MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Anaerococcus prevotii DSM 20548 chromosome

Total Repeats: 876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013171	AGTAAC	2	12	4444	4455	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	257065525
2	NC_013171	TAGAAG	2	12	5010	5021	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257065525
3	NC_013171	AAGGCT	2	12	7282	7293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257065526
4	NC_013171	TTCTTT	2	12	10041	10052	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013171	AGACCT	2	12	10943	10954	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257065530
6	NC_013171	AAAGAA	2	12	11016	11027	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257065530
7	NC_013171	GATGAG	2	12	11713	11724	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	257065531
8	NC_013171	TACATC	2	12	13579	13590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257065533
9	NC_013171	AATGAA	2	12	17736	17747	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257065535
10	NC_013171	TCAAGA	2	12	18173	18184	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	257065535
11	NC_013171	TCCAGC	2	12	18612	18623	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257065535
12	NC_013171	GAAAGA	2	12	22851	22862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257065537
13	NC_013171	AGCCCT	2	12	25262	25273	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257065539
14	NC_013171	CTTAAG	2	12	27687	27698	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257065541
15	NC_013171	TTTAAT	2	12	28458	28469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013171	TATTTT	2	12	29404	29415	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257065544
17	NC_013171	GTAGAA	2	12	30992	31003	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257065546
18	NC_013171	TGGATG	2	12	33978	33989	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	257065548
19	NC_013171	TAATCA	2	12	34384	34395	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	257065548
20	NC_013171	ATAGTA	2	12	34827	34838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257065548
21	NC_013171	AGATAA	2	12	36253	36264	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257065550
22	NC_013171	ATTTTT	2	12	40085	40096	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257065552
23	NC_013171	TAAAGG	2	12	40943	40954	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257065553
24	NC_013171	GACCTA	2	12	41346	41357	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257065554
25	NC_013171	TACCTT	2	12	48579	48590	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257065559
26	NC_013171	CCTAAC	2	12	52943	52954	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	257065563
27	NC_013171	GCCCTA	2	12	53833	53844	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257065564
28	NC_013171	TATTAA	2	12	55514	55525	50 %	50 %	0 %	0 %	257065566
29	NC_013171	TTTATG	2	12	56120	56131	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	257065566
30	NC_013171	TTAAGT	2	12	62650	62661	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257065572
31	NC_013171	ATCCTA	2	12	65741	65752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257065574
32	NC_013171	CTTGGA	2	12	66952	66963	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257065575
33	NC_013171	TGGAAT	2	12	68266	68277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257065576
34	NC_013171	AAAGAG	2	12	69224	69235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257065577
35	NC_013171	GCTATG	2	12	71073	71084	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013171	TAAATA	2	12	71118	71129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013171	CTATAG	2	12	75432	75443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257065582
38	NC_013171	ATATGT	2	12	76621	76632	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257065583
39	NC_013171	CAAAGA	2	12	77246	77257	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	257065584
40	NC_013171	AAAGCG	2	12	83971	83982	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013171	GTGAAG	2	12	84048	84059	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013171	TATTTT	2	12	88002	88013	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013171	GTAGCT	2	12	89926	89937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257065590
44	NC_013171	AAGTTG	2	12	91397	91408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257065591
45	NC_013171	ATTTTG	2	12	91637	91648	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	257065591
46	NC_013171	TAGATT	2	12	94636	94647	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257065593
47	NC_013171	GATTTT	2	12	95277	95288	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	257065593
48	NC_013171	AGGCTT	2	12	96137	96148	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257065594
49	NC_013171	TTTTGA	2	12	96379	96390	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	257065594
50	NC_013171	TGGAAG	2	12	96542	96553	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	257065595
51	NC_013171	ATAGAA	2	12	98478	98489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257065596
52	NC_013171	TCGGAG	2	12	102051	102062	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257065599
53	NC_013171	GTCGAT	2	12	106280	106291	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257065602
54	NC_013171	AAGGGC	2	12	106484	106495	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	257065602
55	NC_013171	TGTTTC	2	12	106528	106539	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013171	ATATCC	2	12	109149	109160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257065607
57	NC_013171	GCCATG	2	12	112153	112164	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257065609
58	NC_013171	TGAATG	2	12	114498	114509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257065611
59	NC_013171	GCTATG	2	12	119762	119773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257065616
60	NC_013171	ATTCAA	2	12	120053	120064	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	257065616
61	NC_013171	TTGAAG	2	12	121066	121077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257065617
62	NC_013171	TTATTT	2	12	121925	121936	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013171	CTTTGG	2	12	122707	122718	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	257065618
64	NC_013171	AGAATC	2	12	124475	124486	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	257065620
65	NC_013171	TTTTTC	2	12	124740	124751	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	257065620
66	NC_013171	AGGAGA	2	12	126981	126992	50 %	0 %	50 %	0 %	257065624
67	NC_013171	CGATTA	2	12	127802	127813	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257065624
68	NC_013171	TTTTAT	2	12	127991	128002	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257065625
69	NC_013171	CATTAA	2	12	128010	128021	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	257065625
70	NC_013171	TTTGTC	2	12	128795	128806	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	257065626
71	NC_013171	AGGGCT	2	12	128882	128893	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257065626
72	NC_013171	TATCTC	2	12	130524	130535	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257065626
73	NC_013171	TGGAAC	2	12	134160	134171	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013171	ATGAAT	2	12	135527	135538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013171	TGAAGT	2	12	138030	138041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257065632
76	NC_013171	TCCTTT	2	12	142023	142034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257065636
77	NC_013171	TTCGAT	2	12	142040	142051	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257065636
78	NC_013171	ATATTG	2	12	142590	142601	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257065636
79	NC_013171	TTTTGA	2	12	143860	143871	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	257065638
80	NC_013171	GTCCTA	2	12	145742	145753	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257065639
81	NC_013171	AGGAGC	2	12	149833	149844	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	257065644
82	NC_013171	GAAAAA	2	12	150344	150355	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257065644
83	NC_013171	TTCCTT	2	12	153111	153122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013171	GTAGAG	2	12	156131	156142	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	257065648
85	NC_013171	CTTTAA	2	12	157180	157191	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257065648
86	NC_013171	AAGAAA	2	12	157425	157436	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257065649
87	NC_013171	AGATTT	2	12	157755	157766	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257065649
88	NC_013171	CAAAGG	2	12	158736	158747	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	257065650
89	NC_013171	AGCCTT	2	12	160926	160937	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257065652
90	NC_013171	CAAATC	2	12	164439	164450	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	257065655
91	NC_013171	CTATGA	2	12	168201	168212	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257065658
92	NC_013171	CAAAGA	2	12	169172	169183	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	257065659
93	NC_013171	AAGTAA	2	12	170524	170535	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257065661
94	NC_013171	AAAAGA	2	12	173107	173118	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257065663
95	NC_013171	TGATAT	2	12	175701	175712	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257065665
96	NC_013171	TAAGCT	2	12	177137	177148	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257065666
97	NC_013171	TATAGA	2	12	192150	192161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257065680
98	NC_013171	AAGCAC	2	12	192468	192479	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	257065680
99	NC_013171	CAAAAA	2	12	192906	192917	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	257065681
100	NC_013171	CTAAGA	2	12	196493	196504	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	257065684
101	NC_013171	TCCTTA	2	12	197198	197209	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257065684
102	NC_013171	CAGATG	2	12	204069	204080	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257065693
103	NC_013171	CTAAGC	2	12	207406	207417	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013171	TAAGGA	2	12	214699	214710	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257065705
105	NC_013171	GAACAC	2	12	215140	215151	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	257065706
106	NC_013171	CCACGC	2	12	215325	215336	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	257065706
107	NC_013171	TAAGGA	2	12	216541	216552	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257065707
108	NC_013171	AGTGGA	2	12	219460	219471	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	257065711
109	NC_013171	ATATAG	2	12	226482	226493	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013171	CCAATT	2	12	227596	227607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257065718
111	NC_013171	TAGCCA	2	12	234446	234457	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257065724
112	NC_013171	AAAGAT	2	12	235385	235396	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257065725
113	NC_013171	AAAGCG	2	12	238347	238358	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_013171	GTGAAG	2	12	238424	238435	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013171	CGATTC	2	12	241330	241341	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013171	AGAAAA	2	12	245853	245864	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	257065729
117	NC_013171	CATTCC	2	12	246776	246787	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	257065730
118	NC_013171	TTTTTA	2	12	246900	246911	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257065731
119	NC_013171	GCCCTA	2	12	253371	253382	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257065736
120	NC_013171	ATTTAC	2	12	255764	255775	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257065739
121	NC_013171	CAGATC	2	12	257333	257344	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257065741
122	NC_013171	TATAAA	2	12	260895	260906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257065745
123	NC_013171	CCTACA	2	12	261936	261947	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	257065746
124	NC_013171	TCCTTC	2	12	267188	267199	0 %	50 %	0 %	50 %	257065752
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127	NC_013171	ATGCCA	2	12	272513	272524	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257065756
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130	NC_013171	TTTGAA	2	12	285859	285870	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257065769
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133	NC_013171	AATTAG	2	12	289522	289533	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257065773
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135	NC_013171	CTATAT	2	12	295922	295933	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_013171	TCCTAC	2	12	295947	295958	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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144	NC_013171	TTAAAA	2	12	312853	312864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_013171	GTTCTT	2	12	320018	320029	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	257065801
148	NC_013171	TATAAA	2	12	324675	324686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013171	TTTTAG	2	12	325606	325617	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	257065808
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168	NC_013171	CCTAGG	2	12	367021	367032	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257065840
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177	NC_013171	ACCCTT	2	12	384828	384839	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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224	NC_013171	GGCTTA	2	12	474530	474541	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257065930
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228	NC_013171	TAAGGG	2	12	479794	479805	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
229	NC_013171	TGAATA	2	12	480870	480881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257065936
230	NC_013171	TATTTG	2	12	482311	482322	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
231	NC_013171	ATATTT	2	12	483754	483765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257065940
232	NC_013171	TCCTGT	2	12	483891	483902	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	257065940
233	NC_013171	TACCCT	2	12	488855	488866	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	257065944
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236	NC_013171	TAAAGC	2	12	494485	494496	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	257065950
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467	NC_013171	AGTGTT	2	12	1006507	1006518	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	257066435
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471	NC_013171	AATATA	2	12	1019010	1019021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_013171	TCTATG	2	12	1078487	1078498	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257066498

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