MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01

Total Repeats: 2182

< Previous12345Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013209	GCCTT	2	10	2662352	2662361	0 %	40 %	20 %	40 %	258543506
2002	NC_013209	AGACG	2	10	2663665	2663674	40 %	0 %	40 %	20 %	258543508
2003	NC_013209	GCCAC	2	10	2664202	2664211	20 %	0 %	20 %	60 %	258543508
2004	NC_013209	CCAGA	2	10	2664864	2664873	40 %	0 %	20 %	40 %	258543508
2005	NC_013209	CACCC	2	10	2666101	2666110	20 %	0 %	0 %	80 %	258543509
2006	NC_013209	CAGCA	2	10	2667551	2667560	40 %	0 %	20 %	40 %	258543510
2007	NC_013209	ACCAA	2	10	2667591	2667600	60 %	0 %	0 %	40 %	258543510
2008	NC_013209	GCCAG	2	10	2667628	2667637	20 %	0 %	40 %	40 %	258543510
2009	NC_013209	ATACG	2	10	2668196	2668205	40 %	20 %	20 %	20 %	258543510
2010	NC_013209	CTTCT	2	10	2669620	2669629	0 %	60 %	0 %	40 %	258543512
2011	NC_013209	AAACG	2	10	2670696	2670705	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2012	NC_013209	ACATG	2	10	2670905	2670914	40 %	20 %	20 %	20 %	258543515
2013	NC_013209	TCACT	2	10	2674061	2674070	20 %	40 %	0 %	40 %	258543518
2014	NC_013209	CAGAT	2	10	2674671	2674680	40 %	20 %	20 %	20 %	258543519
2015	NC_013209	CTTGC	2	10	2677902	2677911	0 %	40 %	20 %	40 %	258543522
2016	NC_013209	AACCC	2	10	2681606	2681615	40 %	0 %	0 %	60 %	258543524
2017	NC_013209	CATGG	2	10	2684955	2684964	20 %	20 %	40 %	20 %	258543528
2018	NC_013209	GTGCT	2	10	2686080	2686089	0 %	40 %	40 %	20 %	258543530
2019	NC_013209	TCTGC	2	10	2686806	2686815	0 %	40 %	20 %	40 %	258543530
2020	NC_013209	CAGCC	2	10	2687550	2687559	20 %	0 %	20 %	60 %	258543531
2021	NC_013209	GAAGC	2	10	2687672	2687681	40 %	0 %	40 %	20 %	258543531
2022	NC_013209	AGAAC	2	10	2694331	2694340	60 %	0 %	20 %	20 %	258543537
2023	NC_013209	TGCCT	2	10	2694738	2694747	0 %	40 %	20 %	40 %	258543537
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2025	NC_013209	TCTGT	2	10	2695297	2695306	0 %	60 %	20 %	20 %	258543537
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2027	NC_013209	GGCAG	2	10	2696529	2696538	20 %	0 %	60 %	20 %	258543539
2028	NC_013209	CATGC	2	10	2697334	2697343	20 %	20 %	20 %	40 %	258543540
2029	NC_013209	TCTGT	2	10	2697814	2697823	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2030	NC_013209	TTTTC	2	10	2699256	2699265	0 %	80 %	0 %	20 %	258543542
2031	NC_013209	AAAAC	2	10	2699566	2699575	80 %	0 %	0 %	20 %	258543543
2032	NC_013209	CCTTT	2	10	2701603	2701612	0 %	60 %	0 %	40 %	258543545
2033	NC_013209	CTGCG	2	10	2703724	2703733	0 %	20 %	40 %	40 %	258543547
2034	NC_013209	TCTGA	2	10	2705273	2705282	20 %	40 %	20 %	20 %	258543548
2035	NC_013209	CCCGG	2	10	2706907	2706916	0 %	0 %	40 %	60 %	258543550
2036	NC_013209	AAAGG	2	10	2709374	2709383	60 %	0 %	40 %	0 %	258543554
2037	NC_013209	CGTAA	2	10	2709515	2709524	40 %	20 %	20 %	20 %	258543554
2038	NC_013209	CAGAA	2	10	2709893	2709902	60 %	0 %	20 %	20 %	258543554
2039	NC_013209	ATCAC	2	10	2711046	2711055	40 %	20 %	0 %	40 %	258543554
2040	NC_013209	GGCGC	2	10	2711281	2711290	0 %	0 %	60 %	40 %	258543554
2041	NC_013209	TGGCT	2	10	2711399	2711408	0 %	40 %	40 %	20 %	258543554
2042	NC_013209	CCCCG	2	10	2712464	2712473	0 %	0 %	20 %	80 %	258543555
2043	NC_013209	GGAAA	2	10	2713574	2713583	60 %	0 %	40 %	0 %	258543556
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2047	NC_013209	TCCAG	2	10	2718291	2718300	20 %	20 %	20 %	40 %	258543561
2048	NC_013209	CATTA	2	10	2718925	2718934	40 %	40 %	0 %	20 %	258543561
2049	NC_013209	ATGGC	2	10	2720199	2720208	20 %	20 %	40 %	20 %	258543562
2050	NC_013209	TGATG	2	10	2720267	2720276	20 %	40 %	40 %	0 %	258543562
2051	NC_013209	GCGGG	2	10	2720630	2720639	0 %	0 %	80 %	20 %	258543562
2052	NC_013209	GACAG	2	10	2722581	2722590	40 %	0 %	40 %	20 %	258543564
2053	NC_013209	ACCAG	2	10	2722824	2722833	40 %	0 %	20 %	40 %	258543564
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2055	NC_013209	CTGCC	2	10	2725489	2725498	0 %	20 %	20 %	60 %	258543566
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2058	NC_013209	CCCTG	2	10	2732160	2732169	0 %	20 %	20 %	60 %	258543573
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2061	NC_013209	GGGCC	2	10	2735752	2735761	0 %	0 %	60 %	40 %	258543575
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2064	NC_013209	CTGGG	2	10	2740279	2740288	0 %	20 %	60 %	20 %	258543580
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2071	NC_013209	TTCAT	2	10	2746363	2746372	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2072	NC_013209	ACATC	2	10	2748535	2748544	40 %	20 %	0 %	40 %	258543589
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2087	NC_013209	CTGCA	2	10	2763911	2763920	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2088	NC_013209	GGGAT	2	10	2764213	2764222	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2089	NC_013209	GCCCA	2	10	2768225	2768234	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2090	NC_013209	CACGA	2	10	2768292	2768301	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2091	NC_013209	CCCAT	2	10	2769622	2769631	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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2097	NC_013209	TGTGG	2	10	2776449	2776458	0 %	40 %	60 %	0 %	258543608
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2125	NC_013209	CCACC	2	10	2814808	2814817	20 %	0 %	0 %	80 %	258543643
2126	NC_013209	TGTTC	2	10	2815143	2815152	0 %	60 %	20 %	20 %	258543644
2127	NC_013209	TGTGC	2	10	2816314	2816323	0 %	40 %	40 %	20 %	258543645
2128	NC_013209	CAAGG	2	10	2816530	2816539	40 %	0 %	40 %	20 %	258543646
2129	NC_013209	CTGCA	2	10	2817045	2817054	20 %	20 %	20 %	40 %	258543646
2130	NC_013209	TCAGC	2	10	2821778	2821787	20 %	20 %	20 %	40 %	258543650
2131	NC_013209	GGGCA	2	10	2823665	2823674	20 %	0 %	60 %	20 %	258543652
2132	NC_013209	TTACC	2	10	2823790	2823799	20 %	40 %	0 %	40 %	258543652
2133	NC_013209	TTTCT	2	10	2828303	2828312	0 %	80 %	0 %	20 %	258543654
2134	NC_013209	CAAAG	2	10	2828586	2828595	60 %	0 %	20 %	20 %	258543654
2135	NC_013209	AACAG	2	10	2829567	2829576	60 %	0 %	20 %	20 %	258543654
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2138	NC_013209	CATCC	2	10	2830914	2830923	20 %	20 %	0 %	60 %	258543655
2139	NC_013209	CATTC	2	10	2833819	2833828	20 %	40 %	0 %	40 %	258543657
2140	NC_013209	TACAA	2	10	2839264	2839273	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2141	NC_013209	CACAT	2	10	2840096	2840105	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2142	NC_013209	CAGAT	2	10	2840648	2840657	40 %	20 %	20 %	20 %	258543663
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2147	NC_013209	GCCGG	2	10	2849275	2849284	0 %	0 %	60 %	40 %	258543672
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2149	NC_013209	GTGCT	2	10	2855510	2855519	0 %	40 %	40 %	20 %	258543676
2150	NC_013209	GCATG	2	10	2856221	2856230	20 %	20 %	40 %	20 %	258543677
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2152	NC_013209	TTCCC	2	10	2857649	2857658	0 %	40 %	0 %	60 %	258543680
2153	NC_013209	GCTGG	2	10	2858314	2858323	0 %	20 %	60 %	20 %	258543681
2154	NC_013209	CATTA	2	10	2858527	2858536	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2155	NC_013209	CTGTT	2	10	2862259	2862268	0 %	60 %	20 %	20 %	258543686
2156	NC_013209	AAAAG	2	10	2867098	2867107	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2157	NC_013209	TCGCG	2	10	2869247	2869256	0 %	20 %	40 %	40 %	258543691
2158	NC_013209	CGCTT	2	10	2869424	2869433	0 %	40 %	20 %	40 %	258543691
2159	NC_013209	GATTA	2	10	2871907	2871916	40 %	40 %	20 %	0 %	258543691
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2162	NC_013209	GTTAT	2	10	2878972	2878981	20 %	60 %	20 %	0 %	258543699
2163	NC_013209	TGCAC	2	10	2879201	2879210	20 %	20 %	20 %	40 %	258543699
2164	NC_013209	CAAAT	2	10	2886923	2886932	60 %	20 %	0 %	20 %	258543707
2165	NC_013209	CATGG	2	10	2891127	2891136	20 %	20 %	40 %	20 %	258543712
2166	NC_013209	TACAT	2	10	2891849	2891858	40 %	40 %	0 %	20 %	258543713
2167	NC_013209	CACCC	2	10	2892003	2892012	20 %	0 %	0 %	80 %	258543713
2168	NC_013209	CAAAA	2	10	2892889	2892898	80 %	0 %	0 %	20 %	258543714
2169	NC_013209	CCATA	2	10	2893011	2893020	40 %	20 %	0 %	40 %	258543714
2170	NC_013209	CAAAG	2	10	2893622	2893631	60 %	0 %	20 %	20 %	258543714
2171	NC_013209	GCAAA	2	10	2893785	2893794	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2178	NC_013209	CCAAG	2	10	2901695	2901704	40 %	0 %	20 %	40 %	258543724
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2181	NC_013209	TGCCC	2	10	2903683	2903692	0 %	20 %	20 %	60 %	258543726
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.