MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI02

Total Repeats: 1148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013207	GGA	2	6	8	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013207	TCT	2	6	14	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013207	GTT	2	6	53	58	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013207	GGC	2	6	113	118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793043
5	NC_013207	GAT	2	6	490	495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013207	ATT	2	6	633	638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013207	TTG	2	6	734	739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013207	GAG	2	6	804	809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013207	GAA	2	6	867	872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013207	ATC	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013207	ATA	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013207	ATT	2	6	955	960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013207	TGA	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013207	GGA	2	6	1173	1178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013207	ACG	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013207	TGC	2	6	1324	1329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013207	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013207	GAT	2	6	1419	1424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013207	GAA	2	6	1492	1497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013207	GGT	2	6	1500	1505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013207	ATG	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013207	ACT	2	6	1668	1673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013207	TCT	2	6	1698	1703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013207	TCG	2	6	1862	1867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793044
25	NC_013207	ATC	3	9	1877	1885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793044
26	NC_013207	CTG	2	6	1986	1991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013207	TCA	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013207	CGT	2	6	2059	2064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793045
29	NC_013207	GAC	2	6	2229	2234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793045
30	NC_013207	TCA	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793045
31	NC_013207	ACG	2	6	2312	2317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793045
32	NC_013207	GCG	2	6	2404	2409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793046
33	NC_013207	CGC	2	6	2441	2446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793046
34	NC_013207	TCT	2	6	2497	2502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793046
35	NC_013207	AGC	2	6	2674	2679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793046
36	NC_013207	CAG	2	6	2732	2737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013207	GTC	2	6	2751	2756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013207	GGT	2	6	3037	3042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013207	AAG	2	6	3074	3079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793048
40	NC_013207	AAG	2	6	3143	3148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793048
41	NC_013207	ACA	2	6	3232	3237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793048
42	NC_013207	CAC	2	6	3241	3246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793048
43	NC_013207	CAG	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793048
44	NC_013207	TCG	2	6	3420	3425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793048
45	NC_013207	CGC	2	6	4027	4032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793048
46	NC_013207	GAC	2	6	4040	4045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793048
47	NC_013207	GGA	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793048
48	NC_013207	TCA	2	6	4432	4437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793048
49	NC_013207	AGC	2	6	4482	4487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793048
50	NC_013207	CGC	2	6	4556	4561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793048
51	NC_013207	GGT	2	6	4644	4649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793048
52	NC_013207	GTT	2	6	5064	5069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793049
53	NC_013207	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793049
54	NC_013207	GTC	2	6	5239	5244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793049
55	NC_013207	ATC	2	6	5335	5340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793049
56	NC_013207	GAA	2	6	5499	5504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793049
57	NC_013207	TCG	2	6	5507	5512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793049
58	NC_013207	CGG	2	6	5603	5608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793049
59	NC_013207	GCA	3	9	5750	5758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793049
60	NC_013207	CGG	2	6	5818	5823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793049
61	NC_013207	GCG	2	6	5919	5924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793049
62	NC_013207	GAA	2	6	5986	5991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793049
63	NC_013207	GAA	2	6	6027	6032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793049
64	NC_013207	CAG	2	6	6130	6135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793049
65	NC_013207	ACA	2	6	6233	6238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793049
66	NC_013207	CGC	2	6	6302	6307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793049
67	NC_013207	GAG	2	6	6308	6313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793049
68	NC_013207	GCG	2	6	6433	6438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793049
69	NC_013207	TTG	2	6	6448	6453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793049
70	NC_013207	TGT	2	6	6738	6743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013207	TAT	2	6	6840	6845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013207	ATG	2	6	6934	6939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013207	CAA	2	6	7043	7048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013207	TGT	2	6	7193	7198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013207	GCG	2	6	7273	7278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013207	TGC	2	6	7320	7325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013207	TCG	2	6	7417	7422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013207	GCA	2	6	7424	7429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013207	GAC	2	6	7436	7441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013207	ACC	2	6	7482	7487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_013207	TAC	2	6	7796	7801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793050
82	NC_013207	CTG	2	6	7861	7866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793050
83	NC_013207	CAT	2	6	7980	7985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793050
84	NC_013207	GCT	2	6	7993	7998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793050
85	NC_013207	CCA	2	6	8092	8097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793050
86	NC_013207	CGT	2	6	8165	8170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793050
87	NC_013207	GCC	2	6	8176	8181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793050
88	NC_013207	AAC	2	6	8301	8306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793050
89	NC_013207	TAT	2	6	8333	8338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257793050
90	NC_013207	ACC	2	6	8341	8346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793050
91	NC_013207	GAC	2	6	8381	8386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793050
92	NC_013207	ACC	2	6	8434	8439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793050
93	NC_013207	CCT	2	6	8471	8476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_013207	TGA	2	6	8490	8495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013207	TAA	2	6	8562	8567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013207	GTT	2	6	8570	8575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013207	TCT	2	6	8622	8627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013207	GAA	2	6	8640	8645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013207	GCG	2	6	8915	8920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013207	TGT	2	6	8987	8992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013207	GTA	2	6	9021	9026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013207	CGA	2	6	9237	9242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793051
103	NC_013207	CCG	2	6	9248	9253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793051
104	NC_013207	GCT	2	6	9285	9290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793051
105	NC_013207	GGC	2	6	9393	9398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793051
106	NC_013207	AGC	2	6	9448	9453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793051
107	NC_013207	GAA	2	6	9466	9471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793051
108	NC_013207	ATG	2	6	9551	9556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793051
109	NC_013207	GGA	2	6	9660	9665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793051
110	NC_013207	GAC	2	6	9673	9678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793051
111	NC_013207	ACC	2	6	9707	9712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793051
112	NC_013207	GGT	2	6	9729	9734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793051
113	NC_013207	GCT	2	6	9773	9778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793051
114	NC_013207	GAG	2	6	9817	9822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793051
115	NC_013207	GGC	2	6	9845	9850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793051
116	NC_013207	GCG	2	6	9976	9981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793051
117	NC_013207	AGG	2	6	10031	10036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793051
118	NC_013207	GTG	2	6	10039	10044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793051
119	NC_013207	GCG	2	6	10113	10118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793051
120	NC_013207	GGA	2	6	10344	10349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793051
121	NC_013207	AGC	2	6	10367	10372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793051
122	NC_013207	TGG	2	6	10379	10384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793051
123	NC_013207	GAC	2	6	10407	10412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793051
124	NC_013207	TGC	2	6	10466	10471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793051
125	NC_013207	TTG	3	9	10486	10494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793051
126	NC_013207	CCG	2	6	10655	10660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793051
127	NC_013207	ACG	2	6	10840	10845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013207	AGT	2	6	10852	10857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013207	AGG	2	6	11078	11083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013207	ATT	2	6	11126	11131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257793052
131	NC_013207	CAA	2	6	11268	11273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793052
132	NC_013207	CCT	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793052
133	NC_013207	ATC	2	6	11430	11435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793052
134	NC_013207	GGT	2	6	11446	11451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793052
135	NC_013207	ATA	2	6	11520	11525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257793052
136	NC_013207	TCA	2	6	11595	11600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793052
137	NC_013207	GGC	2	6	11620	11625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793052
138	NC_013207	TGC	2	6	11818	11823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793052
139	NC_013207	GTC	2	6	11850	11855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793052
140	NC_013207	GGA	2	6	11927	11932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793052
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142	NC_013207	CAT	2	6	12049	12054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793052
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145	NC_013207	GTC	2	6	12423	12428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013207	TCG	2	6	12498	12503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013207	AAC	2	6	12515	12520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_013207	AAC	2	6	12977	12982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793053
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151	NC_013207	ACG	2	6	13400	13405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793053
152	NC_013207	GAC	2	6	13521	13526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793053
153	NC_013207	ATT	2	6	13549	13554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257793054
154	NC_013207	CCT	2	6	13619	13624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793054
155	NC_013207	TGC	2	6	13746	13751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793054
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157	NC_013207	GAT	3	9	13856	13864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793054
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159	NC_013207	CGC	2	6	13954	13959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793055
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163	NC_013207	GAT	2	6	14104	14109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793055
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169	NC_013207	TGG	2	6	14900	14905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793056
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173	NC_013207	CGG	2	6	15250	15255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_013207	CTG	2	6	15990	15995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_013207	CAT	2	6	16201	16206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793057
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190	NC_013207	ATG	2	6	17633	17638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_013207	CAT	2	6	21753	21758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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257	NC_013207	CTT	2	6	23248	23253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_013207	TGT	2	6	23295	23300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_013207	AAG	2	6	23451	23456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_013207	AAG	2	6	23628	23633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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