MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 48350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013385	CCGC	2	8	267693	267700	0 %	0 %	25 %	75 %	260892191
6002	NC_013385	TCG	2	6	267701	267706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892191
6003	NC_013385	GAC	2	6	267760	267765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892191
6004	NC_013385	CCA	2	6	267846	267851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892191
6005	NC_013385	CTT	2	6	267865	267870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892191
6006	NC_013385	CGG	2	6	267896	267901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892191
6007	NC_013385	CCG	2	6	267962	267967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892191
6008	NC_013385	GGC	2	6	268011	268016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892191
6009	NC_013385	CAG	2	6	268036	268041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892191
6010	NC_013385	TCG	2	6	268064	268069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892191
6011	NC_013385	TCC	2	6	268075	268080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892191
6012	NC_013385	GGCG	2	8	268083	268090	0 %	0 %	75 %	25 %	260892191
6013	NC_013385	GC	3	6	268232	268237	0 %	0 %	50 %	50 %	260892191
6014	NC_013385	CCA	2	6	268278	268283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892191
6015	NC_013385	CCG	2	6	268378	268383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892192
6016	NC_013385	CCT	2	6	268396	268401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892192
6017	NC_013385	T	6	6	268407	268412	0 %	100 %	0 %	0 %	260892192
6018	NC_013385	GGC	2	6	268454	268459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892192
6019	NC_013385	TGC	2	6	268464	268469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892192
6020	NC_013385	TCC	2	6	268515	268520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892192
6021	NC_013385	ACC	3	9	268530	268538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892192
6022	NC_013385	CGAAGC	2	12	268579	268590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892192
6023	NC_013385	GC	3	6	268589	268594	0 %	0 %	50 %	50 %	260892192
6024	NC_013385	ACG	2	6	268614	268619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892192
6025	NC_013385	TCG	2	6	268713	268718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892192
6026	NC_013385	CGG	2	6	268735	268740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892192
6027	NC_013385	CAC	2	6	268814	268819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892192
6028	NC_013385	ATC	2	6	268866	268871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892192
6029	NC_013385	TCT	2	6	268872	268877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892192
6030	NC_013385	CTT	2	6	268925	268930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892192
6031	NC_013385	CAC	2	6	269009	269014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_013385	TGT	2	6	269016	269021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_013385	TCT	2	6	269053	269058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_013385	GAA	2	6	269072	269077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_013385	CCT	2	6	269096	269101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892193
6036	NC_013385	GGA	2	6	269126	269131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892193
6037	NC_013385	CCT	2	6	269257	269262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_013385	AGG	2	6	269274	269279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_013385	GAAG	2	8	269298	269305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_013385	TGA	2	6	269483	269488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_013385	GAAAGG	2	12	269497	269508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_013385	TTC	2	6	269515	269520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_013385	CTGG	2	8	269538	269545	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6044	NC_013385	GAG	2	6	269620	269625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_013385	CCTG	2	8	269630	269637	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_013385	GCC	2	6	269647	269652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_013385	CGT	2	6	269666	269671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_013385	TTG	2	6	269737	269742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_013385	AGG	2	6	269767	269772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_013385	CT	3	6	269780	269785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_013385	CTTT	2	8	269801	269808	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6052	NC_013385	CTT	2	6	269820	269825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_013385	GTA	2	6	269988	269993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_013385	CTT	2	6	270162	270167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_013385	C	7	7	270299	270305	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6056	NC_013385	CCA	2	6	270364	270369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_013385	CTTC	2	8	270418	270425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_013385	GAC	2	6	270458	270463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_013385	CCG	2	6	270479	270484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_013385	AGT	2	6	270604	270609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_013385	AG	3	6	270624	270629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_013385	GGC	2	6	270634	270639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_013385	AAG	2	6	270645	270650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_013385	CTG	2	6	270692	270697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_013385	TAG	2	6	270718	270723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_013385	TC	3	6	270790	270795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_013385	AGC	2	6	270807	270812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_013385	CACC	2	8	270838	270845	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6069	NC_013385	GCG	2	6	270854	270859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_013385	GGT	2	6	270880	270885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_013385	TGT	2	6	270892	270897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_013385	CAT	2	6	270943	270948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_013385	TCC	2	6	271015	271020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_013385	GCCT	2	8	271035	271042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6075	NC_013385	CGC	2	6	271043	271048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_013385	CAC	2	6	271081	271086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_013385	TC	3	6	271105	271110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_013385	AGAT	2	8	271239	271246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_013385	CTC	2	6	271274	271279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_013385	GTA	2	6	271337	271342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6082	NC_013385	AGGT	2	8	271423	271430	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_013385	CTT	2	6	271435	271440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_013385	GGT	2	6	271508	271513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_013385	TCC	2	6	271611	271616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_013385	CCT	2	6	271693	271698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6087	NC_013385	TC	3	6	271745	271750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6088	NC_013385	T	6	6	271755	271760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_013385	CCT	2	6	271761	271766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_013385	AAC	2	6	271802	271807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_013385	GCC	2	6	271814	271819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6092	NC_013385	CGG	2	6	271852	271857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_013385	GCG	2	6	271875	271880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_013385	GTC	2	6	271890	271895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_013385	TTC	2	6	271993	271998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_013385	TCC	2	6	272028	272033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6097	NC_013385	CG	3	6	272064	272069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6098	NC_013385	CGC	2	6	272095	272100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_013385	CCG	2	6	272175	272180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_013385	T	6	6	272226	272231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_013385	GA	3	6	272273	272278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_013385	GCG	2	6	272283	272288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892194
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6105	NC_013385	GCT	2	6	272325	272330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892194
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6108	NC_013385	CCGG	2	8	272497	272504	0 %	0 %	50 %	50 %	260892194
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6123	NC_013385	GGA	2	6	273120	273125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892194
6124	NC_013385	CT	3	6	273221	273226	0 %	50 %	0 %	50 %	260892194
6125	NC_013385	CAG	2	6	273247	273252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892194
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6127	NC_013385	GCA	2	6	273306	273311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892194
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6129	NC_013385	TCT	2	6	273418	273423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892195
6130	NC_013385	TGG	2	6	273457	273462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892195
6131	NC_013385	CTGGG	2	10	273468	273477	0 %	20 %	60 %	20 %	260892195
6132	NC_013385	TGC	3	9	273514	273522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892195
6133	NC_013385	GGT	3	9	273551	273559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892195
6134	NC_013385	CTG	2	6	273591	273596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892195
6135	NC_013385	GGCGG	2	10	273597	273606	0 %	0 %	80 %	20 %	260892195
6136	NC_013385	TGC	2	6	273628	273633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892195
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6165	NC_013385	GAA	2	6	275131	275136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6166	NC_013385	GGC	2	6	275173	275178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892198
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6190	NC_013385	T	6	6	276330	276335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6191	NC_013385	CTG	2	6	276336	276341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6211	NC_013385	GTG	2	6	277116	277121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892200
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6232	NC_013385	CTGG	2	8	278165	278172	0 %	25 %	50 %	25 %	260892200
6233	NC_013385	TGG	3	9	278170	278178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892200
6234	NC_013385	CGAGAC	2	12	278189	278200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892200
6235	NC_013385	GGC	2	6	278201	278206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892200
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6239	NC_013385	ACG	2	6	278464	278469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892200
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6241	NC_013385	CAA	2	6	278495	278500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260892200
6242	NC_013385	GCT	2	6	278593	278598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892200
6243	NC_013385	GTG	2	6	278640	278645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892200
6244	NC_013385	GCGAC	2	10	278654	278663	20 %	0 %	40 %	40 %	260892200
6245	NC_013385	GGCC	2	8	278713	278720	0 %	0 %	50 %	50 %	260892200
6246	NC_013385	CCG	2	6	278723	278728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892200
6247	NC_013385	GCT	2	6	278743	278748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892200
6248	NC_013385	CG	3	6	278780	278785	0 %	0 %	50 %	50 %	260892200
6249	NC_013385	GCA	2	6	278806	278811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892200
6250	NC_013385	ACG	2	6	278824	278829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892200
6251	NC_013385	TCC	2	6	278873	278878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892200
6252	NC_013385	TCA	2	6	278902	278907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892200
6253	NC_013385	GGC	2	6	278926	278931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892200
6254	NC_013385	GGC	2	6	278957	278962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892200
6255	NC_013385	AGC	2	6	279034	279039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892200
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6260	NC_013385	TC	3	6	279211	279216	0 %	50 %	0 %	50 %	260892200
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6262	NC_013385	GTG	3	9	279258	279266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892200
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6271	NC_013385	TAC	2	6	279673	279678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892201
6272	NC_013385	TCA	2	6	279713	279718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892201
6273	NC_013385	TGCA	2	8	279727	279734	25 %	25 %	25 %	25 %	260892201
6274	NC_013385	TG	3	6	279751	279756	0 %	50 %	50 %	0 %	260892201
6275	NC_013385	GCCT	2	8	279829	279836	0 %	25 %	25 %	50 %	260892201
6276	NC_013385	CGGG	2	8	279881	279888	0 %	0 %	75 %	25 %	260892201
6277	NC_013385	CGG	2	6	279933	279938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892201
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6282	NC_013385	CGGCC	2	10	280166	280175	0 %	0 %	40 %	60 %	260892201
6283	NC_013385	GCT	2	6	280188	280193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892201
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6285	NC_013385	GGC	2	6	280209	280214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892201
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6291	NC_013385	GAA	2	6	280534	280539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892202
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6300	NC_013385	TGC	2	6	280885	280890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892202
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6320	NC_013385	GGC	2	6	281939	281944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892204
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6343	NC_013385	AG	3	6	282711	282716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6344	NC_013385	ACC	2	6	282760	282765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6345	NC_013385	GTA	2	6	282867	282872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6348	NC_013385	CTGC	2	8	282997	283004	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6349	NC_013385	AGC	2	6	283015	283020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6351	NC_013385	AGG	2	6	283074	283079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6352	NC_013385	AG	3	6	283188	283193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6353	NC_013385	AGAAGG	2	12	283340	283351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6354	NC_013385	TGG	2	6	283423	283428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6355	NC_013385	AGG	2	6	283486	283491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6356	NC_013385	GAGGC	2	10	283492	283501	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6357	NC_013385	T	7	7	283580	283586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6358	NC_013385	GAGG	2	8	283595	283602	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6359	NC_013385	CCG	2	6	283621	283626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6360	NC_013385	CGGA	2	8	283663	283670	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6361	NC_013385	GGT	2	6	283707	283712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6362	NC_013385	GAG	2	6	283713	283718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6363	NC_013385	CTC	2	6	283756	283761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6364	NC_013385	TCC	2	6	283795	283800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6365	NC_013385	AGGG	2	8	283833	283840	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6366	NC_013385	CTTCAA	2	12	283865	283876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6367	NC_013385	GCT	2	6	283917	283922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6368	NC_013385	GTA	2	6	283949	283954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6369	NC_013385	CGA	2	6	284010	284015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6370	NC_013385	CTTT	2	8	284110	284117	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6371	NC_013385	TCG	2	6	284252	284257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892205
6372	NC_013385	TGC	2	6	284312	284317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892205
6373	NC_013385	A	6	6	284400	284405	100 %	0 %	0 %	0 %	260892205
6374	NC_013385	CT	3	6	284434	284439	0 %	50 %	0 %	50 %	260892205
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6497	NC_013385	TCC	2	6	289888	289893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6498	NC_013385	GTC	2	6	289925	289930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6499	NC_013385	CTCC	2	8	289932	289939	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6500	NC_013385	CTC	2	6	289963	289968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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