MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI02

Total Repeats: 1148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013207	CAT	2	6	41685	41690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_013207	GAG	2	6	41900	41905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793079
503	NC_013207	AGC	2	6	42117	42122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793079
504	NC_013207	TCG	2	6	42142	42147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793079
505	NC_013207	GAG	3	9	42167	42175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793079
506	NC_013207	GCA	2	6	42195	42200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793079
507	NC_013207	TGT	2	6	42213	42218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793079
508	NC_013207	GTT	2	6	42262	42267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793079
509	NC_013207	GAG	2	6	42278	42283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793079
510	NC_013207	GCG	3	9	42308	42316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793079
511	NC_013207	AGG	2	6	42321	42326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793079
512	NC_013207	GGC	2	6	42340	42345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793079
513	NC_013207	GGA	2	6	42394	42399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793079
514	NC_013207	TCA	2	6	42424	42429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793079
515	NC_013207	CGC	2	6	42435	42440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793079
516	NC_013207	AGC	2	6	42441	42446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793079
517	NC_013207	TGC	2	6	42501	42506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793079
518	NC_013207	CGG	2	6	42522	42527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793079
519	NC_013207	GCG	2	6	42538	42543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793079
520	NC_013207	GAA	2	6	42550	42555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793079
521	NC_013207	GCC	2	6	42685	42690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793080
522	NC_013207	CTG	2	6	42772	42777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793080
523	NC_013207	CGG	2	6	42840	42845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793080
524	NC_013207	ATT	2	6	42999	43004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257793081
525	NC_013207	TGC	2	6	43072	43077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793081
526	NC_013207	ATC	2	6	43104	43109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793081
527	NC_013207	CTG	2	6	43113	43118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793081
528	NC_013207	GCC	2	6	43279	43284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_013207	GGC	2	6	43305	43310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_013207	GTC	2	6	43326	43331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_013207	CAA	2	6	43413	43418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_013207	TCT	2	6	43458	43463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_013207	GTC	2	6	43519	43524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_013207	GAT	2	6	43531	43536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013207	CTT	2	6	43546	43551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_013207	TGT	2	6	43631	43636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013207	ATC	2	6	43641	43646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_013207	CTC	3	9	43647	43655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_013207	CCG	2	6	43685	43690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_013207	GAT	2	6	43726	43731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013207	ATC	2	6	43817	43822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793082
542	NC_013207	CAG	2	6	43913	43918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_013207	GAA	2	6	43989	43994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013207	CAT	2	6	44024	44029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_013207	TCC	2	6	44085	44090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_013207	CCG	2	6	44094	44099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_013207	CGC	2	6	44274	44279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793083
548	NC_013207	GGC	2	6	44280	44285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793083
549	NC_013207	CGG	2	6	44300	44305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793083
550	NC_013207	GTG	2	6	44311	44316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793083
551	NC_013207	GAC	2	6	44340	44345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793083
552	NC_013207	CGC	2	6	44417	44422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793083
553	NC_013207	GTC	2	6	44439	44444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793083
554	NC_013207	CAA	2	6	44508	44513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793083
555	NC_013207	TGG	2	6	44549	44554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793083
556	NC_013207	TCA	2	6	44609	44614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793083
557	NC_013207	CGA	2	6	44702	44707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793083
558	NC_013207	ACG	2	6	44752	44757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793083
559	NC_013207	GGA	2	6	44835	44840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793083
560	NC_013207	AGC	2	6	44888	44893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793083
561	NC_013207	GCA	2	6	45204	45209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_013207	GGC	2	6	45292	45297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_013207	GAG	2	6	45390	45395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793084
564	NC_013207	GGC	2	6	45439	45444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793084
565	NC_013207	GAT	2	6	45446	45451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793084
566	NC_013207	CTT	2	6	45629	45634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793084
567	NC_013207	AAG	2	6	45714	45719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793084
568	NC_013207	GTT	2	6	45784	45789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793085
569	NC_013207	CCG	2	6	45933	45938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793085
570	NC_013207	TGT	2	6	46016	46021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793085
571	NC_013207	ACG	2	6	46184	46189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793085
572	NC_013207	CAT	2	6	46199	46204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793085
573	NC_013207	TCA	2	6	46260	46265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793085
574	NC_013207	TTG	2	6	46479	46484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013207	GAT	2	6	46624	46629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013207	GTC	2	6	46751	46756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_013207	GTG	2	6	46773	46778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013207	GGT	2	6	46790	46795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013207	ATT	2	6	46812	46817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013207	AGG	2	6	47002	47007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013207	GCG	2	6	47105	47110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793086
582	NC_013207	GAA	2	6	47142	47147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793086
583	NC_013207	ACG	2	6	47425	47430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793086
584	NC_013207	GGT	2	6	47479	47484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793086
585	NC_013207	CAG	2	6	47498	47503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793086
586	NC_013207	ACG	3	9	47671	47679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793086
587	NC_013207	CGC	2	6	47705	47710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793086
588	NC_013207	CGC	2	6	47732	47737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793086
589	NC_013207	GCA	2	6	47766	47771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793086
590	NC_013207	CAC	2	6	47787	47792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793086
591	NC_013207	AAC	2	6	47815	47820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793086
592	NC_013207	TCT	2	6	47849	47854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793086
593	NC_013207	GCA	2	6	47874	47879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793086
594	NC_013207	TGG	2	6	47943	47948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793086
595	NC_013207	ATG	2	6	47951	47956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793086
596	NC_013207	AGT	2	6	47958	47963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793086
597	NC_013207	GAG	2	6	47978	47983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793086
598	NC_013207	CGA	2	6	48018	48023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793086
599	NC_013207	TCC	2	6	48108	48113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793086
600	NC_013207	CGC	2	6	48268	48273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_013207	GAA	2	6	48362	48367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793087
602	NC_013207	GGT	2	6	48383	48388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793087
603	NC_013207	GAC	2	6	48392	48397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793087
604	NC_013207	GGC	2	6	48449	48454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
605	NC_013207	GGA	2	6	48523	48528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793087
606	NC_013207	GCA	2	6	48843	48848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793087
607	NC_013207	TCT	2	6	48927	48932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793087
608	NC_013207	TCC	2	6	48936	48941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793087
609	NC_013207	GTC	2	6	48990	48995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793087
610	NC_013207	AGC	2	6	49092	49097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793087
611	NC_013207	CAT	3	9	49181	49189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793087
612	NC_013207	GGC	2	6	49205	49210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
613	NC_013207	GGC	2	6	49218	49223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
614	NC_013207	CGA	2	6	49249	49254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793087
615	NC_013207	GTT	2	6	49400	49405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793087
616	NC_013207	GGC	2	6	49511	49516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
617	NC_013207	CAA	2	6	49529	49534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793087
618	NC_013207	GTT	2	6	49556	49561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793087
619	NC_013207	GCA	2	6	49712	49717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793087
620	NC_013207	GGT	2	6	49719	49724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793087
621	NC_013207	CTT	2	6	49817	49822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793087
622	NC_013207	GCG	2	6	49834	49839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
623	NC_013207	ACG	2	6	49858	49863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793087
624	NC_013207	CGA	2	6	49957	49962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793087
625	NC_013207	AAC	2	6	49980	49985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793087
626	NC_013207	TGA	2	6	49988	49993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793087
627	NC_013207	CGG	2	6	50021	50026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
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