MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ammonifex degensii KC4 plasmid pADEG01

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013386	CGGG	2	8	1744	1751	0 %	0 %	75 %	25 %	260893986
2	NC_013386	GCCA	2	8	2129	2136	25 %	0 %	25 %	50 %	260893986
3	NC_013386	GGGC	2	8	3088	3095	0 %	0 %	75 %	25 %	260893986
4	NC_013386	TACC	2	8	3247	3254	25 %	25 %	0 %	50 %	260893986
5	NC_013386	TCCC	2	8	3458	3465	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_013386	GCTA	2	8	3515	3522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013386	CTTC	2	8	3537	3544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013386	GCAG	2	8	3745	3752	25 %	0 %	50 %	25 %	260893987
9	NC_013386	GAAC	2	8	4016	4023	50 %	0 %	25 %	25 %	260893987
10	NC_013386	GCCT	2	8	5029	5036	0 %	25 %	25 %	50 %	260893987
11	NC_013386	CCGC	2	8	5435	5442	0 %	0 %	25 %	75 %	260893987
12	NC_013386	ACCC	2	8	5595	5602	25 %	0 %	0 %	75 %	260893987
13	NC_013386	TCGA	2	8	6268	6275	25 %	25 %	25 %	25 %	260893988
14	NC_013386	CCCG	2	8	6698	6705	0 %	0 %	25 %	75 %	260893988
15	NC_013386	CCCG	2	8	6894	6901	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_013386	CCGG	2	8	6939	6946	0 %	0 %	50 %	50 %	260893989
17	NC_013386	AGGA	2	8	7148	7155	50 %	0 %	50 %	0 %	260893989
18	NC_013386	GCCG	2	8	7673	7680	0 %	0 %	50 %	50 %	260893989
19	NC_013386	CCGG	2	8	8452	8459	0 %	0 %	50 %	50 %	260893991
20	NC_013386	GCAC	2	8	8654	8661	25 %	0 %	25 %	50 %	260893991
21	NC_013386	GGGA	2	8	8685	8692	25 %	0 %	75 %	0 %	260893991
22	NC_013386	GTCC	2	8	8698	8705	0 %	25 %	25 %	50 %	260893991
23	NC_013386	TCCG	2	8	9072	9079	0 %	25 %	25 %	50 %	260893992
24	NC_013386	GAAA	2	8	9661	9668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013386	GGCG	2	8	9723	9730	0 %	0 %	75 %	25 %	260893993
26	NC_013386	GGGA	2	8	9889	9896	25 %	0 %	75 %	0 %	260893993
27	NC_013386	GCTG	2	8	10044	10051	0 %	25 %	50 %	25 %	260893993
28	NC_013386	GGAA	2	8	10275	10282	50 %	0 %	50 %	0 %	260893993
29	NC_013386	ACCG	2	8	10331	10338	25 %	0 %	25 %	50 %	260893993
30	NC_013386	CGGG	2	8	10429	10436	0 %	0 %	75 %	25 %	260893993
31	NC_013386	GCGG	2	8	10450	10457	0 %	0 %	75 %	25 %	260893993
32	NC_013386	GCCC	2	8	10560	10567	0 %	0 %	25 %	75 %	260893993
33	NC_013386	TCCC	2	8	11486	11493	0 %	25 %	0 %	75 %	260893994
34	NC_013386	GTAC	2	8	11688	11695	25 %	25 %	25 %	25 %	260893994
35	NC_013386	AGGG	2	8	11808	11815	25 %	0 %	75 %	0 %	260893994
36	NC_013386	CTGG	2	8	12072	12079	0 %	25 %	50 %	25 %	260893994
37	NC_013386	AAAG	2	8	12352	12359	75 %	0 %	25 %	0 %	260893994
38	NC_013386	CTGG	2	8	12513	12520	0 %	25 %	50 %	25 %	260893994
39	NC_013386	GGGC	2	8	12536	12543	0 %	0 %	75 %	25 %	260893994
40	NC_013386	CTTC	2	8	13385	13392	0 %	50 %	0 %	50 %	260893996
41	NC_013386	TCCC	2	8	13568	13575	0 %	25 %	0 %	75 %	260893996
42	NC_013386	CTTC	2	8	13715	13722	0 %	50 %	0 %	50 %	260893996
43	NC_013386	GCAG	2	8	13973	13980	25 %	0 %	50 %	25 %	260893996
44	NC_013386	CCGC	2	8	14135	14142	0 %	0 %	25 %	75 %	260893996
45	NC_013386	CCCT	2	8	14438	14445	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_013386	CGTC	2	8	14509	14516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013386	TCTT	2	8	14635	14642	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013386	AAAG	2	8	15401	15408	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013386	CCCA	2	8	15500	15507	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_013386	TCTT	2	8	15574	15581	0 %	75 %	0 %	25 %	260893998
51	NC_013386	TCAC	2	8	15595	15602	25 %	25 %	0 %	50 %	260893998
52	NC_013386	GCCA	2	8	16033	16040	25 %	0 %	25 %	50 %	260893998
53	NC_013386	GGCC	2	8	16952	16959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013386	CCCG	2	8	17284	17291	0 %	0 %	25 %	75 %	260893999
55	NC_013386	TCCC	2	8	17339	17346	0 %	25 %	0 %	75 %	260893999
56	NC_013386	CTCC	2	8	17406	17413	0 %	25 %	0 %	75 %	260893999
57	NC_013386	ACGC	2	8	17804	17811	25 %	0 %	25 %	50 %	260894000
58	NC_013386	CTTC	2	8	18257	18264	0 %	50 %	0 %	50 %	260894001
59	NC_013386	TCCT	2	8	18274	18281	0 %	50 %	0 %	50 %	260894001
60	NC_013386	GAGC	2	8	18975	18982	25 %	0 %	50 %	25 %	260894002
61	NC_013386	AGAA	2	8	19456	19463	75 %	0 %	25 %	0 %	260894002
62	NC_013386	ACCG	2	8	19749	19756	25 %	0 %	25 %	50 %	260894003
63	NC_013386	AGCA	2	8	19914	19921	50 %	0 %	25 %	25 %	260894003
64	NC_013386	CGCC	2	8	20254	20261	0 %	0 %	25 %	75 %	260894004
65	NC_013386	TGGT	2	8	20308	20315	0 %	50 %	50 %	0 %	260894004
66	NC_013386	TCCG	2	8	20498	20505	0 %	25 %	25 %	50 %	260894004
67	NC_013386	CCCT	2	8	20598	20605	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_013386	TAGG	2	8	20632	20639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013386	TAGG	2	8	20660	20667	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013386	GGCC	2	8	21055	21062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013386	AAAG	2	8	21289	21296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013386	ACCT	2	8	21394	21401	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013386	CCGC	2	8	21517	21524	0 %	0 %	25 %	75 %	260894005
74	NC_013386	CCTG	2	8	21607	21614	0 %	25 %	25 %	50 %	260894005
75	NC_013386	CATC	2	8	21748	21755	25 %	25 %	0 %	50 %	260894005
76	NC_013386	TGGG	2	8	21883	21890	0 %	25 %	75 %	0 %	260894005
77	NC_013386	GGCC	2	8	22759	22766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013386	GCTC	2	8	22937	22944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013386	CTCC	2	8	22976	22983	0 %	25 %	0 %	75 %	260894006
80	NC_013386	CGTC	2	8	23323	23330	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013386	CGGG	2	8	23999	24006	0 %	0 %	75 %	25 %	260894007
82	NC_013386	ACCC	2	8	25539	25546	25 %	0 %	0 %	75 %	260894010
83	NC_013386	TCCC	2	8	25635	25642	0 %	25 %	0 %	75 %	260894010
84	NC_013386	GGAC	2	8	25839	25846	25 %	0 %	50 %	25 %	260894010
85	NC_013386	GTCC	2	8	26102	26109	0 %	25 %	25 %	50 %	260894011
86	NC_013386	CCTC	2	8	26584	26591	0 %	25 %	0 %	75 %	260894011
87	NC_013386	CTTC	2	8	26671	26678	0 %	50 %	0 %	50 %	260894011
88	NC_013386	CCGC	2	8	27373	27380	0 %	0 %	25 %	75 %	260894012
89	NC_013386	ACCC	2	8	27656	27663	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_013386	CCTG	2	8	27813	27820	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.