MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 28706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013416	TCA	2	6	16	21	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013416	CCG	2	6	100	105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013416	CGG	2	6	125	130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013416	CAA	2	6	137	142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013416	GGC	2	6	144	149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013416	CTT	2	6	404	409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866723
7	NC_013416	TCT	2	6	412	417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866723
8	NC_013416	GCG	3	9	428	436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866723
9	NC_013416	CCT	2	6	473	478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261866723
10	NC_013416	TCG	2	6	493	498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866723
11	NC_013416	CGC	2	6	635	640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866724
12	NC_013416	CGC	2	6	662	667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866724
13	NC_013416	TTA	2	6	720	725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866724
14	NC_013416	TCA	2	6	733	738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866724
15	NC_013416	CGC	2	6	748	753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866724
16	NC_013416	TTC	2	6	950	955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866724
17	NC_013416	ATC	2	6	1137	1142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866724
18	NC_013416	TTC	2	6	1169	1174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866724
19	NC_013416	GCA	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866724
20	NC_013416	TTC	2	6	1263	1268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866724
21	NC_013416	CAA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866724
22	NC_013416	GTT	2	6	1412	1417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866724
23	NC_013416	GGT	2	6	1517	1522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013416	TCT	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866725
25	NC_013416	TCA	2	6	1572	1577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866725
26	NC_013416	TCT	2	6	1595	1600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866725
27	NC_013416	TCA	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866725
28	NC_013416	CTT	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866725
29	NC_013416	GCT	2	6	1754	1759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866725
30	NC_013416	TGC	2	6	1807	1812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866725
31	NC_013416	GGC	2	6	1828	1833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866725
32	NC_013416	CTT	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866725
33	NC_013416	GTT	2	6	2067	2072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866725
34	NC_013416	CTT	2	6	2193	2198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866725
35	NC_013416	TTG	2	6	2237	2242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866725
36	NC_013416	CCG	2	6	2480	2485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866725
37	NC_013416	TGG	2	6	2813	2818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866725
38	NC_013416	ACC	2	6	3072	3077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866725
39	NC_013416	TGT	2	6	3236	3241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866725
40	NC_013416	CAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866725
41	NC_013416	CAC	2	6	3349	3354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866725
42	NC_013416	ACC	2	6	3403	3408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866725
43	NC_013416	AGT	2	6	3522	3527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866725
44	NC_013416	GTT	2	6	3538	3543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866725
45	NC_013416	AAT	2	6	3651	3656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866726
46	NC_013416	TCT	2	6	3778	3783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866726
47	NC_013416	AGT	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013416	AGA	2	6	4076	4081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013416	GAA	2	6	4096	4101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013416	GAA	2	6	4206	4211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013416	GAA	2	6	4247	4252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013416	TCC	2	6	4268	4273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013416	TGA	2	6	4490	4495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866727
54	NC_013416	ACA	2	6	4627	4632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866727
55	NC_013416	AAG	2	6	4633	4638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866727
56	NC_013416	ACC	2	6	4840	4845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866728
57	NC_013416	TCA	2	6	5050	5055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866729
58	NC_013416	GGC	2	6	5113	5118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866729
59	NC_013416	AAT	2	6	5132	5137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866729
60	NC_013416	TTG	2	6	5145	5150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866729
61	NC_013416	TGT	2	6	5284	5289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866729
62	NC_013416	GTT	2	6	5309	5314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866729
63	NC_013416	ACA	2	6	5561	5566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866729
64	NC_013416	CAC	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866729
65	NC_013416	AAT	2	6	5655	5660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866729
66	NC_013416	AAT	2	6	5763	5768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866729
67	NC_013416	CGA	2	6	5792	5797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866729
68	NC_013416	CCG	2	6	5877	5882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866729
69	NC_013416	CGA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866729
70	NC_013416	AGG	2	6	5954	5959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261866729
71	NC_013416	TTG	2	6	6000	6005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866729
72	NC_013416	CAA	2	6	6077	6082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866729
73	NC_013416	AAT	2	6	6158	6163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866729
74	NC_013416	GCC	2	6	6194	6199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866730
75	NC_013416	ATA	2	6	6239	6244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866730
76	NC_013416	GTT	3	9	6426	6434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866730
77	NC_013416	CAC	2	6	6555	6560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866730
78	NC_013416	CCG	2	6	6617	6622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866730
79	NC_013416	AAT	2	6	6680	6685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866730
80	NC_013416	TCA	2	6	6716	6721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866730
81	NC_013416	TTG	2	6	6742	6747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866730
82	NC_013416	GTT	2	6	6753	6758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866730
83	NC_013416	TCC	2	6	6796	6801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261866730
84	NC_013416	TCT	2	6	6884	6889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866730
85	NC_013416	AAG	2	6	6909	6914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866730
86	NC_013416	TAA	2	6	7159	7164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866730
87	NC_013416	CCA	2	6	7296	7301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866730
88	NC_013416	TGG	2	6	7389	7394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866731
89	NC_013416	TGC	2	6	7398	7403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866731
90	NC_013416	TGT	2	6	7444	7449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866731
91	NC_013416	TCT	2	6	7549	7554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013416	ACG	2	6	7588	7593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013416	GTT	2	6	7628	7633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013416	GAC	2	6	7992	7997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866732
95	NC_013416	ATT	3	9	8000	8008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866732
96	NC_013416	GAA	2	6	8058	8063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866732
97	NC_013416	CCA	2	6	8095	8100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866732
98	NC_013416	ACC	2	6	8122	8127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866732
99	NC_013416	TGG	2	6	8293	8298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866732
100	NC_013416	CCG	2	6	8349	8354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866732
101	NC_013416	TCA	2	6	8452	8457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866732
102	NC_013416	ACA	2	6	8570	8575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866733
103	NC_013416	ATT	2	6	8661	8666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866733
104	NC_013416	CAA	2	6	8773	8778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866733
105	NC_013416	ACA	3	9	8781	8789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866733
106	NC_013416	CTT	2	6	8844	8849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866733
107	NC_013416	CGG	2	6	9023	9028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866733
108	NC_013416	ATG	2	6	9076	9081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866733
109	NC_013416	GTG	2	6	9137	9142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866733
110	NC_013416	ATT	2	6	9189	9194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866733
111	NC_013416	ATG	2	6	9240	9245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013416	TGT	2	6	9329	9334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866734
113	NC_013416	CAC	2	6	9436	9441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866734
114	NC_013416	CTG	2	6	9461	9466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866734
115	NC_013416	CCG	2	6	9480	9485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866734
116	NC_013416	CCA	2	6	9620	9625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866735
117	NC_013416	CAT	2	6	9677	9682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866735
118	NC_013416	AAT	2	6	9699	9704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866735
119	NC_013416	CAA	2	6	9714	9719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866735
120	NC_013416	CTG	2	6	9857	9862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866735
121	NC_013416	CAT	2	6	10002	10007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866735
122	NC_013416	CAC	2	6	10063	10068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866736
123	NC_013416	TAT	2	6	10077	10082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866736
124	NC_013416	ACA	2	6	10320	10325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866737
125	NC_013416	CGT	2	6	10341	10346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866737
126	NC_013416	CAC	2	6	10428	10433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866737
127	NC_013416	AAC	2	6	10441	10446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866737
128	NC_013416	CCG	2	6	10529	10534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866737
129	NC_013416	TGA	2	6	10619	10624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866737
130	NC_013416	CGG	2	6	10659	10664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866737
131	NC_013416	TCA	2	6	10682	10687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866737
132	NC_013416	TCG	2	6	10778	10783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866737
133	NC_013416	CCA	2	6	10949	10954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866737
134	NC_013416	CAC	2	6	11010	11015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866737
135	NC_013416	CGC	2	6	11068	11073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866738
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137	NC_013416	CGC	2	6	11290	11295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866738
138	NC_013416	GAT	2	6	11305	11310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866738
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258	NC_013416	GGT	2	6	19421	19426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866749
259	NC_013416	AGC	2	6	19435	19440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866749
260	NC_013416	GAA	2	6	19541	19546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866749
261	NC_013416	ATC	2	6	19571	19576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866749
262	NC_013416	GCT	2	6	19582	19587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866749
263	NC_013416	GCA	2	6	19682	19687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866749
264	NC_013416	GTG	2	6	19724	19729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866749
265	NC_013416	ATT	2	6	19737	19742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866749
266	NC_013416	TGG	2	6	19755	19760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866749
267	NC_013416	AGA	2	6	19882	19887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866749
268	NC_013416	ATG	2	6	19945	19950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866749
269	NC_013416	TGA	2	6	19965	19970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866750
270	NC_013416	TCA	2	6	20081	20086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866750
271	NC_013416	GTT	2	6	20165	20170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866750
272	NC_013416	TGA	3	9	20259	20267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866750
273	NC_013416	TCG	2	6	20330	20335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866750
274	NC_013416	TGT	2	6	20529	20534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866750
275	NC_013416	ATA	2	6	20546	20551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866750
276	NC_013416	GGT	2	6	20602	20607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866750
277	NC_013416	GCA	2	6	20629	20634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866750
278	NC_013416	GGC	2	6	20644	20649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866750
279	NC_013416	TGA	2	6	20717	20722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866750
280	NC_013416	GTT	2	6	20814	20819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866750
281	NC_013416	AAC	2	6	20885	20890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866750
282	NC_013416	TGG	2	6	20913	20918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866750
283	NC_013416	TTA	2	6	20999	21004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866750
284	NC_013416	CAA	2	6	21037	21042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866750
285	NC_013416	CTT	2	6	21159	21164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866750
286	NC_013416	ATG	2	6	21181	21186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866750
287	NC_013416	TTC	2	6	21323	21328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866751
288	NC_013416	TTA	2	6	21545	21550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866751
289	NC_013416	TTA	2	6	21584	21589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866751
290	NC_013416	GAA	2	6	21615	21620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866751
291	NC_013416	GCC	2	6	21702	21707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866751
292	NC_013416	GAA	2	6	21717	21722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866751
293	NC_013416	GAA	2	6	21726	21731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866751
294	NC_013416	TTC	2	6	21744	21749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866751
295	NC_013416	GAC	2	6	21783	21788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866751
296	NC_013416	AAT	2	6	21817	21822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866751
297	NC_013416	TGC	2	6	21835	21840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866752
298	NC_013416	ATG	2	6	21851	21856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866752
299	NC_013416	GCG	2	6	21890	21895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866752
300	NC_013416	GGT	2	6	22144	22149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866752
301	NC_013416	CAA	2	6	22178	22183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866752
302	NC_013416	TAA	2	6	22498	22503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866752
303	NC_013416	TGA	2	6	22602	22607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
304	NC_013416	GTT	2	6	22614	22619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
305	NC_013416	GCA	2	6	22731	22736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866753
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309	NC_013416	TTG	2	6	23038	23043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866753
310	NC_013416	TAC	2	6	23062	23067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866753
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314	NC_013416	CAG	2	6	23440	23445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866753
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320	NC_013416	AGC	2	6	23744	23749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866753
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323	NC_013416	ATT	2	6	23787	23792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866753
324	NC_013416	ACT	2	6	23793	23798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866753
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326	NC_013416	TAT	2	6	23816	23821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866753
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333	NC_013416	ATA	2	6	24162	24167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866754
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351	NC_013416	ATA	2	6	25336	25341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866754
352	NC_013416	TAA	2	6	25372	25377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866754
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369	NC_013416	AGT	2	6	26659	26664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866756
370	NC_013416	GTG	2	6	26807	26812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866756
371	NC_013416	TAG	2	6	26873	26878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866756
372	NC_013416	TCA	2	6	26905	26910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866756
373	NC_013416	ACA	2	6	26952	26957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866756
374	NC_013416	ACA	2	6	26961	26966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866756
375	NC_013416	AAC	2	6	26990	26995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866756
376	NC_013416	ATT	2	6	27024	27029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866756
377	NC_013416	GAA	2	6	27081	27086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866756
378	NC_013416	ATT	2	6	27172	27177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866756
379	NC_013416	GTC	2	6	27292	27297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866756
380	NC_013416	TTC	2	6	27577	27582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866756
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382	NC_013416	GAT	3	9	27795	27803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866756
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