MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Actinosynnema mirum DSM 43827 chromosome

Total Repeats: 8452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_013093	TGGAAC	2	12	7346166	7346177	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256380249
7502	NC_013093	CGCCGA	2	12	7347911	7347922	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256380251
7503	NC_013093	GCACGT	2	12	7348403	7348414	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256380252
7504	NC_013093	GGCACA	2	12	7349979	7349990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256380253
7505	NC_013093	GTGAAC	2	12	7351533	7351544	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256380254
7506	NC_013093	CAGCTC	2	12	7352069	7352080	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256380254
7507	NC_013093	GCACCC	2	12	7352181	7352192	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	256380255
7508	NC_013093	CCGACC	2	12	7352999	7353010	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	256380255
7509	NC_013093	GGCGGG	2	12	7353921	7353932	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	256380256
7510	NC_013093	CCAGCA	2	12	7354685	7354696	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	256380256
7511	NC_013093	CATGCC	2	12	7357831	7357842	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256380259
7512	NC_013093	TCGCGC	2	12	7358085	7358096	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256380259
7513	NC_013093	GCACCG	2	12	7358438	7358449	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256380260
7514	NC_013093	TGGCGG	2	12	7358498	7358509	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	256380260
7515	NC_013093	TCGGTG	2	12	7361005	7361016	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256380262
7516	NC_013093	CGAGGA	2	12	7362177	7362188	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	256380263
7517	NC_013093	TCGGCG	2	12	7363412	7363423	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380265
7518	NC_013093	CCTGCG	2	12	7364973	7364984	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256380267
7519	NC_013093	ACCCCG	2	12	7365281	7365292	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	256380268
7520	NC_013093	CACCGC	2	12	7365688	7365699	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	256380268
7521	NC_013093	CCAGGT	2	12	7367085	7367096	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256380268
7522	NC_013093	TCCCAC	2	12	7367183	7367194	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	256380268
7523	NC_013093	CTCGGC	2	12	7367707	7367718	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256380268
7524	NC_013093	CGCCCG	2	12	7369144	7369155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256380269
7525	NC_013093	GCCCAG	2	12	7369541	7369552	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256380269
7526	NC_013093	CCGTTC	2	12	7371581	7371592	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7527	NC_013093	CTCGGC	2	12	7372079	7372090	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256380273
7528	NC_013093	TCGTGA	2	12	7372903	7372914	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256380274
7529	NC_013093	GGCTCG	2	12	7373380	7373391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380274
7530	NC_013093	GCCAGG	2	12	7375536	7375547	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380276
7531	NC_013093	GAGCAG	2	12	7376193	7376204	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	256380277
7532	NC_013093	GGCGAC	2	12	7376766	7376777	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380278
7533	NC_013093	GCAGCG	2	12	7379167	7379178	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380280
7534	NC_013093	TGGCCT	2	12	7381466	7381477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_013093	AGGTCG	2	12	7382879	7382890	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256380285
7536	NC_013093	TGGACC	2	12	7384482	7384493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256380286
7537	NC_013093	ACGCGG	2	12	7384945	7384956	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380287
7538	NC_013093	GAGCCG	2	12	7385250	7385261	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380287
7539	NC_013093	TGGCGC	2	12	7385584	7385595	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380287
7540	NC_013093	CCTCGG	2	12	7386540	7386551	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256380289
7541	NC_013093	ACGTCC	2	12	7386961	7386972	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256380290
7542	NC_013093	CGGGCT	2	12	7391954	7391965	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380295
7543	NC_013093	GTCCTT	2	12	7393548	7393559	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	256380295
7544	NC_013093	TGCGCT	2	12	7393691	7393702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256380295
7545	NC_013093	GTCCGC	2	12	7395768	7395779	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256380296
7546	NC_013093	TCGCCC	2	12	7398367	7398378	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	256380298
7547	NC_013093	CCCGGT	2	12	7402556	7402567	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256380300
7548	NC_013093	CGGCAG	2	12	7402931	7402942	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380301
7549	NC_013093	CCCCTG	2	12	7404393	7404404	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	256380303
7550	NC_013093	AGGGCA	2	12	7405195	7405206	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	256380304
7551	NC_013093	CGGTGA	2	12	7407194	7407205	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256380306
7552	NC_013093	TCGTGC	2	12	7407713	7407724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256380306
7553	NC_013093	TCGACG	2	12	7410432	7410443	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256380309
7554	NC_013093	CGGCGA	2	12	7412372	7412383	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380310
7555	NC_013093	GCCGAT	2	12	7412391	7412402	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256380310
7556	NC_013093	TCGACC	2	12	7413088	7413099	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256380310
7557	NC_013093	CGGCAC	2	12	7416567	7416578	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256380313
7558	NC_013093	GTCGGC	2	12	7416975	7416986	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380313
7559	NC_013093	ACGTCG	2	12	7418530	7418541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256380315
7560	NC_013093	CCAGGA	2	12	7420926	7420937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256380318
7561	NC_013093	GGGGTG	2	12	7422425	7422436	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	256380318
7562	NC_013093	GGAGCA	2	12	7422894	7422905	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	256380318
7563	NC_013093	GCACCA	3	18	7423064	7423081	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	256380318
7564	NC_013093	CGTGGT	2	12	7426740	7426751	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256380322
7565	NC_013093	GGTGGC	2	12	7427181	7427192	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	256380322
7566	NC_013093	GCCGAG	2	12	7427698	7427709	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380322
7567	NC_013093	GCGGTG	2	12	7427869	7427880	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	256380322
7568	NC_013093	CGGTGC	2	12	7428271	7428282	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380323
7569	NC_013093	GACGCG	2	12	7428467	7428478	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380323
7570	NC_013093	CCGCGT	2	12	7429095	7429106	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256380324
7571	NC_013093	CTCCAG	2	12	7430681	7430692	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256380325
7572	NC_013093	CCGGAC	2	12	7431232	7431243	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256380326
7573	NC_013093	TCCGCC	2	12	7431291	7431302	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	256380326
7574	NC_013093	GGGCAG	2	12	7431415	7431426	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	256380326
7575	NC_013093	CAGGCC	2	12	7431694	7431705	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256380327
7576	NC_013093	GCCCAG	2	12	7433628	7433639	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256380328
7577	NC_013093	GGACAC	2	12	7436099	7436110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256380330
7578	NC_013093	CGGCAC	2	12	7436169	7436180	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256380330
7579	NC_013093	GACGAG	2	12	7436869	7436880	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	256380331
7580	NC_013093	GTGCTG	2	12	7438140	7438151	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256380332
7581	NC_013093	AGCGGC	2	12	7438561	7438572	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380332
7582	NC_013093	GCGGCT	2	12	7440075	7440086	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380333
7583	NC_013093	GGTGCT	2	12	7440285	7440296	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256380333
7584	NC_013093	GCGCGG	2	12	7441242	7441253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256380334
7585	NC_013093	GCGAGC	2	12	7441601	7441612	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380334
7586	NC_013093	CGGCGT	2	12	7441761	7441772	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380334
7587	NC_013093	GGTCGC	2	12	7442672	7442683	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380335
7588	NC_013093	TCGGCG	2	12	7442782	7442793	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380335
7589	NC_013093	GCGGCA	2	12	7443824	7443835	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380336
7590	NC_013093	AAGCCG	2	12	7444158	7444169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256380336
7591	NC_013093	GTCGCC	2	12	7444199	7444210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256380336
7592	NC_013093	AACCCG	2	12	7446550	7446561	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	256380338
7593	NC_013093	GGGCGG	2	12	7446980	7446991	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	256380339
7594	NC_013093	ATGCCC	2	12	7446994	7447005	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256380339
7595	NC_013093	CTGGCT	2	12	7450102	7450113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256380343
7596	NC_013093	CCGGGT	2	12	7452809	7452820	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380348
7597	NC_013093	ACCCTG	2	12	7454357	7454368	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256380349
7598	NC_013093	CGACCA	2	12	7454644	7454655	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	256380349
7599	NC_013093	GCAAGG	2	12	7455048	7455059	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	256380349
7600	NC_013093	CCGCTC	2	12	7459795	7459806	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	256380353
7601	NC_013093	GGCGCG	2	12	7460978	7460989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256380355
7602	NC_013093	GCACGC	2	12	7461378	7461389	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256380355
7603	NC_013093	GAGCAG	2	12	7463048	7463059	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	256380357
7604	NC_013093	GGCATC	2	12	7464631	7464642	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256380359
7605	NC_013093	CGGCAC	2	12	7464762	7464773	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256380359
7606	NC_013093	CGGCAT	2	12	7464816	7464827	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256380359
7607	NC_013093	CGGCAT	2	12	7464834	7464845	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256380359
7608	NC_013093	CGGCAT	2	12	7464852	7464863	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256380359
7609	NC_013093	CCACCG	2	12	7469274	7469285	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	256380364
7610	NC_013093	ACGAGG	2	12	7469685	7469696	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	256380364
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7721	NC_013093	CCGACG	2	12	7575404	7575415	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256380445
7722	NC_013093	GAGCCG	2	12	7575832	7575843	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380445
7723	NC_013093	CACCTC	2	12	7576575	7576586	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	256380445
7724	NC_013093	GCCAAG	2	12	7576672	7576683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256380445
7725	NC_013093	CACCGT	2	12	7577574	7577585	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256380445
7726	NC_013093	CAGCTC	2	12	7578168	7578179	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256380445
7727	NC_013093	ACGGCA	3	18	7579022	7579039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256380445
7728	NC_013093	CCGAGG	2	12	7579430	7579441	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380445
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7730	NC_013093	TCGGCG	2	12	7580750	7580761	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380445
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7734	NC_013093	CGCGTA	2	12	7584255	7584266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256380445
7735	NC_013093	CCGACG	2	12	7585469	7585480	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256380445
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7737	NC_013093	GTGCAG	2	12	7586890	7586901	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256380445
7738	NC_013093	TCGACG	2	12	7587040	7587051	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256380445
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7747	NC_013093	CGCCGA	2	12	7592139	7592150	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256380445
7748	NC_013093	CGTGGC	2	12	7594741	7594752	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380446
7749	NC_013093	CCGGCA	2	12	7596196	7596207	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256380448
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7752	NC_013093	GCGGCA	2	12	7596695	7596706	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256380448
7753	NC_013093	CACCTG	2	12	7596855	7596866	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256380448
7754	NC_013093	GCTGCG	2	12	7599230	7599241	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380448
7755	NC_013093	CGCGTT	2	12	7599407	7599418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256380448
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7757	NC_013093	CTGCGG	2	12	7599552	7599563	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380448
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7759	NC_013093	GCCGGT	2	12	7602078	7602089	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380451
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7821	NC_013093	CTGGGC	2	12	7651080	7651091	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380498
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7826	NC_013093	CCGGCT	2	12	7654764	7654775	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7827	NC_013093	GACGTT	2	12	7655177	7655188	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256380501
7828	NC_013093	TGCCGT	2	12	7655305	7655316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256380501
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7830	NC_013093	TGGCCG	2	12	7656583	7656594	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256380503
7831	NC_013093	CGCCAC	2	12	7657466	7657477	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	256380504
7832	NC_013093	GCTGGT	2	12	7657748	7657759	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256380504
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7879	NC_013093	GGCGCG	2	12	7693617	7693628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7880	NC_013093	GTGTGG	2	12	7693735	7693746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7922	NC_013093	CTGCCC	2	12	7722022	7722033	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	256380560
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7926	NC_013093	GCCGCT	2	12	7727043	7727054	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256380564
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7929	NC_013093	CTTGCC	2	12	7730535	7730546	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	256380567
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7932	NC_013093	CCCGGC	2	12	7732630	7732641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7941	NC_013093	GCCCTT	2	12	7739734	7739745	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	256380583
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7944	NC_013093	GCTTCG	2	12	7744428	7744439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256380593
7945	NC_013093	TGCGCT	2	12	7745746	7745757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256380596
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