MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 3554

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013203	TCAT	2	8	183	190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013203	GAAA	2	8	194	201	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013203	ACCA	2	8	286	293	50 %	0 %	0 %	50 %	257783815
4	NC_013203	TCAT	2	8	512	519	25 %	50 %	0 %	25 %	257783815
5	NC_013203	CAAT	2	8	853	860	50 %	25 %	0 %	25 %	257783815
6	NC_013203	TTTA	2	8	1764	1771	25 %	75 %	0 %	0 %	257783816
7	NC_013203	TGCG	2	8	1804	1811	0 %	25 %	50 %	25 %	257783816
8	NC_013203	AAAG	2	8	2226	2233	75 %	0 %	25 %	0 %	257783816
9	NC_013203	TTCT	2	8	3049	3056	0 %	75 %	0 %	25 %	257783817
10	NC_013203	AGAT	2	8	4138	4145	50 %	25 %	25 %	0 %	257783818
11	NC_013203	GACG	2	8	4314	4321	25 %	0 %	50 %	25 %	257783818
12	NC_013203	TTTG	2	8	4664	4671	0 %	75 %	25 %	0 %	257783818
13	NC_013203	TGAG	2	8	5026	5033	25 %	25 %	50 %	0 %	257783818
14	NC_013203	TGAT	2	8	5405	5412	25 %	50 %	25 %	0 %	257783819
15	NC_013203	GTAT	2	8	5934	5941	25 %	50 %	25 %	0 %	257783820
16	NC_013203	TGCA	2	8	6153	6160	25 %	25 %	25 %	25 %	257783820
17	NC_013203	CTAT	2	8	6588	6595	25 %	50 %	0 %	25 %	257783820
18	NC_013203	CTTT	2	8	6689	6696	0 %	75 %	0 %	25 %	257783820
19	NC_013203	TCCG	2	8	7121	7128	0 %	25 %	25 %	50 %	257783820
20	NC_013203	TGAT	2	8	7449	7456	25 %	50 %	25 %	0 %	257783820
21	NC_013203	TTCA	2	8	7757	7764	25 %	50 %	0 %	25 %	257783820
22	NC_013203	CCGA	2	8	8080	8087	25 %	0 %	25 %	50 %	257783821
23	NC_013203	CTTC	2	8	8108	8115	0 %	50 %	0 %	50 %	257783821
24	NC_013203	TGAG	2	8	8207	8214	25 %	25 %	50 %	0 %	257783821
25	NC_013203	ATGA	2	8	9277	9284	50 %	25 %	25 %	0 %	257783821
26	NC_013203	CGTC	2	8	10005	10012	0 %	25 %	25 %	50 %	257783821
27	NC_013203	TGCC	2	8	10305	10312	0 %	25 %	25 %	50 %	257783821
28	NC_013203	AAAG	2	8	10482	10489	75 %	0 %	25 %	0 %	257783821
29	NC_013203	CCAT	2	8	12208	12215	25 %	25 %	0 %	50 %	257783823
30	NC_013203	GGTA	2	8	13408	13415	25 %	25 %	50 %	0 %	257783824
31	NC_013203	GCTT	2	8	13692	13699	0 %	50 %	25 %	25 %	257783824
32	NC_013203	AATC	2	8	13830	13837	50 %	25 %	0 %	25 %	257783824
33	NC_013203	TGTT	2	8	13977	13984	0 %	75 %	25 %	0 %	257783824
34	NC_013203	GTTC	2	8	14156	14163	0 %	50 %	25 %	25 %	257783824
35	NC_013203	TGCT	2	8	14361	14368	0 %	50 %	25 %	25 %	257783824
36	NC_013203	GTTC	2	8	14663	14670	0 %	50 %	25 %	25 %	257783824
37	NC_013203	CGAG	2	8	16076	16083	25 %	0 %	50 %	25 %	257783826
38	NC_013203	AGTC	2	8	16175	16182	25 %	25 %	25 %	25 %	257783826
39	NC_013203	ATTG	2	8	16631	16638	25 %	50 %	25 %	0 %	257783826
40	NC_013203	ACGT	2	8	17197	17204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013203	ACTT	2	8	17245	17252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013203	GCTG	2	8	17578	17585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013203	TGGC	2	8	17837	17844	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013203	GGTT	2	8	19094	19101	0 %	50 %	50 %	0 %	257783827
45	NC_013203	TGAT	2	8	19249	19256	25 %	50 %	25 %	0 %	257783827
46	NC_013203	CCAA	2	8	19257	19264	50 %	0 %	0 %	50 %	257783827
47	NC_013203	AAAC	2	8	19399	19406	75 %	0 %	0 %	25 %	257783827
48	NC_013203	GGTA	2	8	19847	19854	25 %	25 %	50 %	0 %	257783827
49	NC_013203	CAGA	2	8	20482	20489	50 %	0 %	25 %	25 %	257783828
50	NC_013203	AAGA	2	8	20966	20973	75 %	0 %	25 %	0 %	257783829
51	NC_013203	CCTT	2	8	22262	22269	0 %	50 %	0 %	50 %	257783829
52	NC_013203	GTTG	2	8	22422	22429	0 %	50 %	50 %	0 %	257783829
53	NC_013203	TAAA	2	8	22770	22777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013203	TTGC	2	8	22859	22866	0 %	50 %	25 %	25 %	257783830
55	NC_013203	GCTT	2	8	25899	25906	0 %	50 %	25 %	25 %	257783832
56	NC_013203	GAAG	2	8	26368	26375	50 %	0 %	50 %	0 %	257783833
57	NC_013203	CTTT	2	8	27091	27098	0 %	75 %	0 %	25 %	257783835
58	NC_013203	TTGT	2	8	27664	27671	0 %	75 %	25 %	0 %	257783835
59	NC_013203	GGCA	2	8	27843	27850	25 %	0 %	50 %	25 %	257783835
60	NC_013203	ATGC	2	8	28531	28538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013203	ATTC	2	8	28994	29001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013203	TTCT	2	8	29118	29125	0 %	75 %	0 %	25 %	257783837
63	NC_013203	TAAC	2	8	29508	29515	50 %	25 %	0 %	25 %	257783837
64	NC_013203	GCGG	2	8	30707	30714	0 %	0 %	75 %	25 %	257783838
65	NC_013203	TATG	2	8	30784	30791	25 %	50 %	25 %	0 %	257783838
66	NC_013203	CCAA	2	8	31370	31377	50 %	0 %	0 %	50 %	257783838
67	NC_013203	ATCG	2	8	31868	31875	25 %	25 %	25 %	25 %	257783838
68	NC_013203	TGGT	2	8	32415	32422	0 %	50 %	50 %	0 %	257783839
69	NC_013203	GCTC	2	8	32441	32448	0 %	25 %	25 %	50 %	257783839
70	NC_013203	ATGA	2	8	32714	32721	50 %	25 %	25 %	0 %	257783839
71	NC_013203	GAGC	2	8	33056	33063	25 %	0 %	50 %	25 %	257783839
72	NC_013203	CGCT	2	8	33574	33581	0 %	25 %	25 %	50 %	257783839
73	NC_013203	CTTA	2	8	34214	34221	25 %	50 %	0 %	25 %	257783840
74	NC_013203	CTGA	2	8	34466	34473	25 %	25 %	25 %	25 %	257783840
75	NC_013203	TCTT	2	8	34990	34997	0 %	75 %	0 %	25 %	257783841
76	NC_013203	AGCC	2	8	35134	35141	25 %	0 %	25 %	50 %	257783841
77	NC_013203	TTTG	2	8	35344	35351	0 %	75 %	25 %	0 %	257783841
78	NC_013203	GCTT	2	8	35397	35404	0 %	50 %	25 %	25 %	257783841
79	NC_013203	AGCA	2	8	35644	35651	50 %	0 %	25 %	25 %	257783841
80	NC_013203	GGTA	2	8	35696	35703	25 %	25 %	50 %	0 %	257783841
81	NC_013203	GCAA	2	8	35788	35795	50 %	0 %	25 %	25 %	257783841
82	NC_013203	TTGA	2	8	36785	36792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013203	GCAG	2	8	37054	37061	25 %	0 %	50 %	25 %	257783842
84	NC_013203	CAAA	2	8	38075	38082	75 %	0 %	0 %	25 %	257783843
85	NC_013203	AATA	2	8	38571	38578	75 %	25 %	0 %	0 %	257783843
86	NC_013203	CATG	2	8	38643	38650	25 %	25 %	25 %	25 %	257783843
87	NC_013203	TCAT	2	8	38837	38844	25 %	50 %	0 %	25 %	257783843
88	NC_013203	AGGC	2	8	40590	40597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013203	GTCT	2	8	41474	41481	0 %	50 %	25 %	25 %	257783846
90	NC_013203	TTAA	2	8	41719	41726	50 %	50 %	0 %	0 %	257783846
91	NC_013203	CCAA	2	8	42299	42306	50 %	0 %	0 %	50 %	257783847
92	NC_013203	TTAC	2	8	42312	42319	25 %	50 %	0 %	25 %	257783847
93	NC_013203	CTTC	2	8	42848	42855	0 %	50 %	0 %	50 %	257783847
94	NC_013203	TTGC	2	8	43007	43014	0 %	50 %	25 %	25 %	257783847
95	NC_013203	CATG	2	8	46245	46252	25 %	25 %	25 %	25 %	257783851
96	NC_013203	TATC	2	8	46512	46519	25 %	50 %	0 %	25 %	257783852
97	NC_013203	TGGG	2	8	47487	47494	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013203	TGTA	2	8	47741	47748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013203	AAAG	2	8	49768	49775	75 %	0 %	25 %	0 %	257783855
100	NC_013203	GTTT	2	8	50080	50087	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013203	TTAA	2	8	50140	50147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013203	ATGC	2	8	50793	50800	25 %	25 %	25 %	25 %	257783857
103	NC_013203	TGCG	2	8	51546	51553	0 %	25 %	50 %	25 %	257783858
104	NC_013203	GTTT	2	8	52630	52637	0 %	75 %	25 %	0 %	257783859
105	NC_013203	ATAA	2	8	52885	52892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013203	CTTT	2	8	53684	53691	0 %	75 %	0 %	25 %	257783861
107	NC_013203	AAAT	2	8	53895	53902	75 %	25 %	0 %	0 %	257783861
108	NC_013203	CTTT	2	8	55127	55134	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013203	GTTT	2	8	55281	55288	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013203	TCTT	2	8	55439	55446	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013203	GCTG	2	8	57250	57257	0 %	25 %	50 %	25 %	257783864
112	NC_013203	GGCT	2	8	57970	57977	0 %	25 %	50 %	25 %	257783864
113	NC_013203	TAAA	2	8	58436	58443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013203	CAAT	2	8	58460	58467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013203	GTTT	3	12	58706	58717	0 %	75 %	25 %	0 %	257783865
116	NC_013203	GCAG	2	8	59064	59071	25 %	0 %	50 %	25 %	257783865
117	NC_013203	CTCA	2	8	59368	59375	25 %	25 %	0 %	50 %	257783865
118	NC_013203	CAAC	2	8	59608	59615	50 %	0 %	0 %	50 %	257783866
119	NC_013203	TCGA	2	8	59995	60002	25 %	25 %	25 %	25 %	257783867
120	NC_013203	GCTG	2	8	60465	60472	0 %	25 %	50 %	25 %	257783867
121	NC_013203	TTCC	2	8	60948	60955	0 %	50 %	0 %	50 %	257783867
122	NC_013203	TTTG	2	8	61583	61590	0 %	75 %	25 %	0 %	257783868
123	NC_013203	TTTA	2	8	61715	61722	25 %	75 %	0 %	0 %	257783868
124	NC_013203	CTTT	2	8	61752	61759	0 %	75 %	0 %	25 %	257783868
125	NC_013203	TGCT	2	8	62124	62131	0 %	50 %	25 %	25 %	257783868
126	NC_013203	GTTG	2	8	63726	63733	0 %	50 %	50 %	0 %	257783869
127	NC_013203	CGCA	2	8	65846	65853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013203	AAAG	2	8	65951	65958	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013203	GCAA	2	8	66213	66220	50 %	0 %	25 %	25 %	257783870
130	NC_013203	AAGT	2	8	67810	67817	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013203	GGAT	2	8	68533	68540	25 %	25 %	50 %	0 %	257783871
132	NC_013203	AGGA	2	8	68589	68596	50 %	0 %	50 %	0 %	257783871
133	NC_013203	GAAA	2	8	69325	69332	75 %	0 %	25 %	0 %	257783872
134	NC_013203	ATTT	2	8	69584	69591	25 %	75 %	0 %	0 %	257783872
135	NC_013203	AGTC	2	8	69668	69675	25 %	25 %	25 %	25 %	257783872
136	NC_013203	TATC	2	8	69831	69838	25 %	50 %	0 %	25 %	257783872
137	NC_013203	AAGC	2	8	70383	70390	50 %	0 %	25 %	25 %	257783872
138	NC_013203	TCTT	2	8	70680	70687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013203	TTCC	2	8	71892	71899	0 %	50 %	0 %	50 %	257783873
140	NC_013203	TTAT	2	8	72525	72532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013203	AGGT	2	8	72752	72759	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013203	ATTG	2	8	73099	73106	25 %	50 %	25 %	0 %	257783874
143	NC_013203	GGTC	2	8	73189	73196	0 %	25 %	50 %	25 %	257783874
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