MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 56359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37502	NC_013124	GCC	2	6	1426167	1426172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372149
37503	NC_013124	CGCC	2	8	1426183	1426190	0 %	0 %	25 %	75 %	256372149
37504	NC_013124	GC	4	8	1426202	1426209	0 %	0 %	50 %	50 %	256372149
37505	NC_013124	CGA	2	6	1426219	1426224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372149
37506	NC_013124	GC	3	6	1426243	1426248	0 %	0 %	50 %	50 %	256372149
37507	NC_013124	GCC	3	9	1426343	1426351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372149
37508	NC_013124	GGC	2	6	1426370	1426375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372149
37509	NC_013124	CGATC	2	10	1426399	1426408	20 %	20 %	20 %	40 %	256372149
37510	NC_013124	TCC	2	6	1426440	1426445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372149
37511	NC_013124	CGC	2	6	1426447	1426452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372149
37512	NC_013124	GAG	2	6	1426457	1426462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372149
37513	NC_013124	ACCG	2	8	1426489	1426496	25 %	0 %	25 %	50 %	256372149
37514	NC_013124	CAC	2	6	1426511	1426516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372149
37515	NC_013124	ATC	2	6	1426541	1426546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372149
37516	NC_013124	CGAG	2	8	1426576	1426583	25 %	0 %	50 %	25 %	256372149
37517	NC_013124	CGC	2	6	1426592	1426597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372149
37518	NC_013124	TCGA	2	8	1426604	1426611	25 %	25 %	25 %	25 %	256372149
37519	NC_013124	GAA	2	6	1426675	1426680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256372150
37520	NC_013124	CG	3	6	1426710	1426715	0 %	0 %	50 %	50 %	256372150
37521	NC_013124	GCG	2	6	1426737	1426742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372150
37522	NC_013124	GC	3	6	1426777	1426782	0 %	0 %	50 %	50 %	256372150
37523	NC_013124	CGA	2	6	1426806	1426811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372150
37524	NC_013124	TCGA	2	8	1426864	1426871	25 %	25 %	25 %	25 %	256372150
37525	NC_013124	CCT	3	9	1426890	1426898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372150
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37527	NC_013124	CGA	2	6	1427007	1427012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372150
37528	NC_013124	CGTC	2	8	1427016	1427023	0 %	25 %	25 %	50 %	256372150
37529	NC_013124	CGA	3	9	1427046	1427054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372150
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37532	NC_013124	TCG	2	6	1427163	1427168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372150
37533	NC_013124	ATCGC	2	10	1427174	1427183	20 %	20 %	20 %	40 %	256372150
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37535	NC_013124	GGA	2	6	1427208	1427213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372150
37536	NC_013124	CGA	2	6	1427229	1427234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372150
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37538	NC_013124	GAG	2	6	1427347	1427352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372150
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37555	NC_013124	GC	3	6	1428051	1428056	0 %	0 %	50 %	50 %	256372151
37556	NC_013124	ACC	2	6	1428132	1428137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372151
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37566	NC_013124	CGAC	2	8	1428558	1428565	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37567	NC_013124	CGGT	3	12	1428566	1428577	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37568	NC_013124	AGG	2	6	1428609	1428614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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37602	NC_013124	GCTG	2	8	1429956	1429963	0 %	25 %	50 %	25 %	256372153
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37617	NC_013124	GC	3	6	1430323	1430328	0 %	0 %	50 %	50 %	256372153
37618	NC_013124	GAC	2	6	1430383	1430388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372153
37619	NC_013124	CAT	2	6	1430407	1430412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372153
37620	NC_013124	TCC	2	6	1430451	1430456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372153
37621	NC_013124	CCG	2	6	1430467	1430472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
37622	NC_013124	GCC	2	6	1430602	1430607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
37623	NC_013124	TCG	2	6	1430613	1430618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372153
37624	NC_013124	CGC	2	6	1430671	1430676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
37625	NC_013124	CGT	2	6	1430725	1430730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372153
37626	NC_013124	GC	3	6	1430747	1430752	0 %	0 %	50 %	50 %	256372153
37627	NC_013124	CGC	2	6	1430822	1430827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
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37629	NC_013124	CCT	2	6	1430899	1430904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372153
37630	NC_013124	CTC	2	6	1430920	1430925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372153
37631	NC_013124	GTTC	2	8	1430926	1430933	0 %	50 %	25 %	25 %	256372153
37632	NC_013124	GCT	2	6	1430968	1430973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372153
37633	NC_013124	CCG	2	6	1430978	1430983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
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37635	NC_013124	GCC	2	6	1431019	1431024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
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37638	NC_013124	CTC	2	6	1431161	1431166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372153
37639	NC_013124	TCG	2	6	1431246	1431251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372153
37640	NC_013124	GC	3	6	1431274	1431279	0 %	0 %	50 %	50 %	256372153
37641	NC_013124	GC	3	6	1431313	1431318	0 %	0 %	50 %	50 %	256372153
37642	NC_013124	CGC	3	9	1431334	1431342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
37643	NC_013124	TCG	2	6	1431369	1431374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372153
37644	NC_013124	ACG	2	6	1431420	1431425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372153
37645	NC_013124	CTT	2	6	1431442	1431447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372153
37646	NC_013124	ACT	2	6	1431450	1431455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372153
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37648	NC_013124	CG	3	6	1431537	1431542	0 %	0 %	50 %	50 %	256372153
37649	NC_013124	CCG	2	6	1431549	1431554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
37650	NC_013124	CCG	2	6	1431560	1431565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
37651	NC_013124	GCC	3	9	1431602	1431610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
37652	NC_013124	CGA	2	6	1431627	1431632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372153
37653	NC_013124	CCG	2	6	1431642	1431647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
37654	NC_013124	GCC	2	6	1431703	1431708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
37655	NC_013124	TCC	2	6	1431723	1431728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372153
37656	NC_013124	TCG	2	6	1431759	1431764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372153
37657	NC_013124	GC	4	8	1431827	1431834	0 %	0 %	50 %	50 %	256372153
37658	NC_013124	GC	4	8	1431856	1431863	0 %	0 %	50 %	50 %	256372153
37659	NC_013124	CGG	2	6	1431886	1431891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372153
37660	NC_013124	CAT	2	6	1431901	1431906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372153
37661	NC_013124	CGATGC	2	12	1431910	1431921	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256372153
37662	NC_013124	GCC	2	6	1431989	1431994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
37663	NC_013124	GTG	2	6	1432004	1432009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372153
37664	NC_013124	GCC	2	6	1432052	1432057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
37665	NC_013124	CTC	2	6	1432084	1432089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372153
37666	NC_013124	GTG	2	6	1432097	1432102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372153
37667	NC_013124	CGA	2	6	1432114	1432119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372153
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37669	NC_013124	CGC	2	6	1432156	1432161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
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37672	NC_013124	CGAG	2	8	1432200	1432207	25 %	0 %	50 %	25 %	256372153
37673	NC_013124	TCG	2	6	1432233	1432238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372153
37674	NC_013124	ACC	2	6	1432245	1432250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372153
37675	NC_013124	GC	3	6	1432251	1432256	0 %	0 %	50 %	50 %	256372153
37676	NC_013124	TCG	3	9	1432290	1432298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372153
37677	NC_013124	CCG	2	6	1432302	1432307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
37678	NC_013124	CG	3	6	1432331	1432336	0 %	0 %	50 %	50 %	256372153
37679	NC_013124	CGT	2	6	1432399	1432404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372153
37680	NC_013124	GCC	2	6	1432464	1432469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372153
37681	NC_013124	CGG	2	6	1432477	1432482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372153
37682	NC_013124	GGT	2	6	1432514	1432519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372153
37683	NC_013124	CAG	2	6	1432547	1432552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372153
37684	NC_013124	GTG	2	6	1432553	1432558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372153
37685	NC_013124	GAC	2	6	1432606	1432611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37686	NC_013124	TCG	2	6	1432624	1432629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37687	NC_013124	CGGC	2	8	1432646	1432653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37688	NC_013124	ACG	2	6	1432721	1432726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37689	NC_013124	GAGC	2	8	1432762	1432769	25 %	0 %	50 %	25 %	256372154
37690	NC_013124	TCC	2	6	1432770	1432775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372154
37691	NC_013124	CAT	2	6	1432792	1432797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372154
37692	NC_013124	CG	4	8	1432827	1432834	0 %	0 %	50 %	50 %	256372154
37693	NC_013124	TCG	2	6	1432863	1432868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372154
37694	NC_013124	CCA	2	6	1432956	1432961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372154
37695	NC_013124	GAT	2	6	1432984	1432989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372154
37696	NC_013124	CGT	2	6	1432990	1432995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372154
37697	NC_013124	GCC	2	6	1433015	1433020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372154
37698	NC_013124	TTCGCC	2	12	1433057	1433068	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	256372154
37699	NC_013124	G	6	6	1433088	1433093	0 %	0 %	100 %	0 %	256372154
37700	NC_013124	GCCG	2	8	1433128	1433135	0 %	0 %	50 %	50 %	256372154
37701	NC_013124	CTC	2	6	1433144	1433149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372154
37702	NC_013124	CG	3	6	1433153	1433158	0 %	0 %	50 %	50 %	256372154
37703	NC_013124	CCGA	2	8	1433165	1433172	25 %	0 %	25 %	50 %	256372154
37704	NC_013124	TCG	2	6	1433223	1433228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372154
37705	NC_013124	GGC	2	6	1433239	1433244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372154
37706	NC_013124	CTC	2	6	1433246	1433251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372154
37707	NC_013124	CGT	2	6	1433263	1433268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372154
37708	NC_013124	GCC	2	6	1433276	1433281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372154
37709	NC_013124	CGC	2	6	1433323	1433328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372154
37710	NC_013124	TCG	2	6	1433340	1433345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372154
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37712	NC_013124	CGT	2	6	1433417	1433422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372154
37713	NC_013124	CTC	2	6	1433432	1433437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372154
37714	NC_013124	GGC	2	6	1433439	1433444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372154
37715	NC_013124	CAAC	2	8	1433451	1433458	50 %	0 %	0 %	50 %	256372154
37716	NC_013124	AC	3	6	1433457	1433462	50 %	0 %	0 %	50 %	256372154
37717	NC_013124	TCG	2	6	1433515	1433520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372154
37718	NC_013124	GAGC	2	8	1433526	1433533	25 %	0 %	50 %	25 %	256372154
37719	NC_013124	TCA	2	6	1433562	1433567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372154
37720	NC_013124	CAT	2	6	1433569	1433574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372154
37721	NC_013124	TCG	2	6	1433592	1433597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372154
37722	NC_013124	CG	3	6	1433630	1433635	0 %	0 %	50 %	50 %	256372154
37723	NC_013124	CTC	3	9	1433663	1433671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372154
37724	NC_013124	CACC	2	8	1433688	1433695	25 %	0 %	0 %	75 %	256372154
37725	NC_013124	GAG	2	6	1433792	1433797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372154
37726	NC_013124	CGC	2	6	1433809	1433814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372154
37727	NC_013124	GCC	3	9	1433846	1433854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372154
37728	NC_013124	CGA	2	6	1433878	1433883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372154
37729	NC_013124	CGG	2	6	1433911	1433916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372154
37730	NC_013124	TTC	2	6	1433954	1433959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372154
37731	NC_013124	TCCA	2	8	1433967	1433974	25 %	25 %	0 %	50 %	256372154
37732	NC_013124	GCG	2	6	1433990	1433995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372154
37733	NC_013124	GCTC	2	8	1434003	1434010	0 %	25 %	25 %	50 %	256372154
37734	NC_013124	TCC	2	6	1434028	1434033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372154
37735	NC_013124	CACC	2	8	1434082	1434089	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
37736	NC_013124	ACC	2	6	1434169	1434174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37737	NC_013124	TGG	2	6	1434210	1434215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37738	NC_013124	GTG	2	6	1434231	1434236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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37836	NC_013124	GGGC	2	8	1437851	1437858	0 %	0 %	75 %	25 %	256372158
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37849	NC_013124	CGA	2	6	1438300	1438305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372159
37850	NC_013124	GAC	2	6	1438325	1438330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372159
37851	NC_013124	CTCC	2	8	1438376	1438383	0 %	25 %	0 %	75 %	256372159
37852	NC_013124	CG	3	6	1438470	1438475	0 %	0 %	50 %	50 %	256372159
37853	NC_013124	ACC	2	6	1438486	1438491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372159
37854	NC_013124	CGAAC	2	10	1438496	1438505	40 %	0 %	20 %	40 %	256372159
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37856	NC_013124	CGC	2	6	1438577	1438582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372159
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37862	NC_013124	CGGG	2	8	1438768	1438775	0 %	0 %	75 %	25 %	256372159
37863	NC_013124	CGA	3	9	1438778	1438786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372159
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37953	NC_013124	CGAGG	2	10	1441546	1441555	20 %	0 %	60 %	20 %	256372160
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37955	NC_013124	AGT	2	6	1441654	1441659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372160
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37962	NC_013124	CGT	2	6	1441887	1441892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372160
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