MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 81968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52502	NC_013851	TCGG	2	8	2263072	2263079	0 %	25 %	50 %	25 %	288941691
52503	NC_013851	TCGG	2	8	2263129	2263136	0 %	25 %	50 %	25 %	288941691
52504	NC_013851	CAC	2	6	2263143	2263148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288941691
52505	NC_013851	CGA	2	6	2263202	2263207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288941691
52506	NC_013851	CCT	2	6	2263232	2263237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288941691
52507	NC_013851	CGG	2	6	2263244	2263249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288941691
52508	NC_013851	GAT	2	6	2263356	2263361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288941691
52509	NC_013851	CGA	2	6	2263364	2263369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288941691
52510	NC_013851	CGGT	2	8	2263372	2263379	0 %	25 %	50 %	25 %	288941691
52511	NC_013851	GTT	2	6	2263404	2263409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288941691
52512	NC_013851	CAG	3	9	2263413	2263421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288941691
52513	NC_013851	GTC	2	6	2263422	2263427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288941691
52514	NC_013851	CG	3	6	2263482	2263487	0 %	0 %	50 %	50 %	288941691
52515	NC_013851	GAA	2	6	2263536	2263541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288941691
52516	NC_013851	CGC	2	6	2263578	2263583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288941691
52517	NC_013851	CCAG	2	8	2263622	2263629	25 %	0 %	25 %	50 %	288941691
52518	NC_013851	GCC	2	6	2263647	2263652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288941691
52519	NC_013851	CTGA	2	8	2263664	2263671	25 %	25 %	25 %	25 %	288941691
52520	NC_013851	CG	3	6	2263692	2263697	0 %	0 %	50 %	50 %	288941691
52521	NC_013851	CG	4	8	2263752	2263759	0 %	0 %	50 %	50 %	288941691
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52524	NC_013851	GCA	2	6	2263907	2263912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288941691
52525	NC_013851	AGCAA	2	10	2263949	2263958	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52526	NC_013851	TAA	2	6	2264000	2264005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288941692
52527	NC_013851	GA	3	6	2264018	2264023	50 %	0 %	50 %	0 %	288941692
52528	NC_013851	TCTGGG	2	12	2264037	2264048	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	288941692
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52531	NC_013851	CGG	2	6	2264121	2264126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288941692
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52534	NC_013851	GAC	2	6	2264188	2264193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288941692
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52542	NC_013851	GAT	2	6	2264473	2264478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288941692
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52544	NC_013851	TGC	2	6	2264540	2264545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288941692
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52550	NC_013851	GCG	2	6	2264929	2264934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288941692
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52553	NC_013851	GTG	2	6	2265017	2265022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288941692
52554	NC_013851	TTC	2	6	2265046	2265051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288941692
52555	NC_013851	CGG	2	6	2265318	2265323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52556	NC_013851	CGT	2	6	2265361	2265366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52557	NC_013851	CG	3	6	2265383	2265388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52558	NC_013851	GC	4	8	2265399	2265406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52559	NC_013851	CCGCG	2	10	2265593	2265602	0 %	0 %	40 %	60 %	288941693
52560	NC_013851	CG	4	8	2265599	2265606	0 %	0 %	50 %	50 %	288941693
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52616	NC_013851	GCT	2	6	2268026	2268031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288941693
52617	NC_013851	CG	3	6	2268107	2268112	0 %	0 %	50 %	50 %	288941693
52618	NC_013851	GAT	2	6	2268117	2268122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288941693
52619	NC_013851	TGGA	2	8	2268139	2268146	25 %	25 %	50 %	0 %	288941693
52620	NC_013851	TGCG	2	8	2268183	2268190	0 %	25 %	50 %	25 %	288941693
52621	NC_013851	GCG	2	6	2268274	2268279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288941693
52622	NC_013851	CGAA	2	8	2268301	2268308	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52623	NC_013851	CTGGCT	2	12	2268343	2268354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288941694
52624	NC_013851	ATGG	2	8	2268391	2268398	25 %	25 %	50 %	0 %	288941694
52625	NC_013851	GTC	2	6	2268425	2268430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288941694
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52628	NC_013851	GTG	2	6	2268527	2268532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288941694
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52630	NC_013851	GGCT	2	8	2268563	2268570	0 %	25 %	50 %	25 %	288941694
52631	NC_013851	GCG	2	6	2268571	2268576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288941694
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52636	NC_013851	TGC	2	6	2268780	2268785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288941694
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52640	NC_013851	GCT	2	6	2268923	2268928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288941695
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52643	NC_013851	TGC	2	6	2269043	2269048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288941695
52644	NC_013851	GAT	2	6	2269059	2269064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288941695
52645	NC_013851	CG	3	6	2269100	2269105	0 %	0 %	50 %	50 %	288941695
52646	NC_013851	CGG	2	6	2269215	2269220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288941695
52647	NC_013851	TCA	2	6	2269232	2269237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288941695
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52651	NC_013851	CG	3	6	2269519	2269524	0 %	0 %	50 %	50 %	288941695
52652	NC_013851	TCG	2	6	2269532	2269537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288941695
52653	NC_013851	GAA	2	6	2269677	2269682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288941695
52654	NC_013851	CGT	2	6	2269755	2269760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288941696
52655	NC_013851	CAG	2	6	2269801	2269806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288941696
52656	NC_013851	GTC	2	6	2269828	2269833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288941696
52657	NC_013851	CCCG	2	8	2269890	2269897	0 %	0 %	25 %	75 %	288941696
52658	NC_013851	CTG	2	6	2269933	2269938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288941696
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52718	NC_013851	GC	4	8	2272761	2272768	0 %	0 %	50 %	50 %	288941698
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52720	NC_013851	AGCG	2	8	2272894	2272901	25 %	0 %	50 %	25 %	288941698
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52725	NC_013851	GC	3	6	2273059	2273064	0 %	0 %	50 %	50 %	288941698
52726	NC_013851	CGG	2	6	2273106	2273111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288941698
52727	NC_013851	TGA	2	6	2273171	2273176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288941698
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52732	NC_013851	CG	3	6	2273367	2273372	0 %	0 %	50 %	50 %	288941698
52733	NC_013851	AGCG	2	8	2273386	2273393	25 %	0 %	50 %	25 %	288941698
52734	NC_013851	CGGC	2	8	2273395	2273402	0 %	0 %	50 %	50 %	288941698
52735	NC_013851	CAT	2	6	2273406	2273411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288941698
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52743	NC_013851	GCACG	2	10	2273688	2273697	20 %	0 %	40 %	40 %	288941698
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52845	NC_013851	G	6	6	2277992	2277997	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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52849	NC_013851	CGG	2	6	2278185	2278190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288941700
52850	NC_013851	GGC	2	6	2278216	2278221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288941700
52851	NC_013851	GC	3	6	2278305	2278310	0 %	0 %	50 %	50 %	288941700
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