	25 %	50 %	25 %	288947705
62	NC_013852	ATCT	2	8	29381	29388	25 %	50 %	0 %	25 %	288947706
63	NC_013852	GCTG	2	8	30815	30822	0 %	25 %	50 %	25 %	288947709
64	NC_013852	GGAG	2	8	30934	30941	25 %	0 %	75 %	0 %	288947709
65	NC_013852	CAAC	3	12	31588	31599	50 %	0 %	0 %	50 %	288947710
66	NC_013852	CAAG	2	8	31670	31677	50 %	0 %	25 %	25 %	288947711
67	NC_013852	GCCG	2	8	33027	33034	0 %	0 %	50 %	50 %	288947712
68	NC_013852	GTTC	2	8	33322	33329	0 %	50 %	25 %	25 %	288947712
69	NC_013852	CTGG	2	8	33683	33690	0 %	25 %	50 %	25 %	288947713
70	NC_013852	GCGG	2	8	33866	33873	0 %	0 %	75 %	25 %	288947713
71	NC_013852	GTTG	2	8	34090	34097	0 %	50 %	50 %	0 %	288947713
72	NC_013852	TGAG	2	8	34992	34999	25 %	25 %	50 %	0 %	288947715
73	NC_013852	GCTG	2	8	35021	35028	0 %	25 %	50 %	25 %	288947715
74	NC_013852	GGCC	2	8	35132	35139	0 %	0 %	50 %	50 %	288947715
75	NC_013852	TGCC	2	8	35160	35167	0 %	25 %	25 %	50 %	288947715
76	NC_013852	GGCG	2	8	35533	35540	0 %	0 %	75 %	25 %	288947716
77	NC_013852	GACG	2	8	35627	35634	25 %	0 %	50 %	25 %	288947716
78	NC_013852	CCGG	2	8	35664	35671	0 %	0 %	50 %	50 %	288947716
79	NC_013852	GGGC	2	8	36597	36604	0 %	0 %	75 %	25 %	288947717
80	NC_013852	AATC	2	8	36763	36770	50 %	25 %	0 %	25 %	288947718
81	NC_013852	TCAT	2	8	37082	37089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013852	GCGG	2	8	37495	37502	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013852	TCGC	2	8	37770	37777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013852	GACC	2	8	37855	37862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013852	ACCG	2	8	38253	38260	25 %	0 %	25 %	50 %	288947720
86	NC_013852	GATC	2	8	38830	38837	25 %	25 %	25 %	25 %	288947720
87	NC_013852	CTTC	2	8	39091	39098	0 %	50 %	0 %	50 %	288947721
88	NC_013852	CCTG	2	8	39168	39175	0 %	25 %	25 %	50 %	288947721
89	NC_013852	CCCG	2	8	39298	39305	0 %	0 %	25 %	75 %	288947721
90	NC_013852	GATC	2	8	39796	39803	25 %	25 %	25 %	25 %	288947721
91	NC_013852	CGAA	2	8	40080	40087	50 %	0 %	25 %	25 %	288947721
92	NC_013852	CGCC	2	8	40875	40882	0 %	0 %	25 %	75 %	288947721
93	NC_013852	TCGA	2	8	42315	42322	25 %	25 %	25 %	25 %	288947721
94	NC_013852	CCCG	2	8	43592	43599	0 %	0 %	25 %	75 %	288947722
95	NC_013852	TTTC	2	8	44271	44278	0 %	75 %	0 %	25 %	288947723
96	NC_013852	AACA	2	8	44771	44778	75 %	0 %	0 %	25 %	288947723
97	NC_013852	GTCA	2	8	44949	44956	25 %	25 %	25 %	25 %	288947723
98	NC_013852	TAGA	2	8	45385	45392	50 %	25 %	25 %	0 %	288947724
99	NC_013852	AAGC	2	8	45401	45408	50 %	0 %	25 %	25 %	288947724
100	NC_013852	ATGC	2	8	45583	45590	25 %	25 %	25 %	25 %	288947724
101	NC_013852	AAAG	2	8	45696	45703	75 %	0 %	25 %	0 %	288947724
102	NC_013852	GTAA	2	8	46083	46090	50 %	25 %	25 %	0 %	288947724
103	NC_013852	TGAT	2	8	46102	46109	25 %	50 %	25 %	0 %	288947724
104	NC_013852	AGAA	2	8	46157	46164	75 %	0 %	25 %	0 %	288947724
105	NC_013852	GTCG	2	8	46563	46570	0 %	25 %	50 %	25 %	288947725
106	NC_013852	TCGC	2	8	47345	47352	0 %	25 %	25 %	50 %	288947725
107	NC_013852	CGTC	2	8	47380	47387	0 %	25 %	25 %	50 %	288947725
108	NC_013852	CGGG	2	8	48052	48059	0 %	0 %	75 %	25 %	288947725
109	NC_013852	CGCT	2	8	48603	48610	0 %	25 %	25 %	50 %	288947725
110	NC_013852	TCGA	2	8	48618	48625	25 %	25 %	25 %	25 %	288947725
111	NC_013852	CCGG	2	8	48666	48673	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
112	NC_013852	CGGC	2	8	49632	49639	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
113	NC_013852	GGCG	2	8	49753	49760	0 %	0 %	75 %	25 %	288947725
114	NC_013852	GACA	2	8	50064	50071	50 %	0 %	25 %	25 %	288947725
115	NC_013852	CCCG	2	8	50381	50388	0 %	0 %	25 %	75 %	288947725
116	NC_013852	AGCG	2	8	50448	50455	25 %	0 %	50 %	25 %	288947725
117	NC_013852	CCGC	2	8	50649	50656	0 %	0 %	25 %	75 %	288947725
118	NC_013852	CGGT	2	8	51282	51289	0 %	25 %	50 %	25 %	288947725
119	NC_013852	TCCA	2	8	51336	51343	25 %	25 %	0 %	50 %	288947725
120	NC_013852	GGCT	2	8	52907	52914	0 %	25 %	50 %	25 %	288947727
121	NC_013852	GATC	2	8	53085	53092	25 %	25 %	25 %	25 %	288947727
122	NC_013852	GCGG	2	8	53265	53272	0 %	0 %	75 %	25 %	288947728
123	NC_013852	AGGT	2	8	54320	54327	25 %	25 %	50 %	0 %	288947729
124	NC_013852	TCCC	2	8	54554	54561	0 %	25 %	0 %	75 %	288947730
125	NC_013852	CCGG	2	8	54683	54690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013852	GGCT	2	8	56552	56559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013852	CGGC	2	8	56927	56934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013852	GTCA	2	8	57413	57420	25 %	25 %	25 %	25 %	288947733
129	NC_013852	GATT	2	8	57583	57590	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013852	AAGT	2	8	57859	57866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013852	CTGG	2	8	57972	57979	0 %	25 %	50 %	25 %	288947734
132	NC_013852	ATCG	2	8	58042	58049	25 %	25 %	25 %	25 %	288947734
133	NC_013852	AGCC	3	12	58230	58241	25 %	0 %	25 %	50 %	288947734
134	NC_013852	GATG	2	8	58769	58776	25 %	25 %	50 %	0 %	288947735
135	NC_013852	ATTG	2	8	59164	59171	25 %	50 %	25 %	0 %	288947736
136	NC_013852	GCTG	2	8	59374	59381	0 %	25 %	50 %	25 %	288947737
137	NC_013852	GCAA	2	8	59700	59707	50 %	0 %	25 %	25 %	288947737
138	NC_013852	GACC	2	8	59870	59877	25 %	0 %	25 %	50 %	288947737
139	NC_013852	ATCC	2	8	60367	60374	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013852	GCCC	2	8	60511	60518	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_013852	ACCC	2	8	60689	60696	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_013852	GCCC	2	8	60697	60704	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.