MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

< Previous12345678910111213...135136Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_013205	CAC	2	6	84094	84099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510084
2003	NC_013205	CGGC	2	8	84108	84115	0 %	0 %	50 %	50 %	258510084
2004	NC_013205	CG	3	6	84118	84123	0 %	0 %	50 %	50 %	258510084
2005	NC_013205	GCC	2	6	84140	84145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510084
2006	NC_013205	CGC	2	6	84214	84219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510084
2007	NC_013205	TCCT	2	8	84266	84273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2008	NC_013205	CGC	2	6	84287	84292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2009	NC_013205	GATG	2	8	84359	84366	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_013205	CTC	2	6	84400	84405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510085
2011	NC_013205	CAA	2	6	84453	84458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510085
2012	NC_013205	GAA	3	9	84477	84485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510085
2013	NC_013205	TCA	2	6	84644	84649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510085
2014	NC_013205	CGT	2	6	84692	84697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510085
2015	NC_013205	CGA	2	6	84701	84706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510085
2016	NC_013205	CTA	2	6	84741	84746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510085
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2039	NC_013205	CG	3	6	85592	85597	0 %	0 %	50 %	50 %	258510086
2040	NC_013205	ACT	2	6	85679	85684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510086
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2046	NC_013205	CGA	2	6	85899	85904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510086
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2055	NC_013205	TCA	2	6	86249	86254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510086
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2062	NC_013205	GC	3	6	86605	86610	0 %	0 %	50 %	50 %	258510086
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2115	NC_013205	CGAG	2	8	89033	89040	25 %	0 %	50 %	25 %	258510088
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2121	NC_013205	GC	3	6	89176	89181	0 %	0 %	50 %	50 %	258510088
2122	NC_013205	CTCG	2	8	89196	89203	0 %	25 %	25 %	50 %	258510088
2123	NC_013205	CG	3	6	89219	89224	0 %	0 %	50 %	50 %	258510088
2124	NC_013205	TCCA	2	8	89343	89350	25 %	25 %	0 %	50 %	258510089
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2126	NC_013205	CGA	2	6	89417	89422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510089
2127	NC_013205	GCG	2	6	89434	89439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510089
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2143	NC_013205	CG	3	6	89914	89919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2144	NC_013205	GGCG	2	8	89958	89965	0 %	0 %	75 %	25 %	258510090
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2153	NC_013205	GT	3	6	90331	90336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2491	NC_013205	ACGTCG	2	12	103924	103935	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258510101
2492	NC_013205	CTT	2	6	103965	103970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510101
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2498	NC_013205	GC	3	6	104145	104150	0 %	0 %	50 %	50 %	258510101
2499	NC_013205	CG	3	6	104241	104246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2500	NC_013205	AGG	2	6	104289	104294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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