MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 51164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013740	CAG	2	6	131635	131640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047497
3002	NC_013740	GCC	2	6	131686	131691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047497
3003	NC_013740	GCC	2	6	131725	131730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047497
3004	NC_013740	GGCA	2	8	131762	131769	25 %	0 %	50 %	25 %	284047497
3005	NC_013740	CAG	3	9	131776	131784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047497
3006	NC_013740	TCTT	2	8	131819	131826	0 %	75 %	0 %	25 %	284047497
3007	NC_013740	TTG	2	6	131840	131845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284047497
3008	NC_013740	GCA	2	6	131878	131883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047497
3009	NC_013740	ATA	2	6	131914	131919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284047497
3010	NC_013740	ATT	2	6	132077	132082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047498
3011	NC_013740	CCG	2	6	132109	132114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047498
3012	NC_013740	TTGC	2	8	132135	132142	0 %	50 %	25 %	25 %	284047498
3013	NC_013740	GGGCA	2	10	132173	132182	20 %	0 %	60 %	20 %	284047498
3014	NC_013740	AGA	2	6	132221	132226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047498
3015	NC_013740	CAT	2	6	132236	132241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047498
3016	NC_013740	CTT	2	6	132252	132257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047498
3017	NC_013740	GGCA	2	8	132296	132303	25 %	0 %	50 %	25 %	284047498
3018	NC_013740	CAT	3	9	132435	132443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047498
3019	NC_013740	CCG	2	6	132445	132450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047498
3020	NC_013740	CCG	2	6	132481	132486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047498
3021	NC_013740	TTG	2	6	132547	132552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284047498
3022	NC_013740	TGT	2	6	132596	132601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284047498
3023	NC_013740	ACGGC	2	10	132607	132616	20 %	0 %	40 %	40 %	284047498
3024	NC_013740	GCAG	2	8	132664	132671	25 %	0 %	50 %	25 %	284047498
3025	NC_013740	GCAGAC	2	12	132747	132758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047498
3026	NC_013740	TCT	2	6	132785	132790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047498
3027	NC_013740	TGT	2	6	132815	132820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284047498
3028	NC_013740	GAT	2	6	132831	132836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047498
3029	NC_013740	GAT	2	6	132882	132887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047498
3030	NC_013740	TCG	2	6	132889	132894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047498
3031	NC_013740	CAG	2	6	132903	132908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047498
3032	NC_013740	GGT	2	6	132914	132919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047498
3033	NC_013740	CAG	2	6	132954	132959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047498
3034	NC_013740	CCTT	2	8	132982	132989	0 %	50 %	0 %	50 %	284047498
3035	NC_013740	GCC	2	6	133026	133031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047498
3036	NC_013740	TTC	2	6	133086	133091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047498
3037	NC_013740	CAT	2	6	133133	133138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047498
3038	NC_013740	TGA	2	6	133142	133147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047498
3039	NC_013740	ACC	2	6	133294	133299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047498
3040	NC_013740	G	6	6	133398	133403	0 %	0 %	100 %	0 %	284047498
3041	NC_013740	CTT	2	6	133430	133435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047498
3042	NC_013740	TA	3	6	133490	133495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_013740	A	6	6	133508	133513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_013740	GAA	2	6	133547	133552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_013740	TCT	2	6	133568	133573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_013740	A	7	7	133586	133592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_013740	TAA	2	6	133619	133624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_013740	GAA	2	6	133664	133669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_013740	TA	3	6	133689	133694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_013740	AT	4	8	133698	133705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_013740	GGA	2	6	133732	133737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_013740	GAT	2	6	133763	133768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047499
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3054	NC_013740	GGC	2	6	133927	133932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047499
3055	NC_013740	TGC	2	6	133989	133994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047499
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3057	NC_013740	CCT	2	6	134061	134066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047499
3058	NC_013740	CCT	2	6	134173	134178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047499
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3060	NC_013740	CGG	2	6	134202	134207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047499
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3074	NC_013740	A	6	6	134752	134757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_013740	AAC	2	6	134768	134773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_013740	GCT	2	6	134819	134824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3090	NC_013740	TGAA	2	8	135879	135886	50 %	25 %	25 %	0 %	284047501
3091	NC_013740	GAA	2	6	135901	135906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047501
3092	NC_013740	GCCCT	2	10	135911	135920	0 %	20 %	20 %	60 %	284047501
3093	NC_013740	GGA	3	9	135964	135972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047501
3094	NC_013740	TG	3	6	135992	135997	0 %	50 %	50 %	0 %	284047501
3095	NC_013740	GCTCC	2	10	136074	136083	0 %	20 %	20 %	60 %	284047501
3096	NC_013740	GGC	2	6	136094	136099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047501
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3100	NC_013740	GGAA	2	8	136413	136420	50 %	0 %	50 %	0 %	284047501
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3123	NC_013740	C	6	6	137570	137575	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3246	NC_013740	AAAGA	2	10	143296	143305	80 %	0 %	20 %	0 %	284047507
3247	NC_013740	CTG	2	6	143335	143340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047507
3248	NC_013740	AGA	2	6	143385	143390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047507
3249	NC_013740	GAA	2	6	143394	143399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047507
3250	NC_013740	TGC	2	6	143462	143467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047507
3251	NC_013740	CCA	2	6	143483	143488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047507
3252	NC_013740	CGA	2	6	143505	143510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047507
3253	NC_013740	GAA	2	6	143545	143550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047507
3254	NC_013740	ACCT	2	8	143572	143579	25 %	25 %	0 %	50 %	284047507
3255	NC_013740	GCC	2	6	143593	143598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047507
3256	NC_013740	GGCT	2	8	143599	143606	0 %	25 %	50 %	25 %	284047507
3257	NC_013740	TGC	2	6	143612	143617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047507
3258	NC_013740	G	6	6	143625	143630	0 %	0 %	100 %	0 %	284047507
3259	NC_013740	CGGAAG	2	12	143650	143661	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	284047507
3260	NC_013740	GAT	2	6	143721	143726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_013740	A	7	7	143864	143870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_013740	GGAA	2	8	144098	144105	50 %	0 %	50 %	0 %	284047508
3263	NC_013740	TCA	2	6	144116	144121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047508
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3269	NC_013740	G	8	8	144330	144337	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3270	NC_013740	GCA	2	6	144348	144353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3271	NC_013740	CTT	2	6	144404	144409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3272	NC_013740	GGA	2	6	144415	144420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3273	NC_013740	TCA	2	6	144437	144442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047509
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3275	NC_013740	CTG	2	6	144607	144612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047509
3276	NC_013740	G	6	6	144695	144700	0 %	0 %	100 %	0 %	284047509
3277	NC_013740	GAAG	2	8	144732	144739	50 %	0 %	50 %	0 %	284047509
3278	NC_013740	TGG	3	9	144749	144757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047509
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3283	NC_013740	TTCA	2	8	144993	145000	25 %	50 %	0 %	25 %	284047510
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3286	NC_013740	GATGCC	2	12	145149	145160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284047510
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3291	NC_013740	CCA	2	6	145367	145372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047510
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3303	NC_013740	GAT	2	6	145662	145667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047510
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3342	NC_013740	CCTT	2	8	147389	147396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3343	NC_013740	TTTC	2	8	147405	147412	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3344	NC_013740	G	7	7	147443	147449	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3345	NC_013740	AAAC	2	8	147480	147487	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3346	NC_013740	ATA	2	6	147531	147536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3347	NC_013740	ACAA	2	8	147538	147545	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3348	NC_013740	CAAA	2	8	147546	147553	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3349	NC_013740	GGAG	2	8	147563	147570	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3350	NC_013740	GAA	2	6	147577	147582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047512
3351	NC_013740	ACTGGT	2	12	147595	147606	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284047512
3352	NC_013740	CTG	2	6	147608	147613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047512
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3354	NC_013740	CAG	2	6	147671	147676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047512
3355	NC_013740	GTG	3	9	147677	147685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047512
3356	NC_013740	G	6	6	147690	147695	0 %	0 %	100 %	0 %	284047512
3357	NC_013740	CGG	2	6	147716	147721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047512
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3359	NC_013740	A	6	6	147849	147854	100 %	0 %	0 %	0 %	284047512
3360	NC_013740	AGA	2	6	147858	147863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047512
3361	NC_013740	T	6	6	147945	147950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3362	NC_013740	CCCTG	2	10	148111	148120	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3363	NC_013740	TCCAG	2	10	148180	148189	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3364	NC_013740	GCA	2	6	148229	148234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3365	NC_013740	GGA	2	6	148265	148270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3366	NC_013740	GCT	2	6	148308	148313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3368	NC_013740	CAG	2	6	148432	148437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3492	NC_013740	AAG	2	6	154050	154055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_013740	GCAA	2	8	154065	154072	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3494	NC_013740	T	6	6	154081	154086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_013740	ATC	2	6	154124	154129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3496	NC_013740	CTG	2	6	154143	154148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3497	NC_013740	GGAG	2	8	154153	154160	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_013740	GCT	2	6	154189	154194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047516
3499	NC_013740	CTG	2	6	154220	154225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047516
3500	NC_013740	CGG	2	6	154227	154232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047516

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