MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013205	GGC	2	6	22100	22105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510036
502	NC_013205	TCG	2	6	22111	22116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510036
503	NC_013205	GAT	2	6	22118	22123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510036
504	NC_013205	GGCG	2	8	22127	22134	0 %	0 %	75 %	25 %	258510036
505	NC_013205	CGA	2	6	22151	22156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510036
506	NC_013205	CGA	2	6	22168	22173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510036
507	NC_013205	CCT	2	6	22175	22180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510036
508	NC_013205	GC	3	6	22191	22196	0 %	0 %	50 %	50 %	258510036
509	NC_013205	TGG	2	6	22207	22212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510036
510	NC_013205	CGA	2	6	22265	22270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510036
511	NC_013205	TCG	3	9	22291	22299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510036
512	NC_013205	TCA	2	6	22336	22341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510036
513	NC_013205	GCC	2	6	22395	22400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510036
514	NC_013205	CCGC	2	8	22408	22415	0 %	0 %	25 %	75 %	258510036
515	NC_013205	CAGC	2	8	22481	22488	25 %	0 %	25 %	50 %	258510036
516	NC_013205	GGC	2	6	22508	22513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510036
517	NC_013205	GC	3	6	22512	22517	0 %	0 %	50 %	50 %	258510036
518	NC_013205	TCG	2	6	22576	22581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510036
519	NC_013205	CG	3	6	22594	22599	0 %	0 %	50 %	50 %	258510036
520	NC_013205	GCG	2	6	22605	22610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510036
521	NC_013205	GCTG	2	8	22636	22643	0 %	25 %	50 %	25 %	258510036
522	NC_013205	GA	3	6	22663	22668	50 %	0 %	50 %	0 %	258510036
523	NC_013205	TC	4	8	22717	22724	0 %	50 %	0 %	50 %	258510036
524	NC_013205	CGCC	2	8	22748	22755	0 %	0 %	25 %	75 %	258510036
525	NC_013205	AGC	2	6	22810	22815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510036
526	NC_013205	ATG	2	6	22823	22828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510036
527	NC_013205	CG	3	6	22846	22851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
528	NC_013205	GCG	2	6	22854	22859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_013205	TGAGG	2	10	22863	22872	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013205	CGC	2	6	22887	22892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_013205	GCG	2	6	22970	22975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_013205	ATGT	2	8	22996	23003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013205	CG	3	6	23012	23017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_013205	GGT	2	6	23045	23050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013205	GCG	2	6	23150	23155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_013205	ACG	2	6	23219	23224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_013205	GCC	2	6	23293	23298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_013205	AAGAC	2	10	23323	23332	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
539	NC_013205	CTC	2	6	23356	23361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_013205	TGA	2	6	23567	23572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013205	TAT	2	6	23597	23602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510037
542	NC_013205	AACG	2	8	23629	23636	50 %	0 %	25 %	25 %	258510037
543	NC_013205	AGGA	2	8	23755	23762	50 %	0 %	50 %	0 %	258510037
544	NC_013205	CAA	2	6	23838	23843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510037
545	NC_013205	T	6	6	23859	23864	0 %	100 %	0 %	0 %	258510037
546	NC_013205	GGC	2	6	23865	23870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510037
547	NC_013205	ACTT	2	8	23879	23886	25 %	50 %	0 %	25 %	258510037
548	NC_013205	AGC	2	6	23926	23931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510037
549	NC_013205	TGA	2	6	23962	23967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510037
550	NC_013205	TGA	2	6	23996	24001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510037
551	NC_013205	TCT	2	6	24016	24021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510037
552	NC_013205	GTTA	2	8	24033	24040	25 %	50 %	25 %	0 %	258510037
553	NC_013205	TCG	2	6	24092	24097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510037
554	NC_013205	TGC	2	6	24118	24123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510037
555	NC_013205	GA	4	8	24145	24152	50 %	0 %	50 %	0 %	258510037
556	NC_013205	GCA	2	6	24170	24175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510037
557	NC_013205	TCG	2	6	24178	24183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510037
558	NC_013205	CCAT	2	8	24339	24346	25 %	25 %	0 %	50 %	258510037
559	NC_013205	GAC	2	6	24348	24353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510037
560	NC_013205	AGGTG	2	10	24395	24404	20 %	20 %	60 %	0 %	258510037
561	NC_013205	CAT	2	6	24510	24515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510037
562	NC_013205	CGC	2	6	24578	24583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510037
563	NC_013205	TAA	2	6	24649	24654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013205	TC	3	6	24722	24727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_013205	CTG	2	6	24734	24739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_013205	TGCT	2	8	24756	24763	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_013205	TCCA	2	8	24780	24787	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_013205	ACG	2	6	24822	24827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_013205	TTTC	2	8	24958	24965	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
570	NC_013205	CTT	2	6	24983	24988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_013205	AGA	2	6	25085	25090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013205	CTG	2	6	25195	25200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510038
573	NC_013205	GACG	2	8	25343	25350	25 %	0 %	50 %	25 %	258510038
574	NC_013205	CCG	2	6	25356	25361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510038
575	NC_013205	AGATG	2	10	25379	25388	40 %	20 %	40 %	0 %	258510038
576	NC_013205	CGA	2	6	25397	25402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510038
577	NC_013205	TGA	2	6	25502	25507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510038
578	NC_013205	GGC	2	6	25530	25535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510038
579	NC_013205	GAA	2	6	25563	25568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510038
580	NC_013205	C	6	6	25601	25606	0 %	0 %	0 %	100 %	258510038
581	NC_013205	CGC	2	6	25624	25629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510038
582	NC_013205	GGT	2	6	25732	25737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510038
583	NC_013205	CGT	2	6	25747	25752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510038
584	NC_013205	TGC	2	6	25757	25762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510038
585	NC_013205	CG	3	6	25812	25817	0 %	0 %	50 %	50 %	258510038
586	NC_013205	CGA	2	6	25828	25833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510038
587	NC_013205	TGT	2	6	25840	25845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510038
588	NC_013205	CA	3	6	25929	25934	50 %	0 %	0 %	50 %	258510038
589	NC_013205	AGC	2	6	25950	25955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510038
590	NC_013205	GT	3	6	26023	26028	0 %	50 %	50 %	0 %	258510038
591	NC_013205	CGA	2	6	26179	26184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510038
592	NC_013205	TCC	2	6	26201	26206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510038
593	NC_013205	T	6	6	26235	26240	0 %	100 %	0 %	0 %	258510038
594	NC_013205	ATC	2	6	26306	26311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_013205	TGGA	2	8	26484	26491	25 %	25 %	50 %	0 %	258510039
596	NC_013205	CTT	2	6	26519	26524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510039
597	NC_013205	CTT	2	6	26609	26614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510039
598	NC_013205	TCA	2	6	26632	26637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510039
599	NC_013205	ACG	2	6	26683	26688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510039
600	NC_013205	CTC	2	6	26749	26754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_013205	GAG	2	6	26842	26847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013205	CGC	2	6	26864	26869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_013205	TTG	2	6	26998	27003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013205	CGA	2	6	27036	27041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_013205	TCG	2	6	27404	27409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_013205	AAGCGA	2	12	27431	27442	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
607	NC_013205	GAG	2	6	27478	27483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013205	A	6	6	27495	27500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013205	AGT	2	6	27529	27534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013205	AGA	2	6	27576	27581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013205	ACC	2	6	27648	27653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_013205	GAC	2	6	27803	27808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_013205	TGAG	2	8	27847	27854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013205	ACTC	2	8	27856	27863	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_013205	AGG	2	6	27873	27878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013205	TTC	2	6	27919	27924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510040
617	NC_013205	GTT	2	6	27934	27939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510040
618	NC_013205	GCGG	2	8	28104	28111	0 %	0 %	75 %	25 %	258510040
619	NC_013205	ACTG	2	8	28125	28132	25 %	25 %	25 %	25 %	258510040
620	NC_013205	GACG	2	8	28215	28222	25 %	0 %	50 %	25 %	258510040
621	NC_013205	ATG	2	6	28246	28251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510040
622	NC_013205	CGA	2	6	28280	28285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510040
623	NC_013205	CGG	2	6	28391	28396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510040
624	NC_013205	AG	4	8	28400	28407	50 %	0 %	50 %	0 %	258510040
625	NC_013205	TCT	2	6	28409	28414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510040
626	NC_013205	GTA	2	6	28477	28482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510040
627	NC_013205	CCG	2	6	28493	28498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510040
628	NC_013205	CTTCC	2	10	28510	28519	0 %	40 %	0 %	60 %	258510040
629	NC_013205	GGT	2	6	28524	28529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510040
630	NC_013205	GCT	2	6	28564	28569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510040
631	NC_013205	CGT	2	6	28674	28679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510040
632	NC_013205	CGT	2	6	28710	28715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510040
633	NC_013205	CG	3	6	28726	28731	0 %	0 %	50 %	50 %	258510040
634	NC_013205	TGG	2	6	28772	28777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510040
635	NC_013205	TGT	2	6	28826	28831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510040
636	NC_013205	CGT	2	6	28899	28904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510040
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644	NC_013205	TGTGC	2	10	29261	29270	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
645	NC_013205	GC	3	6	29339	29344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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647	NC_013205	TGGA	2	8	29455	29462	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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659	NC_013205	CTTC	2	8	30339	30346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
660	NC_013205	GA	3	6	30365	30370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
661	NC_013205	TCA	2	6	30436	30441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
662	NC_013205	CT	3	6	30518	30523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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669	NC_013205	GTAA	2	8	30716	30723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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672	NC_013205	CG	3	6	30900	30905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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739	NC_013205	ATC	2	6	33852	33857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
740	NC_013205	AGA	2	6	33922	33927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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742	NC_013205	CGG	2	6	33941	33946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
743	NC_013205	TTGCG	2	10	33966	33975	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
744	NC_013205	GAGC	2	8	33982	33989	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
745	NC_013205	CGT	2	6	34054	34059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510045
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751	NC_013205	CGG	2	6	34184	34189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
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754	NC_013205	CGG	2	6	34225	34230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
755	NC_013205	CTTCGC	2	12	34231	34242	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	258510045
756	NC_013205	GCGTC	2	10	34339	34348	0 %	20 %	40 %	40 %	258510045
757	NC_013205	GGC	2	6	34349	34354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
758	NC_013205	CGCGG	2	10	34375	34384	0 %	0 %	60 %	40 %	258510045
759	NC_013205	GC	3	6	34436	34441	0 %	0 %	50 %	50 %	258510045
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