MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 48350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_013385	CTC	3	9	1240535	1240543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28502	NC_013385	AG	3	6	1240562	1240567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28503	NC_013385	G	6	6	1240590	1240595	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28504	NC_013385	C	6	6	1240608	1240613	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28505	NC_013385	CGG	2	6	1240674	1240679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893092
28506	NC_013385	CTCG	2	8	1240768	1240775	0 %	25 %	25 %	50 %	260893092
28507	NC_013385	GAG	2	6	1240898	1240903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893092
28508	NC_013385	GGC	2	6	1240906	1240911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893092
28509	NC_013385	GCC	2	6	1240973	1240978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893092
28510	NC_013385	CCA	2	6	1241016	1241021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893092
28511	NC_013385	GCC	2	6	1241054	1241059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893092
28512	NC_013385	TCTGC	2	10	1241091	1241100	0 %	40 %	20 %	40 %	260893092
28513	NC_013385	ATG	2	6	1241108	1241113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893092
28514	NC_013385	AGT	2	6	1241140	1241145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893092
28515	NC_013385	TCC	2	6	1241147	1241152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893092
28516	NC_013385	CTT	2	6	1241155	1241160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893092
28517	NC_013385	CCT	2	6	1241172	1241177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893092
28518	NC_013385	GCCT	2	8	1241186	1241193	0 %	25 %	25 %	50 %	260893092
28519	NC_013385	GGC	2	6	1241293	1241298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893092
28520	NC_013385	TCC	2	6	1241303	1241308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893092
28521	NC_013385	GCC	2	6	1241354	1241359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893092
28522	NC_013385	CTG	3	9	1241370	1241378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893092
28523	NC_013385	CTC	2	6	1241386	1241391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893092
28524	NC_013385	CTG	2	6	1241412	1241417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893092
28525	NC_013385	CTG	2	6	1241428	1241433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893092
28526	NC_013385	CCA	2	6	1241454	1241459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893092
28527	NC_013385	GCC	2	6	1241468	1241473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893092
28528	NC_013385	CAGGGC	2	12	1241482	1241493	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893092
28529	NC_013385	GCT	2	6	1241502	1241507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893092
28530	NC_013385	GCC	2	6	1241534	1241539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893092
28531	NC_013385	GCC	2	6	1241555	1241560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893092
28532	NC_013385	AGG	2	6	1241609	1241614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893092
28533	NC_013385	CTA	2	6	1241715	1241720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893092
28534	NC_013385	GTA	2	6	1241791	1241796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893092
28535	NC_013385	CTT	2	6	1241805	1241810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893092
28536	NC_013385	CT	3	6	1241819	1241824	0 %	50 %	0 %	50 %	260893092
28537	NC_013385	AGC	2	6	1241836	1241841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893092
28538	NC_013385	TGG	2	6	1241913	1241918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893092
28539	NC_013385	GA	3	6	1241930	1241935	50 %	0 %	50 %	0 %	260893092
28540	NC_013385	CCA	2	6	1241949	1241954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893092
28541	NC_013385	GTT	3	9	1241962	1241970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260893092
28542	NC_013385	CAC	2	6	1242148	1242153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893092
28543	NC_013385	CAA	2	6	1242169	1242174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260893092
28544	NC_013385	GAA	2	6	1242177	1242182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893092
28545	NC_013385	GCC	2	6	1242183	1242188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893092
28546	NC_013385	CCT	2	6	1242221	1242226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28547	NC_013385	AAG	2	6	1242374	1242379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893093
28548	NC_013385	GGCC	2	8	1242388	1242395	0 %	0 %	50 %	50 %	260893093
28549	NC_013385	GCC	2	6	1242438	1242443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893093
28550	NC_013385	CAG	2	6	1242518	1242523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893093
28551	NC_013385	TTA	2	6	1242529	1242534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260893093
28552	NC_013385	GAT	2	6	1242548	1242553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893093
28553	NC_013385	CGC	2	6	1242625	1242630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893093
28554	NC_013385	AAAAG	2	10	1242639	1242648	80 %	0 %	20 %	0 %	260893093
28555	NC_013385	GAA	2	6	1242671	1242676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893093
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28557	NC_013385	ACC	2	6	1242873	1242878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893093
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28559	NC_013385	AGC	2	6	1242938	1242943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893093
28560	NC_013385	CGC	2	6	1242990	1242995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893093
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28562	NC_013385	TGG	2	6	1243045	1243050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28563	NC_013385	CCT	2	6	1243059	1243064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28564	NC_013385	T	6	6	1243117	1243122	0 %	100 %	0 %	0 %	260893094
28565	NC_013385	TACCT	2	10	1243295	1243304	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28566	NC_013385	AAG	2	6	1243335	1243340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28567	NC_013385	CCA	2	6	1243347	1243352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28568	NC_013385	GAG	2	6	1243378	1243383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28569	NC_013385	CAC	2	6	1243493	1243498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893095
28570	NC_013385	GTC	2	6	1243571	1243576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893095
28571	NC_013385	TGG	2	6	1243597	1243602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893095
28572	NC_013385	ACC	2	6	1243608	1243613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893095
28573	NC_013385	CG	3	6	1243702	1243707	0 %	0 %	50 %	50 %	260893095
28574	NC_013385	CCA	2	6	1243762	1243767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893095
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28578	NC_013385	CCG	2	6	1243978	1243983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893095
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28584	NC_013385	GTA	2	6	1244180	1244185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893095
28585	NC_013385	CCG	2	6	1244310	1244315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893095
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28589	NC_013385	CGT	2	6	1244608	1244613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893095
28590	NC_013385	CG	3	6	1244689	1244694	0 %	0 %	50 %	50 %	260893095
28591	NC_013385	GAA	2	6	1244742	1244747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893095
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28594	NC_013385	TTCGA	2	10	1244801	1244810	20 %	40 %	20 %	20 %	260893095
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28597	NC_013385	CCA	2	6	1245034	1245039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893096
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28600	NC_013385	GTC	2	6	1245262	1245267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893096
28601	NC_013385	TGA	2	6	1245294	1245299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893096
28602	NC_013385	ACT	2	6	1245314	1245319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893096
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28604	NC_013385	TAT	2	6	1245397	1245402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260893096
28605	NC_013385	TGC	2	6	1245414	1245419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893096
28606	NC_013385	CTA	2	6	1245516	1245521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893096
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28608	NC_013385	CAG	2	6	1245585	1245590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893096
28609	NC_013385	ATA	2	6	1245623	1245628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260893096
28610	NC_013385	GAG	2	6	1245667	1245672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893096
28611	NC_013385	TA	3	6	1245757	1245762	50 %	50 %	0 %	0 %	260893096
28612	NC_013385	CCG	2	6	1245792	1245797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893096
28613	NC_013385	CAC	2	6	1245844	1245849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893096
28614	NC_013385	TCCC	2	8	1245854	1245861	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28615	NC_013385	GCC	2	6	1245883	1245888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28616	NC_013385	ACCT	2	8	1245904	1245911	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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28959	NC_013385	GC	3	6	1262397	1262402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28960	NC_013385	GTA	2	6	1262460	1262465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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