MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Archaeoglobus profundus DSM 5631 chromosome

Total Repeats: 1014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013741	TGATT	2	10	1041	1050	20 %	60 %	20 %	0 %	284161129
2	NC_013741	CTGTT	2	10	1157	1166	0 %	60 %	20 %	20 %	284161129
3	NC_013741	GTGAG	2	10	1953	1962	20 %	20 %	60 %	0 %	284161130
4	NC_013741	TAAGC	2	10	9062	9071	40 %	20 %	20 %	20 %	284161135
5	NC_013741	AGGAA	2	10	9641	9650	60 %	0 %	40 %	0 %	284161136
6	NC_013741	AATCA	2	10	9691	9700	60 %	20 %	0 %	20 %	284161136
7	NC_013741	TCCAT	2	10	10946	10955	20 %	40 %	0 %	40 %	284161138
8	NC_013741	AGTTT	2	10	13489	13498	20 %	60 %	20 %	0 %	284161141
9	NC_013741	GATTT	2	10	15172	15181	20 %	60 %	20 %	0 %	284161143
10	NC_013741	ATCTC	2	10	16791	16800	20 %	40 %	0 %	40 %	284161146
11	NC_013741	TTGAG	2	10	17913	17922	20 %	40 %	40 %	0 %	284161147
12	NC_013741	AAGAT	2	10	19452	19461	60 %	20 %	20 %	0 %	284161149
13	NC_013741	AAAGG	2	10	21718	21727	60 %	0 %	40 %	0 %	284161154
14	NC_013741	TCCTT	2	10	23545	23554	0 %	60 %	0 %	40 %	284161157
15	NC_013741	TTGTT	2	10	28749	28758	0 %	80 %	20 %	0 %	284161160
16	NC_013741	GAAAT	2	10	29933	29942	60 %	20 %	20 %	0 %	284161163
17	NC_013741	CCAAG	2	10	31946	31955	40 %	0 %	20 %	40 %	284161165
18	NC_013741	CTTTC	2	10	33392	33401	0 %	60 %	0 %	40 %	284161167
19	NC_013741	CTGCT	2	10	33916	33925	0 %	40 %	20 %	40 %	284161167
20	NC_013741	ATTTA	2	10	33993	34002	40 %	60 %	0 %	0 %	284161167
21	NC_013741	CTTCT	2	10	34127	34136	0 %	60 %	0 %	40 %	284161167
22	NC_013741	CTTTT	2	10	34137	34146	0 %	80 %	0 %	20 %	284161167
23	NC_013741	ATCTC	2	10	34930	34939	20 %	40 %	0 %	40 %	284161167
24	NC_013741	TCTTT	2	10	35156	35165	0 %	80 %	0 %	20 %	284161167
25	NC_013741	CAAAA	2	10	36173	36182	80 %	0 %	0 %	20 %	284161167
26	NC_013741	TCCAG	2	10	37801	37810	20 %	20 %	20 %	40 %	284161170
27	NC_013741	AATCC	2	10	37988	37997	40 %	20 %	0 %	40 %	284161170
28	NC_013741	ATCAA	2	10	40966	40975	60 %	20 %	0 %	20 %	284161173
29	NC_013741	TTTAA	2	10	41720	41729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013741	AGTTG	2	10	42031	42040	20 %	40 %	40 %	0 %	284161174
31	NC_013741	ACTCA	2	10	42725	42734	40 %	20 %	0 %	40 %	284161176
32	NC_013741	CCCTT	2	10	44218	44227	0 %	40 %	0 %	60 %	284161179
33	NC_013741	CTCTA	2	10	45186	45195	20 %	40 %	0 %	40 %	284161180
34	NC_013741	AAGGG	2	10	46025	46034	40 %	0 %	60 %	0 %	284161182
35	NC_013741	CTCAT	2	10	48425	48434	20 %	40 %	0 %	40 %	284161185
36	NC_013741	GAAAA	2	10	49200	49209	80 %	0 %	20 %	0 %	284161185
37	NC_013741	AAAGA	2	10	49864	49873	80 %	0 %	20 %	0 %	284161186
38	NC_013741	AAGGC	2	10	50325	50334	40 %	0 %	40 %	20 %	284161186
39	NC_013741	GCGAT	2	10	51878	51887	20 %	20 %	40 %	20 %	284161187
40	NC_013741	CAAAT	2	10	53284	53293	60 %	20 %	0 %	20 %	284161188
41	NC_013741	GCTCG	2	10	54931	54940	0 %	20 %	40 %	40 %	284161190
42	NC_013741	TCTGC	2	10	61086	61095	0 %	40 %	20 %	40 %	284161199
43	NC_013741	ATTTG	2	10	64083	64092	20 %	60 %	20 %	0 %	284161204
44	NC_013741	TGAGT	2	10	64797	64806	20 %	40 %	40 %	0 %	284161204
45	NC_013741	GAAGA	2	10	65137	65146	60 %	0 %	40 %	0 %	284161204
46	NC_013741	GTAGA	2	10	65207	65216	40 %	20 %	40 %	0 %	284161204
47	NC_013741	ATCGA	2	10	69219	69228	40 %	20 %	20 %	20 %	284161207
48	NC_013741	AGGTT	2	10	69238	69247	20 %	40 %	40 %	0 %	284161207
49	NC_013741	TCCAG	2	10	75621	75630	20 %	20 %	20 %	40 %	284161214
50	NC_013741	GATAA	2	10	77928	77937	60 %	20 %	20 %	0 %	284161216
51	NC_013741	ACGGA	2	10	81249	81258	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013741	GAAAG	2	10	84541	84550	60 %	0 %	40 %	0 %	284161219
53	NC_013741	AAGGA	2	10	86787	86796	60 %	0 %	40 %	0 %	284161221
54	NC_013741	AGGTT	2	10	92414	92423	20 %	40 %	40 %	0 %	284161227
55	NC_013741	CTTTG	2	10	93134	93143	0 %	60 %	20 %	20 %	284161228
56	NC_013741	AACAA	3	15	98206	98220	80 %	0 %	0 %	20 %	284161233
57	NC_013741	TCAAT	2	10	99042	99051	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013741	TTTAG	2	10	99347	99356	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013741	CAAAC	2	10	99512	99521	60 %	0 %	0 %	40 %	284161236
60	NC_013741	TCTCC	2	10	100616	100625	0 %	40 %	0 %	60 %	284161237
61	NC_013741	CTCCC	2	10	101563	101572	0 %	20 %	0 %	80 %	284161238
62	NC_013741	CCATT	2	10	102108	102117	20 %	40 %	0 %	40 %	284161239
63	NC_013741	TCCTT	2	10	103477	103486	0 %	60 %	0 %	40 %	284161243
64	NC_013741	TATAT	2	10	105384	105393	40 %	60 %	0 %	0 %	284161244
65	NC_013741	ATGAA	2	10	105728	105737	60 %	20 %	20 %	0 %	284161244
66	NC_013741	CTCTT	2	10	106698	106707	0 %	60 %	0 %	40 %	284161245
67	NC_013741	AGGAG	2	10	106738	106747	40 %	0 %	60 %	0 %	284161245
68	NC_013741	CATCT	2	10	107905	107914	20 %	40 %	0 %	40 %	284161248
69	NC_013741	TTATT	2	10	108099	108108	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013741	TTATT	2	10	108154	108163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013741	CCCTT	2	10	108492	108501	0 %	40 %	0 %	60 %	284161249
72	NC_013741	CCTCT	2	10	108673	108682	0 %	40 %	0 %	60 %	284161249
73	NC_013741	CATCC	2	10	112373	112382	20 %	20 %	0 %	60 %	284161257
74	NC_013741	AAAAT	2	10	112413	112422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013741	AGCTC	2	10	113281	113290	20 %	20 %	20 %	40 %	284161258
76	NC_013741	TAGAA	2	10	114615	114624	60 %	20 %	20 %	0 %	284161259
77	NC_013741	AATTT	2	10	117197	117206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013741	AAAGA	2	10	117458	117467	80 %	0 %	20 %	0 %	284161261
79	NC_013741	GTGAT	2	10	120705	120714	20 %	40 %	40 %	0 %	284161265
80	NC_013741	CCCAT	2	10	121608	121617	20 %	20 %	0 %	60 %	284161266
81	NC_013741	GAAGG	2	10	122977	122986	40 %	0 %	60 %	0 %	284161267
82	NC_013741	TTCAG	2	10	123368	123377	20 %	40 %	20 %	20 %	284161268
83	NC_013741	CTCAT	2	10	124132	124141	20 %	40 %	0 %	40 %	284161269
84	NC_013741	TCCTC	2	10	125028	125037	0 %	40 %	0 %	60 %	284161270
85	NC_013741	AGTTG	2	10	129033	129042	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013741	CAGTC	2	10	130155	130164	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_013741	GAATT	2	10	131225	131234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013741	ATTTA	2	10	132043	132052	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013741	AAGCT	2	10	136473	136482	40 %	20 %	20 %	20 %	284161283
90	NC_013741	AGATA	2	10	138242	138251	60 %	20 %	20 %	0 %	284161285
91	NC_013741	GAACA	2	10	139197	139206	60 %	0 %	20 %	20 %	284161285
92	NC_013741	TGAGT	2	10	139604	139613	20 %	40 %	40 %	0 %	284161285
93	NC_013741	AGGAG	2	10	143416	143425	40 %	0 %	60 %	0 %	284161289
94	NC_013741	GGCAA	2	10	149402	149411	40 %	0 %	40 %	20 %	284161295
95	NC_013741	AAGAG	2	10	152600	152609	60 %	0 %	40 %	0 %	284161299
96	NC_013741	TGATA	2	10	154849	154858	40 %	40 %	20 %	0 %	284161301
97	NC_013741	CCCAA	2	10	156866	156875	40 %	0 %	0 %	60 %	284161305
98	NC_013741	CGTTG	2	10	157117	157126	0 %	40 %	40 %	20 %	284161305
99	NC_013741	AGATA	2	10	158153	158162	60 %	20 %	20 %	0 %	284161306
100	NC_013741	CTTTC	2	10	158411	158420	0 %	60 %	0 %	40 %	284161306
101	NC_013741	TAATT	2	10	163879	163888	40 %	60 %	0 %	0 %	284161313
102	NC_013741	GGAGC	2	10	165025	165034	20 %	0 %	60 %	20 %	284161315
103	NC_013741	TAGGA	2	10	165369	165378	40 %	20 %	40 %	0 %	284161315
104	NC_013741	CAGAT	2	10	166775	166784	40 %	20 %	20 %	20 %	284161317
105	NC_013741	TGGTG	2	10	168620	168629	0 %	40 %	60 %	0 %	284161319
106	NC_013741	ACCTT	2	10	169699	169708	20 %	40 %	0 %	40 %	284161321
107	NC_013741	TTGGC	2	10	172062	172071	0 %	40 %	40 %	20 %	284161324
108	NC_013741	ATTGG	2	10	172864	172873	20 %	40 %	40 %	0 %	284161325
109	NC_013741	TGGCT	2	10	173316	173325	0 %	40 %	40 %	20 %	284161325
110	NC_013741	AGCAT	2	10	174034	174043	40 %	20 %	20 %	20 %	284161326
111	NC_013741	TCTCC	2	10	175878	175887	0 %	40 %	0 %	60 %	284161328
112	NC_013741	AGATC	2	10	176489	176498	40 %	20 %	20 %	20 %	284161330
113	NC_013741	TCTCT	2	10	181520	181529	0 %	60 %	0 %	40 %	284161335
114	NC_013741	GAGAT	2	10	182919	182928	40 %	20 %	40 %	0 %	284161336
115	NC_013741	GATTT	2	10	185113	185122	20 %	60 %	20 %	0 %	284161338
116	NC_013741	AAGAT	2	10	188217	188226	60 %	20 %	20 %	0 %	284161342
117	NC_013741	CTTGA	2	10	191403	191412	20 %	40 %	20 %	20 %	284161345
118	NC_013741	GCTTT	2	10	191415	191424	0 %	60 %	20 %	20 %	284161345
119	NC_013741	TTGTC	2	10	193947	193956	0 %	60 %	20 %	20 %	284161349
120	NC_013741	CGATG	2	10	194205	194214	20 %	20 %	40 %	20 %	284161349
121	NC_013741	TGTTC	2	10	194450	194459	0 %	60 %	20 %	20 %	284161349
122	NC_013741	TCGAA	2	10	197743	197752	40 %	20 %	20 %	20 %	284161352
123	NC_013741	ATCCA	2	10	203347	203356	40 %	20 %	0 %	40 %	284161363
124	NC_013741	ATAAA	2	10	203736	203745	80 %	20 %	0 %	0 %	284161363
125	NC_013741	TTGAG	2	10	205923	205932	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013741	GTTTG	2	10	207405	207414	0 %	60 %	40 %	0 %	284161368
127	NC_013741	AGGAT	2	10	208036	208045	40 %	20 %	40 %	0 %	284161368
128	NC_013741	TTAAT	2	10	211464	211473	40 %	60 %	0 %	0 %	284161371
129	NC_013741	GAAGA	2	10	217287	217296	60 %	0 %	40 %	0 %	284161378
130	NC_013741	AGAGG	2	10	225422	225431	40 %	0 %	60 %	0 %	284161386
131	NC_013741	TGAGC	2	10	225620	225629	20 %	20 %	40 %	20 %	284161386
132	NC_013741	GAGAT	2	10	228058	228067	40 %	20 %	40 %	0 %	284161389
133	NC_013741	TTACG	2	10	230451	230460	20 %	40 %	20 %	20 %	284161393
134	NC_013741	GAGAG	2	10	231354	231363	40 %	0 %	60 %	0 %	284161393
135	NC_013741	TAAAT	2	10	232080	232089	60 %	40 %	0 %	0 %	284161393
136	NC_013741	CTATC	2	10	232503	232512	20 %	40 %	0 %	40 %	284161393
137	NC_013741	CCTAT	2	10	232568	232577	20 %	40 %	0 %	40 %	284161393
138	NC_013741	GAAAC	2	10	232772	232781	60 %	0 %	20 %	20 %	284161393
139	NC_013741	GGGAG	2	10	234203	234212	20 %	0 %	80 %	0 %	284161396
140	NC_013741	TGGAT	2	10	234316	234325	20 %	40 %	40 %	0 %	284161396
141	NC_013741	GAATT	2	10	235652	235661	40 %	40 %	20 %	0 %	284161397
142	NC_013741	CCTGC	2	10	235720	235729	0 %	20 %	20 %	60 %	284161397
143	NC_013741	GAATA	2	10	235800	235809	60 %	20 %	20 %	0 %	284161397
144	NC_013741	TAAAG	2	10	236797	236806	60 %	20 %	20 %	0 %	284161398
145	NC_013741	CTTGG	2	10	238015	238024	0 %	40 %	40 %	20 %	284161400
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147	NC_013741	AGAAA	2	10	240630	240639	80 %	0 %	20 %	0 %	284161403
148	NC_013741	TCCTT	2	10	242525	242534	0 %	60 %	0 %	40 %	284161405
149	NC_013741	TTTTC	2	10	246158	246167	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_013741	TATGC	2	10	246226	246235	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_013741	GAAGA	2	10	247262	247271	60 %	0 %	40 %	0 %	284161409
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153	NC_013741	TGTCG	2	10	249588	249597	0 %	40 %	40 %	20 %	284161411
154	NC_013741	CTCTT	2	10	250778	250787	0 %	60 %	0 %	40 %	284161413
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157	NC_013741	ACTAC	2	10	254438	254447	40 %	20 %	0 %	40 %	284161417
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161	NC_013741	TGAAG	2	10	260565	260574	40 %	20 %	40 %	0 %	284161421
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167	NC_013741	AACTT	2	10	265375	265384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_013741	TTTCC	2	10	267614	267623	0 %	60 %	0 %	40 %	284161433
169	NC_013741	ATATA	2	10	270490	270499	60 %	40 %	0 %	0 %	284161436
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187	NC_013741	AATTC	2	10	310464	310473	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_013741	GGTAG	2	10	312038	312047	20 %	20 %	60 %	0 %	284161484
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195	NC_013741	GAAAA	2	10	320557	320566	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_013741	ATTGC	2	10	325178	325187	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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244	NC_013741	ATTTC	2	10	382795	382804	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
245	NC_013741	GAAGA	2	10	384569	384578	60 %	0 %	40 %	0 %	284161567
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253	NC_013741	TCTCT	2	10	392111	392120	0 %	60 %	0 %	40 %	284161577
254	NC_013741	AAAGA	2	10	396957	396966	80 %	0 %	20 %	0 %	284161580
255	NC_013741	TGTTC	2	10	397087	397096	0 %	60 %	20 %	20 %	284161580
256	NC_013741	GCTTT	2	10	400765	400774	0 %	60 %	20 %	20 %	284161584
257	NC_013741	TCGAA	2	10	401787	401796	40 %	20 %	20 %	20 %	284161586
258	NC_013741	ACTGG	2	10	401941	401950	20 %	20 %	40 %	20 %	284161586
259	NC_013741	GCAGA	2	10	402305	402314	40 %	0 %	40 %	20 %	284161586
260	NC_013741	GCAAA	2	10	403399	403408	60 %	0 %	20 %	20 %	284161589
261	NC_013741	CTTTC	2	10	408488	408497	0 %	60 %	0 %	40 %	284161596
262	NC_013741	AGTTG	2	10	409812	409821	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
263	NC_013741	GAAAG	2	10	409917	409926	60 %	0 %	40 %	0 %	284161600
264	NC_013741	ATCCA	2	10	411450	411459	40 %	20 %	0 %	40 %	284161601
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