MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 48350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_013385	CCT	2	6	1354844	1354849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31003	NC_013385	GCA	2	6	1354856	1354861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31004	NC_013385	CTG	2	6	1354891	1354896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31005	NC_013385	CT	3	6	1354932	1354937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31006	NC_013385	CGG	2	6	1354942	1354947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31007	NC_013385	AGG	2	6	1354975	1354980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31008	NC_013385	GAAA	2	8	1354994	1355001	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31009	NC_013385	CAA	2	6	1355030	1355035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31010	NC_013385	GTC	2	6	1355106	1355111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31011	NC_013385	GGAG	2	8	1355122	1355129	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31012	NC_013385	TCC	3	9	1355161	1355169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31013	NC_013385	CCG	2	6	1355198	1355203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31014	NC_013385	GAA	2	6	1355208	1355213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31015	NC_013385	CTCC	2	8	1355216	1355223	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31016	NC_013385	GAAG	2	8	1355234	1355241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31017	NC_013385	CT	3	6	1355245	1355250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31018	NC_013385	GTA	2	6	1355343	1355348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31019	NC_013385	GAG	2	6	1355374	1355379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31020	NC_013385	TCCG	2	8	1355454	1355461	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31021	NC_013385	CTG	2	6	1355473	1355478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31022	NC_013385	GGA	2	6	1355483	1355488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31023	NC_013385	GCA	2	6	1355508	1355513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31024	NC_013385	TCC	2	6	1355536	1355541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31025	NC_013385	TCGGGA	2	12	1355599	1355610	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31026	NC_013385	CCA	2	6	1355634	1355639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31028	NC_013385	CTC	2	6	1355751	1355756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31029	NC_013385	CGG	2	6	1355769	1355774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31030	NC_013385	CGC	3	9	1355818	1355826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31031	NC_013385	CGC	3	9	1355843	1355851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31032	NC_013385	CGCA	2	8	1355904	1355911	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31033	NC_013385	GCC	2	6	1355912	1355917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31034	NC_013385	CTGC	2	8	1355943	1355950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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31036	NC_013385	AG	3	6	1356094	1356099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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31038	NC_013385	CTTC	2	8	1356110	1356117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31039	NC_013385	TACC	2	8	1356130	1356137	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31040	NC_013385	CG	4	8	1356166	1356173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31041	NC_013385	TAGG	2	8	1356303	1356310	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31042	NC_013385	CAC	2	6	1356342	1356347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31043	NC_013385	CGG	2	6	1356377	1356382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31044	NC_013385	CTG	2	6	1356384	1356389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31051	NC_013385	CA	3	6	1356660	1356665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31052	NC_013385	A	6	6	1356680	1356685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31056	NC_013385	CG	3	6	1356915	1356920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31057	NC_013385	CTC	2	6	1356923	1356928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31058	NC_013385	C	6	6	1356951	1356956	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31059	NC_013385	CAC	2	6	1357038	1357043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31060	NC_013385	GGC	2	6	1357049	1357054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31061	NC_013385	GCC	2	6	1357087	1357092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31062	NC_013385	GGT	2	6	1357115	1357120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31063	NC_013385	ACCT	2	8	1357147	1357154	25 %	25 %	0 %	50 %	260893206
31064	NC_013385	TA	3	6	1357201	1357206	50 %	50 %	0 %	0 %	260893206
31065	NC_013385	GCCT	2	8	1357212	1357219	0 %	25 %	25 %	50 %	260893206
31066	NC_013385	CT	3	6	1357218	1357223	0 %	50 %	0 %	50 %	260893206
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31070	NC_013385	GCA	3	9	1357387	1357395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893206
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31072	NC_013385	CCCG	2	8	1357475	1357482	0 %	0 %	25 %	75 %	260893206
31073	NC_013385	GCG	2	6	1357629	1357634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893206
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31077	NC_013385	CT	4	8	1357955	1357962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31078	NC_013385	TGCGA	2	10	1357994	1358003	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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31081	NC_013385	CTC	2	6	1358129	1358134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31084	NC_013385	CAAC	2	8	1358312	1358319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31085	NC_013385	CTT	2	6	1358407	1358412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31089	NC_013385	ACC	2	6	1358619	1358624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31091	NC_013385	GGT	2	6	1358665	1358670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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31093	NC_013385	ACA	2	6	1358760	1358765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31094	NC_013385	CAA	2	6	1358776	1358781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31095	NC_013385	CG	3	6	1358872	1358877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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31101	NC_013385	TCCTTC	2	12	1359294	1359305	0 %	50 %	0 %	50 %	260893207
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31103	NC_013385	TCC	2	6	1359426	1359431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31104	NC_013385	CTC	2	6	1359463	1359468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31105	NC_013385	TCCG	2	8	1359480	1359487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31106	NC_013385	CAG	2	6	1359494	1359499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31107	NC_013385	CCTC	2	8	1359552	1359559	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31108	NC_013385	CCA	2	6	1359620	1359625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31109	NC_013385	CTCAGA	2	12	1359673	1359684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31110	NC_013385	CTC	2	6	1359704	1359709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31111	NC_013385	CG	3	6	1359738	1359743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31112	NC_013385	CCT	2	6	1359771	1359776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31113	NC_013385	AGG	2	6	1359788	1359793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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31117	NC_013385	CAGCCA	2	12	1359981	1359992	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31118	NC_013385	GACG	2	8	1360082	1360089	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31119	NC_013385	CTT	2	6	1360143	1360148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893208
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31121	NC_013385	CCGC	2	8	1360173	1360180	0 %	0 %	25 %	75 %	260893208
31122	NC_013385	GAT	2	6	1360243	1360248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893208
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31124	NC_013385	CGC	2	6	1360319	1360324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893208
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31126	NC_013385	CAC	2	6	1360342	1360347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893208
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31132	NC_013385	GC	3	6	1360582	1360587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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31157	NC_013385	CCG	2	6	1361676	1361681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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31208	NC_013385	GGCC	2	8	1363522	1363529	0 %	0 %	50 %	50 %	260893213
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31220	NC_013385	GGGAG	2	10	1363906	1363915	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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31228	NC_013385	GCTCC	2	10	1364252	1364261	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31229	NC_013385	GTT	2	6	1364354	1364359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31230	NC_013385	TCC	2	6	1364427	1364432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893214
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31234	NC_013385	AC	3	6	1364640	1364645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31235	NC_013385	CTT	2	6	1364649	1364654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31236	NC_013385	TA	3	6	1364659	1364664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31237	NC_013385	TCT	2	6	1364702	1364707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893215
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31241	NC_013385	GGAA	2	8	1364847	1364854	50 %	0 %	50 %	0 %	260893215
31242	NC_013385	TTC	2	6	1364911	1364916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893215
31243	NC_013385	GTG	2	6	1364935	1364940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893215
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31245	NC_013385	GAT	2	6	1365010	1365015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893215
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31482	NC_013385	CCG	2	6	1375007	1375012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893226
31483	NC_013385	CTC	2	6	1375039	1375044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893226
31484	NC_013385	GGGCCA	2	12	1375121	1375132	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893226
31485	NC_013385	CAG	2	6	1375135	1375140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893226
31486	NC_013385	GCG	2	6	1375150	1375155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893226
31487	NC_013385	CTT	2	6	1375180	1375185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893226
31488	NC_013385	TCACGC	2	12	1375206	1375217	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893226
31489	NC_013385	CTC	2	6	1375234	1375239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893227
31490	NC_013385	GCC	2	6	1375243	1375248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893227
31491	NC_013385	CGC	2	6	1375302	1375307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893227
31492	NC_013385	TG	3	6	1375330	1375335	0 %	50 %	50 %	0 %	260893227
31493	NC_013385	CG	3	6	1375378	1375383	0 %	0 %	50 %	50 %	260893227
31494	NC_013385	CTGC	2	8	1375453	1375460	0 %	25 %	25 %	50 %	260893227
31495	NC_013385	CGG	2	6	1375499	1375504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893227
31496	NC_013385	CGG	3	9	1375508	1375516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893227
31497	NC_013385	TCG	2	6	1375550	1375555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893227
31498	NC_013385	CCA	2	6	1375564	1375569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893227
31499	NC_013385	TCG	2	6	1375577	1375582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893227
31500	NC_013385	CCT	2	6	1375649	1375654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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