MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_013205	CCG	2	6	2064963	2064968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46002	NC_013205	CTC	2	6	2065122	2065127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511987
46003	NC_013205	CG	3	6	2065169	2065174	0 %	0 %	50 %	50 %	258511987
46004	NC_013205	GGCA	2	8	2065186	2065193	25 %	0 %	50 %	25 %	258511987
46005	NC_013205	TCT	2	6	2065202	2065207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511987
46006	NC_013205	CGT	2	6	2065241	2065246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511987
46007	NC_013205	CTT	2	6	2065338	2065343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511987
46008	NC_013205	GCT	2	6	2065344	2065349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511987
46009	NC_013205	GCGG	2	8	2065383	2065390	0 %	0 %	75 %	25 %	258511987
46010	NC_013205	GAGAT	2	10	2065465	2065474	40 %	20 %	40 %	0 %	258511987
46011	NC_013205	GAC	2	6	2065492	2065497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511987
46012	NC_013205	CTT	2	6	2065503	2065508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511987
46013	NC_013205	GC	3	6	2065554	2065559	0 %	0 %	50 %	50 %	258511987
46014	NC_013205	GC	3	6	2065591	2065596	0 %	0 %	50 %	50 %	258511987
46015	NC_013205	TCC	2	6	2065600	2065605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511987
46016	NC_013205	CAG	2	6	2065683	2065688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511987
46017	NC_013205	GAA	2	6	2065820	2065825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46018	NC_013205	C	6	6	2065876	2065881	0 %	0 %	0 %	100 %	258511988
46019	NC_013205	CGG	2	6	2065989	2065994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511988
46020	NC_013205	CTCG	2	8	2066023	2066030	0 %	25 %	25 %	50 %	258511988
46021	NC_013205	CCA	3	9	2066062	2066070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511988
46022	NC_013205	ATC	2	6	2066100	2066105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511988
46023	NC_013205	CG	3	6	2066118	2066123	0 %	0 %	50 %	50 %	258511988
46024	NC_013205	C	6	6	2066145	2066150	0 %	0 %	0 %	100 %	258511988
46025	NC_013205	AAC	2	6	2066211	2066216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511988
46026	NC_013205	CTCC	3	12	2066227	2066238	0 %	25 %	0 %	75 %	258511988
46027	NC_013205	CG	3	6	2066243	2066248	0 %	0 %	50 %	50 %	258511988
46028	NC_013205	ACGA	2	8	2066308	2066315	50 %	0 %	25 %	25 %	258511988
46029	NC_013205	CGC	2	6	2066419	2066424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511988
46030	NC_013205	CCG	2	6	2066518	2066523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511988
46031	NC_013205	GCA	2	6	2066529	2066534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511988
46032	NC_013205	AGCGC	2	10	2066584	2066593	20 %	0 %	40 %	40 %	258511988
46033	NC_013205	CG	3	6	2066686	2066691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46034	NC_013205	CAT	2	6	2066694	2066699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511989
46035	NC_013205	CG	3	6	2066741	2066746	0 %	0 %	50 %	50 %	258511989
46036	NC_013205	TCC	2	6	2066754	2066759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511989
46037	NC_013205	ATCC	2	8	2066779	2066786	25 %	25 %	0 %	50 %	258511989
46038	NC_013205	AGC	2	6	2066814	2066819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511989
46039	NC_013205	GCC	2	6	2066834	2066839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511989
46040	NC_013205	GCC	2	6	2066867	2066872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511989
46041	NC_013205	CGC	2	6	2066915	2066920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511989
46042	NC_013205	GCA	2	6	2066941	2066946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511989
46043	NC_013205	CTC	2	6	2066987	2066992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511989
46044	NC_013205	CGC	2	6	2067010	2067015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511989
46045	NC_013205	ACGCA	2	10	2067038	2067047	40 %	0 %	20 %	40 %	258511989
46046	NC_013205	TGCG	2	8	2067050	2067057	0 %	25 %	50 %	25 %	258511989
46047	NC_013205	CGC	2	6	2067061	2067066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511989
46048	NC_013205	GC	3	6	2067189	2067194	0 %	0 %	50 %	50 %	258511989
46049	NC_013205	CGT	2	6	2067257	2067262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511989
46050	NC_013205	CGT	2	6	2067310	2067315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511989
46051	NC_013205	GCA	2	6	2067322	2067327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511989
46052	NC_013205	CGG	2	6	2067328	2067333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511989
46053	NC_013205	GCG	2	6	2067379	2067384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511989
46054	NC_013205	GGC	2	6	2067422	2067427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511989
46055	NC_013205	CG	3	6	2067458	2067463	0 %	0 %	50 %	50 %	258511989
46056	NC_013205	CAC	2	6	2067479	2067484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511989
46057	NC_013205	GTA	2	6	2067512	2067517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511989
46058	NC_013205	GAC	2	6	2067557	2067562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511989
46059	NC_013205	GTCC	2	8	2067608	2067615	0 %	25 %	25 %	50 %	258511989
46060	NC_013205	GATA	2	8	2067646	2067653	50 %	25 %	25 %	0 %	258511989
46061	NC_013205	TTC	2	6	2067663	2067668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511989
46062	NC_013205	CCA	2	6	2067706	2067711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511989
46063	NC_013205	TGC	2	6	2067767	2067772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511990
46064	NC_013205	CGC	2	6	2067787	2067792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511990
46065	NC_013205	GCA	2	6	2067809	2067814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511990
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46067	NC_013205	AGT	2	6	2067851	2067856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511990
46068	NC_013205	GTTCC	2	10	2067865	2067874	0 %	40 %	20 %	40 %	258511990
46069	NC_013205	GTA	2	6	2067885	2067890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511990
46070	NC_013205	GGC	2	6	2067961	2067966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511990
46071	NC_013205	TCC	2	6	2067969	2067974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511990
46072	NC_013205	CG	3	6	2068000	2068005	0 %	0 %	50 %	50 %	258511990
46073	NC_013205	GAC	2	6	2068026	2068031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511990
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46075	NC_013205	GA	3	6	2068161	2068166	50 %	0 %	50 %	0 %	258511990
46076	NC_013205	CCGC	2	8	2068202	2068209	0 %	0 %	25 %	75 %	258511990
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46078	NC_013205	TTCG	2	8	2068218	2068225	0 %	50 %	25 %	25 %	258511990
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46083	NC_013205	GTC	2	6	2068389	2068394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511990
46084	NC_013205	CGC	2	6	2068416	2068421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511990
46085	NC_013205	GCCGC	2	10	2068448	2068457	0 %	0 %	40 %	60 %	258511990
46086	NC_013205	CGG	2	6	2068479	2068484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511990
46087	NC_013205	GAC	2	6	2068497	2068502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511990
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46089	NC_013205	GCCA	2	8	2068578	2068585	25 %	0 %	25 %	50 %	258511990
46090	NC_013205	GCCC	2	8	2068592	2068599	0 %	0 %	25 %	75 %	258511990
46091	NC_013205	CGG	2	6	2068673	2068678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511990
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46099	NC_013205	GC	3	6	2069064	2069069	0 %	0 %	50 %	50 %	258511991
46100	NC_013205	CG	4	8	2069094	2069101	0 %	0 %	50 %	50 %	258511991
46101	NC_013205	GCC	2	6	2069138	2069143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511991
46102	NC_013205	CGA	2	6	2069144	2069149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511991
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46110	NC_013205	CG	3	6	2069503	2069508	0 %	0 %	50 %	50 %	258511992
46111	NC_013205	CTCG	2	8	2069581	2069588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46112	NC_013205	GC	3	6	2069639	2069644	0 %	0 %	50 %	50 %	258511993
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46118	NC_013205	GAC	2	6	2069877	2069882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511993
46119	NC_013205	CCA	2	6	2069909	2069914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511993
46120	NC_013205	GCGCG	2	10	2069948	2069957	0 %	0 %	60 %	40 %	258511993
46121	NC_013205	CGA	2	6	2069993	2069998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511993
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46123	NC_013205	CAC	2	6	2070072	2070077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511993
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46179	NC_013205	TCC	2	6	2072313	2072318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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46184	NC_013205	GC	3	6	2072607	2072612	0 %	0 %	50 %	50 %	258511994
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46192	NC_013205	GAT	2	6	2072895	2072900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511994
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46213	NC_013205	ATT	2	6	2073723	2073728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46214	NC_013205	A	7	7	2073771	2073777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46215	NC_013205	CCGCTC	2	12	2073790	2073801	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46216	NC_013205	TC	3	6	2073837	2073842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46217	NC_013205	ACG	2	6	2073900	2073905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511995
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46219	NC_013205	TCC	2	6	2074054	2074059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46220	NC_013205	TC	3	6	2074097	2074102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46221	NC_013205	ATCC	2	8	2074178	2074185	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46222	NC_013205	CGA	2	6	2074306	2074311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511996
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46225	NC_013205	GGCTC	2	10	2074426	2074435	0 %	20 %	40 %	40 %	258511996
46226	NC_013205	CGC	2	6	2074454	2074459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511996
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46228	NC_013205	GAG	2	6	2074499	2074504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511996
46229	NC_013205	GC	3	6	2074599	2074604	0 %	0 %	50 %	50 %	258511996
46230	NC_013205	TGC	2	6	2074653	2074658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511996
46231	NC_013205	CGC	2	6	2074673	2074678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511996
46232	NC_013205	CG	3	6	2074715	2074720	0 %	0 %	50 %	50 %	258511996
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46338	NC_013205	CGCGC	2	10	2079145	2079154	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46339	NC_013205	CGAG	2	8	2079177	2079184	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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46469	NC_013205	TCC	2	6	2085418	2085423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512004
46470	NC_013205	TCC	2	6	2085438	2085443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512005
46471	NC_013205	ATCCG	2	10	2085451	2085460	20 %	20 %	20 %	40 %	258512005
46472	NC_013205	GCT	2	6	2085485	2085490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512005
46473	NC_013205	GCTC	2	8	2085533	2085540	0 %	25 %	25 %	50 %	258512005
46474	NC_013205	ACG	2	6	2085550	2085555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512005
46475	NC_013205	GCC	2	6	2085641	2085646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512005
46476	NC_013205	GT	3	6	2085673	2085678	0 %	50 %	50 %	0 %	258512005
46477	NC_013205	TC	3	6	2085723	2085728	0 %	50 %	0 %	50 %	258512005
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46479	NC_013205	C	6	6	2085843	2085848	0 %	0 %	0 %	100 %	258512005
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46481	NC_013205	CG	3	6	2085954	2085959	0 %	0 %	50 %	50 %	258512005
46482	NC_013205	GTC	2	6	2085996	2086001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512005
46483	NC_013205	TCG	2	6	2086009	2086014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512005
46484	NC_013205	TTCGC	2	10	2086030	2086039	0 %	40 %	20 %	40 %	258512005
46485	NC_013205	TTC	2	6	2086090	2086095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512005
46486	NC_013205	TCC	2	6	2086126	2086131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512005
46487	NC_013205	ATC	2	6	2086153	2086158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512005
46488	NC_013205	CCGA	2	8	2086192	2086199	25 %	0 %	25 %	50 %	258512005
46489	NC_013205	GTA	2	6	2086374	2086379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512005
46490	NC_013205	ACG	2	6	2086432	2086437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512005
46491	NC_013205	TTCC	2	8	2086445	2086452	0 %	50 %	0 %	50 %	258512005
46492	NC_013205	TCCG	2	8	2086469	2086476	0 %	25 %	25 %	50 %	258512005
46493	NC_013205	CGT	2	6	2086518	2086523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512005
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46495	NC_013205	GCC	2	6	2086676	2086681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512005
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46497	NC_013205	CTCC	2	8	2086697	2086704	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46498	NC_013205	CCG	2	6	2086714	2086719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46499	NC_013205	TCG	2	6	2086769	2086774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46500	NC_013205	CG	3	6	2086872	2086877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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