MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 56359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_013124	CGC	2	6	292987	292992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371102
7502	NC_013124	GACC	2	8	293010	293017	25 %	0 %	25 %	50 %	256371102
7503	NC_013124	CGT	2	6	293058	293063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371102
7504	NC_013124	CG	3	6	293282	293287	0 %	0 %	50 %	50 %	256371102
7505	NC_013124	TCG	2	6	293289	293294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371102
7506	NC_013124	GCG	2	6	293295	293300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371102
7507	NC_013124	TGG	2	6	293306	293311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371102
7508	NC_013124	CGA	2	6	293388	293393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371102
7509	NC_013124	TGCG	2	8	293394	293401	0 %	25 %	50 %	25 %	256371102
7510	NC_013124	TCG	2	6	293486	293491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371102
7511	NC_013124	GC	3	6	293627	293632	0 %	0 %	50 %	50 %	256371102
7512	NC_013124	CGG	3	9	293649	293657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371102
7513	NC_013124	GAAGG	2	10	293680	293689	40 %	0 %	60 %	0 %	256371102
7514	NC_013124	CGA	2	6	293697	293702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371102
7515	NC_013124	AGC	2	6	293705	293710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371102
7516	NC_013124	CCA	2	6	293734	293739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371102
7517	NC_013124	CGA	2	6	293745	293750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371102
7518	NC_013124	ACG	2	6	293789	293794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371102
7519	NC_013124	CGG	2	6	293853	293858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371102
7520	NC_013124	GGC	2	6	293932	293937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371102
7521	NC_013124	ACC	2	6	293954	293959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371102
7522	NC_013124	CGAG	2	8	293991	293998	25 %	0 %	50 %	25 %	256371102
7523	NC_013124	GAT	2	6	294010	294015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371102
7524	NC_013124	TGG	2	6	294050	294055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371102
7525	NC_013124	GC	3	6	294060	294065	0 %	0 %	50 %	50 %	256371102
7526	NC_013124	GCG	2	6	294110	294115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371102
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7529	NC_013124	GAGCGG	2	12	294309	294320	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	256371103
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7531	NC_013124	CCGA	2	8	294363	294370	25 %	0 %	25 %	50 %	256371103
7532	NC_013124	GGC	2	6	294372	294377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371103
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7536	NC_013124	GC	4	8	294518	294525	0 %	0 %	50 %	50 %	256371103
7537	NC_013124	CGA	3	9	294527	294535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371103
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7542	NC_013124	CGT	2	6	294734	294739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371103
7543	NC_013124	TCG	2	6	294763	294768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371103
7544	NC_013124	GC	3	6	294809	294814	0 %	0 %	50 %	50 %	256371103
7545	NC_013124	CCT	2	6	294829	294834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7546	NC_013124	GCG	2	6	294860	294865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_013124	CCA	2	6	294908	294913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7548	NC_013124	GGC	2	6	294914	294919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_013124	CTCGC	2	10	294949	294958	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7550	NC_013124	TCGC	2	8	295007	295014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7551	NC_013124	GGT	2	6	295024	295029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_013124	GTG	2	6	295125	295130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_013124	TTCT	2	8	295143	295150	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7554	NC_013124	CATG	2	8	295175	295182	25 %	25 %	25 %	25 %	256371104
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7557	NC_013124	GTGGCG	2	12	295257	295268	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	256371104
7558	NC_013124	GCT	2	6	295280	295285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371104
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7560	NC_013124	CGC	2	6	295515	295520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371104
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7565	NC_013124	GTC	4	12	295662	295673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371104
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7574	NC_013124	CGGAT	2	10	295975	295984	20 %	20 %	40 %	20 %	256371104
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7581	NC_013124	GCC	2	6	296368	296373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371104
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7586	NC_013124	GC	3	6	296512	296517	0 %	0 %	50 %	50 %	256371104
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7589	NC_013124	TCG	2	6	296561	296566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371104
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7593	NC_013124	GT	3	6	296621	296626	0 %	50 %	50 %	0 %	256371105
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7605	NC_013124	GTA	2	6	296957	296962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371105
7606	NC_013124	TCG	2	6	296965	296970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371105
7607	NC_013124	GC	4	8	297001	297008	0 %	0 %	50 %	50 %	256371105
7608	NC_013124	ACGCG	2	10	297043	297052	20 %	0 %	40 %	40 %	256371105
7609	NC_013124	CG	3	6	297055	297060	0 %	0 %	50 %	50 %	256371105
7610	NC_013124	GCTC	2	8	297063	297070	0 %	25 %	25 %	50 %	256371105
7611	NC_013124	GC	3	6	297095	297100	0 %	0 %	50 %	50 %	256371105
7612	NC_013124	CGA	2	6	297124	297129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371105
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7617	NC_013124	GC	3	6	297370	297375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7618	NC_013124	GAC	2	6	297421	297426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7619	NC_013124	GAT	2	6	297464	297469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371106
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7622	NC_013124	TCG	2	6	297589	297594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371106
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7624	NC_013124	TCG	4	12	297661	297672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371106
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7734	NC_013124	GC	3	6	301811	301816	0 %	0 %	50 %	50 %	256371109
7735	NC_013124	GCCCT	2	10	301822	301831	0 %	20 %	20 %	60 %	256371109
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7741	NC_013124	GGC	2	6	302019	302024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371109
7742	NC_013124	GTC	2	6	302107	302112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371109
7743	NC_013124	GTG	2	6	302171	302176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371110
7744	NC_013124	ACGATG	2	12	302183	302194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256371110
7745	NC_013124	GTG	2	6	302206	302211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371110
7746	NC_013124	CGT	2	6	302218	302223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371110
7747	NC_013124	GAG	3	9	302236	302244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371110
7748	NC_013124	CGAG	2	8	302250	302257	25 %	0 %	50 %	25 %	256371110
7749	NC_013124	ACG	2	6	302276	302281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371110
7750	NC_013124	GTG	2	6	302302	302307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371110
7751	NC_013124	TCGCG	2	10	302315	302324	0 %	20 %	40 %	40 %	256371110
7752	NC_013124	CGC	2	6	302328	302333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371110
7753	NC_013124	TCGACC	2	12	302348	302359	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256371110
7754	NC_013124	TCG	2	6	302381	302386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371110
7755	NC_013124	CG	3	6	302413	302418	0 %	0 %	50 %	50 %	256371110
7756	NC_013124	ACC	2	6	302517	302522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371110
7757	NC_013124	CGG	2	6	302525	302530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371110
7758	NC_013124	GGCCG	2	10	302631	302640	0 %	0 %	60 %	40 %	256371110
7759	NC_013124	TGA	2	6	302643	302648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371110
7760	NC_013124	CGC	2	6	302659	302664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371110
7761	NC_013124	GGCG	2	8	302667	302674	0 %	0 %	75 %	25 %	256371110
7762	NC_013124	CCGAG	2	10	302688	302697	20 %	0 %	40 %	40 %	256371110
7763	NC_013124	GCC	2	6	302713	302718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371110
7764	NC_013124	CGA	3	9	302733	302741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371110
7765	NC_013124	TGC	2	6	302757	302762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371110
7766	NC_013124	GCC	2	6	302785	302790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371110
7767	NC_013124	GAC	2	6	302797	302802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371110
7768	NC_013124	CAGC	2	8	302850	302857	25 %	0 %	25 %	50 %	256371110
7769	NC_013124	GGC	2	6	302866	302871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371110
7770	NC_013124	CGT	2	6	302883	302888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371110
7771	NC_013124	GGC	2	6	302971	302976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371110
7772	NC_013124	TCG	2	6	302978	302983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371110
7773	NC_013124	CGA	3	9	303030	303038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371110
7774	NC_013124	GAC	2	6	303052	303057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7775	NC_013124	GCTC	2	8	303088	303095	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7776	NC_013124	GGC	2	6	303177	303182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371111
7777	NC_013124	TGGGG	2	10	303206	303215	0 %	20 %	80 %	0 %	256371111
7778	NC_013124	TCG	2	6	303224	303229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371111
7779	NC_013124	CGCGAG	2	12	303261	303272	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256371111
7780	NC_013124	GCTGC	2	10	303284	303293	0 %	20 %	40 %	40 %	256371111
7781	NC_013124	TCG	2	6	303370	303375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371111
7782	NC_013124	GC	4	8	303385	303392	0 %	0 %	50 %	50 %	256371111
7783	NC_013124	CCA	2	6	303416	303421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371111
7784	NC_013124	ATG	2	6	303547	303552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371111
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7786	NC_013124	GTCC	2	8	303601	303608	0 %	25 %	25 %	50 %	256371111
7787	NC_013124	CA	3	6	303628	303633	50 %	0 %	0 %	50 %	256371111
7788	NC_013124	GC	3	6	303671	303676	0 %	0 %	50 %	50 %	256371111
7789	NC_013124	GGC	2	6	303725	303730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371111
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7791	NC_013124	TGC	2	6	303781	303786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371111
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7799	NC_013124	CGT	2	6	304143	304148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371111
7800	NC_013124	CCT	2	6	304160	304165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371111
7801	NC_013124	TCG	2	6	304186	304191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371111
7802	NC_013124	GCGG	2	8	304194	304201	0 %	0 %	75 %	25 %	256371111
7803	NC_013124	TCG	2	6	304237	304242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371111
7804	NC_013124	TGC	2	6	304246	304251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371111
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7807	NC_013124	GC	3	6	304353	304358	0 %	0 %	50 %	50 %	256371111
7808	NC_013124	TGGA	2	8	304388	304395	25 %	25 %	50 %	0 %	256371111
7809	NC_013124	GATCG	2	10	304434	304443	20 %	20 %	40 %	20 %	256371111
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7811	NC_013124	CGGC	2	8	304459	304466	0 %	0 %	50 %	50 %	256371111
7812	NC_013124	CGC	2	6	304482	304487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371111
7813	NC_013124	CCA	2	6	304495	304500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371111
7814	NC_013124	CGA	2	6	304511	304516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371111
7815	NC_013124	GAC	2	6	304518	304523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371111
7816	NC_013124	GAC	2	6	304567	304572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7817	NC_013124	CGGCG	2	10	304659	304668	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7818	NC_013124	GAA	2	6	304703	304708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7819	NC_013124	ACG	2	6	304767	304772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371112
7820	NC_013124	ACGC	2	8	304787	304794	25 %	0 %	25 %	50 %	256371112
7821	NC_013124	AGC	2	6	304800	304805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371112
7822	NC_013124	CG	3	6	304808	304813	0 %	0 %	50 %	50 %	256371112
7823	NC_013124	ATC	2	6	304892	304897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256371112
7824	NC_013124	TCC	2	6	304950	304955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371112
7825	NC_013124	TCG	2	6	304962	304967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371112
7826	NC_013124	CGCC	2	8	304978	304985	0 %	0 %	25 %	75 %	256371112
7827	NC_013124	ATC	2	6	305037	305042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256371112
7828	NC_013124	CCT	2	6	305137	305142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371112
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7830	NC_013124	GC	3	6	305197	305202	0 %	0 %	50 %	50 %	256371112
7831	NC_013124	GATGA	2	10	305263	305272	40 %	20 %	40 %	0 %	256371112
7832	NC_013124	TGC	2	6	305294	305299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371113
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7834	NC_013124	ATCG	2	8	305381	305388	25 %	25 %	25 %	25 %	256371113
7835	NC_013124	CGG	2	6	305449	305454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371113
7836	NC_013124	GAC	2	6	305472	305477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371113
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7838	NC_013124	ATCGC	2	10	305558	305567	20 %	20 %	20 %	40 %	256371113
7839	NC_013124	GACG	2	8	305569	305576	25 %	0 %	50 %	25 %	256371113
7840	NC_013124	GCG	2	6	305652	305657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371113
7841	NC_013124	AGC	2	6	305675	305680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371113
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7843	NC_013124	CTGG	2	8	305832	305839	0 %	25 %	50 %	25 %	256371113
7844	NC_013124	CGA	2	6	305841	305846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371113
7845	NC_013124	GAG	2	6	305857	305862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371113
7846	NC_013124	CGGTG	2	10	305883	305892	0 %	20 %	60 %	20 %	256371113
7847	NC_013124	CG	4	8	305955	305962	0 %	0 %	50 %	50 %	256371113
7848	NC_013124	ACG	2	6	305996	306001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371113
7849	NC_013124	GGGC	2	8	306024	306031	0 %	0 %	75 %	25 %	256371113
7850	NC_013124	TCG	2	6	306071	306076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371113
7851	NC_013124	AGC	2	6	306104	306109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371113
7852	NC_013124	CGACGC	2	12	306191	306202	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256371113
7853	NC_013124	ACA	2	6	306209	306214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256371113
7854	NC_013124	AGC	2	6	306224	306229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371113
7855	NC_013124	GGAGC	2	10	306252	306261	20 %	0 %	60 %	20 %	256371113
7856	NC_013124	ACG	2	6	306361	306366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371113
7857	NC_013124	CGA	2	6	306429	306434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371113
7858	NC_013124	CATC	2	8	306471	306478	25 %	25 %	0 %	50 %	256371113
7859	NC_013124	CGAG	2	8	306521	306528	25 %	0 %	50 %	25 %	256371113
7860	NC_013124	CTG	2	6	306632	306637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371113
7861	NC_013124	GTG	2	6	306692	306697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371113
7862	NC_013124	GCTC	2	8	306762	306769	0 %	25 %	25 %	50 %	256371113
7863	NC_013124	CGA	2	6	306807	306812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371113
7864	NC_013124	CGGT	2	8	306827	306834	0 %	25 %	50 %	25 %	256371113
7865	NC_013124	TCGC	2	8	306838	306845	0 %	25 %	25 %	50 %	256371113
7866	NC_013124	CGG	2	6	306861	306866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371113
7867	NC_013124	GGA	2	6	306879	306884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371113
7868	NC_013124	GCT	2	6	306886	306891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371113
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7870	NC_013124	CCGG	2	8	306929	306936	0 %	0 %	50 %	50 %	256371113
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7872	NC_013124	GA	3	6	307025	307030	50 %	0 %	50 %	0 %	256371113
7873	NC_013124	TCG	2	6	307052	307057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371113
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7884	NC_013124	CGG	2	6	307661	307666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371114
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7893	NC_013124	CGA	2	6	308244	308249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371114
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7901	NC_013124	CCT	2	6	308462	308467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7902	NC_013124	GTG	2	6	308530	308535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7985	NC_013124	TCG	2	6	310948	310953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371116
7986	NC_013124	TGG	2	6	310990	310995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371116
7987	NC_013124	CTC	2	6	311019	311024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371116
7988	NC_013124	GC	3	6	311131	311136	0 %	0 %	50 %	50 %	256371116
7989	NC_013124	CGA	2	6	311139	311144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371116
7990	NC_013124	CGA	2	6	311153	311158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371116
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7994	NC_013124	GCGG	2	8	311274	311281	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7995	NC_013124	ACC	2	6	311316	311321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8000	NC_013124	CTG	2	6	311578	311583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371117

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