MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 48350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013385	CTT	2	6	155989	155994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_013385	CTTTT	2	10	156029	156038	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3503	NC_013385	G	6	6	156058	156063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_013385	G	6	6	156183	156188	0 %	0 %	100 %	0 %	260892087
3505	NC_013385	GGC	2	6	156204	156209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892087
3506	NC_013385	AGG	2	6	156224	156229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892087
3507	NC_013385	CGG	2	6	156255	156260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892087
3508	NC_013385	GGT	2	6	156264	156269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892087
3509	NC_013385	CCA	2	6	156275	156280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892087
3510	NC_013385	CTGGC	2	10	156301	156310	0 %	20 %	40 %	40 %	260892087
3511	NC_013385	GTG	2	6	156334	156339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892087
3512	NC_013385	CGG	2	6	156416	156421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892087
3513	NC_013385	ACT	2	6	156535	156540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892087
3514	NC_013385	GGA	2	6	156555	156560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892087
3515	NC_013385	GTG	2	6	156583	156588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892087
3516	NC_013385	G	6	6	156603	156608	0 %	0 %	100 %	0 %	260892087
3517	NC_013385	AAGGA	2	10	156637	156646	60 %	0 %	40 %	0 %	260892087
3518	NC_013385	GGT	2	6	156660	156665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892087
3519	NC_013385	GCCG	2	8	156675	156682	0 %	0 %	50 %	50 %	260892087
3520	NC_013385	GGGA	2	8	156699	156706	25 %	0 %	75 %	0 %	260892087
3521	NC_013385	GGCA	2	8	156712	156719	25 %	0 %	50 %	25 %	260892087
3522	NC_013385	TCC	2	6	156750	156755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892087
3523	NC_013385	CGA	2	6	156777	156782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892087
3524	NC_013385	ACC	2	6	156796	156801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892087
3525	NC_013385	GGC	2	6	156831	156836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892087
3526	NC_013385	AAGG	2	8	156838	156845	50 %	0 %	50 %	0 %	260892087
3527	NC_013385	GGC	2	6	156870	156875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892087
3528	NC_013385	CCGG	2	8	156903	156910	0 %	0 %	50 %	50 %	260892087
3529	NC_013385	GTTGTC	2	12	156925	156936	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	260892087
3530	NC_013385	CGGCG	2	10	157030	157039	0 %	0 %	60 %	40 %	260892088
3531	NC_013385	CCG	2	6	157128	157133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892088
3532	NC_013385	GGA	2	6	157161	157166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892088
3533	NC_013385	GGA	2	6	157179	157184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892088
3534	NC_013385	CCTTC	2	10	157194	157203	0 %	40 %	0 %	60 %	260892088
3535	NC_013385	ACC	2	6	157204	157209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892088
3536	NC_013385	AGG	2	6	157211	157216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892088
3537	NC_013385	CTT	2	6	157283	157288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892088
3538	NC_013385	ACC	2	6	157294	157299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892088
3539	NC_013385	GGT	2	6	157311	157316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892088
3540	NC_013385	CCG	2	6	157326	157331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892088
3541	NC_013385	TGG	2	6	157355	157360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892088
3542	NC_013385	TGG	2	6	157550	157555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892088
3543	NC_013385	TCCT	2	8	157560	157567	0 %	50 %	0 %	50 %	260892088
3544	NC_013385	TCC	2	6	157571	157576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892088
3545	NC_013385	ATC	2	6	157732	157737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892088
3546	NC_013385	GGT	2	6	157809	157814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892088
3547	NC_013385	TAC	2	6	157869	157874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892088
3548	NC_013385	CCCTGC	2	12	157942	157953	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260892088
3549	NC_013385	ACC	2	6	157960	157965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892088
3550	NC_013385	CGA	2	6	157995	158000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892088
3551	NC_013385	GAG	2	6	158015	158020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892088
3552	NC_013385	CTTCC	2	10	158028	158037	0 %	40 %	0 %	60 %	260892088
3553	NC_013385	GGCT	2	8	158069	158076	0 %	25 %	50 %	25 %	260892088
3554	NC_013385	AGG	2	6	158147	158152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892088
3555	NC_013385	GCTC	2	8	158258	158265	0 %	25 %	25 %	50 %	260892088
3556	NC_013385	CCG	3	9	158301	158309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892088
3557	NC_013385	GGTGGC	2	12	158381	158392	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260892089
3558	NC_013385	CAT	2	6	158429	158434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892089
3559	NC_013385	GGC	2	6	158465	158470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892089
3560	NC_013385	TGG	2	6	158530	158535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892089
3561	NC_013385	GCT	2	6	158562	158567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892089
3562	NC_013385	GAT	2	6	158628	158633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892089
3563	NC_013385	CGG	2	6	158710	158715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892089
3564	NC_013385	AGG	2	6	158722	158727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892089
3565	NC_013385	GGC	2	6	158744	158749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892089
3566	NC_013385	ACC	3	9	158793	158801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892089
3567	NC_013385	TC	3	6	158806	158811	0 %	50 %	0 %	50 %	260892089
3568	NC_013385	GAAG	2	8	158828	158835	50 %	0 %	50 %	0 %	260892089
3569	NC_013385	ACC	2	6	158849	158854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892089
3570	NC_013385	TTC	2	6	158914	158919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892089
3571	NC_013385	GGA	2	6	158942	158947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892089
3572	NC_013385	TCA	2	6	159013	159018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892089
3573	NC_013385	GTG	2	6	159147	159152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892089
3574	NC_013385	GAG	2	6	159153	159158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892089
3575	NC_013385	GGC	2	6	159188	159193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892089
3576	NC_013385	T	6	6	159394	159399	0 %	100 %	0 %	0 %	260892089
3577	NC_013385	TGG	2	6	159421	159426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892089
3578	NC_013385	GCT	2	6	159442	159447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892089
3579	NC_013385	GGGC	2	8	159455	159462	0 %	0 %	75 %	25 %	260892089
3580	NC_013385	CTGCAT	2	12	159488	159499	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260892089
3581	NC_013385	CGG	2	6	159551	159556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892089
3582	NC_013385	TTA	2	6	159649	159654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260892089
3583	NC_013385	CAC	2	6	159668	159673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892089
3584	NC_013385	CGGGGA	2	12	159700	159711	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260892089
3585	NC_013385	GGA	2	6	159725	159730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892089
3586	NC_013385	GGT	2	6	159788	159793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892089
3587	NC_013385	CG	3	6	159822	159827	0 %	0 %	50 %	50 %	260892089
3588	NC_013385	TTC	2	6	159845	159850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892089
3589	NC_013385	CGG	2	6	159853	159858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892089
3590	NC_013385	TGG	3	9	159859	159867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892089
3591	NC_013385	GAG	2	6	159924	159929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892089
3592	NC_013385	CTT	2	6	160020	160025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892089
3593	NC_013385	GGAG	2	8	160073	160080	25 %	0 %	75 %	0 %	260892089
3594	NC_013385	TAAC	2	8	160091	160098	50 %	25 %	0 %	25 %	260892089
3595	NC_013385	AGG	2	6	160116	160121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892090
3596	NC_013385	GGC	2	6	160158	160163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892090
3597	NC_013385	GCGGG	2	10	160215	160224	0 %	0 %	80 %	20 %	260892090
3598	NC_013385	CCG	2	6	160286	160291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892090
3599	NC_013385	TCC	2	6	160295	160300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892090
3600	NC_013385	GGAGG	2	10	160317	160326	20 %	0 %	80 %	0 %	260892090
3601	NC_013385	CCT	2	6	160384	160389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892090
3602	NC_013385	GGA	2	6	160431	160436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892090
3603	NC_013385	GC	3	6	160486	160491	0 %	0 %	50 %	50 %	260892090
3604	NC_013385	CGG	2	6	160497	160502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892090
3605	NC_013385	GAA	2	6	160576	160581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892090
3606	NC_013385	C	6	6	160599	160604	0 %	0 %	0 %	100 %	260892090
3607	NC_013385	CTT	2	6	160608	160613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892090
3608	NC_013385	CAG	2	6	160666	160671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892090
3609	NC_013385	GAG	2	6	160731	160736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892090
3610	NC_013385	AGA	2	6	160739	160744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892090
3611	NC_013385	CCG	2	6	160805	160810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892091
3612	NC_013385	GGA	2	6	160856	160861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892091
3613	NC_013385	CCTTC	2	10	160871	160880	0 %	40 %	0 %	60 %	260892091
3614	NC_013385	ACC	2	6	160881	160886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892091
3615	NC_013385	AGG	2	6	160888	160893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892091
3616	NC_013385	CCT	2	6	160960	160965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892091
3617	NC_013385	CAC	2	6	160970	160975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892091
3618	NC_013385	GGT	2	6	160988	160993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892091
3619	NC_013385	TACGGC	2	12	161091	161102	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260892091
3620	NC_013385	CGG	2	6	161111	161116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892091
3621	NC_013385	G	6	6	161172	161177	0 %	0 %	100 %	0 %	260892091
3622	NC_013385	TCATGC	2	12	161194	161205	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260892091
3623	NC_013385	CAC	2	6	161216	161221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892091
3624	NC_013385	TGC	2	6	161229	161234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892091
3625	NC_013385	CCGGG	2	10	161306	161315	0 %	0 %	60 %	40 %	260892091
3626	NC_013385	AT	3	6	161389	161394	50 %	50 %	0 %	0 %	260892091
3627	NC_013385	GGC	2	6	161426	161431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892091
3628	NC_013385	GGA	2	6	161465	161470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892091
3629	NC_013385	CTTC	2	8	161474	161481	0 %	50 %	0 %	50 %	260892091
3630	NC_013385	CTCC	2	8	161514	161521	0 %	25 %	0 %	75 %	260892091
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3636	NC_013385	CTC	2	6	161730	161735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892091
3637	NC_013385	CTG	2	6	161763	161768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892091
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3642	NC_013385	CGG	2	6	161877	161882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892091
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3649	NC_013385	CTCGC	2	10	162062	162071	0 %	20 %	20 %	60 %	260892092
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3651	NC_013385	CCGG	2	8	162142	162149	0 %	0 %	50 %	50 %	260892092
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3656	NC_013385	GCGG	2	8	162355	162362	0 %	0 %	75 %	25 %	260892092
3657	NC_013385	TGA	2	6	162403	162408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892092
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3659	NC_013385	GC	3	6	162534	162539	0 %	0 %	50 %	50 %	260892093
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3680	NC_013385	TTTAT	2	10	163305	163314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3710	NC_013385	GCG	2	6	164294	164299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892094
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3739	NC_013385	CGGGA	2	10	165583	165592	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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3742	NC_013385	GCC	2	6	165650	165655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3743	NC_013385	TGGGC	2	10	165685	165694	0 %	20 %	60 %	20 %	260892096
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3863	NC_013385	GTT	2	6	171118	171123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3865	NC_013385	TAC	2	6	171137	171142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3993	NC_013385	TGG	2	6	176859	176864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892106
3994	NC_013385	GGA	2	6	176887	176892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892106
3995	NC_013385	TCA	2	6	176916	176921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892106
3996	NC_013385	GGA	2	6	176971	176976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892106
3997	NC_013385	GGA	2	6	177037	177042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892106
3998	NC_013385	AGGGGA	2	12	177067	177078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892106
3999	NC_013385	GGT	2	6	177091	177096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892106
4000	NC_013385	CCTGA	2	10	177197	177206	20 %	20 %	20 %	40 %	260892106

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