MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40503	NC_013205	GGC	2	6	1824355	1824360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511734
40504	NC_013205	CG	3	6	1824460	1824465	0 %	0 %	50 %	50 %	258511734
40505	NC_013205	ATG	2	6	1824500	1824505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511734
40506	NC_013205	CGG	2	6	1824511	1824516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511734
40507	NC_013205	GC	3	6	1824546	1824551	0 %	0 %	50 %	50 %	258511734
40508	NC_013205	ATG	3	9	1824572	1824580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511734
40509	NC_013205	ATC	2	6	1824715	1824720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511734
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40511	NC_013205	TAA	2	6	1824823	1824828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40546	NC_013205	GC	4	8	1826283	1826290	0 %	0 %	50 %	50 %	258511736
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40618	NC_013205	TGC	2	6	1829324	1829329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511739
40619	NC_013205	CGA	2	6	1829354	1829359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511739
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40622	NC_013205	GCA	2	6	1829478	1829483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511739
40623	NC_013205	GCC	2	6	1829556	1829561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511739
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40625	NC_013205	GAT	2	6	1829610	1829615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511739
40626	NC_013205	CGC	2	6	1829718	1829723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511739
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40633	NC_013205	GC	3	6	1830064	1830069	0 %	0 %	50 %	50 %	258511739
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40653	NC_013205	TGTA	2	8	1830787	1830794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40654	NC_013205	CGG	2	6	1830882	1830887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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40721	NC_013205	CGGTGA	2	12	1833949	1833960	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258511743
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40731	NC_013205	GACG	2	8	1834273	1834280	25 %	0 %	50 %	25 %	258511744
40732	NC_013205	CCA	2	6	1834347	1834352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511744
40733	NC_013205	CACG	2	8	1834369	1834376	25 %	0 %	25 %	50 %	258511744
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40853	NC_013205	TCA	2	6	1840339	1840344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511752
40854	NC_013205	ATG	2	6	1840359	1840364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511752
40855	NC_013205	CGA	2	6	1840402	1840407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511752
40856	NC_013205	CCGGCG	2	12	1840420	1840431	0 %	0 %	50 %	50 %	258511752
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40860	NC_013205	GGCGCG	2	12	1840530	1840541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511752
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40867	NC_013205	A	6	6	1840871	1840876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40969	NC_013205	GC	3	6	1845368	1845373	0 %	0 %	50 %	50 %	258511760
40970	NC_013205	CGT	2	6	1845389	1845394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511760
40971	NC_013205	GCG	3	9	1845406	1845414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511760
40972	NC_013205	CGA	2	6	1845425	1845430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511760
40973	NC_013205	CGC	3	9	1845476	1845484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511760
40974	NC_013205	GAT	2	6	1845490	1845495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511760
40975	NC_013205	CG	3	6	1845496	1845501	0 %	0 %	50 %	50 %	258511760
40976	NC_013205	GC	3	6	1845537	1845542	0 %	0 %	50 %	50 %	258511760
40977	NC_013205	CCA	2	6	1845556	1845561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511760
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40979	NC_013205	TCG	2	6	1845681	1845686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511760
40980	NC_013205	GC	3	6	1845786	1845791	0 %	0 %	50 %	50 %	258511760
40981	NC_013205	TCG	2	6	1845822	1845827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511760
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40984	NC_013205	GAG	2	6	1846019	1846024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40985	NC_013205	GAG	2	6	1846031	1846036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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40988	NC_013205	AAG	2	6	1846132	1846137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511761
40989	NC_013205	CG	4	8	1846209	1846216	0 %	0 %	50 %	50 %	258511762
40990	NC_013205	TGC	2	6	1846316	1846321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511762
40991	NC_013205	GAT	2	6	1846401	1846406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511762
40992	NC_013205	AGTTC	2	10	1846454	1846463	20 %	40 %	20 %	20 %	258511762
40993	NC_013205	GC	3	6	1846477	1846482	0 %	0 %	50 %	50 %	258511762
40994	NC_013205	CGT	2	6	1846535	1846540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511762
40995	NC_013205	CG	3	6	1846596	1846601	0 %	0 %	50 %	50 %	258511762
40996	NC_013205	CGT	2	6	1846605	1846610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511762
40997	NC_013205	TTC	2	6	1846636	1846641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511762
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40999	NC_013205	AG	3	6	1846807	1846812	50 %	0 %	50 %	0 %	258511763
41000	NC_013205	GAC	2	6	1846865	1846870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511763

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