MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans plasmid S25

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013438	ATTT	2	8	533	540	25 %	75 %	0 %	0 %	261876184
2	NC_013438	AATT	2	8	555	562	50 %	50 %	0 %	0 %	261876184
3	NC_013438	AATT	2	8	577	584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013438	TTTC	2	8	1269	1276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013438	TATT	2	8	1283	1290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013438	AATT	2	8	1561	1568	50 %	50 %	0 %	0 %	261876187
7	NC_013438	TAAC	2	8	1666	1673	50 %	25 %	0 %	25 %	261876187
8	NC_013438	TAAA	2	8	1855	1862	75 %	25 %	0 %	0 %	261876187
9	NC_013438	AGAA	2	8	2248	2255	75 %	0 %	25 %	0 %	261876187
10	NC_013438	CAAG	2	8	2461	2468	50 %	0 %	25 %	25 %	261876187
11	NC_013438	CCAA	2	8	3036	3043	50 %	0 %	0 %	50 %	261876189
12	NC_013438	TTTC	2	8	3281	3288	0 %	75 %	0 %	25 %	261876189
13	NC_013438	TCAA	2	8	3502	3509	50 %	25 %	0 %	25 %	261876189
14	NC_013438	TCAA	2	8	3531	3538	50 %	25 %	0 %	25 %	261876189
15	NC_013438	AAAC	2	8	3592	3599	75 %	0 %	0 %	25 %	261876190
16	NC_013438	TCAA	2	8	3637	3644	50 %	25 %	0 %	25 %	261876190
17	NC_013438	TACT	2	8	3728	3735	25 %	50 %	0 %	25 %	261876190
18	NC_013438	TATT	2	8	3957	3964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013438	CTTT	2	8	4119	4126	0 %	75 %	0 %	25 %	261876191
20	NC_013438	GTAT	2	8	4139	4146	25 %	50 %	25 %	0 %	261876191
21	NC_013438	ACGC	2	8	5123	5130	25 %	0 %	25 %	50 %	261876191
22	NC_013438	TTGA	2	8	5219	5226	25 %	50 %	25 %	0 %	261876191
23	NC_013438	ATGT	2	8	5319	5326	25 %	50 %	25 %	0 %	261876191
24	NC_013438	AAAC	2	8	5613	5620	75 %	0 %	0 %	25 %	261876191
25	NC_013438	ATTT	2	8	5825	5832	25 %	75 %	0 %	0 %	261876191
26	NC_013438	CGTG	2	8	5860	5867	0 %	25 %	50 %	25 %	261876191
27	NC_013438	CGTG	2	8	6040	6047	0 %	25 %	50 %	25 %	261876191
28	NC_013438	AATC	2	8	6274	6281	50 %	25 %	0 %	25 %	261876191
29	NC_013438	ATGA	2	8	7170	7177	50 %	25 %	25 %	0 %	261876192
30	NC_013438	CGCA	2	8	7575	7582	25 %	0 %	25 %	50 %	261876192
31	NC_013438	GGTT	2	8	8264	8271	0 %	50 %	50 %	0 %	261876194
32	NC_013438	TAAA	2	8	8773	8780	75 %	25 %	0 %	0 %	261876194
33	NC_013438	GTAT	2	8	9076	9083	25 %	50 %	25 %	0 %	261876196
34	NC_013438	TTAT	2	8	9731	9738	25 %	75 %	0 %	0 %	261876197
35	NC_013438	CCGA	2	8	10130	10137	25 %	0 %	25 %	50 %	261876197
36	NC_013438	ATCA	2	8	10236	10243	50 %	25 %	0 %	25 %	261876197
37	NC_013438	TAAA	2	8	10245	10252	75 %	25 %	0 %	0 %	261876197
38	NC_013438	TTTA	2	8	10775	10782	25 %	75 %	0 %	0 %	261876198
39	NC_013438	CAAG	2	8	10790	10797	50 %	0 %	25 %	25 %	261876198
40	NC_013438	CCGA	2	8	10896	10903	25 %	0 %	25 %	50 %	261876198
41	NC_013438	CTAT	2	8	11559	11566	25 %	50 %	0 %	25 %	261876198
42	NC_013438	GCGT	2	8	12400	12407	0 %	25 %	50 %	25 %	261876199
43	NC_013438	GATA	2	8	12780	12787	50 %	25 %	25 %	0 %	261876199
44	NC_013438	CAAG	2	8	13467	13474	50 %	0 %	25 %	25 %	261876201
45	NC_013438	TATT	2	8	13746	13753	25 %	75 %	0 %	0 %	261876202
46	NC_013438	TTTA	2	8	14481	14488	25 %	75 %	0 %	0 %	261876202
47	NC_013438	ACGA	2	8	14798	14805	50 %	0 %	25 %	25 %	261876202
48	NC_013438	GTGC	2	8	15663	15670	0 %	25 %	50 %	25 %	261876203
49	NC_013438	AAAT	2	8	16329	16336	75 %	25 %	0 %	0 %	261876204
50	NC_013438	GAAT	2	8	16451	16458	50 %	25 %	25 %	0 %	261876205
51	NC_013438	AGTG	2	8	16521	16528	25 %	25 %	50 %	0 %	261876205
52	NC_013438	ATTT	2	8	17372	17379	25 %	75 %	0 %	0 %	261876206
53	NC_013438	TTTG	2	8	17517	17524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013438	AATT	2	8	17747	17754	50 %	50 %	0 %	0 %	261876207
55	NC_013438	GGTT	2	8	17956	17963	0 %	50 %	50 %	0 %	261876207
56	NC_013438	AGTA	2	8	18029	18036	50 %	25 %	25 %	0 %	261876208
57	NC_013438	TCGT	2	8	18163	18170	0 %	50 %	25 %	25 %	261876208
58	NC_013438	TGAT	2	8	18289	18296	25 %	50 %	25 %	0 %	261876208
59	NC_013438	GAAA	2	8	18549	18556	75 %	0 %	25 %	0 %	261876208
60	NC_013438	AAAG	2	8	18856	18863	75 %	0 %	25 %	0 %	261876209
61	NC_013438	CGAC	2	8	19658	19665	25 %	0 %	25 %	50 %	261876210
62	NC_013438	GAAA	2	8	19677	19684	75 %	0 %	25 %	0 %	261876210
63	NC_013438	AGCA	2	8	20336	20343	50 %	0 %	25 %	25 %	261876210
64	NC_013438	AAGA	2	8	20371	20378	75 %	0 %	25 %	0 %	261876210
65	NC_013438	GATT	2	8	20616	20623	25 %	50 %	25 %	0 %	261876210
66	NC_013438	ATTC	2	8	20720	20727	25 %	50 %	0 %	25 %	261876210
67	NC_013438	TAGA	2	8	20729	20736	50 %	25 %	25 %	0 %	261876210
68	NC_013438	TTAA	2	8	21073	21080	50 %	50 %	0 %	0 %	261876210
69	NC_013438	AAAG	2	8	21395	21402	75 %	0 %	25 %	0 %	261876211
70	NC_013438	TAAA	2	8	21615	21622	75 %	25 %	0 %	0 %	261876212
71	NC_013438	TTAA	2	8	21626	21633	50 %	50 %	0 %	0 %	261876212
72	NC_013438	AACT	2	8	21951	21958	50 %	25 %	0 %	25 %	261876213
73	NC_013438	AAAG	2	8	22688	22695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013438	TCTT	2	8	22763	22770	0 %	75 %	0 %	25 %	261876215
75	NC_013438	TTGA	2	8	23083	23090	25 %	50 %	25 %	0 %	261876216
76	NC_013438	CAAC	2	8	23221	23228	50 %	0 %	0 %	50 %	261876216
77	NC_013438	TGAT	2	8	23432	23439	25 %	50 %	25 %	0 %	261876216
78	NC_013438	TGAA	2	8	23480	23487	50 %	25 %	25 %	0 %	261876216
79	NC_013438	TTCT	2	8	24108	24115	0 %	75 %	0 %	25 %	261876219
80	NC_013438	TTTA	2	8	24136	24143	25 %	75 %	0 %	0 %	261876219
81	NC_013438	TAAA	2	8	24969	24976	75 %	25 %	0 %	0 %	261876219
82	NC_013438	TAAT	2	8	25524	25531	50 %	50 %	0 %	0 %	261876220
83	NC_013438	TGAT	2	8	25543	25550	25 %	50 %	25 %	0 %	261876220
84	NC_013438	TACA	2	8	25552	25559	50 %	25 %	0 %	25 %	261876220
85	NC_013438	TATC	2	8	25716	25723	25 %	50 %	0 %	25 %	261876220
86	NC_013438	CAAA	2	8	25895	25902	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013438	GAAA	2	8	26051	26058	75 %	0 %	25 %	0 %	261876221
88	NC_013438	ATAA	2	8	26070	26077	75 %	25 %	0 %	0 %	261876221
89	NC_013438	CAAG	2	8	26436	26443	50 %	0 %	25 %	25 %	261876222
90	NC_013438	GAAA	2	8	26614	26621	75 %	0 %	25 %	0 %	261876222
91	NC_013438	CAAA	2	8	26704	26711	75 %	0 %	0 %	25 %	261876222
92	NC_013438	AAAC	2	8	27088	27095	75 %	0 %	0 %	25 %	261876222
93	NC_013438	CGAG	2	8	27165	27172	25 %	0 %	50 %	25 %	261876222
94	NC_013438	TCAA	2	8	27443	27450	50 %	25 %	0 %	25 %	261876222
95	NC_013438	ACAA	2	8	27495	27502	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013438	TATG	2	8	27546	27553	25 %	50 %	25 %	0 %	261876223
97	NC_013438	AGAA	2	8	28344	28351	75 %	0 %	25 %	0 %	261876223
98	NC_013438	ATAA	2	8	28387	28394	75 %	25 %	0 %	0 %	261876223
99	NC_013438	GTAA	2	8	28462	28469	50 %	25 %	25 %	0 %	261876223
100	NC_013438	TCAA	2	8	28743	28750	50 %	25 %	0 %	25 %	261876223
101	NC_013438	ATGA	2	8	28846	28853	50 %	25 %	25 %	0 %	261876223
102	NC_013438	ATTT	2	8	28880	28887	25 %	75 %	0 %	0 %	261876223
103	NC_013438	ATAA	2	8	28945	28952	75 %	25 %	0 %	0 %	261876223
104	NC_013438	ATAA	2	8	29017	29024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013438	GCAA	2	8	29123	29130	50 %	0 %	25 %	25 %	261876224
106	NC_013438	AAAG	2	8	29491	29498	75 %	0 %	25 %	0 %	261876224
107	NC_013438	TCAC	2	8	29561	29568	25 %	25 %	0 %	50 %	261876224
108	NC_013438	TAAA	2	8	30020	30027	75 %	25 %	0 %	0 %	261876224
109	NC_013438	TAGA	2	8	30248	30255	50 %	25 %	25 %	0 %	261876224
110	NC_013438	AAAG	3	12	30294	30305	75 %	0 %	25 %	0 %	261876224
111	NC_013438	TAAT	2	8	30616	30623	50 %	50 %	0 %	0 %	261876225
112	NC_013438	CATA	2	8	30634	30641	50 %	25 %	0 %	25 %	261876225
113	NC_013438	TATT	2	8	30873	30880	25 %	75 %	0 %	0 %	261876225

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.