MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_013205	GACAG	2	10	2043038	2043047	40 %	0 %	40 %	20 %	258511962
45502	NC_013205	CTG	2	6	2043076	2043081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511962
45503	NC_013205	TTG	2	6	2043098	2043103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258511962
45504	NC_013205	GGT	2	6	2043111	2043116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511962
45505	NC_013205	GC	3	6	2043121	2043126	0 %	0 %	50 %	50 %	258511962
45506	NC_013205	T	6	6	2043142	2043147	0 %	100 %	0 %	0 %	258511962
45507	NC_013205	TTC	2	6	2043151	2043156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511962
45508	NC_013205	GTA	2	6	2043190	2043195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511962
45509	NC_013205	ACC	2	6	2043228	2043233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45510	NC_013205	AGGGC	2	10	2043258	2043267	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45511	NC_013205	ATCC	2	8	2043293	2043300	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45512	NC_013205	CTT	2	6	2043328	2043333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511963
45513	NC_013205	CCA	2	6	2043363	2043368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511963
45514	NC_013205	CGC	2	6	2043406	2043411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
45515	NC_013205	TGC	2	6	2043419	2043424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511963
45516	NC_013205	GCC	2	6	2043443	2043448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
45517	NC_013205	TCG	2	6	2043462	2043467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511963
45518	NC_013205	TCGCG	2	10	2043537	2043546	0 %	20 %	40 %	40 %	258511963
45519	NC_013205	AGC	2	6	2043614	2043619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511963
45520	NC_013205	CGC	2	6	2043674	2043679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
45521	NC_013205	TCC	2	6	2043686	2043691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511963
45522	NC_013205	CCT	2	6	2043708	2043713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511963
45523	NC_013205	TCA	2	6	2043714	2043719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511963
45524	NC_013205	GGTGAT	2	12	2043757	2043768	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258511963
45525	NC_013205	CGC	2	6	2043858	2043863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
45526	NC_013205	GCG	2	6	2043864	2043869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511963
45527	NC_013205	TGT	2	6	2043909	2043914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258511963
45528	NC_013205	GCA	2	6	2043939	2043944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511963
45529	NC_013205	CGAC	2	8	2043954	2043961	25 %	0 %	25 %	50 %	258511963
45530	NC_013205	GCC	2	6	2043974	2043979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
45531	NC_013205	GAT	2	6	2044027	2044032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511963
45532	NC_013205	CGC	2	6	2044044	2044049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
45533	NC_013205	GCG	2	6	2044074	2044079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511963
45534	NC_013205	AGC	2	6	2044088	2044093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511963
45535	NC_013205	CGCC	2	8	2044122	2044129	0 %	0 %	25 %	75 %	258511963
45536	NC_013205	CGA	2	6	2044149	2044154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511963
45537	NC_013205	CCT	2	6	2044209	2044214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511963
45538	NC_013205	CCG	2	6	2044238	2044243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
45539	NC_013205	CGGC	2	8	2044266	2044273	0 %	0 %	50 %	50 %	258511963
45540	NC_013205	TCG	2	6	2044314	2044319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511963
45541	NC_013205	CGA	2	6	2044323	2044328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511963
45542	NC_013205	CTC	2	6	2044342	2044347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511963
45543	NC_013205	CCG	2	6	2044398	2044403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
45544	NC_013205	TGG	2	6	2044422	2044427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511963
45545	NC_013205	CGA	2	6	2044438	2044443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511963
45546	NC_013205	CTT	2	6	2044450	2044455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511963
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45549	NC_013205	ATG	2	6	2044553	2044558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511963
45550	NC_013205	GTC	2	6	2044570	2044575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511963
45551	NC_013205	GCC	2	6	2044576	2044581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
45552	NC_013205	GGT	2	6	2044584	2044589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511963
45553	NC_013205	TCG	2	6	2044599	2044604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511963
45554	NC_013205	GCC	3	9	2044657	2044665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
45555	NC_013205	TGGTC	2	10	2044683	2044692	0 %	40 %	40 %	20 %	258511963
45556	NC_013205	TCC	2	6	2044694	2044699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511963
45557	NC_013205	TGA	2	6	2044740	2044745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511963
45558	NC_013205	CG	3	6	2044782	2044787	0 %	0 %	50 %	50 %	258511963
45559	NC_013205	GCTG	2	8	2044797	2044804	0 %	25 %	50 %	25 %	258511963
45560	NC_013205	TGA	2	6	2044827	2044832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511963
45561	NC_013205	ATC	2	6	2044892	2044897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511963
45562	NC_013205	GCG	2	6	2044911	2044916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511963
45563	NC_013205	GAT	2	6	2044975	2044980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511963
45564	NC_013205	ACG	2	6	2045057	2045062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511963
45565	NC_013205	CGT	2	6	2045068	2045073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511963
45566	NC_013205	GAC	2	6	2045098	2045103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511963
45567	NC_013205	CGC	2	6	2045109	2045114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
45568	NC_013205	TGG	2	6	2045139	2045144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511963
45569	NC_013205	TCCC	2	8	2045182	2045189	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45570	NC_013205	TGG	2	6	2045222	2045227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45571	NC_013205	GCA	2	6	2045283	2045288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511964
45572	NC_013205	GCA	2	6	2045301	2045306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511964
45573	NC_013205	CG	3	6	2045503	2045508	0 %	0 %	50 %	50 %	258511964
45574	NC_013205	GCA	2	6	2045529	2045534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511964
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45577	NC_013205	TGC	2	6	2045636	2045641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511964
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45582	NC_013205	TCC	3	9	2045732	2045740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511964
45583	NC_013205	TCC	2	6	2045762	2045767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511964
45584	NC_013205	TCCGCC	2	12	2045792	2045803	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	258511964
45585	NC_013205	CGC	3	9	2045809	2045817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511964
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45587	NC_013205	TCC	2	6	2045846	2045851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511964
45588	NC_013205	GA	3	6	2045936	2045941	50 %	0 %	50 %	0 %	258511965
45589	NC_013205	GTG	2	6	2046023	2046028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511965
45590	NC_013205	CCA	2	6	2046054	2046059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511965
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45596	NC_013205	GCCA	2	8	2046307	2046314	25 %	0 %	25 %	50 %	258511965
45597	NC_013205	ACC	2	6	2046359	2046364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511965
45598	NC_013205	CGT	2	6	2046396	2046401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511965
45599	NC_013205	GATGGC	2	12	2046466	2046477	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258511965
45600	NC_013205	GCC	3	9	2046481	2046489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511965
45601	NC_013205	TCG	2	6	2046611	2046616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511965
45602	NC_013205	TCC	2	6	2046764	2046769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511965
45603	NC_013205	TGG	2	6	2046792	2046797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511965
45604	NC_013205	GAT	2	6	2046874	2046879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511965
45605	NC_013205	CCT	2	6	2046923	2046928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45606	NC_013205	GCC	2	6	2047009	2047014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511966
45607	NC_013205	CGC	2	6	2047084	2047089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511966
45608	NC_013205	CG	3	6	2047224	2047229	0 %	0 %	50 %	50 %	258511966
45609	NC_013205	CG	3	6	2047252	2047257	0 %	0 %	50 %	50 %	258511966
45610	NC_013205	CGG	2	6	2047283	2047288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511966
45611	NC_013205	CGC	2	6	2047328	2047333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511966
45612	NC_013205	GC	3	6	2047346	2047351	0 %	0 %	50 %	50 %	258511966
45613	NC_013205	CGC	2	6	2047409	2047414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511966
45614	NC_013205	CGT	2	6	2047634	2047639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511966
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45616	NC_013205	TCGCG	2	10	2047727	2047736	0 %	20 %	40 %	40 %	258511966
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45618	NC_013205	GCA	2	6	2047760	2047765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511966
45619	NC_013205	GC	3	6	2047784	2047789	0 %	0 %	50 %	50 %	258511966
45620	NC_013205	GATTC	2	10	2047856	2047865	20 %	40 %	20 %	20 %	258511966
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45731	NC_013205	TTTTTG	2	12	2053573	2053584	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	258511973
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45734	NC_013205	GGC	2	6	2053756	2053761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511973
45735	NC_013205	TCCG	2	8	2053804	2053811	0 %	25 %	25 %	50 %	258511973
45736	NC_013205	GCG	2	6	2053908	2053913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511974
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45740	NC_013205	CGT	2	6	2054187	2054192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511974
45741	NC_013205	GC	3	6	2054200	2054205	0 %	0 %	50 %	50 %	258511974
45742	NC_013205	CG	3	6	2054316	2054321	0 %	0 %	50 %	50 %	258511974
45743	NC_013205	TGCG	2	8	2054387	2054394	0 %	25 %	50 %	25 %	258511974
45744	NC_013205	GAC	2	6	2054428	2054433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511974
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45801	NC_013205	CA	3	6	2056941	2056946	50 %	0 %	0 %	50 %	258511976
45802	NC_013205	TGC	2	6	2057028	2057033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511976
45803	NC_013205	GGC	2	6	2057042	2057047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511976
45804	NC_013205	CGA	2	6	2057083	2057088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511976
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45811	NC_013205	CGACG	2	10	2057342	2057351	20 %	0 %	40 %	40 %	258511976
45812	NC_013205	CGA	2	6	2057404	2057409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511976
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45817	NC_013205	CG	3	6	2057565	2057570	0 %	0 %	50 %	50 %	258511976
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45822	NC_013205	CG	3	6	2057696	2057701	0 %	0 %	50 %	50 %	258511976
45823	NC_013205	CGA	2	6	2057743	2057748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511976
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45833	NC_013205	CG	3	6	2058272	2058277	0 %	0 %	50 %	50 %	258511977
45834	NC_013205	CCT	2	6	2058279	2058284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511977
45835	NC_013205	CGT	3	9	2058337	2058345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511977
45836	NC_013205	CGTC	2	8	2058360	2058367	0 %	25 %	25 %	50 %	258511977
45837	NC_013205	GCT	2	6	2058424	2058429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511977
45838	NC_013205	CCAAC	2	10	2058471	2058480	40 %	0 %	0 %	60 %	258511977
45839	NC_013205	GC	3	6	2058502	2058507	0 %	0 %	50 %	50 %	258511977
45840	NC_013205	GAA	2	6	2058526	2058531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511977
45841	NC_013205	CG	3	6	2058535	2058540	0 %	0 %	50 %	50 %	258511977
45842	NC_013205	CGT	2	6	2058630	2058635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511977
45843	NC_013205	CGC	2	6	2058656	2058661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511977
45844	NC_013205	CACG	2	8	2058702	2058709	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45845	NC_013205	TCCC	2	8	2058727	2058734	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45846	NC_013205	GCT	2	6	2058761	2058766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45847	NC_013205	GA	3	6	2058815	2058820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45848	NC_013205	GGA	2	6	2058946	2058951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511978
45849	NC_013205	GC	3	6	2058995	2059000	0 %	0 %	50 %	50 %	258511978
45850	NC_013205	TGC	2	6	2059053	2059058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511978
45851	NC_013205	CGA	2	6	2059066	2059071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511978
45852	NC_013205	TGA	2	6	2059143	2059148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511978
45853	NC_013205	AGG	2	6	2059197	2059202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511978
45854	NC_013205	CGAG	2	8	2059338	2059345	25 %	0 %	50 %	25 %	258511978
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45882	NC_013205	CCTC	2	8	2060469	2060476	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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45891	NC_013205	CGTA	2	8	2060870	2060877	25 %	25 %	25 %	25 %	258511981
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45921	NC_013205	GAA	2	6	2061897	2061902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511983
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45925	NC_013205	TGCAC	2	10	2062014	2062023	20 %	20 %	20 %	40 %	258511983
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45949	NC_013205	CAC	2	6	2063046	2063051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511984
45950	NC_013205	CGC	2	6	2063066	2063071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511984
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45952	NC_013205	CGT	2	6	2063172	2063177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511984
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45955	NC_013205	CGC	2	6	2063330	2063335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511984
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45958	NC_013205	CGC	2	6	2063396	2063401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511984
45959	NC_013205	TCGG	2	8	2063434	2063441	0 %	25 %	50 %	25 %	258511984
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45961	NC_013205	TTG	2	6	2063455	2063460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258511984
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45963	NC_013205	CGACG	2	10	2063481	2063490	20 %	0 %	40 %	40 %	258511984
45964	NC_013205	CGC	2	6	2063494	2063499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511984
45965	NC_013205	GC	3	6	2063498	2063503	0 %	0 %	50 %	50 %	258511984
45966	NC_013205	CGTC	2	8	2063714	2063721	0 %	25 %	25 %	50 %	258511984
45967	NC_013205	CA	4	8	2063745	2063752	50 %	0 %	0 %	50 %	258511984
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