MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013205	ATC	2	6	275101	275106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510268
6502	NC_013205	TCGC	2	8	275128	275135	0 %	25 %	25 %	50 %	258510268
6503	NC_013205	GC	3	6	275143	275148	0 %	0 %	50 %	50 %	258510268
6504	NC_013205	TCA	2	6	275216	275221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510268
6505	NC_013205	TCG	2	6	275222	275227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510268
6506	NC_013205	TTC	2	6	275239	275244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510268
6507	NC_013205	GC	3	6	275346	275351	0 %	0 %	50 %	50 %	258510269
6508	NC_013205	CG	3	6	275381	275386	0 %	0 %	50 %	50 %	258510269
6509	NC_013205	TCG	3	9	275411	275419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510269
6510	NC_013205	GC	3	6	275501	275506	0 %	0 %	50 %	50 %	258510269
6511	NC_013205	CGT	2	6	275700	275705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510269
6512	NC_013205	GGT	2	6	275709	275714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510269
6513	NC_013205	G	6	6	275817	275822	0 %	0 %	100 %	0 %	258510269
6514	NC_013205	TGT	2	6	275855	275860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510269
6515	NC_013205	TGC	2	6	275978	275983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510269
6516	NC_013205	TCATCG	2	12	276008	276019	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258510269
6517	NC_013205	CTGC	2	8	276021	276028	0 %	25 %	25 %	50 %	258510269
6518	NC_013205	GC	3	6	276113	276118	0 %	0 %	50 %	50 %	258510269
6519	NC_013205	GCC	2	6	276199	276204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510269
6520	NC_013205	CACCAT	2	12	276240	276251	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258510269
6521	NC_013205	GGT	2	6	276363	276368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510269
6522	NC_013205	CCG	2	6	276399	276404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510269
6523	NC_013205	CGG	2	6	276440	276445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510269
6524	NC_013205	GGACG	2	10	276474	276483	20 %	0 %	60 %	20 %	258510269
6525	NC_013205	GGT	2	6	276564	276569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510269
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6532	NC_013205	CGA	2	6	276771	276776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510269
6533	NC_013205	TCG	2	6	276779	276784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510269
6534	NC_013205	TCG	2	6	276845	276850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510269
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6536	NC_013205	CA	3	6	276924	276929	50 %	0 %	0 %	50 %	258510269
6537	NC_013205	GGC	2	6	276930	276935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510269
6538	NC_013205	TCCGA	2	10	276967	276976	20 %	20 %	20 %	40 %	258510269
6539	NC_013205	GGT	2	6	276990	276995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510269
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6541	NC_013205	TCA	2	6	277016	277021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510269
6542	NC_013205	CG	3	6	277022	277027	0 %	0 %	50 %	50 %	258510269
6543	NC_013205	ACG	2	6	277055	277060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510269
6544	NC_013205	CAT	2	6	277077	277082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510269
6545	NC_013205	GCT	2	6	277197	277202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510269
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6553	NC_013205	TGG	2	6	277726	277731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510270
6554	NC_013205	CT	3	6	277815	277820	0 %	50 %	0 %	50 %	258510270
6555	NC_013205	TCGC	2	8	277832	277839	0 %	25 %	25 %	50 %	258510270
6556	NC_013205	CGC	2	6	277853	277858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510270
6557	NC_013205	GC	3	6	277942	277947	0 %	0 %	50 %	50 %	258510270
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6564	NC_013205	CGT	2	6	278107	278112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510271
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6580	NC_013205	GCGG	2	8	278751	278758	0 %	0 %	75 %	25 %	258510271
6581	NC_013205	CG	4	8	278834	278841	0 %	0 %	50 %	50 %	258510271
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6593	NC_013205	GGT	2	6	279136	279141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510271
6594	NC_013205	CGGCG	2	10	279181	279190	0 %	0 %	60 %	40 %	258510271
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6605	NC_013205	TGG	2	6	279654	279659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510271
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6611	NC_013205	CCGC	2	8	279847	279854	0 %	0 %	25 %	75 %	258510271
6612	NC_013205	TCG	2	6	279921	279926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510271
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6614	NC_013205	CCTGC	2	10	280022	280031	0 %	20 %	20 %	60 %	258510271
6615	NC_013205	TCGG	2	8	280037	280044	0 %	25 %	50 %	25 %	258510271
6616	NC_013205	TCG	2	6	280053	280058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510271
6617	NC_013205	GC	3	6	280122	280127	0 %	0 %	50 %	50 %	258510271
6618	NC_013205	CG	3	6	280163	280168	0 %	0 %	50 %	50 %	258510271
6619	NC_013205	TCG	2	6	280173	280178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510271
6620	NC_013205	TCG	2	6	280188	280193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510271
6621	NC_013205	ACGGGC	2	12	280250	280261	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_013205	GCG	2	6	280269	280274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_013205	GGA	2	6	280291	280296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_013205	GCCACC	2	12	280364	280375	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	258510272
6625	NC_013205	GAT	2	6	280435	280440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510272
6626	NC_013205	GCA	2	6	280461	280466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510272
6627	NC_013205	CGAG	2	8	280506	280513	25 %	0 %	50 %	25 %	258510272
6628	NC_013205	GAC	2	6	280528	280533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510272
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6633	NC_013205	TGG	2	6	280733	280738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510272
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6635	NC_013205	CGA	2	6	280891	280896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510272
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6637	NC_013205	T	6	6	280944	280949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6638	NC_013205	CG	3	6	281003	281008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6639	NC_013205	CGA	2	6	281121	281126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510273
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6643	NC_013205	CG	3	6	281287	281292	0 %	0 %	50 %	50 %	258510273
6644	NC_013205	TGCGA	2	10	281347	281356	20 %	20 %	40 %	20 %	258510273
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6663	NC_013205	ACGA	2	8	282196	282203	50 %	0 %	25 %	25 %	258510274
6664	NC_013205	GC	3	6	282258	282263	0 %	0 %	50 %	50 %	258510274
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6692	NC_013205	GAG	2	6	283417	283422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6741	NC_013205	GGCG	2	8	285695	285702	0 %	0 %	75 %	25 %	258510276
6742	NC_013205	AGC	3	9	285721	285729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510276
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6999	NC_013205	AGG	2	6	299141	299146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7000	NC_013205	AGC	2	6	299181	299186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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