MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-011

Total Repeats: 306

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013210	CG	3	6	422	427	0 %	0 %	50 %	50 %	258512910
2	NC_013210	GC	3	6	1642	1647	0 %	0 %	50 %	50 %	258512913
3	NC_013210	CG	3	6	3554	3559	0 %	0 %	50 %	50 %	258512914
4	NC_013210	TG	3	6	3679	3684	0 %	50 %	50 %	0 %	258512914
5	NC_013210	TG	3	6	3870	3875	0 %	50 %	50 %	0 %	258512914
6	NC_013210	GC	3	6	4264	4269	0 %	0 %	50 %	50 %	258512915
7	NC_013210	TA	3	6	5601	5606	50 %	50 %	0 %	0 %	258512917
8	NC_013210	CG	3	6	5616	5621	0 %	0 %	50 %	50 %	258512917
9	NC_013210	TG	3	6	6660	6665	0 %	50 %	50 %	0 %	258512917
10	NC_013210	AG	3	6	6796	6801	50 %	0 %	50 %	0 %	258512917
11	NC_013210	TG	3	6	7721	7726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013210	GT	3	6	7932	7937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013210	GA	3	6	8787	8792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013210	GA	3	6	10492	10497	50 %	0 %	50 %	0 %	258512921
15	NC_013210	CG	3	6	10969	10974	0 %	0 %	50 %	50 %	258512921
16	NC_013210	CG	3	6	12404	12409	0 %	0 %	50 %	50 %	258512921
17	NC_013210	AG	3	6	12499	12504	50 %	0 %	50 %	0 %	258512921
18	NC_013210	TC	3	6	12843	12848	0 %	50 %	0 %	50 %	258512921
19	NC_013210	CG	3	6	13042	13047	0 %	0 %	50 %	50 %	258512921
20	NC_013210	AG	3	6	13316	13321	50 %	0 %	50 %	0 %	258512921
21	NC_013210	GC	3	6	15254	15259	0 %	0 %	50 %	50 %	258512922
22	NC_013210	GC	3	6	15958	15963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013210	CG	3	6	16079	16084	0 %	0 %	50 %	50 %	258512923
24	NC_013210	AC	3	6	17325	17330	50 %	0 %	0 %	50 %	258512924
25	NC_013210	CA	3	6	18308	18313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013210	CG	3	6	19455	19460	0 %	0 %	50 %	50 %	258512926
27	NC_013210	GC	3	6	19868	19873	0 %	0 %	50 %	50 %	258512926
28	NC_013210	AG	4	8	20557	20564	50 %	0 %	50 %	0 %	258512927
29	NC_013210	TC	3	6	20622	20627	0 %	50 %	0 %	50 %	258512927
30	NC_013210	AC	3	6	20787	20792	50 %	0 %	0 %	50 %	258512927
31	NC_013210	GC	3	6	21198	21203	0 %	0 %	50 %	50 %	258512928
32	NC_013210	TC	3	6	22255	22260	0 %	50 %	0 %	50 %	258512930
33	NC_013210	GA	4	8	22334	22341	50 %	0 %	50 %	0 %	258512930
34	NC_013210	CT	4	8	24088	24095	0 %	50 %	0 %	50 %	258512931
35	NC_013210	GC	3	6	24239	24244	0 %	0 %	50 %	50 %	258512931
36	NC_013210	GT	3	6	26885	26890	0 %	50 %	50 %	0 %	258512934
37	NC_013210	AG	3	6	27127	27132	50 %	0 %	50 %	0 %	258512934
38	NC_013210	CT	3	6	27964	27969	0 %	50 %	0 %	50 %	258512935
39	NC_013210	GA	3	6	27991	27996	50 %	0 %	50 %	0 %	258512935
40	NC_013210	GC	3	6	29495	29500	0 %	0 %	50 %	50 %	258512936
41	NC_013210	CA	3	6	30982	30987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013210	GA	3	6	31027	31032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013210	CA	3	6	31304	31309	50 %	0 %	0 %	50 %	258512938
44	NC_013210	AG	3	6	31555	31560	50 %	0 %	50 %	0 %	258512938
45	NC_013210	TC	3	6	32080	32085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013210	GT	3	6	32168	32173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013210	CT	3	6	32191	32196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013210	AC	3	6	32382	32387	50 %	0 %	0 %	50 %	258512939
49	NC_013210	GA	3	6	34545	34550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013210	AG	3	6	35004	35009	50 %	0 %	50 %	0 %	258512942
51	NC_013210	GC	3	6	35084	35089	0 %	0 %	50 %	50 %	258512942
52	NC_013210	AC	3	6	35107	35112	50 %	0 %	0 %	50 %	258512942
53	NC_013210	CG	3	6	35285	35290	0 %	0 %	50 %	50 %	258512942
54	NC_013210	CG	3	6	36137	36142	0 %	0 %	50 %	50 %	258512942
55	NC_013210	GT	3	6	36145	36150	0 %	50 %	50 %	0 %	258512942
56	NC_013210	CA	3	6	36677	36682	50 %	0 %	0 %	50 %	258512942
57	NC_013210	CT	3	6	37468	37473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013210	CA	3	6	38310	38315	50 %	0 %	0 %	50 %	258512943
59	NC_013210	CA	3	6	38631	38636	50 %	0 %	0 %	50 %	258512944
60	NC_013210	GC	3	6	41477	41482	0 %	0 %	50 %	50 %	258512948
61	NC_013210	GC	3	6	43146	43151	0 %	0 %	50 %	50 %	258512949
62	NC_013210	CA	3	6	44651	44656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013210	TA	3	6	44836	44841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013210	AT	3	6	44950	44955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013210	AC	3	6	45495	45500	50 %	0 %	0 %	50 %	258512951
66	NC_013210	GC	3	6	46538	46543	0 %	0 %	50 %	50 %	258512952
67	NC_013210	CA	3	6	47460	47465	50 %	0 %	0 %	50 %	258512953
68	NC_013210	CG	3	6	48000	48005	0 %	0 %	50 %	50 %	258512953
69	NC_013210	GT	3	6	48678	48683	0 %	50 %	50 %	0 %	258512954
70	NC_013210	TG	3	6	48991	48996	0 %	50 %	50 %	0 %	258512955
71	NC_013210	CT	3	6	49129	49134	0 %	50 %	0 %	50 %	258512955
72	NC_013210	GA	3	6	49648	49653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013210	AG	3	6	49811	49816	50 %	0 %	50 %	0 %	258512956
74	NC_013210	AC	3	6	50502	50507	50 %	0 %	0 %	50 %	258512956
75	NC_013210	GT	3	6	51427	51432	0 %	50 %	50 %	0 %	258512957
76	NC_013210	CA	3	6	53220	53225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013210	AG	3	6	54255	54260	50 %	0 %	50 %	0 %	258512959
78	NC_013210	CG	3	6	55740	55745	0 %	0 %	50 %	50 %	258512960
79	NC_013210	CG	3	6	56078	56083	0 %	0 %	50 %	50 %	258512960
80	NC_013210	CG	3	6	56821	56826	0 %	0 %	50 %	50 %	258512960
81	NC_013210	CA	3	6	59419	59424	50 %	0 %	0 %	50 %	258512962
82	NC_013210	GC	3	6	59990	59995	0 %	0 %	50 %	50 %	258512962
83	NC_013210	CT	3	6	60161	60166	0 %	50 %	0 %	50 %	258512962
84	NC_013210	TC	3	6	60453	60458	0 %	50 %	0 %	50 %	258512962
85	NC_013210	CG	3	6	60900	60905	0 %	0 %	50 %	50 %	258512963
86	NC_013210	CA	3	6	61269	61274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013210	CA	3	6	61448	61453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013210	GC	3	6	61732	61737	0 %	0 %	50 %	50 %	258512964
89	NC_013210	CA	3	6	61763	61768	50 %	0 %	0 %	50 %	258512964
90	NC_013210	GC	3	6	61787	61792	0 %	0 %	50 %	50 %	258512964
91	NC_013210	CT	4	8	61813	61820	0 %	50 %	0 %	50 %	258512964
92	NC_013210	AC	3	6	63075	63080	50 %	0 %	0 %	50 %	258512965
93	NC_013210	AC	3	6	63770	63775	50 %	0 %	0 %	50 %	258512965
94	NC_013210	CG	3	6	64464	64469	0 %	0 %	50 %	50 %	258512966
95	NC_013210	AT	3	6	65623	65628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013210	TC	3	6	66316	66321	0 %	50 %	0 %	50 %	258512967
97	NC_013210	CA	3	6	67278	67283	50 %	0 %	0 %	50 %	258512968
98	NC_013210	AG	3	6	67556	67561	50 %	0 %	50 %	0 %	258512968
99	NC_013210	AT	3	6	67803	67808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013210	TA	4	8	68010	68017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013210	TA	3	6	68064	68069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013210	GA	3	6	68082	68087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013210	AC	3	6	68103	68108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013210	AT	3	6	68312	68317	50 %	50 %	0 %	0 %	258512969
105	NC_013210	CT	3	6	68385	68390	0 %	50 %	0 %	50 %	258512969
106	NC_013210	TC	3	6	69102	69107	0 %	50 %	0 %	50 %	258512969
107	NC_013210	TA	3	6	69845	69850	50 %	50 %	0 %	0 %	258512969
108	NC_013210	AG	3	6	70827	70832	50 %	0 %	50 %	0 %	258512970
109	NC_013210	GC	3	6	70938	70943	0 %	0 %	50 %	50 %	258512970
110	NC_013210	GC	3	6	71523	71528	0 %	0 %	50 %	50 %	258512970
111	NC_013210	TG	3	6	71879	71884	0 %	50 %	50 %	0 %	258512971
112	NC_013210	GA	3	6	72023	72028	50 %	0 %	50 %	0 %	258512971
113	NC_013210	GC	3	6	73175	73180	0 %	0 %	50 %	50 %	258512973
114	NC_013210	CT	4	8	74621	74628	0 %	50 %	0 %	50 %	258512974
115	NC_013210	TC	3	6	74691	74696	0 %	50 %	0 %	50 %	258512974
116	NC_013210	CG	3	6	76032	76037	0 %	0 %	50 %	50 %	258512975
117	NC_013210	TG	3	6	77159	77164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013210	CG	4	8	80190	80197	0 %	0 %	50 %	50 %	258512977
119	NC_013210	GA	3	6	80563	80568	50 %	0 %	50 %	0 %	258512977
120	NC_013210	GC	3	6	80805	80810	0 %	0 %	50 %	50 %	258512977
121	NC_013210	CT	3	6	81001	81006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013210	AG	3	6	81022	81027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013210	CA	3	6	82966	82971	50 %	0 %	0 %	50 %	258512979
124	NC_013210	CT	3	6	83116	83121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013210	CT	3	6	83161	83166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013210	TG	3	6	83334	83339	0 %	50 %	50 %	0 %	258512980
127	NC_013210	CT	3	6	84737	84742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013210	CA	3	6	85579	85584	50 %	0 %	0 %	50 %	258512982
129	NC_013210	CT	3	6	86900	86905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013210	CA	3	6	87172	87177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013210	GT	3	6	87919	87924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013210	AG	3	6	87932	87937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013210	CG	3	6	89422	89427	0 %	0 %	50 %	50 %	258512985
134	NC_013210	GC	3	6	89835	89840	0 %	0 %	50 %	50 %	258512985
135	NC_013210	AG	3	6	90474	90479	50 %	0 %	50 %	0 %	258512986
136	NC_013210	AG	4	8	90774	90781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013210	TC	3	6	90820	90825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013210	AT	3	6	90837	90842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013210	AT	3	6	90891	90896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013210	AC	3	6	91248	91253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013210	AC	3	6	92538	92543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013210	GC	3	6	94373	94378	0 %	0 %	50 %	50 %	258512990
143	NC_013210	GC	3	6	95994	95999	0 %	0 %	50 %	50 %	258512992
144	NC_013210	GA	3	6	96522	96527	50 %	0 %	50 %	0 %	258512993
145	NC_013210	GA	3	6	96852	96857	50 %	0 %	50 %	0 %	258512993
146	NC_013210	TG	3	6	97021	97026	0 %	50 %	50 %	0 %	258512993
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289	NC_013210	TC	3	6	179038	179043	0 %	50 %	0 %	50 %	258513080
290	NC_013210	GA	3	6	180516	180521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
291	NC_013210	GA	3	6	180672	180677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
292	NC_013210	AG	3	6	180835	180840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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305	NC_013210	AG	3	6	189517	189522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
306	NC_013210	GC	3	6	190586	190591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.