MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinosynnema mirum DSM 43827 chromosome

Total Repeats: 259223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013093	CGC	2	6	100983	100988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374253
3002	NC_013093	GCT	3	9	101034	101042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374253
3003	NC_013093	TGG	2	6	101048	101053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374253
3004	NC_013093	GCG	2	6	101066	101071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374253
3005	NC_013093	AGCG	2	8	101101	101108	25 %	0 %	50 %	25 %	256374253
3006	NC_013093	ATC	2	6	101134	101139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374253
3007	NC_013093	CAC	2	6	101181	101186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374253
3008	NC_013093	CGA	2	6	101208	101213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374253
3009	NC_013093	CGG	2	6	101229	101234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374253
3010	NC_013093	TCG	2	6	101264	101269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374253
3011	NC_013093	GTT	2	6	101310	101315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256374253
3012	NC_013093	CG	3	6	101356	101361	0 %	0 %	50 %	50 %	256374253
3013	NC_013093	GCT	2	6	101388	101393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374253
3014	NC_013093	TGG	2	6	101399	101404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374253
3015	NC_013093	CTG	3	9	101410	101418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374253
3016	NC_013093	AGTTCG	2	12	101423	101434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256374253
3017	NC_013093	GTG	2	6	101464	101469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374253
3018	NC_013093	CGG	2	6	101477	101482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374253
3019	NC_013093	GGGCG	2	10	101504	101513	0 %	0 %	80 %	20 %	256374253
3020	NC_013093	TGC	2	6	101594	101599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374253
3021	NC_013093	TCC	2	6	101644	101649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374253
3022	NC_013093	GC	3	6	101693	101698	0 %	0 %	50 %	50 %	256374253
3023	NC_013093	CCG	2	6	101699	101704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374253
3024	NC_013093	CCCG	2	8	101766	101773	0 %	0 %	25 %	75 %	256374253
3025	NC_013093	CGT	2	6	101783	101788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374253
3026	NC_013093	CG	3	6	101823	101828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_013093	CCG	2	6	101862	101867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_013093	GCCCC	2	10	101875	101884	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3029	NC_013093	GCG	2	6	101885	101890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_013093	CGG	2	6	101895	101900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_013093	CCCG	2	8	101920	101927	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3032	NC_013093	GCCC	2	8	101935	101942	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3033	NC_013093	TCC	2	6	101956	101961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_013093	GCCC	2	8	101962	101969	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3035	NC_013093	TCC	2	6	101972	101977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_013093	GCCC	2	8	101978	101985	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3037	NC_013093	CCA	2	6	102040	102045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374254
3038	NC_013093	GCA	2	6	102046	102051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374254
3039	NC_013093	GCG	2	6	102106	102111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374254
3040	NC_013093	CTC	3	9	102116	102124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374254
3041	NC_013093	GCGG	2	8	102127	102134	0 %	0 %	75 %	25 %	256374254
3042	NC_013093	CCGC	2	8	102157	102164	0 %	0 %	25 %	75 %	256374254
3043	NC_013093	GCC	2	6	102180	102185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374254
3044	NC_013093	TCG	2	6	102189	102194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374254
3045	NC_013093	GCC	2	6	102201	102206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374254
3046	NC_013093	CG	3	6	102212	102217	0 %	0 %	50 %	50 %	256374254
3047	NC_013093	CCG	2	6	102244	102249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374254
3048	NC_013093	CCA	2	6	102367	102372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374254
3049	NC_013093	CAG	2	6	102404	102409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374254
3050	NC_013093	CAG	2	6	102446	102451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374254
3051	NC_013093	TCG	2	6	102459	102464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374254
3052	NC_013093	CCT	2	6	102505	102510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374254
3053	NC_013093	CCA	2	6	102511	102516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374254
3054	NC_013093	CCA	2	6	102520	102525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374254
3055	NC_013093	CGCC	2	8	102529	102536	0 %	0 %	25 %	75 %	256374254
3056	NC_013093	CCGC	2	8	102547	102554	0 %	0 %	25 %	75 %	256374254
3057	NC_013093	CCG	2	6	102562	102567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374254
3058	NC_013093	AGC	2	6	102672	102677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374254
3059	NC_013093	GCA	3	9	102685	102693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374254
3060	NC_013093	CCG	2	6	102707	102712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374254
3061	NC_013093	GC	3	6	102799	102804	0 %	0 %	50 %	50 %	256374254
3062	NC_013093	CGA	2	6	102865	102870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374254
3063	NC_013093	GC	3	6	102916	102921	0 %	0 %	50 %	50 %	256374254
3064	NC_013093	GTC	3	9	102953	102961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374254
3065	NC_013093	CTC	2	6	102995	103000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374254
3066	NC_013093	GGC	2	6	103005	103010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374254
3067	NC_013093	CCG	2	6	103026	103031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374254
3068	NC_013093	CG	4	8	103062	103069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_013093	CGG	2	6	103074	103079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_013093	CGGGG	2	10	103195	103204	0 %	0 %	80 %	20 %	256374255
3071	NC_013093	GC	3	6	103213	103218	0 %	0 %	50 %	50 %	256374255
3072	NC_013093	GC	3	6	103239	103244	0 %	0 %	50 %	50 %	256374255
3073	NC_013093	CGC	2	6	103271	103276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3074	NC_013093	TCG	2	6	103336	103341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374255
3075	NC_013093	CGC	2	6	103351	103356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3076	NC_013093	CGC	2	6	103370	103375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3077	NC_013093	CCG	3	9	103417	103425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3078	NC_013093	CGC	3	9	103430	103438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3079	NC_013093	AGG	2	6	103447	103452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374255
3080	NC_013093	GC	3	6	103457	103462	0 %	0 %	50 %	50 %	256374255
3081	NC_013093	CGCT	2	8	103476	103483	0 %	25 %	25 %	50 %	256374255
3082	NC_013093	CGGCC	2	10	103514	103523	0 %	0 %	40 %	60 %	256374255
3083	NC_013093	CCA	2	6	103540	103545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374255
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3085	NC_013093	CGT	2	6	103607	103612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374255
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3088	NC_013093	ACC	3	9	103749	103757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374255
3089	NC_013093	GCCCAG	2	12	103824	103835	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256374255
3090	NC_013093	CCG	2	6	103847	103852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3091	NC_013093	CCA	2	6	103876	103881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374255
3092	NC_013093	CGC	2	6	103928	103933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3093	NC_013093	GTCG	2	8	103940	103947	0 %	25 %	50 %	25 %	256374255
3094	NC_013093	GCC	2	6	104064	104069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
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3096	NC_013093	CCG	2	6	104102	104107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3097	NC_013093	AGGC	2	8	104155	104162	25 %	0 %	50 %	25 %	256374255
3098	NC_013093	GCG	2	6	104198	104203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374255
3099	NC_013093	CGG	2	6	104204	104209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374255
3100	NC_013093	CCGG	2	8	104240	104247	0 %	0 %	50 %	50 %	256374255
3101	NC_013093	CAC	2	6	104256	104261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374255
3102	NC_013093	CCA	3	9	104290	104298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374255
3103	NC_013093	CGC	2	6	104300	104305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
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3105	NC_013093	CGC	2	6	104387	104392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3106	NC_013093	GAG	2	6	104406	104411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374255
3107	NC_013093	ACC	2	6	104421	104426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374255
3108	NC_013093	TGC	2	6	104446	104451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374255
3109	NC_013093	CGC	2	6	104459	104464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3110	NC_013093	CCGG	2	8	104480	104487	0 %	0 %	50 %	50 %	256374255
3111	NC_013093	TGC	3	9	104557	104565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374255
3112	NC_013093	CGA	2	6	104567	104572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374255
3113	NC_013093	CCG	2	6	104599	104604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3114	NC_013093	CCG	4	12	104626	104637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3115	NC_013093	GCC	2	6	104646	104651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3116	NC_013093	CCAC	2	8	104662	104669	25 %	0 %	0 %	75 %	256374255
3117	NC_013093	GCC	2	6	104682	104687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3118	NC_013093	CGA	3	9	104693	104701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374255
3119	NC_013093	CAC	2	6	104702	104707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374255
3120	NC_013093	GC	3	6	104714	104719	0 %	0 %	50 %	50 %	256374255
3121	NC_013093	CAC	2	6	104735	104740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374255
3122	NC_013093	CTG	2	6	104766	104771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374255
3123	NC_013093	CGG	2	6	104774	104779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374255
3124	NC_013093	CGC	2	6	104780	104785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3125	NC_013093	GCT	2	6	104801	104806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374255
3126	NC_013093	GCG	2	6	104809	104814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374255
3127	NC_013093	GCC	2	6	104864	104869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3128	NC_013093	GC	3	6	104911	104916	0 %	0 %	50 %	50 %	256374255
3129	NC_013093	TGC	2	6	104929	104934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374255
3130	NC_013093	CACG	2	8	104954	104961	25 %	0 %	25 %	50 %	256374255
3131	NC_013093	CGC	2	6	104963	104968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3132	NC_013093	GGCCG	2	10	105021	105030	0 %	0 %	60 %	40 %	256374255
3133	NC_013093	TGG	2	6	105043	105048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374255
3134	NC_013093	CGACAC	2	12	105050	105061	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	256374255
3135	NC_013093	GCC	2	6	105092	105097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3136	NC_013093	GCC	2	6	105102	105107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
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3138	NC_013093	CTG	2	6	105183	105188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374255
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3142	NC_013093	GCC	2	6	105216	105221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3143	NC_013093	CCG	2	6	105230	105235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
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3146	NC_013093	CCG	2	6	105298	105303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3147	NC_013093	CCGGG	2	10	105341	105350	0 %	0 %	60 %	40 %	256374255
3148	NC_013093	CGC	2	6	105353	105358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3149	NC_013093	CGC	2	6	105387	105392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3150	NC_013093	GGCGCG	2	12	105402	105413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374255
3151	NC_013093	GCC	2	6	105447	105452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3152	NC_013093	GCT	2	6	105488	105493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374255
3153	NC_013093	CGCTGG	2	12	105517	105528	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256374255
3154	NC_013093	CGC	3	9	105551	105559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
3155	NC_013093	CCGCG	2	10	105566	105575	0 %	0 %	40 %	60 %	256374255
3156	NC_013093	GGACC	2	10	105628	105637	20 %	0 %	40 %	40 %	256374255
3157	NC_013093	CGT	2	6	105734	105739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374255
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3162	NC_013093	CCG	2	6	105940	105945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374255
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3164	NC_013093	GCT	2	6	105992	105997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374255
3165	NC_013093	CGG	2	6	106001	106006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374255
3166	NC_013093	GCT	2	6	106037	106042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374255
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3169	NC_013093	CGA	2	6	106067	106072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374255
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3189	NC_013093	CGC	2	6	106672	106677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374256
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3201	NC_013093	CCGG	2	8	107020	107027	0 %	0 %	50 %	50 %	256374256
3202	NC_013093	TCG	2	6	107037	107042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374256
3203	NC_013093	CGT	2	6	107113	107118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374256
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3205	NC_013093	TGGG	2	8	107138	107145	0 %	25 %	75 %	0 %	256374256
3206	NC_013093	CGA	2	6	107191	107196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374256
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3209	NC_013093	TCG	2	6	107288	107293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374256
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3211	NC_013093	CGG	2	6	107339	107344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3212	NC_013093	GCG	2	6	107359	107364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3213	NC_013093	CCCG	2	8	107365	107372	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3214	NC_013093	GCCCC	2	10	107402	107411	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3215	NC_013093	C	6	6	107408	107413	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3216	NC_013093	CAC	2	6	107429	107434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3217	NC_013093	CCCG	2	8	107435	107442	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3218	NC_013093	GGGC	2	8	107512	107519	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3219	NC_013093	CCG	2	6	107532	107537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3220	NC_013093	CGG	2	6	107565	107570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374257
3221	NC_013093	CCAC	2	8	107572	107579	25 %	0 %	0 %	75 %	256374257
3222	NC_013093	CTGC	2	8	107584	107591	0 %	25 %	25 %	50 %	256374257
3223	NC_013093	CCG	2	6	107623	107628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374257
3224	NC_013093	TTC	2	6	107637	107642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256374257
3225	NC_013093	TCT	2	6	107647	107652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256374257
3226	NC_013093	CGC	2	6	107718	107723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374257
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3228	NC_013093	GTC	2	6	107793	107798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374257
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3232	NC_013093	CGA	2	6	107908	107913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374257
3233	NC_013093	TCG	2	6	107919	107924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374257
3234	NC_013093	CCG	2	6	107958	107963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374257
3235	NC_013093	CGC	2	6	108076	108081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374257
3236	NC_013093	CGA	2	6	108091	108096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374257
3237	NC_013093	TCC	2	6	108114	108119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374257
3238	NC_013093	ACC	2	6	108144	108149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374257
3239	NC_013093	GTC	2	6	108155	108160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374257
3240	NC_013093	CAG	2	6	108164	108169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374257
3241	NC_013093	CG	3	6	108254	108259	0 %	0 %	50 %	50 %	256374258
3242	NC_013093	TTC	2	6	108344	108349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256374258
3243	NC_013093	TGG	2	6	108372	108377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374258
3244	NC_013093	AGC	2	6	108378	108383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374258
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3248	NC_013093	CTG	2	6	108485	108490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374258
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3370	NC_013093	GTGGGA	2	12	112470	112481	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	256374263
3371	NC_013093	CCT	2	6	112509	112514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374263
3372	NC_013093	ACC	2	6	112569	112574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374263
3373	NC_013093	CCG	2	6	112605	112610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374263
3374	NC_013093	GCG	2	6	112611	112616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374263
3375	NC_013093	TTC	2	6	112621	112626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256374263
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3377	NC_013093	CCG	2	6	112684	112689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3378	NC_013093	CG	3	6	112697	112702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3379	NC_013093	CGC	2	6	112743	112748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3380	NC_013093	CGC	3	9	112757	112765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374264
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3382	NC_013093	CGGTC	2	10	112849	112858	0 %	20 %	40 %	40 %	256374264
3383	NC_013093	TCG	2	6	112900	112905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374264
3384	NC_013093	TCG	2	6	113037	113042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3385	NC_013093	GCC	2	6	113173	113178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374265
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3441	NC_013093	CGG	2	6	115442	115447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374268
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3490	NC_013093	GTCCG	2	10	117318	117327	0 %	20 %	40 %	40 %	256374268
3491	NC_013093	CAC	2	6	117338	117343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374268
3492	NC_013093	CGC	2	6	117376	117381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374268
3493	NC_013093	CGG	2	6	117410	117415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374268
3494	NC_013093	ACGAGG	2	12	117436	117447	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	256374268
3495	NC_013093	CCA	2	6	117481	117486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374268
3496	NC_013093	GC	4	8	117529	117536	0 %	0 %	50 %	50 %	256374268
3497	NC_013093	ACC	2	6	117544	117549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374268
3498	NC_013093	CGT	2	6	117611	117616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374268
3499	NC_013093	ACA	2	6	117655	117660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256374268
3500	NC_013093	CAC	3	9	117671	117679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374268

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