MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 31231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013203	CAAG	2	8	277171	277178	50 %	0 %	25 %	25 %	257784043
5502	NC_013203	TGCG	2	8	277250	277257	0 %	25 %	50 %	25 %	257784043
5503	NC_013203	TCTT	2	8	277271	277278	0 %	75 %	0 %	25 %	257784043
5504	NC_013203	CAG	3	9	277356	277364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784043
5505	NC_013203	ATT	2	6	277365	277370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784043
5506	NC_013203	GTC	2	6	277432	277437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784043
5507	NC_013203	CTTC	2	8	277502	277509	0 %	50 %	0 %	50 %	257784043
5508	NC_013203	GCA	2	6	277543	277548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784043
5509	NC_013203	GAT	2	6	277604	277609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784043
5510	NC_013203	AG	4	8	277698	277705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_013203	ATT	2	6	277742	277747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_013203	AC	3	6	277796	277801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5513	NC_013203	GAA	2	6	277838	277843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784044
5514	NC_013203	AGA	2	6	277846	277851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784044
5515	NC_013203	TAC	3	9	277882	277890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784044
5516	NC_013203	A	6	6	277891	277896	100 %	0 %	0 %	0 %	257784044
5517	NC_013203	GAT	2	6	277922	277927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784044
5518	NC_013203	GTT	2	6	277953	277958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784044
5519	NC_013203	GTT	2	6	277985	277990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784044
5520	NC_013203	GAG	2	6	278078	278083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257784044
5521	NC_013203	AAG	2	6	278211	278216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784044
5522	NC_013203	ATA	2	6	278226	278231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784044
5523	NC_013203	ATT	2	6	278258	278263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784044
5524	NC_013203	TTC	2	6	278289	278294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784044
5525	NC_013203	GT	3	6	278452	278457	0 %	50 %	50 %	0 %	257784044
5526	NC_013203	ACA	2	6	278498	278503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784044
5527	NC_013203	GTT	2	6	278525	278530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784044
5528	NC_013203	TAAA	2	8	278559	278566	75 %	25 %	0 %	0 %	257784044
5529	NC_013203	CAG	2	6	278579	278584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784044
5530	NC_013203	A	7	7	278683	278689	100 %	0 %	0 %	0 %	257784044
5531	NC_013203	GCT	3	9	278741	278749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784044
5532	NC_013203	CTC	2	6	278757	278762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257784044
5533	NC_013203	TACA	2	8	278766	278773	50 %	25 %	0 %	25 %	257784044
5534	NC_013203	GCAT	2	8	278887	278894	25 %	25 %	25 %	25 %	257784044
5535	NC_013203	TTCT	2	8	278946	278953	0 %	75 %	0 %	25 %	257784044
5536	NC_013203	AAG	2	6	278982	278987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784044
5537	NC_013203	GGATG	2	10	279002	279011	20 %	20 %	60 %	0 %	257784044
5538	NC_013203	GGC	2	6	279050	279055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257784044
5539	NC_013203	TGG	2	6	279061	279066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784044
5540	NC_013203	GCT	2	6	279104	279109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784044
5541	NC_013203	TCCA	2	8	279165	279172	25 %	25 %	0 %	50 %	257784044
5542	NC_013203	ATTT	2	8	279248	279255	25 %	75 %	0 %	0 %	257784044
5543	NC_013203	AC	3	6	279308	279313	50 %	0 %	0 %	50 %	257784044
5544	NC_013203	ATACT	2	10	279361	279370	40 %	40 %	0 %	20 %	257784044
5545	NC_013203	CTG	2	6	279381	279386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784044
5546	NC_013203	GAG	2	6	279431	279436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257784044
5547	NC_013203	TCT	2	6	279445	279450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784044
5548	NC_013203	CTT	2	6	279566	279571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784044
5549	NC_013203	GTT	2	6	279698	279703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784044
5550	NC_013203	TAC	2	6	279838	279843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784044
5551	NC_013203	GTT	2	6	279863	279868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784044
5552	NC_013203	CGTGG	2	10	279884	279893	0 %	20 %	60 %	20 %	257784044
5553	NC_013203	TGC	2	6	279900	279905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784044
5554	NC_013203	GTC	2	6	279999	280004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784044
5555	NC_013203	TGCAGG	2	12	280045	280056	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257784044
5556	NC_013203	GAA	2	6	280087	280092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784044
5557	NC_013203	CGTG	2	8	280197	280204	0 %	25 %	50 %	25 %	257784044
5558	NC_013203	GAGG	2	8	280295	280302	25 %	0 %	75 %	0 %	257784044
5559	NC_013203	TG	3	6	280355	280360	0 %	50 %	50 %	0 %	257784044
5560	NC_013203	CAAAGT	2	12	280362	280373	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	257784044
5561	NC_013203	GGA	2	6	280463	280468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257784044
5562	NC_013203	CAA	2	6	280488	280493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784044
5563	NC_013203	AAG	2	6	280595	280600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784044
5564	NC_013203	GTAT	2	8	280609	280616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_013203	AAC	2	6	280631	280636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_013203	GCT	2	6	280652	280657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_013203	GTT	2	6	280662	280667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_013203	TAGG	2	8	280677	280684	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_013203	CTA	2	6	280749	280754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_013203	ACA	2	6	280798	280803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784045
5571	NC_013203	TAA	2	6	280829	280834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784045
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5577	NC_013203	GCA	2	6	281199	281204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784045
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5581	NC_013203	GCA	2	6	281451	281456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784045
5582	NC_013203	TCC	2	6	281570	281575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257784045
5583	NC_013203	GCA	2	6	281631	281636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784045
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5587	NC_013203	GCATGC	2	12	281782	281793	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257784045
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5589	NC_013203	TGT	2	6	281822	281827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784045
5590	NC_013203	ACA	2	6	281919	281924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784045
5591	NC_013203	A	6	6	282028	282033	100 %	0 %	0 %	0 %	257784045
5592	NC_013203	A	6	6	282070	282075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_013203	TCT	2	6	282099	282104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_013203	ATAG	2	8	282117	282124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_013203	CAAA	2	8	282128	282135	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5596	NC_013203	A	7	7	282149	282155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_013203	TAA	2	6	282248	282253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_013203	AGG	2	6	282254	282259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_013203	GCA	2	6	282297	282302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784046
5600	NC_013203	GC	3	6	282335	282340	0 %	0 %	50 %	50 %	257784046
5601	NC_013203	AGA	2	6	282368	282373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784046
5602	NC_013203	GCAT	2	8	282387	282394	25 %	25 %	25 %	25 %	257784046
5603	NC_013203	TGA	2	6	282422	282427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784046
5604	NC_013203	ATC	2	6	282483	282488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784046
5605	NC_013203	TTGGTA	2	12	282514	282525	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	257784046
5606	NC_013203	TGG	2	6	282581	282586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784046
5607	NC_013203	GTG	2	6	282589	282594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784046
5608	NC_013203	GGC	2	6	282609	282614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257784046
5609	NC_013203	TGC	2	6	282632	282637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784046
5610	NC_013203	GTT	2	6	282687	282692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784046
5611	NC_013203	TGG	2	6	282794	282799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784046
5612	NC_013203	GTG	2	6	282880	282885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784046
5613	NC_013203	CAT	2	6	282911	282916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784046
5614	NC_013203	AAT	2	6	282939	282944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784046
5615	NC_013203	TGA	2	6	282950	282955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784046
5616	NC_013203	CGCTG	2	10	283083	283092	0 %	20 %	40 %	40 %	257784046
5617	NC_013203	CGT	2	6	283122	283127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784046
5618	NC_013203	GAG	2	6	283170	283175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257784046
5619	NC_013203	CTTC	2	8	283176	283183	0 %	50 %	0 %	50 %	257784046
5620	NC_013203	CGA	2	6	283199	283204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784046
5621	NC_013203	CATGTA	2	12	283217	283228	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257784046
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5623	NC_013203	CAA	2	6	283289	283294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784046
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5991	NC_013203	TGT	2	6	302513	302518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784067
5992	NC_013203	T	6	6	302622	302627	0 %	100 %	0 %	0 %	257784067
5993	NC_013203	ATA	2	6	302695	302700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784067
5994	NC_013203	TTCC	2	8	302705	302712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5995	NC_013203	CG	3	6	302764	302769	0 %	0 %	50 %	50 %	257784068
5996	NC_013203	T	6	6	302779	302784	0 %	100 %	0 %	0 %	257784068
5997	NC_013203	GTC	2	6	302810	302815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784068
5998	NC_013203	CTT	2	6	302831	302836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784068
5999	NC_013203	TGCT	2	8	302876	302883	0 %	50 %	25 %	25 %	257784068
6000	NC_013203	AAG	2	6	302894	302899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784068

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