MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 9376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013205	GC	4	8	411	418	0 %	0 %	50 %	50 %	258510021
2	NC_013205	GC	3	6	1076	1081	0 %	0 %	50 %	50 %	258510021
3	NC_013205	CG	3	6	1180	1185	0 %	0 %	50 %	50 %	258510021
4	NC_013205	CG	3	6	1307	1312	0 %	0 %	50 %	50 %	258510021
5	NC_013205	TC	3	6	1323	1328	0 %	50 %	0 %	50 %	258510021
6	NC_013205	GC	3	6	1428	1433	0 %	0 %	50 %	50 %	258510021
7	NC_013205	CG	3	6	1867	1872	0 %	0 %	50 %	50 %	258510022
8	NC_013205	GC	3	6	2469	2474	0 %	0 %	50 %	50 %	258510022
9	NC_013205	GC	4	8	2705	2712	0 %	0 %	50 %	50 %	258510022
10	NC_013205	CG	4	8	3237	3244	0 %	0 %	50 %	50 %	258510024
11	NC_013205	CG	3	6	3501	3506	0 %	0 %	50 %	50 %	258510024
12	NC_013205	CG	3	6	3632	3637	0 %	0 %	50 %	50 %	258510024
13	NC_013205	GC	3	6	3641	3646	0 %	0 %	50 %	50 %	258510024
14	NC_013205	CG	3	6	3771	3776	0 %	0 %	50 %	50 %	258510024
15	NC_013205	TG	3	6	4361	4366	0 %	50 %	50 %	0 %	258510025
16	NC_013205	GC	3	6	5107	5112	0 %	0 %	50 %	50 %	258510025
17	NC_013205	CG	3	6	5116	5121	0 %	0 %	50 %	50 %	258510025
18	NC_013205	CG	3	6	5348	5353	0 %	0 %	50 %	50 %	258510025
19	NC_013205	GC	3	6	5388	5393	0 %	0 %	50 %	50 %	258510025
20	NC_013205	GC	5	10	5405	5414	0 %	0 %	50 %	50 %	258510025
21	NC_013205	GC	3	6	5610	5615	0 %	0 %	50 %	50 %	258510025
22	NC_013205	CG	3	6	6116	6121	0 %	0 %	50 %	50 %	258510025
23	NC_013205	AC	3	6	6152	6157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013205	GC	3	6	6933	6938	0 %	0 %	50 %	50 %	258510026
25	NC_013205	GC	3	6	7015	7020	0 %	0 %	50 %	50 %	258510026
26	NC_013205	CG	4	8	7044	7051	0 %	0 %	50 %	50 %	258510026
27	NC_013205	GC	4	8	7327	7334	0 %	0 %	50 %	50 %	258510026
28	NC_013205	GC	3	6	7420	7425	0 %	0 %	50 %	50 %	258510026
29	NC_013205	GC	3	6	7942	7947	0 %	0 %	50 %	50 %	258510026
30	NC_013205	CG	3	6	8398	8403	0 %	0 %	50 %	50 %	258510026
31	NC_013205	CG	3	6	8408	8413	0 %	0 %	50 %	50 %	258510026
32	NC_013205	GC	3	6	8674	8679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013205	GC	3	6	8690	8695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013205	GT	3	6	9533	9538	0 %	50 %	50 %	0 %	258510028
35	NC_013205	GC	3	6	9749	9754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013205	GC	3	6	10430	10435	0 %	0 %	50 %	50 %	258510030
37	NC_013205	CG	3	6	10689	10694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013205	AC	3	6	10725	10730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013205	GA	3	6	10996	11001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013205	AC	3	6	11615	11620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013205	AC	3	6	11997	12002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013205	AC	3	6	12166	12171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013205	GT	3	6	12359	12364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013205	CT	3	6	12386	12391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013205	CG	3	6	12844	12849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013205	GC	3	6	14136	14141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013205	GA	3	6	14472	14477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013205	CG	3	6	14786	14791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013205	GA	3	6	15680	15685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013205	TG	3	6	16021	16026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013205	AG	3	6	16126	16131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013205	GC	3	6	16353	16358	0 %	0 %	50 %	50 %	258510031
53	NC_013205	GC	3	6	17151	17156	0 %	0 %	50 %	50 %	258510031
54	NC_013205	GC	3	6	18000	18005	0 %	0 %	50 %	50 %	258510032
55	NC_013205	CG	4	8	18116	18123	0 %	0 %	50 %	50 %	258510032
56	NC_013205	GC	3	6	18301	18306	0 %	0 %	50 %	50 %	258510032
57	NC_013205	CG	4	8	18473	18480	0 %	0 %	50 %	50 %	258510032
58	NC_013205	GA	3	6	18676	18681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013205	GC	3	6	18787	18792	0 %	0 %	50 %	50 %	258510033
60	NC_013205	CG	3	6	18898	18903	0 %	0 %	50 %	50 %	258510033
61	NC_013205	GC	3	6	19067	19072	0 %	0 %	50 %	50 %	258510033
62	NC_013205	CG	3	6	19096	19101	0 %	0 %	50 %	50 %	258510033
63	NC_013205	CG	3	6	19471	19476	0 %	0 %	50 %	50 %	258510034
64	NC_013205	CG	3	6	19513	19518	0 %	0 %	50 %	50 %	258510034
65	NC_013205	CG	3	6	20109	20114	0 %	0 %	50 %	50 %	258510034
66	NC_013205	CG	3	6	20202	20207	0 %	0 %	50 %	50 %	258510034
67	NC_013205	CG	4	8	20523	20530	0 %	0 %	50 %	50 %	258510034
68	NC_013205	GC	3	6	20801	20806	0 %	0 %	50 %	50 %	258510035
69	NC_013205	GC	3	6	21584	21589	0 %	0 %	50 %	50 %	258510036
70	NC_013205	CG	3	6	21715	21720	0 %	0 %	50 %	50 %	258510036
71	NC_013205	TC	3	6	22018	22023	0 %	50 %	0 %	50 %	258510036
72	NC_013205	GC	3	6	22191	22196	0 %	0 %	50 %	50 %	258510036
73	NC_013205	GC	3	6	22512	22517	0 %	0 %	50 %	50 %	258510036
74	NC_013205	CG	3	6	22594	22599	0 %	0 %	50 %	50 %	258510036
75	NC_013205	GA	3	6	22663	22668	50 %	0 %	50 %	0 %	258510036
76	NC_013205	TC	4	8	22717	22724	0 %	50 %	0 %	50 %	258510036
77	NC_013205	CG	3	6	22846	22851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013205	CG	3	6	23012	23017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013205	GA	4	8	24145	24152	50 %	0 %	50 %	0 %	258510037
80	NC_013205	TC	3	6	24722	24727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013205	CG	3	6	25812	25817	0 %	0 %	50 %	50 %	258510038
82	NC_013205	CA	3	6	25929	25934	50 %	0 %	0 %	50 %	258510038
83	NC_013205	GT	3	6	26023	26028	0 %	50 %	50 %	0 %	258510038
84	NC_013205	AG	4	8	28400	28407	50 %	0 %	50 %	0 %	258510040
85	NC_013205	CG	3	6	28726	28731	0 %	0 %	50 %	50 %	258510040
86	NC_013205	GC	3	6	29339	29344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013205	CG	3	6	29574	29579	0 %	0 %	50 %	50 %	258510041
88	NC_013205	CG	3	6	29996	30001	0 %	0 %	50 %	50 %	258510041
89	NC_013205	GA	3	6	30365	30370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013205	CT	3	6	30518	30523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013205	GC	3	6	30872	30877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013205	CG	3	6	30900	30905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013205	CG	3	6	32427	32432	0 %	0 %	50 %	50 %	258510043
94	NC_013205	GC	3	6	32464	32469	0 %	0 %	50 %	50 %	258510043
95	NC_013205	GC	3	6	32544	32549	0 %	0 %	50 %	50 %	258510043
96	NC_013205	GC	3	6	32825	32830	0 %	0 %	50 %	50 %	258510043
97	NC_013205	GC	3	6	33203	33208	0 %	0 %	50 %	50 %	258510044
98	NC_013205	GA	3	6	33824	33829	50 %	0 %	50 %	0 %	258510044
99	NC_013205	GC	3	6	34087	34092	0 %	0 %	50 %	50 %	258510045
100	NC_013205	CG	3	6	34115	34120	0 %	0 %	50 %	50 %	258510045
101	NC_013205	GC	3	6	34436	34441	0 %	0 %	50 %	50 %	258510045
102	NC_013205	GC	3	6	34681	34686	0 %	0 %	50 %	50 %	258510045
103	NC_013205	GC	3	6	35132	35137	0 %	0 %	50 %	50 %	258510045
104	NC_013205	CG	3	6	35771	35776	0 %	0 %	50 %	50 %	258510046
105	NC_013205	GC	3	6	35821	35826	0 %	0 %	50 %	50 %	258510046
106	NC_013205	CG	3	6	35973	35978	0 %	0 %	50 %	50 %	258510046
107	NC_013205	CG	3	6	36232	36237	0 %	0 %	50 %	50 %	258510046
108	NC_013205	GC	3	6	36482	36487	0 %	0 %	50 %	50 %	258510046
109	NC_013205	GC	3	6	36865	36870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013205	CA	3	6	36933	36938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013205	GA	3	6	37022	37027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013205	GC	3	6	37258	37263	0 %	0 %	50 %	50 %	258510047
113	NC_013205	AC	4	8	37312	37319	50 %	0 %	0 %	50 %	258510047
114	NC_013205	CG	3	6	37376	37381	0 %	0 %	50 %	50 %	258510047
115	NC_013205	GC	3	6	37564	37569	0 %	0 %	50 %	50 %	258510047
116	NC_013205	GC	3	6	37853	37858	0 %	0 %	50 %	50 %	258510047
117	NC_013205	CG	3	6	37909	37914	0 %	0 %	50 %	50 %	258510047
118	NC_013205	CG	3	6	38844	38849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013205	GC	3	6	39020	39025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013205	CG	3	6	39787	39792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013205	GT	3	6	41111	41116	0 %	50 %	50 %	0 %	258510048
122	NC_013205	GC	3	6	41140	41145	0 %	0 %	50 %	50 %	258510048
123	NC_013205	GC	3	6	41372	41377	0 %	0 %	50 %	50 %	258510048
124	NC_013205	CA	3	6	41556	41561	50 %	0 %	0 %	50 %	258510048
125	NC_013205	GT	3	6	41650	41655	0 %	50 %	50 %	0 %	258510048
126	NC_013205	GC	3	6	43187	43192	0 %	0 %	50 %	50 %	258510050
127	NC_013205	GC	3	6	43233	43238	0 %	0 %	50 %	50 %	258510050
128	NC_013205	GC	4	8	43408	43415	0 %	0 %	50 %	50 %	258510050
129	NC_013205	GC	3	6	43685	43690	0 %	0 %	50 %	50 %	258510050
130	NC_013205	GC	3	6	43733	43738	0 %	0 %	50 %	50 %	258510050
131	NC_013205	CG	3	6	44105	44110	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
132	NC_013205	CG	3	6	44140	44145	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
133	NC_013205	GA	3	6	44565	44570	50 %	0 %	50 %	0 %	258510051
134	NC_013205	CG	3	6	44684	44689	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
135	NC_013205	CG	3	6	44966	44971	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
136	NC_013205	GC	3	6	45055	45060	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
137	NC_013205	CG	3	6	45130	45135	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
138	NC_013205	CG	3	6	45385	45390	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
139	NC_013205	CG	3	6	45656	45661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013205	GC	3	6	47183	47188	0 %	0 %	50 %	50 %	258510053
141	NC_013205	GC	3	6	47413	47418	0 %	0 %	50 %	50 %	258510053
142	NC_013205	CG	3	6	47957	47962	0 %	0 %	50 %	50 %	258510054
143	NC_013205	CG	3	6	48002	48007	0 %	0 %	50 %	50 %	258510054
144	NC_013205	CG	4	8	48085	48092	0 %	0 %	50 %	50 %	258510054
145	NC_013205	CG	3	6	48393	48398	0 %	0 %	50 %	50 %	258510055
146	NC_013205	CA	3	6	48465	48470	50 %	0 %	0 %	50 %	258510055
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