MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_013205	GAT	2	6	1961469	1961474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511881
43502	NC_013205	ACGT	2	8	1961560	1961567	25 %	25 %	25 %	25 %	258511881
43503	NC_013205	GCGA	2	8	1961596	1961603	25 %	0 %	50 %	25 %	258511881
43504	NC_013205	AGCGG	2	10	1961638	1961647	20 %	0 %	60 %	20 %	258511881
43505	NC_013205	ATGGCG	2	12	1961662	1961673	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258511881
43506	NC_013205	GCC	2	6	1961708	1961713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511881
43507	NC_013205	GCC	2	6	1961761	1961766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511881
43508	NC_013205	CTG	2	6	1961787	1961792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511881
43509	NC_013205	CGT	2	6	1961805	1961810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511881
43510	NC_013205	GAA	2	6	1961813	1961818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511881
43511	NC_013205	ATG	2	6	1961830	1961835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511881
43512	NC_013205	CCGC	2	8	1961851	1961858	0 %	0 %	25 %	75 %	258511881
43513	NC_013205	CAG	2	6	1961892	1961897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511881
43514	NC_013205	GGC	3	9	1961964	1961972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511881
43515	NC_013205	GCG	3	9	1961978	1961986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511881
43516	NC_013205	GCG	2	6	1962023	1962028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511881
43517	NC_013205	GCC	2	6	1962087	1962092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511881
43518	NC_013205	CGA	2	6	1962164	1962169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511881
43519	NC_013205	CGA	2	6	1962173	1962178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511881
43520	NC_013205	GCCA	2	8	1962202	1962209	25 %	0 %	25 %	50 %	258511881
43521	NC_013205	GC	3	6	1962227	1962232	0 %	0 %	50 %	50 %	258511881
43522	NC_013205	CCG	2	6	1962243	1962248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511881
43523	NC_013205	ACC	2	6	1962267	1962272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511882
43524	NC_013205	CGC	2	6	1962282	1962287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511882
43525	NC_013205	ACCA	2	8	1962294	1962301	50 %	0 %	0 %	50 %	258511882
43526	NC_013205	TGG	2	6	1962316	1962321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511882
43527	NC_013205	GAA	2	6	1962337	1962342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511882
43528	NC_013205	CGTC	2	8	1962385	1962392	0 %	25 %	25 %	50 %	258511882
43529	NC_013205	TCG	2	6	1962469	1962474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511882
43530	NC_013205	CG	3	6	1962515	1962520	0 %	0 %	50 %	50 %	258511882
43531	NC_013205	CAC	2	6	1962584	1962589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511882
43532	NC_013205	ACG	2	6	1962595	1962600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511882
43533	NC_013205	GCCC	2	8	1962616	1962623	0 %	0 %	25 %	75 %	258511882
43534	NC_013205	CG	4	8	1962625	1962632	0 %	0 %	50 %	50 %	258511882
43535	NC_013205	CG	3	6	1962658	1962663	0 %	0 %	50 %	50 %	258511882
43536	NC_013205	TCG	2	6	1962664	1962669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511882
43537	NC_013205	TGA	2	6	1962673	1962678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511882
43538	NC_013205	ATC	2	6	1962687	1962692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511882
43539	NC_013205	CAG	2	6	1962716	1962721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511882
43540	NC_013205	CCCGTC	2	12	1962729	1962740	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	258511882
43541	NC_013205	CCG	2	6	1962744	1962749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511882
43542	NC_013205	ACG	2	6	1962843	1962848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511882
43543	NC_013205	CCA	2	6	1962871	1962876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511882
43544	NC_013205	CCGA	2	8	1962936	1962943	25 %	0 %	25 %	50 %	258511882
43545	NC_013205	ATG	2	6	1962957	1962962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511882
43546	NC_013205	GAT	2	6	1962968	1962973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511882
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43548	NC_013205	CGA	2	6	1962991	1962996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511882
43549	NC_013205	CGG	2	6	1963024	1963029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511882
43550	NC_013205	GGC	2	6	1963151	1963156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511882
43551	NC_013205	GGC	2	6	1963184	1963189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511882
43552	NC_013205	GCC	2	6	1963197	1963202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511882
43553	NC_013205	CCT	2	6	1963263	1963268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43554	NC_013205	TCT	2	6	1963294	1963299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511883
43555	NC_013205	TCG	2	6	1963330	1963335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511883
43556	NC_013205	CGC	2	6	1963433	1963438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511883
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43558	NC_013205	TCG	2	6	1963506	1963511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511883
43559	NC_013205	TCG	2	6	1963527	1963532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511883
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43564	NC_013205	GCCGTA	2	12	1963772	1963783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258511883
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43569	NC_013205	TGC	2	6	1964061	1964066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511883
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43582	NC_013205	CG	3	6	1964897	1964902	0 %	0 %	50 %	50 %	258511884
43583	NC_013205	GC	3	6	1964906	1964911	0 %	0 %	50 %	50 %	258511884
43584	NC_013205	CG	3	6	1964989	1964994	0 %	0 %	50 %	50 %	258511884
43585	NC_013205	GC	4	8	1965088	1965095	0 %	0 %	50 %	50 %	258511884
43586	NC_013205	GA	3	6	1965109	1965114	50 %	0 %	50 %	0 %	258511884
43587	NC_013205	CGCC	2	8	1965135	1965142	0 %	0 %	25 %	75 %	258511884
43588	NC_013205	CAC	2	6	1965155	1965160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511884
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43592	NC_013205	CGGC	2	8	1965293	1965300	0 %	0 %	50 %	50 %	258511884
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43596	NC_013205	CTC	2	6	1965505	1965510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511885
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43599	NC_013205	ACGT	2	8	1965602	1965609	25 %	25 %	25 %	25 %	258511885
43600	NC_013205	CG	3	6	1965619	1965624	0 %	0 %	50 %	50 %	258511885
43601	NC_013205	GCG	2	6	1965651	1965656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511885
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43603	NC_013205	CAC	2	6	1965736	1965741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511885
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43605	NC_013205	GAG	2	6	1965817	1965822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511885
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43607	NC_013205	CGAGCA	2	12	1965966	1965977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511885
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43609	NC_013205	CG	3	6	1966058	1966063	0 %	0 %	50 %	50 %	258511885
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43612	NC_013205	GC	3	6	1966113	1966118	0 %	0 %	50 %	50 %	258511885
43613	NC_013205	CGTG	2	8	1966161	1966168	0 %	25 %	50 %	25 %	258511885
43614	NC_013205	TCG	2	6	1966202	1966207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511885
43615	NC_013205	CCGC	2	8	1966221	1966228	0 %	0 %	25 %	75 %	258511885
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43970	NC_013205	AGA	2	6	1981067	1981072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511897
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