MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Aggregatibacter phage S1249

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013597	CACG	2	8	675	682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013597	TTGA	2	8	802	809	25 %	50 %	25 %	0 %	273809545
3	NC_013597	TGGT	2	8	2268	2275	0 %	50 %	50 %	0 %	273809546
4	NC_013597	CAGC	2	8	2841	2848	25 %	0 %	25 %	50 %	273809547
5	NC_013597	GCCC	2	8	2871	2878	0 %	0 %	25 %	75 %	273809547
6	NC_013597	TGCC	2	8	3231	3238	0 %	25 %	25 %	50 %	273809548
7	NC_013597	GATA	2	8	3342	3349	50 %	25 %	25 %	0 %	273809548
8	NC_013597	GTCC	2	8	4166	4173	0 %	25 %	25 %	50 %	273809548
9	NC_013597	TTGA	2	8	4842	4849	25 %	50 %	25 %	0 %	273809550
10	NC_013597	CAAC	2	8	5128	5135	50 %	0 %	0 %	50 %	273809550
11	NC_013597	TCTT	2	8	5342	5349	0 %	75 %	0 %	25 %	273809551
12	NC_013597	GATT	2	8	5473	5480	25 %	50 %	25 %	0 %	273809551
13	NC_013597	GTCC	2	8	5868	5875	0 %	25 %	25 %	50 %	273809551
14	NC_013597	AACC	2	8	5967	5974	50 %	0 %	0 %	50 %	273809551
15	NC_013597	TTGA	2	8	6010	6017	25 %	50 %	25 %	0 %	273809551
16	NC_013597	TCAA	2	8	6203	6210	50 %	25 %	0 %	25 %	273809552
17	NC_013597	TACT	2	8	6359	6366	25 %	50 %	0 %	25 %	273809552
18	NC_013597	GTTT	2	8	6433	6440	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013597	AAGC	2	8	6602	6609	50 %	0 %	25 %	25 %	273809553
20	NC_013597	CCCG	2	8	6881	6888	0 %	0 %	25 %	75 %	273809554
21	NC_013597	TGCC	2	8	6903	6910	0 %	25 %	25 %	50 %	273809554
22	NC_013597	ATTG	2	8	7387	7394	25 %	50 %	25 %	0 %	273809554
23	NC_013597	GATT	2	8	7574	7581	25 %	50 %	25 %	0 %	273809555
24	NC_013597	TTCA	2	8	8944	8951	25 %	50 %	0 %	25 %	273809555
25	NC_013597	TGCT	2	8	9469	9476	0 %	50 %	25 %	25 %	273809555
26	NC_013597	TTGA	2	8	9913	9920	25 %	50 %	25 %	0 %	273809556
27	NC_013597	GATA	2	8	10423	10430	50 %	25 %	25 %	0 %	273809557
28	NC_013597	GTCG	2	8	10782	10789	0 %	25 %	50 %	25 %	273809558
29	NC_013597	GGCG	2	8	11001	11008	0 %	0 %	75 %	25 %	273809558
30	NC_013597	GTTG	2	8	11239	11246	0 %	50 %	50 %	0 %	273809558
31	NC_013597	TGCC	2	8	12088	12095	0 %	25 %	25 %	50 %	273809558
32	NC_013597	CATT	2	8	12385	12392	25 %	50 %	0 %	25 %	273809559
33	NC_013597	GATT	2	8	12985	12992	25 %	50 %	25 %	0 %	273809560
34	NC_013597	GCTT	2	8	13054	13061	0 %	50 %	25 %	25 %	273809561
35	NC_013597	CAAT	2	8	13471	13478	50 %	25 %	0 %	25 %	273809562
36	NC_013597	AGAA	2	8	13727	13734	75 %	0 %	25 %	0 %	273809562
37	NC_013597	TTTA	2	8	14385	14392	25 %	75 %	0 %	0 %	273809563
38	NC_013597	CTTA	2	8	14685	14692	25 %	50 %	0 %	25 %	273809563
39	NC_013597	GTTG	2	8	14810	14817	0 %	50 %	50 %	0 %	273809564
40	NC_013597	CCTT	2	8	14970	14977	0 %	50 %	0 %	50 %	273809564
41	NC_013597	CAAA	2	8	16142	16149	75 %	0 %	0 %	25 %	273809565
42	NC_013597	TCTA	2	8	16421	16428	25 %	50 %	0 %	25 %	273809566
43	NC_013597	GATT	2	8	16760	16767	25 %	50 %	25 %	0 %	273809566
44	NC_013597	CCTT	2	8	17350	17357	0 %	50 %	0 %	50 %	273809568
45	NC_013597	GCAA	2	8	18538	18545	50 %	0 %	25 %	25 %	273809568
46	NC_013597	GGTT	2	8	19082	19089	0 %	50 %	50 %	0 %	273809568
47	NC_013597	CGGT	2	8	19162	19169	0 %	25 %	50 %	25 %	273809568
48	NC_013597	TAAT	2	8	20136	20143	50 %	50 %	0 %	0 %	273809569
49	NC_013597	TGAT	2	8	20160	20167	25 %	50 %	25 %	0 %	273809569
50	NC_013597	TCGG	2	8	20291	20298	0 %	25 %	50 %	25 %	273809569
51	NC_013597	CAAC	2	8	20334	20341	50 %	0 %	0 %	50 %	273809569
52	NC_013597	TGAG	2	8	20403	20410	25 %	25 %	50 %	0 %	273809569
53	NC_013597	GTCA	2	8	20563	20570	25 %	25 %	25 %	25 %	273809569
54	NC_013597	CATT	2	8	20766	20773	25 %	50 %	0 %	25 %	273809570
55	NC_013597	TTTG	2	8	21227	21234	0 %	75 %	25 %	0 %	273809570
56	NC_013597	AACC	2	8	21271	21278	50 %	0 %	0 %	50 %	273809570
57	NC_013597	GTTA	2	8	22566	22573	25 %	50 %	25 %	0 %	273809571
58	NC_013597	GCTT	2	8	23847	23854	0 %	50 %	25 %	25 %	273809575
59	NC_013597	GTTG	2	8	24355	24362	0 %	50 %	50 %	0 %	273809576
60	NC_013597	GGAT	2	8	26332	26339	25 %	25 %	50 %	0 %	273809579
61	NC_013597	CGAC	2	8	26428	26435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013597	CCAA	2	8	27139	27146	50 %	0 %	0 %	50 %	273809581
63	NC_013597	GGCA	2	8	27271	27278	25 %	0 %	50 %	25 %	273809581
64	NC_013597	TTCA	2	8	27434	27441	25 %	50 %	0 %	25 %	273809581
65	NC_013597	AATC	2	8	27493	27500	50 %	25 %	0 %	25 %	273809581
66	NC_013597	TAAT	2	8	27785	27792	50 %	50 %	0 %	0 %	273809582
67	NC_013597	ATTA	2	8	27812	27819	50 %	50 %	0 %	0 %	273809583
68	NC_013597	CAAA	2	8	28105	28112	75 %	0 %	0 %	25 %	273809584
69	NC_013597	ATAA	2	8	29437	29444	75 %	25 %	0 %	0 %	273809587
70	NC_013597	TACT	2	8	29488	29495	25 %	50 %	0 %	25 %	273809587
71	NC_013597	TTAA	2	8	30398	30405	50 %	50 %	0 %	0 %	273809588
72	NC_013597	TTTA	2	8	31080	31087	25 %	75 %	0 %	0 %	273809589
73	NC_013597	TGGG	2	8	31119	31126	0 %	25 %	75 %	0 %	273809589
74	NC_013597	TATT	2	8	31208	31215	25 %	75 %	0 %	0 %	273809589
75	NC_013597	CATT	2	8	31535	31542	25 %	50 %	0 %	25 %	273809591
76	NC_013597	AAAT	2	8	31818	31825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013597	AAAT	2	8	32483	32490	75 %	25 %	0 %	0 %	273809592
78	NC_013597	ATTT	2	8	32497	32504	25 %	75 %	0 %	0 %	273809592
79	NC_013597	ACAA	2	8	32974	32981	75 %	0 %	0 %	25 %	273809593
80	NC_013597	TCAT	2	8	33034	33041	25 %	50 %	0 %	25 %	273809593
81	NC_013597	AGAT	2	8	33556	33563	50 %	25 %	25 %	0 %	273809593
82	NC_013597	CAAA	2	8	33845	33852	75 %	0 %	0 %	25 %	273809593
83	NC_013597	CATC	2	8	34103	34110	25 %	25 %	0 %	50 %	273809593
84	NC_013597	ATTT	2	8	34413	34420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013597	ATTA	2	8	34623	34630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013597	CAAA	2	8	34757	34764	75 %	0 %	0 %	25 %	273809594
87	NC_013597	TGGG	2	8	34770	34777	0 %	25 %	75 %	0 %	273809594
88	NC_013597	GACA	2	8	34847	34854	50 %	0 %	25 %	25 %	273809594
89	NC_013597	AATC	2	8	34927	34934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013597	AAAG	2	8	35107	35114	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013597	TCGG	2	8	35303	35310	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013597	AATT	2	8	35683	35690	50 %	50 %	0 %	0 %	273809595
93	NC_013597	TTGT	2	8	35949	35956	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013597	TCTT	2	8	36147	36154	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013597	TAAA	2	8	36181	36188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013597	TTTA	2	8	36247	36254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013597	TTCA	2	8	36298	36305	25 %	50 %	0 %	25 %	273809596
98	NC_013597	TTAA	2	8	36406	36413	50 %	50 %	0 %	0 %	273809596
99	NC_013597	ATTT	2	8	36557	36564	25 %	75 %	0 %	0 %	273809596
100	NC_013597	TGGC	2	8	36600	36607	0 %	25 %	50 %	25 %	273809596
101	NC_013597	AACG	2	8	36774	36781	50 %	0 %	25 %	25 %	273809597
102	NC_013597	CTAA	2	8	36995	37002	50 %	25 %	0 %	25 %	273809597
103	NC_013597	AATT	2	8	37031	37038	50 %	50 %	0 %	0 %	273809597
104	NC_013597	CCTA	2	8	37443	37450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013597	CCAC	2	8	37704	37711	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_013597	AACC	2	8	37808	37815	50 %	0 %	0 %	50 %	273809598
107	NC_013597	TGCT	2	8	37823	37830	0 %	50 %	25 %	25 %	273809598
108	NC_013597	TAAC	2	8	38468	38475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013597	ATTT	2	8	38710	38717	25 %	75 %	0 %	0 %	273809599
110	NC_013597	TGAT	2	8	39152	39159	25 %	50 %	25 %	0 %	273809601
111	NC_013597	GTTT	2	8	39375	39382	0 %	75 %	25 %	0 %	273809602
112	NC_013597	GGCA	2	8	39398	39405	25 %	0 %	50 %	25 %	273809602
113	NC_013597	AACA	2	8	39518	39525	75 %	0 %	0 %	25 %	273809602
114	NC_013597	CAAA	2	8	39862	39869	75 %	0 %	0 %	25 %	273809602
115	NC_013597	AAAC	2	8	40004	40011	75 %	0 %	0 %	25 %	273809602
116	NC_013597	AAAG	2	8	40303	40310	75 %	0 %	25 %	0 %	273809603
117	NC_013597	AACC	2	8	41536	41543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013597	TGAA	2	8	41598	41605	50 %	25 %	25 %	0 %	273809606
119	NC_013597	TATC	2	8	42340	42347	25 %	50 %	0 %	25 %	273809607
120	NC_013597	CAAA	2	8	42729	42736	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013597	GAAG	2	8	43203	43210	50 %	0 %	50 %	0 %	273809608
122	NC_013597	TTGG	2	8	43284	43291	0 %	50 %	50 %	0 %	273809608
123	NC_013597	TAAC	2	8	43896	43903	50 %	25 %	0 %	25 %	273809608

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.