MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_013205	CGC	2	6	367234	367239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510331
8502	NC_013205	TCC	2	6	367289	367294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8503	NC_013205	GTG	2	6	367297	367302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_013205	GGCGCG	2	12	367312	367323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_013205	CTC	2	6	367351	367356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8506	NC_013205	CT	3	6	367411	367416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8507	NC_013205	GCGA	2	8	367438	367445	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8508	NC_013205	GCG	2	6	367472	367477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_013205	CCGC	2	8	367521	367528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8510	NC_013205	CGC	2	6	367604	367609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510332
8511	NC_013205	CG	3	6	367639	367644	0 %	0 %	50 %	50 %	258510332
8512	NC_013205	TCCA	2	8	367653	367660	25 %	25 %	0 %	50 %	258510332
8513	NC_013205	GCC	2	6	367668	367673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510332
8514	NC_013205	TCGG	2	8	367683	367690	0 %	25 %	50 %	25 %	258510332
8515	NC_013205	TCG	2	6	367696	367701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510332
8516	NC_013205	GTG	2	6	367730	367735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510332
8517	NC_013205	GTG	2	6	367830	367835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510332
8518	NC_013205	CGT	2	6	367846	367851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510332
8519	NC_013205	GGC	2	6	367859	367864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510332
8520	NC_013205	GCCC	2	8	367907	367914	0 %	0 %	25 %	75 %	258510332
8521	NC_013205	CGA	2	6	367919	367924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510332
8522	NC_013205	GATC	2	8	368060	368067	25 %	25 %	25 %	25 %	258510332
8523	NC_013205	GCC	2	6	368087	368092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510332
8524	NC_013205	TCG	2	6	368106	368111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510332
8525	NC_013205	CCT	2	6	368173	368178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510332
8526	NC_013205	GAT	2	6	368252	368257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510332
8527	NC_013205	GCG	2	6	368317	368322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510332
8528	NC_013205	CCA	2	6	368332	368337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510332
8529	NC_013205	GCCT	2	8	368341	368348	0 %	25 %	25 %	50 %	258510332
8530	NC_013205	CGT	2	6	368392	368397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510332
8531	NC_013205	CGC	2	6	368509	368514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510332
8532	NC_013205	GCG	2	6	368551	368556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510332
8533	NC_013205	CGC	2	6	368572	368577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510332
8534	NC_013205	GCA	2	6	368672	368677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510332
8535	NC_013205	ACC	2	6	368682	368687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510332
8536	NC_013205	CGG	2	6	368734	368739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510332
8537	NC_013205	GC	4	8	368747	368754	0 %	0 %	50 %	50 %	258510332
8538	NC_013205	GTG	2	6	368772	368777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510332
8539	NC_013205	GGTG	2	8	368845	368852	0 %	25 %	75 %	0 %	258510332
8540	NC_013205	TC	3	6	368899	368904	0 %	50 %	0 %	50 %	258510332
8541	NC_013205	CGT	2	6	368908	368913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510332
8542	NC_013205	CACG	2	8	368918	368925	25 %	0 %	25 %	50 %	258510332
8543	NC_013205	ACC	2	6	368962	368967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510332
8544	NC_013205	GCG	2	6	368968	368973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510332
8545	NC_013205	AGG	2	6	369015	369020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_013205	TCA	2	6	369060	369065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510333
8547	NC_013205	CGA	2	6	369142	369147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510333
8548	NC_013205	TGC	2	6	369159	369164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510333
8549	NC_013205	CG	4	8	369288	369295	0 %	0 %	50 %	50 %	258510333
8550	NC_013205	CG	3	6	369355	369360	0 %	0 %	50 %	50 %	258510333
8551	NC_013205	GCC	2	6	369372	369377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510333
8552	NC_013205	GGA	2	6	369388	369393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510333
8553	NC_013205	CGG	2	6	369463	369468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510333
8554	NC_013205	TAC	2	6	369473	369478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510333
8555	NC_013205	CCG	2	6	369489	369494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510333
8556	NC_013205	GCC	2	6	369571	369576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510333
8557	NC_013205	ACT	2	6	369621	369626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510333
8558	NC_013205	GC	3	6	369697	369702	0 %	0 %	50 %	50 %	258510333
8559	NC_013205	ATC	2	6	369711	369716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510333
8560	NC_013205	CGCGC	2	10	369727	369736	0 %	0 %	40 %	60 %	258510333
8561	NC_013205	GGCT	2	8	369797	369804	0 %	25 %	50 %	25 %	258510333
8562	NC_013205	GAA	2	6	369829	369834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510333
8563	NC_013205	GTG	2	6	369956	369961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510333
8564	NC_013205	CGT	2	6	369991	369996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510333
8565	NC_013205	CGA	2	6	370018	370023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510333
8566	NC_013205	TCGC	2	8	370025	370032	0 %	25 %	25 %	50 %	258510333
8567	NC_013205	GGC	2	6	370079	370084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8568	NC_013205	T	6	6	370123	370128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_013205	GGT	2	6	370188	370193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_013205	CG	3	6	370248	370253	0 %	0 %	50 %	50 %	258510334
8571	NC_013205	CGC	2	6	370261	370266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510334
8572	NC_013205	CCGC	2	8	370359	370366	0 %	0 %	25 %	75 %	258510334
8573	NC_013205	CGA	2	6	370635	370640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510335
8574	NC_013205	GAG	2	6	370651	370656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510335
8575	NC_013205	GCC	2	6	370711	370716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510335
8576	NC_013205	CG	3	6	370788	370793	0 %	0 %	50 %	50 %	258510335
8577	NC_013205	CCT	2	6	370818	370823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510335
8578	NC_013205	CGA	2	6	370844	370849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510335
8579	NC_013205	CG	3	6	370922	370927	0 %	0 %	50 %	50 %	258510335
8580	NC_013205	CGA	2	6	370929	370934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510335
8581	NC_013205	CAC	2	6	370936	370941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510335
8582	NC_013205	C	6	6	370969	370974	0 %	0 %	0 %	100 %	258510335
8583	NC_013205	GGCCGA	2	12	370995	371006	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258510335
8584	NC_013205	CGT	2	6	371047	371052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510335
8585	NC_013205	CGATGG	2	12	371136	371147	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258510335
8586	NC_013205	CGC	2	6	371154	371159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510335
8587	NC_013205	GCCC	2	8	371178	371185	0 %	0 %	25 %	75 %	258510335
8588	NC_013205	ACC	2	6	371231	371236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510335
8589	NC_013205	AGCCG	2	10	371322	371331	20 %	0 %	40 %	40 %	258510335
8590	NC_013205	CGC	2	6	371385	371390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510335
8591	NC_013205	GGACG	2	10	371410	371419	20 %	0 %	60 %	20 %	258510335
8592	NC_013205	GAT	2	6	371422	371427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510335
8593	NC_013205	GC	3	6	371461	371466	0 %	0 %	50 %	50 %	258510336
8594	NC_013205	TGA	2	6	371523	371528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510336
8595	NC_013205	GCG	2	6	371532	371537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510336
8596	NC_013205	GCGAA	2	10	371540	371549	40 %	0 %	40 %	20 %	258510336
8597	NC_013205	TCGC	2	8	371596	371603	0 %	25 %	25 %	50 %	258510336
8598	NC_013205	TGA	2	6	371667	371672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510336
8599	NC_013205	GC	4	8	371718	371725	0 %	0 %	50 %	50 %	258510336
8600	NC_013205	CGA	2	6	371748	371753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510336
8601	NC_013205	CCG	2	6	371778	371783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510336
8602	NC_013205	GCC	2	6	371797	371802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510336
8603	NC_013205	CGC	2	6	371854	371859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510336
8604	NC_013205	CGG	2	6	371862	371867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510336
8605	NC_013205	AC	3	6	371877	371882	50 %	0 %	0 %	50 %	258510336
8606	NC_013205	CGC	2	6	371883	371888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510336
8607	NC_013205	ACG	2	6	371921	371926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510336
8608	NC_013205	CGC	2	6	372000	372005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510336
8609	NC_013205	CGG	2	6	372046	372051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510336
8610	NC_013205	GAT	2	6	372055	372060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510336
8611	NC_013205	CGA	2	6	372084	372089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510336
8612	NC_013205	CGC	2	6	372094	372099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510336
8613	NC_013205	ATG	2	6	372149	372154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510336
8614	NC_013205	GAT	2	6	372214	372219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510336
8615	NC_013205	GAT	2	6	372256	372261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510336
8616	NC_013205	CGT	2	6	372291	372296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510336
8617	NC_013205	GCA	2	6	372357	372362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510336
8618	NC_013205	CG	4	8	372427	372434	0 %	0 %	50 %	50 %	258510336
8619	NC_013205	GAT	2	6	372475	372480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510336
8620	NC_013205	CCCACA	2	12	372555	372566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510336
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8622	NC_013205	CAC	2	6	372586	372591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510336
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8988	NC_013205	ACG	2	6	388663	388668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510346
8989	NC_013205	CGAG	2	8	388695	388702	25 %	0 %	50 %	25 %	258510346
8990	NC_013205	GGA	2	6	388743	388748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510346
8991	NC_013205	CCGG	2	8	388762	388769	0 %	0 %	50 %	50 %	258510347
8992	NC_013205	GAG	2	6	388807	388812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510347
8993	NC_013205	AT	3	6	388905	388910	50 %	50 %	0 %	0 %	258510347
8994	NC_013205	G	6	6	388964	388969	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8995	NC_013205	TCA	2	6	389041	389046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510348
8996	NC_013205	CTC	2	6	389113	389118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510348
8997	NC_013205	GTC	2	6	389165	389170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510348
8998	NC_013205	TCA	2	6	389204	389209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510348
8999	NC_013205	GGA	2	6	389210	389215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510348
9000	NC_013205	TTC	2	6	389263	389268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510348

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